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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* Bpti *

LOGs for ID: 251227075224456254

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 251227075224456254.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 251227075224456254.atom to be opened.

 Openam> File opened: 251227075224456254.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     58
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     58
            Number of atoms found    =    909
            Mean number per residue  =     15.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    27.949101 +/-     5.517308 From:    16.204000 To:    41.738000
 =     9.301231 +/-     5.632721 From:    -4.018000 To:    24.661000
 =     0.429042 +/-     8.081702 From:   -15.922000 To:    17.555000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is  14.6395 % Filled.
 Pdbmat>       544536  non-zero elements.
 Pdbmat>        59913 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    131.82 +/-     44.81
         Maximum number =    232
         Minimum number =     24

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.198260E+06
 Pdbmat> Larger element =  872.103    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
58 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 251227075224456254.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 251227075224456254.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 251227075224456254.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   909 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    58 residues.
 Blocpdb>    26 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    14 atoms in block      2
 Block first atom:     27
 Blocpdb>    12 atoms in block      3
 Block first atom:     41
 Blocpdb>    20 atoms in block      4
 Block first atom:     53
 Blocpdb>    10 atoms in block      5
 Block first atom:     73
 Blocpdb>    19 atoms in block      6
 Block first atom:     83
 Blocpdb>    24 atoms in block      7
 Block first atom:    102
 Blocpdb>    14 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    14 atoms in block      9
 Block first atom:    140
 Blocpdb>    21 atoms in block     10
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    14 atoms in block     11
 Block first atom:    175
 Blocpdb>     7 atoms in block     12
 Block first atom:    189
 Blocpdb>    14 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    10 atoms in block     14
 Block first atom:    210
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    220
 Blocpdb>    10 atoms in block     16
 Block first atom:    242
 Blocpdb>    24 atoms in block     17
 Block first atom:    252
 Blocpdb>    19 atoms in block     18
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    19 atoms in block     19
 Block first atom:    295
 Blocpdb>    24 atoms in block     20
 Block first atom:    314
 Blocpdb>    21 atoms in block     21
 Block first atom:    338
 Blocpdb>    20 atoms in block     22
 Block first atom:    359
 Blocpdb>    21 atoms in block     23
 Block first atom:    379
 Blocpdb>    14 atoms in block     24
 Block first atom:    400
 Blocpdb>    10 atoms in block     25
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    22 atoms in block     26
 Block first atom:    424
 Blocpdb>    10 atoms in block     27
 Block first atom:    446
 Blocpdb>     7 atoms in block     28
 Block first atom:    456
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    10 atoms in block     30
 Block first atom:    482
 Blocpdb>    17 atoms in block     31
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    14 atoms in block     32
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    20 atoms in block     33
 Block first atom:    523
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    543
 Blocpdb>    21 atoms in block     35
 Block first atom:    559
 Blocpdb>     7 atoms in block     36
 Block first atom:    580
 Blocpdb>     7 atoms in block     37
 Block first atom:    587
 Blocpdb>    10 atoms in block     38
 Block first atom:    594
 Blocpdb>    24 atoms in block     39
 Block first atom:    604
 Blocpdb>    10 atoms in block     40
 Block first atom:    628
 Blocpdb>    22 atoms in block     41
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    24 atoms in block     42
 Block first atom:    660
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    684
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    698
 Blocpdb>    20 atoms in block     45
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    22 atoms in block     46
 Block first atom:    732
 Blocpdb>    11 atoms in block     47
 Block first atom:    754
 Blocpdb>    10 atoms in block     48
 Block first atom:    765
 Blocpdb>    15 atoms in block     49
 Block first atom:    775
 Blocpdb>    12 atoms in block     50
 Block first atom:    790
 Blocpdb>    10 atoms in block     51
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    25 atoms in block     52
 Block first atom:    812
 Blocpdb>    24 atoms in block     53
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    14 atoms in block     54
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    10 atoms in block     55
 Block first atom:    875
 Blocpdb>     7 atoms in block     56
 Block first atom:    885
 Blocpdb>     7 atoms in block     57
 Block first atom:    892
 Blocpdb>    11 atoms in block     58
 Block first atom:    898

 Blocpdb>    58 blocks.

 Blocpdb> At most,     26 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       544594 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2727

 Prepmat> Matrix trace    =    1198260.0000
 Prepmat> Last element read:    2727   2727        76.4924
 Prepmat>         1712 lines saved.
 Prepmat>         1036 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   909
 RTB> Total mass =         909.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   909
 RTB> Number of blocks =    58
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  140511.7488
 RTB>     23430 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      348
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    23430
 Diagstd> Projected matrix trace =  140511.7488

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    348 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 140511.7488
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000     11.5543578     15.2172878     18.7806478     23.6714989
     25.7599506     28.9298605     35.4414763     41.6789150     42.7146896
     47.4718189     52.0996920     55.8936322     57.7081654     65.2517682
     67.7778362     71.6077948     74.2215313     76.4680101     85.5295934
     86.4703598     96.6036554     99.2661625    102.3496104    107.0308266
    109.2140666    113.0408213    116.1802308    122.7170587    125.0397810
    125.4109656    129.2990821    131.3383384    136.8045783    138.6881533
    143.0265108    148.3639383    152.5157775    155.1816748    156.6021945
    160.6487415    163.1690319    167.5747058    168.1259714    170.2064430
    175.2713741    178.4132175    180.4736652    183.7064998    186.4568237
    191.2697748    194.6801981    197.4567265    198.5610536    204.7822425
    208.0390952    209.8746976    212.7784009    213.9202333    217.2431647
    218.6567543    222.1176191    223.4737016    228.1442389    231.7764365
    233.8930861    235.6812585    237.3184083    240.0685154    241.3686641
    244.5266167    246.8435187    250.2330234    253.5869317    255.2240892
    257.0529078    259.7725773    260.6625162    262.7212233    263.2133504
    266.3707759    267.4439292    269.1768931    269.9861982    273.9541576
    276.2179832    277.2190296    278.9650000    282.4853472    284.1901463
    284.9811476    286.8564921    290.2302313    292.6642473    293.9061059
    296.6101698    298.6463036    301.3696902    304.9555272    306.1585181
    307.5452759

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034329      0.0034332      0.0034334      0.0034336      0.0034337
      0.0034340    369.1205183    423.6077597    470.5985285    528.3335127
    551.1474384    584.0747745    646.4741777    701.0572464    709.7148744
    748.1922690    783.8137150    811.8512183    824.9239531    877.1854566
    894.0033174    918.9151886    935.5354209    949.5879058   1004.2769246
   1009.7849961   1067.3136418   1081.9218627   1098.5969200   1123.4395789
   1134.8398285   1154.5504965   1170.4729939   1202.9504778   1214.2815113
   1216.0824927   1234.7897088   1244.4889334   1270.1224609   1278.8363223
   1298.6841863   1322.6942235   1341.0737654   1352.7436303   1358.9209751
   1376.3660265   1387.1203677   1405.7222310   1408.0325139   1416.7175641
   1437.6420797   1450.4701409   1458.8216482   1471.8296296   1482.8062952
   1501.8219708   1515.1518833   1525.9181781   1530.1792717   1553.9656961
   1566.2740708   1573.1687902   1584.0141272   1588.2585870   1600.5466646
   1605.7455564   1618.4034109   1623.3362678   1640.2121836   1653.2172227
   1660.7488960   1667.0852331   1672.8653805   1682.5302598   1687.0801814
   1698.0807932   1706.1065273   1717.7801976   1729.2537045   1734.8267559
   1741.0311472   1750.2171370   1753.2125544   1760.1223560   1761.7701076
   1772.3054302   1775.8719695   1781.6162626   1784.2925492   1797.3565064
   1804.7674734   1808.0348602   1813.7195718   1825.1276435   1830.6266822
   1833.1725512   1839.1943404   1849.9781723   1857.7193973   1861.6566438
   1870.2010608   1876.6092478   1885.1463265   1896.3283373   1900.0649811
   1904.3633310

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    909
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     58

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9940E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   178.4    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   180.5    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.7    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   186.5    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   191.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   194.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   197.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   198.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   204.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   208.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   209.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   212.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   213.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   217.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   218.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   222.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   223.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   228.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   231.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   233.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   235.7    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   237.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   240.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   241.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   244.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   246.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   250.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   253.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   255.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   257.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   259.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   260.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   262.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   263.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   266.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   267.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   269.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   270.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   274.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   276.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   277.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   279.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   282.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   284.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   285.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   286.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   290.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   292.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   293.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   296.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   298.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   301.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   305.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   306.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   307.5    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    348 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00005 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99997
 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00005
 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99995 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
 0.99995 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99995
 1.00003 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99994
 0.99995 1.00005 1.00002 0.99997 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998
 1.00004 0.99996 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00000 0.99996 1.00004 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
 0.99995

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    16362 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00005 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99997
 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00005
 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99995 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
 0.99995 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99995
 1.00003 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99994
 0.99995 1.00005 1.00002 0.99997 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998
 1.00004 0.99996 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00000 0.99996 1.00004 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
 0.99995

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 251227075224456254.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 251227075224456254.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 251227075224456254.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 251227075224456254.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     58
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     58
            Number of atoms found    =    909
            Mean number per residue  =     15.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9940E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9981E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   113.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   116.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   125.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   125.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   129.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   136.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   148.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   152.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   155.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   156.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   160.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   163.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   167.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   168.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   170.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   175.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   178.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   180.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   186.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   191.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   194.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   197.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   198.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   204.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   208.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   209.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   212.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   213.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   217.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   218.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   222.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   223.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   228.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   231.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   233.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   235.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   237.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   240.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   241.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   244.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   246.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   250.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   253.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   255.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   257.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   259.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   260.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   262.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   263.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   266.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   267.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   269.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   270.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   274.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   276.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   277.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   279.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   282.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   284.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   285.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   286.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   290.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   292.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   293.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   296.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   298.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   301.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   305.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   306.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   307.5    

 Bfactors>  106 vectors,   2727 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :    11.550000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.798 for     58 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.010 +/-   0.01
 Bfactors> =     13.885 +/-   6.75
 Bfactors> Shiftng-fct=     13.874
 Bfactors> Scaling-fct=    570.337

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 251227075224456254.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 251227075224456254.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   369.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   423.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   470.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   528.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   551.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   584.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   646.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   701.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   709.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   748.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   783.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   811.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   877.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   894.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   918.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   935.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   949.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1004.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1010.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1067.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1082.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1098.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1123.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1135.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1154.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1171.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1203.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1214.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1216.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1235.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1244.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1270.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1279.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1299.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1323.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1341.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1353.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1359.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1376.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1387.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1406.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1408.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1417.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1438.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1450.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1459.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1472.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1483.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1502.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1515.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1526.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1530.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1554.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1566.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1573.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1584.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1588.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1600.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1606.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1618.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1623.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1640.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1653.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1661.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1667.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1673.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1683.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1687.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1698.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1706.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1718.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1729.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1735.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1741.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1750.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1753.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1760.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1762.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1772.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1776.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1782.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1784.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1797.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1805.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1808.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1814.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1825.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1831.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1833.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1839.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1850.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1858.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1862.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1870.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1876.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1885.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1896.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1900.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1904.    

 Chkmod>  106 vectors,   2727 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    909 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    31 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    65 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    75 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    77 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    84 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   106 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7273
      0.0034      0.7932
      0.0034      0.6804
      0.0034      0.7936
      0.0034      0.7488
      0.0034      0.9491
    369.0351      0.2361
    423.6273      0.3806
    470.5702      0.1636
    528.2941      0.3874
    551.1243      0.1429
    584.0511      0.0934
    646.4330      0.2708
    701.0363      0.0873
    709.6454      0.2397
    748.1458      0.2551
    783.7824      0.2285
    811.7900      0.2768
    824.9017      0.4779
    877.1359      0.3028
    893.9792      0.3770
    918.8899      0.4825
    935.4856      0.4424
    949.5595      0.4102
   1004.2362      0.5289
   1009.7395      0.4826
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   1214.0362      0.2276
   1215.9771      0.4419
   1234.7411      0.2764
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   1741.1159      0.4226
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   1759.9757      0.4442
   1761.6498      0.3938
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   1775.6499      0.4058
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   1813.7555      0.3800
   1825.0966      0.4911
   1830.5798      0.4032
   1833.1545      0.3654
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   1857.7531      0.4066
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   1870.0887      0.4173
   1876.3832      0.4782
   1885.1602      0.5305
   1896.3852      0.4097
   1900.1121      0.4857
   1904.1414      0.4344
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 251227075224456254 7 -40 40 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-40
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
making animated gifs
5 models are in 251227075224456254.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 251227075224456254 8 -40 40 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-40
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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making animated gifs
5 models are in 251227075224456254.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 251227075224456254 9 -40 40 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-40
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251227075224456254.atom
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251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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making animated gifs
5 models are in 251227075224456254.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 251227075224456254 10 -40 40 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-40
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 251227075224456254 11 -40 40 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-40
251227075224456254.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
251227075224456254.eigenfacs
251227075224456254.atom
making animated gifs
5 models are in 251227075224456254.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 251227075224456254.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
251227075224456254.10.pdb
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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