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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Ecoli yecd  ***

LOGs for ID: 251228182821571726

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 251228182821571726.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 251228182821571726.atom to be opened. Openam> File opened: 251228182821571726.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 748 First residue number = 12 Last residue number = 199 Number of atoms found = 5751 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 46.930133 +/- 16.391160 From: 12.015000 To: 83.506000 = 28.995722 +/- 14.873131 From: -6.682000 To: 65.500000 = 16.069194 +/- 12.514745 From: -17.377000 To: 48.379000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5264 % Filled. Pdbmat> 2271866 non-zero elements. Pdbmat> 248640 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.47 +/- 22.18 Maximum number = 128 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 4.972800E+06 Pdbmat> Larger element = 473.013 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 748 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 251228182821571726.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 251228182821571726.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 251228182821571726.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5751 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 748 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 29 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 27 atoms in block 3 Block first atom: 63 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 90 Blocpdb> 30 atoms in block 5 Block first atom: 121 Blocpdb> 31 atoms in block 6 Block first atom: 151 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 182 Blocpdb> 29 atoms in block 8 Block first atom: 207 Blocpdb> 33 atoms in block 9 Block first atom: 236 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 269 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 295 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 325 Blocpdb> 34 atoms in block 13 Block first atom: 351 Blocpdb> 33 atoms in block 14 Block first atom: 385 Blocpdb> 29 atoms in block 15 Block first atom: 418 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 447 Blocpdb> 31 atoms in block 17 Block first atom: 481 Blocpdb> 27 atoms in block 18 Block first atom: 512 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 539 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 564 Blocpdb> 45 atoms in block 21 Block first atom: 595 Blocpdb> 31 atoms in block 22 Block first atom: 640 Blocpdb> 24 atoms in block 23 Block first atom: 671 Blocpdb> 29 atoms in block 24 Block first atom: 695 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 724 Blocpdb> 43 atoms in block 26 Block first atom: 757 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 800 Blocpdb> 27 atoms in block 28 Block first atom: 832 Blocpdb> 34 atoms in block 29 Block first atom: 859 Blocpdb> 37 atoms in block 30 Block first atom: 893 Blocpdb> 31 atoms in block 31 Block first atom: 930 Blocpdb> 25 atoms in block 32 Block first atom: 961 Blocpdb> 29 atoms in block 33 Block first atom: 986 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 1015 Blocpdb> 29 atoms in block 35 Block first atom: 1043 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1072 Blocpdb> 31 atoms in block 37 Block first atom: 1108 Blocpdb> 28 atoms in block 38 Block first atom: 1139 Blocpdb> 28 atoms in block 39 Block first atom: 1167 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 1195 Blocpdb> 33 atoms in block 41 Block first atom: 1217 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1250 Blocpdb> 38 atoms in block 43 Block first atom: 1280 Blocpdb> 31 atoms in block 44 Block first atom: 1318 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1349 Blocpdb> 33 atoms in block 46 Block first atom: 1384 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1417 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1447 Blocpdb> 27 atoms in block 49 Block first atom: 1477 Blocpdb> 30 atoms in block 50 Block first atom: 1504 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1534 Blocpdb> 34 atoms in block 52 Block first atom: 1564 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1598 Blocpdb> 30 atoms in block 54 Block first atom: 1618 Blocpdb> 31 atoms in block 55 Block first atom: 1648 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1679 Blocpdb> 27 atoms in block 57 Block first atom: 1708 Blocpdb> 33 atoms in block 58 Block first atom: 1735 Blocpdb> 27 atoms in block 59 Block first atom: 1768 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 1795 Blocpdb> 31 atoms in block 61 Block first atom: 1832 Blocpdb> 30 atoms in block 62 Block first atom: 1863 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1893 Blocpdb> 31 atoms in block 64 Block first atom: 1924 Blocpdb> 25 atoms in block 65 Block first atom: 1955 Blocpdb> 29 atoms in block 66 Block first atom: 1980 Blocpdb> 38 atoms in block 67 Block first atom: 2009 Blocpdb> 40 atoms in block 68 Block first atom: 2047 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 2087 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2109 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2137 Blocpdb> 37 atoms in block 72 Block first atom: 2170 Blocpdb> 34 atoms in block 73 Block first atom: 2207 Blocpdb> 31 atoms in block 74 Block first atom: 2241 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2272 Blocpdb> 41 atoms in block 76 Block first atom: 2306 Blocpdb> 27 atoms in block 77 Block first atom: 2347 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 2403 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 2428 Blocpdb> 27 atoms in block 81 Block first atom: 2455 Blocpdb> 38 atoms in block 82 Block first atom: 2482 Blocpdb> 32 atoms in block 83 Block first atom: 2520 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 2552 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 2583 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 2610 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 2632 Blocpdb> 32 atoms in block 88 Block first atom: 2661 Blocpdb> 34 atoms in block 89 Block first atom: 2693 Blocpdb> 38 atoms in block 90 Block first atom: 2727 Blocpdb> 34 atoms in block 91 Block first atom: 2765 Blocpdb> 31 atoms in block 92 Block first atom: 2799 Blocpdb> 29 atoms in block 93 Block first atom: 2830 Blocpdb> 9 atoms in block 94 Block first atom: 2859 Blocpdb> 33 atoms in block 95 Block first atom: 2868 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 2901 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2929 Blocpdb> 33 atoms in block 98 Block first atom: 2956 Blocpdb> 29 atoms in block 99 Block first atom: 2989 Blocpdb> 27 atoms in block 100 Block first atom: 3018 Blocpdb> 28 atoms in block 101 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 102 Block first atom: 3073 Blocpdb> 31 atoms in block 103 Block first atom: 3102 Blocpdb> 26 atoms in block 104 Block first atom: 3133 Blocpdb> 36 atoms in block 105 Block first atom: 3159 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 3195 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 3219 Blocpdb> 29 atoms in block 108 Block first atom: 3252 Blocpdb> 33 atoms in block 109 Block first atom: 3281 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 3314 Blocpdb> 33 atoms in block 111 Block first atom: 3345 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 3378 Blocpdb> 27 atoms in block 113 Block first atom: 3405 Blocpdb> 31 atoms in block 114 Block first atom: 3432 Blocpdb> 45 atoms in block 115 Block first atom: 3463 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 3508 Blocpdb> 26 atoms in block 117 Block first atom: 3535 Blocpdb> 30 atoms in block 118 Block first atom: 3561 Blocpdb> 34 atoms in block 119 Block first atom: 3591 Blocpdb> 38 atoms in block 120 Block first atom: 3625 Blocpdb> 32 atoms in block 121 Block first atom: 3663 Blocpdb> 32 atoms in block 122 Block first atom: 3695 Blocpdb> 36 atoms in block 123 Block first atom: 3727 Blocpdb> 34 atoms in block 124 Block first atom: 3763 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3797 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 3827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 3853 Blocpdb> 26 atoms in block 128 Block first atom: 3882 Blocpdb> 31 atoms in block 129 Block first atom: 3908 Blocpdb> 36 atoms in block 130 Block first atom: 3939 Blocpdb> 31 atoms in block 131 Block first atom: 3975 Blocpdb> 29 atoms in block 132 Block first atom: 4006 Blocpdb> 25 atoms in block 133 Block first atom: 4035 Blocpdb> 21 atoms in block 134 Block first atom: 4060 Blocpdb> 36 atoms in block 135 Block first atom: 4081 Blocpdb> 30 atoms in block 136 Block first atom: 4117 Blocpdb> 37 atoms in block 137 Block first atom: 4147 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 4184 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 4219 Blocpdb> 34 atoms in block 140 Block first atom: 4250 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 4284 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4306 Blocpdb> 29 atoms in block 143 Block first atom: 4339 Blocpdb> 27 atoms in block 144 Block first atom: 4368 Blocpdb> 31 atoms in block 145 Block first atom: 4395 Blocpdb> 30 atoms in block 146 Block first atom: 4426 Blocpdb> 31 atoms in block 147 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 4487 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4512 Blocpdb> 33 atoms in block 150 Block first atom: 4541 Blocpdb> 26 atoms in block 151 Block first atom: 4574 Blocpdb> 30 atoms in block 152 Block first atom: 4600 Blocpdb> 26 atoms in block 153 Block first atom: 4630 Blocpdb> 34 atoms in block 154 Block first atom: 4656 Blocpdb> 33 atoms in block 155 Block first atom: 4690 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 4723 Blocpdb> 34 atoms in block 157 Block first atom: 4752 Blocpdb> 31 atoms in block 158 Block first atom: 4786 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 4817 Blocpdb> 25 atoms in block 160 Block first atom: 4844 Blocpdb> 31 atoms in block 161 Block first atom: 4869 Blocpdb> 45 atoms in block 162 Block first atom: 4900 Blocpdb> 31 atoms in block 163 Block first atom: 4945 Blocpdb> 24 atoms in block 164 Block first atom: 4976 Blocpdb> 29 atoms in block 165 Block first atom: 5000 Blocpdb> 33 atoms in block 166 Block first atom: 5029 Blocpdb> 43 atoms in block 167 Block first atom: 5062 Blocpdb> 32 atoms in block 168 Block first atom: 5105 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 5137 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 5164 Blocpdb> 37 atoms in block 171 Block first atom: 5198 Blocpdb> 31 atoms in block 172 Block first atom: 5235 Blocpdb> 25 atoms in block 173 Block first atom: 5266 Blocpdb> 29 atoms in block 174 Block first atom: 5291 Blocpdb> 28 atoms in block 175 Block first atom: 5320 Blocpdb> 29 atoms in block 176 Block first atom: 5348 Blocpdb> 36 atoms in block 177 Block first atom: 5377 Blocpdb> 31 atoms in block 178 Block first atom: 5413 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 5444 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 5472 Blocpdb> 22 atoms in block 181 Block first atom: 5500 Blocpdb> 33 atoms in block 182 Block first atom: 5522 Blocpdb> 30 atoms in block 183 Block first atom: 5555 Blocpdb> 38 atoms in block 184 Block first atom: 5585 Blocpdb> 31 atoms in block 185 Block first atom: 5623 Blocpdb> 35 atoms in block 186 Block first atom: 5654 Blocpdb> 33 atoms in block 187 Block first atom: 5689 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 5721 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2272054 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17253 Prepmat> Matrix trace = 4972800.0000 Prepmat> Last element read: 17253 17253 128.3828 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 15835 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5751 RTB> Total mass = 5751.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5751 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 246057.8404 RTB> 66696 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66696 Diagstd> Projected matrix trace = 246057.8404 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 246057.8404 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.5757644 2.4125867 3.0808895 4.7153356 4.7820818 5.0419725 6.2595856 6.8854307 8.3216258 8.7743565 9.3565981 9.6887112 12.2832995 12.4090756 14.1519965 14.5278655 14.8845206 15.3513303 15.8686723 16.0561574 16.3416882 17.0960760 18.4261120 18.5043586 19.6356375 20.2135051 20.6499924 21.0169838 22.5547718 22.8947050 22.9827435 23.2313919 24.0498883 25.5176277 26.2062869 26.7267487 26.9835639 27.9315432 28.1747934 28.7087825 29.2260137 29.7560603 30.4480292 30.5474068 30.8066696 31.2579263 31.6731703 31.9528360 32.4059303 32.5019656 33.0110449 33.2297143 33.7403147 33.9182651 34.3965287 34.7539536 35.1081757 35.5406560 35.5499051 35.8350931 36.2449391 36.7914046 37.0024044 37.5278403 38.0888181 39.0028388 39.6849439 39.7826526 40.4070882 41.2228576 41.4677463 41.5562957 42.4331732 42.4835497 42.8276585 43.7626927 44.1712812 44.7450884 45.2442857 45.4229050 45.6064275 46.3194510 46.7285172 47.1645120 47.8928634 48.1207899 48.4618562 48.7957866 49.2877365 49.7169690 50.6187585 51.0995999 51.6614966 51.9050021 52.5275561 52.8385379 53.4044180 53.8792894 54.4993136 54.7627962 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034324 0.0034329 0.0034336 0.0034341 0.0034341 136.3141455 168.6695738 190.6045850 235.8042266 237.4672803 243.8347029 271.6865076 284.9448651 313.2559805 321.6643407 332.1653058 338.0090164 380.5859931 382.5295547 408.5113587 413.9007237 418.9504937 425.4693582 432.5791427 435.1270566 438.9789953 448.9970634 466.1354505 467.1241256 481.1913186 488.2205936 493.4637197 497.8293249 515.7206229 519.5924193 520.5904725 523.3990091 532.5394832 548.5490016 555.9017307 561.3947477 564.0854984 573.9086174 576.4022273 581.8387857 587.0567310 592.3562774 599.2042351 600.1812925 602.7228489 607.1211488 611.1404757 613.8326502 618.1694343 619.0847324 623.9142654 625.9772992 630.7682791 632.4294651 636.8726339 640.1730518 643.4271933 647.3780951 647.4623262 650.0541705 653.7609369 658.6708814 660.5569297 665.2303670 670.1839592 678.1775188 684.0820038 684.9236289 690.2780417 697.2111560 699.2790172 700.0252322 707.3722771 707.7920474 710.6527575 718.3685293 721.7142467 726.3868365 730.4275547 731.8679568 733.3449525 739.0553785 742.3116562 745.7666408 751.5029368 753.2890490 755.9538839 758.5538935 762.3681028 765.6805271 772.5934555 776.2543198 780.5105394 782.3478381 787.0256344 789.3519315 793.5675006 797.0878883 801.6610745 803.5965952 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5751 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.576 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.322 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.774 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 103518 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 251228182821571726.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 251228182821571726.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 251228182821571726.atom Openam> file on opening on unit 11: 251228182821571726.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 748 First residue number = 12 Last residue number = 199 Number of atoms found = 5751 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.576 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.413 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.774 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.76 Bfactors> 106 vectors, 17253 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.576000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.733 for 748 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.01 Bfactors> = 11.108 +/- 4.43 Bfactors> Shiftng-fct= 11.093 Bfactors> Scaling-fct= 360.903 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 251228182821571726.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 251228182821571726.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.6 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Chkmod> That is: 5751 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9477 0.0034 0.8834 0.0034 0.7417 0.0034 0.9211 0.0034 0.7994 0.0034 0.7541 136.3185 0.6926 168.6768 0.6759 190.5998 0.7278 235.7857 0.6159 237.4551 0.6381 243.8249 0.5924 271.6838 0.4864 284.9237 0.4633 313.2496 0.6939 321.6440 0.7065 332.1582 0.7645 337.9995 0.7259 380.5185 0.6410 382.5274 0.5509 408.4650 0.3192 413.9134 0.3935 418.8689 0.6183 425.4327 0.1696 432.5787 0.4164 435.1604 0.3637 438.9375 0.3957 449.0293 0.3045 466.1646 0.5418 467.0491 0.4578 481.2241 0.4598 488.1573 0.2315 493.4426 0.2980 497.8437 0.3585 515.6439 0.4710 519.5167 0.3703 520.5371 0.4188 523.3609 0.3567 532.5179 0.3028 548.5510 0.0806 555.9172 0.2779 561.4048 0.4063 564.0240 0.3019 573.8681 0.3183 576.3285 0.2430 581.8261 0.4525 587.0716 0.3943 592.3701 0.3267 599.1979 0.3989 600.1810 0.4045 602.7296 0.3571 607.1152 0.2803 611.0837 0.2173 613.7791 0.3593 618.1817 0.3521 619.0394 0.2798 623.8776 0.4046 625.9531 0.4885 630.7383 0.4279 632.4185 0.2858 636.8774 0.4562 640.1092 0.3317 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 251228182821571726.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 251228182821571726.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 251228182821571726 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=40 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=60 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=80 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 251228182821571726 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=40 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom calculating perturbed structure for DQ=60 251228182821571726.eigenfacs 251228182821571726.atom 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