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* apo-dimer-test *

LOGs for ID: 2601021904551024081

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601021904551024081.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601021904551024081.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601021904551024081.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    612
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    612
            Number of atoms found    =   9362
            Mean number per residue  =     15.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    23.340187 +/-    15.457120 From:   -12.898000 To:    56.359000
 =    -1.724135 +/-    14.794443 From:   -40.324000 To:    37.113000
 =    13.208692 +/-    13.760606 From:   -20.149000 To:    51.713000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........

%Pdbmat-W>     14 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.7811 % Filled.
 Pdbmat>      7025281  non-zero elements.
 Pdbmat>       774476 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    165.45 +/-     47.97
         Maximum number =    254
         Minimum number =     27

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.548952E+07
 Pdbmat> Larger element =  908.103    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
612 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601021904551024081.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601021904551024081.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601021904551024081.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  9362 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   612 residues.
 Blocpdb>    64 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    69 atoms in block      2
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    54 atoms in block      3
 Block first atom:    134
 Blocpdb>    49 atoms in block      4
 Block first atom:    188
 Blocpdb>    66 atoms in block      5
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    46 atoms in block      6
 Block first atom:    303
 Blocpdb>    61 atoms in block      7
 Block first atom:    349
 Blocpdb>    69 atoms in block      8
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    56 atoms in block      9
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    70 atoms in block     10
 Block first atom:    535
 Blocpdb>    62 atoms in block     11
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    52 atoms in block     12
 Block first atom:    667
 Blocpdb>    64 atoms in block     13
 Block first atom:    719
 Blocpdb>    62 atoms in block     14
 Block first atom:    783
 Blocpdb>    81 atoms in block     15
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    64 atoms in block     16
 Block first atom:    926
 Blocpdb>    69 atoms in block     17
 Block first atom:    990
 Blocpdb>    48 atoms in block     18
 Block first atom:   1059
 Blocpdb>    76 atoms in block     19
 Block first atom:   1107
 Blocpdb>    59 atoms in block     20
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    59 atoms in block     21
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>    68 atoms in block     22
 Block first atom:   1301
 Blocpdb>    69 atoms in block     23
 Block first atom:   1369
 Blocpdb>    52 atoms in block     24
 Block first atom:   1438
 Blocpdb>    72 atoms in block     25
 Block first atom:   1490
 Blocpdb>    79 atoms in block     26
 Block first atom:   1562
 Blocpdb>    74 atoms in block     27
 Block first atom:   1641
 Blocpdb>    58 atoms in block     28
 Block first atom:   1715
 Blocpdb>    56 atoms in block     29
 Block first atom:   1773
 Blocpdb>    53 atoms in block     30
 Block first atom:   1829
 Blocpdb>    43 atoms in block     31
 Block first atom:   1882
 Blocpdb>    65 atoms in block     32
 Block first atom:   1925
 Blocpdb>    65 atoms in block     33
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    67 atoms in block     34
 Block first atom:   2055
 Blocpdb>    60 atoms in block     35
 Block first atom:   2122
 Blocpdb>    51 atoms in block     36
 Block first atom:   2182
 Blocpdb>    45 atoms in block     37
 Block first atom:   2233
 Blocpdb>    60 atoms in block     38
 Block first atom:   2278
 Blocpdb>    56 atoms in block     39
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    58 atoms in block     40
 Block first atom:   2394
 Blocpdb>    72 atoms in block     41
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    65 atoms in block     42
 Block first atom:   2524
 Blocpdb>    54 atoms in block     43
 Block first atom:   2589
 Blocpdb>    43 atoms in block     44
 Block first atom:   2643
 Blocpdb>    55 atoms in block     45
 Block first atom:   2686
 Blocpdb>    62 atoms in block     46
 Block first atom:   2741
 Blocpdb>    72 atoms in block     47
 Block first atom:   2803
 Blocpdb>    58 atoms in block     48
 Block first atom:   2875
 Blocpdb>    41 atoms in block     49
 Block first atom:   2933
 Blocpdb>    59 atoms in block     50
 Block first atom:   2974
 Blocpdb>    60 atoms in block     51
 Block first atom:   3033
 Blocpdb>    72 atoms in block     52
 Block first atom:   3093
 Blocpdb>    57 atoms in block     53
 Block first atom:   3165
 Blocpdb>    52 atoms in block     54
 Block first atom:   3222
 Blocpdb>    87 atoms in block     55
 Block first atom:   3274
 Blocpdb>    72 atoms in block     56
 Block first atom:   3361
 Blocpdb>    61 atoms in block     57
 Block first atom:   3433
 Blocpdb>    65 atoms in block     58
 Block first atom:   3494
 Blocpdb>    65 atoms in block     59
 Block first atom:   3559
 Blocpdb>    71 atoms in block     60
 Block first atom:   3624
 Blocpdb>    64 atoms in block     61
 Block first atom:   3695
 Blocpdb>    57 atoms in block     62
 Block first atom:   3759
 Blocpdb>    59 atoms in block     63
 Block first atom:   3816
 Blocpdb>    57 atoms in block     64
 Block first atom:   3875
 Blocpdb>    50 atoms in block     65
 Block first atom:   3932
 Blocpdb>    64 atoms in block     66
 Block first atom:   3982
 Blocpdb>    51 atoms in block     67
 Block first atom:   4046
 Blocpdb>    75 atoms in block     68
 Block first atom:   4097
 Blocpdb>    55 atoms in block     69
 Block first atom:   4172
 Blocpdb>    59 atoms in block     70
 Block first atom:   4227
 Blocpdb>    56 atoms in block     71
 Block first atom:   4286
 Blocpdb>    63 atoms in block     72
 Block first atom:   4342
 Blocpdb>    61 atoms in block     73
 Block first atom:   4405
 Blocpdb>    62 atoms in block     74
 Block first atom:   4466
 Blocpdb>    68 atoms in block     75
 Block first atom:   4528
 Blocpdb>    48 atoms in block     76
 Block first atom:   4596
 Blocpdb>    58 atoms in block     77
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>    83 atoms in block     78
 Block first atom:   4702
 Blocpdb>    55 atoms in block     79
 Block first atom:   4785
 Blocpdb>    60 atoms in block     80
 Block first atom:   4840
 Blocpdb>    51 atoms in block     81
 Block first atom:   4900
 Blocpdb>    58 atoms in block     82
 Block first atom:   4951
 Blocpdb>    49 atoms in block     83
 Block first atom:   5009
 Blocpdb>    59 atoms in block     84
 Block first atom:   5058
 Blocpdb>    67 atoms in block     85
 Block first atom:   5117
 Blocpdb>    64 atoms in block     86
 Block first atom:   5184
 Blocpdb>    70 atoms in block     87
 Block first atom:   5248
 Blocpdb>    55 atoms in block     88
 Block first atom:   5318
 Blocpdb>    63 atoms in block     89
 Block first atom:   5373
 Blocpdb>    63 atoms in block     90
 Block first atom:   5436
 Blocpdb>    65 atoms in block     91
 Block first atom:   5499
 Blocpdb>    76 atoms in block     92
 Block first atom:   5564
 Blocpdb>    65 atoms in block     93
 Block first atom:   5640
 Blocpdb>    62 atoms in block     94
 Block first atom:   5705
 Blocpdb>    54 atoms in block     95
 Block first atom:   5767
 Blocpdb>    78 atoms in block     96
 Block first atom:   5821
 Blocpdb>    52 atoms in block     97
 Block first atom:   5899
 Blocpdb>    58 atoms in block     98
 Block first atom:   5951
 Blocpdb>    82 atoms in block     99
 Block first atom:   6009
 Blocpdb>    52 atoms in block    100
 Block first atom:   6091
 Blocpdb>    64 atoms in block    101
 Block first atom:   6143
 Blocpdb>    79 atoms in block    102
 Block first atom:   6207
 Blocpdb>    79 atoms in block    103
 Block first atom:   6286
 Blocpdb>    55 atoms in block    104
 Block first atom:   6365
 Blocpdb>    61 atoms in block    105
 Block first atom:   6420
 Blocpdb>    61 atoms in block    106
 Block first atom:   6481
 Blocpdb>    46 atoms in block    107
 Block first atom:   6542
 Blocpdb>    55 atoms in block    108
 Block first atom:   6588
 Blocpdb>    55 atoms in block    109
 Block first atom:   6643
 Blocpdb>    72 atoms in block    110
 Block first atom:   6698
 Blocpdb>    62 atoms in block    111
 Block first atom:   6770
 Blocpdb>    64 atoms in block    112
 Block first atom:   6832
 Blocpdb>    36 atoms in block    113
 Block first atom:   6896
 Blocpdb>    54 atoms in block    114
 Block first atom:   6932
 Blocpdb>    66 atoms in block    115
 Block first atom:   6986
 Blocpdb>    50 atoms in block    116
 Block first atom:   7052
 Blocpdb>    69 atoms in block    117
 Block first atom:   7102
 Blocpdb>    66 atoms in block    118
 Block first atom:   7171
 Blocpdb>    54 atoms in block    119
 Block first atom:   7237
 Blocpdb>    50 atoms in block    120
 Block first atom:   7291
 Blocpdb>    60 atoms in block    121
 Block first atom:   7341
 Blocpdb>    62 atoms in block    122
 Block first atom:   7401
 Blocpdb>    57 atoms in block    123
 Block first atom:   7463
 Blocpdb>    67 atoms in block    124
 Block first atom:   7520
 Blocpdb>    47 atoms in block    125
 Block first atom:   7587
 Blocpdb>    47 atoms in block    126
 Block first atom:   7634
 Blocpdb>    63 atoms in block    127
 Block first atom:   7681
 Blocpdb>    59 atoms in block    128
 Block first atom:   7744
 Blocpdb>    74 atoms in block    129
 Block first atom:   7803
 Blocpdb>    59 atoms in block    130
 Block first atom:   7877
 Blocpdb>    67 atoms in block    131
 Block first atom:   7936
 Blocpdb>    77 atoms in block    132
 Block first atom:   8003
 Blocpdb>    62 atoms in block    133
 Block first atom:   8080
 Blocpdb>    65 atoms in block    134
 Block first atom:   8142
 Blocpdb>    59 atoms in block    135
 Block first atom:   8207
 Blocpdb>    74 atoms in block    136
 Block first atom:   8266
 Blocpdb>    69 atoms in block    137
 Block first atom:   8340
 Blocpdb>    60 atoms in block    138
 Block first atom:   8409
 Blocpdb>    66 atoms in block    139
 Block first atom:   8469
 Blocpdb>    51 atoms in block    140
 Block first atom:   8535
 Blocpdb>    48 atoms in block    141
 Block first atom:   8586
 Blocpdb>    64 atoms in block    142
 Block first atom:   8634
 Blocpdb>    50 atoms in block    143
 Block first atom:   8698
 Blocpdb>    67 atoms in block    144
 Block first atom:   8748
 Blocpdb>    69 atoms in block    145
 Block first atom:   8815
 Blocpdb>    45 atoms in block    146
 Block first atom:   8884
 Blocpdb>    76 atoms in block    147
 Block first atom:   8929
 Blocpdb>    47 atoms in block    148
 Block first atom:   9005
 Blocpdb>    61 atoms in block    149
 Block first atom:   9052
 Blocpdb>    68 atoms in block    150
 Block first atom:   9113
 Blocpdb>    68 atoms in block    151
 Block first atom:   9181
 Blocpdb>    46 atoms in block    152
 Block first atom:   9249
 Blocpdb>    68 atoms in block    153
 Block first atom:   9294

 Blocpdb>   153 blocks.

 Blocpdb> At most,     87 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    36 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      7025434 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      28086

 Prepmat> Matrix trace    =   15489520.0000
 Prepmat> Last element read:   28086  28086       355.4374
 Prepmat>        11782 lines saved.
 Prepmat>        10050 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  9362
 RTB> Total mass =        9362.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  9362
 RTB> Number of blocks =   153
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  387064.0915
 RTB>     60021 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      918
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    60021
 Diagstd> Projected matrix trace =  387064.0915

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    918 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 387064.0915
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      3.2597588      4.3647559      4.8129241      5.1608818
      5.5958855      6.7439468      7.1398653      8.8089058     10.2900380
     15.0074987     16.3437246     19.5027281     20.1272652     21.5604748
     22.6125841     23.1036012     24.0026625     29.9563225     31.1084508
     31.7669987     35.9556114     38.5023310     40.4272018     43.8509559
     44.8769152     49.4650412     50.6150384     51.9691502     53.1120971
     53.2859231     53.9844324     55.0531962     55.7509978     58.1004046
     60.6668220     61.5220695     64.2019984     64.4387229     65.7994009
     67.5195375     68.2392736     71.3313867     71.9103691     72.4015329
     74.7164989     76.4796198     77.4139055     78.2626146     79.5990100
     80.2069831     81.9243545     82.8633206     84.7263607     86.0321313
     87.0978210     88.9200873     89.8991933     91.5246446     92.6379296
     94.1509259     95.3039987     96.6927766     97.7123909     99.1606893
     99.7964963    100.6370745    102.5370492    103.4813216    103.8213349
    105.7698876    107.1488826    108.1999154    109.1353337    110.0625240
    110.9246834    111.7411674    113.1943860    114.3821824    114.9198495
    116.2065461    117.2017269    118.8879029    120.1152312    120.9472999
    121.4468552    122.9531654    123.8727156    125.3781888    126.0092597
    127.0861262    127.7162466    128.3181599    129.8408801    131.2830095
    132.1072903    132.7725229    134.6142510    135.4866398    136.3676471
    137.5324458

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034304      0.0034317      0.0034333      0.0034340      0.0034350
      0.0034351    196.0595553    226.8690541    238.2318294    246.6932340
    256.8796426    282.0021027    290.1618362    322.2969994    348.3403389
    420.6776482    439.0063462    479.5600130    487.1779965    504.2250762
    516.3811472    521.9574729    532.0163625    594.3462528    605.6677821
    612.0450260    651.1463633    673.8120788    690.4498212    719.0925886
    727.4560808    763.7381201    772.5650652    782.8311307    791.3926367
    792.6866190    797.8652492    805.7244621    810.8146787    827.7226868
    845.8062751    851.7472659    870.1007710    871.7034054    880.8587040
    892.2981851    897.0413813    917.1399546    920.8545516    923.9940207
    938.6496809    949.6599886    955.4429697    960.6660802    968.8334243
    972.5263358    982.8829338    988.4994838    999.5500756   1007.2229694
   1013.4420622   1023.9888331   1029.6110092   1038.8774174   1045.1766541
   1053.6771886   1060.1097817   1067.8058506   1073.4210317   1081.3469228
   1084.8081203   1089.3671678   1099.6024223   1104.6539849   1106.4673024
   1116.8023054   1124.0589902   1129.5585334   1134.4306993   1139.2394471
   1143.6927790   1147.8942551   1155.3344521   1161.3803387   1164.1067422
   1170.6055450   1175.6073311   1184.0338366   1190.1297763   1194.2448274
   1196.7086136   1204.1071558   1208.6014462   1215.9235675   1218.9798038
   1224.1773822   1227.2084971   1230.0969505   1237.3740550   1244.2267732
   1248.1266967   1251.2652513   1259.9137043   1263.9896455   1268.0925580
   1273.4968158

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   9362
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    153

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9793E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.260    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.365    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.813    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.161    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.596    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.744    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.140    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.809    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   113.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   116.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   118.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   120.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   120.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   123.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   123.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   125.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   127.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   127.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   129.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   132.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   132.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   134.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   136.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.5    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    918 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99996 1.00003 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002
 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>   168516 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99996 1.00003 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002
 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601021904551024081.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601021904551024081.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601021904551024081.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601021904551024081.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    612
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    612
            Number of atoms found    =   9362
            Mean number per residue  =     15.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9793E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.260    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.365    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.813    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.161    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.596    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.744    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.140    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.809    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   113.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   116.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   120.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   120.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   125.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   127.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   127.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   129.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   132.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   132.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   134.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   136.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.5    

 Bfactors>  106 vectors,  28086 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     3.260000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !

 Bfactors> =      0.005 +/-   0.00
 Bfactors> =      0.000 +/-   0.00
 Bfactors> Shiftng-fct=     -0.005
 Bfactors> Scaling-fct=      0.000

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601021904551024081.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601021904551024081.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4303E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4315E-03

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1117.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1130.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1134.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1139.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1161.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1164.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1171.    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1244.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1251.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1260.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1264.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1268.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1273.    

 Chkmod>  106 vectors,  28086 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   9362 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8808
      0.0034      0.8171
      0.0034      0.8510
      0.0034      0.9314
      0.0034      0.7680
      0.0034      0.7650
    196.0584      0.6171
    226.8657      0.3439
    238.2235      0.5430
    246.6855      0.5896
    256.8712      0.6619
    281.9911      0.4288
    290.1521      0.5629
    322.2849      0.6371
    348.3247      0.4848
    420.6946      0.6064
    438.9375      0.7000
    479.5059      0.6883
    487.1902      0.5672
    504.1979      0.4729
    516.3295      0.6407
    521.8944      0.6775
    531.9640      0.6518
    594.3572      0.5229
    605.6569      0.4572
    612.0477      0.5176
    651.1581      0.4665
    673.7628      0.3851
    690.4441      0.0530
    719.0539      0.0669
    727.4499      0.1673
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    782.8039      0.4948
    791.3430      0.3660
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   1081.2967      0.4883
   1084.7806      0.4522
   1089.1197      0.3861
   1099.3566      0.3790
   1104.7063      0.5123
   1106.3061      0.4252
   1116.9133      0.4820
   1123.7543      0.4359
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   1147.6335      0.4146
   1155.3135      0.3293
   1161.4209      0.4716
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   1268.1885      0.5017
   1273.2919      0.4628
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601021904551024081 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601021904551024081.eigenfacs
2601021904551024081.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601021904551024081.eigenfacs
2601021904551024081.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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2601021904551024081.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m51.121s
user	0m50.573s
sys	0m0.521s
rm: cannot remove '2601021904551024081.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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