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***  FN-Int  ***

LOGs for ID: 2601091652381667111

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601091652381667111.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601091652381667111.atom to be opened. Openam> File opened: 2601091652381667111.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1224 First residue number = 1 Last residue number = 1509 Number of atoms found = 9390 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 195.415045 +/- 27.207262 From: 138.584000 To: 268.837000 = 192.303291 +/- 21.152450 From: 138.340000 To: 249.539000 = 199.932173 +/- 26.577795 From: 156.542000 To: 273.266000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8720 % Filled. Pdbmat> 3459811 non-zero elements. Pdbmat> 378224 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.56 +/- 21.51 Maximum number = 134 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 7.564480E+06 Pdbmat> Larger element = 499.576 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1224 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601091652381667111.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601091652381667111.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601091652381667111.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9390 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1224 residues. Blocpdb> 54 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 44 atoms in block 2 Block first atom: 55 Blocpdb> 54 atoms in block 3 Block first atom: 99 Blocpdb> 63 atoms in block 4 Block first atom: 153 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 216 Blocpdb> 45 atoms in block 6 Block first atom: 259 Blocpdb> 48 atoms in block 7 Block first atom: 304 Blocpdb> 49 atoms in block 8 Block first atom: 352 Blocpdb> 50 atoms in block 9 Block first atom: 401 Blocpdb> 51 atoms in block 10 Block first atom: 451 Blocpdb> 53 atoms in block 11 Block first atom: 502 Blocpdb> 56 atoms in block 12 Block first atom: 555 Blocpdb> 49 atoms in block 13 Block first atom: 611 Blocpdb> 58 atoms in block 14 Block first atom: 660 Blocpdb> 57 atoms in block 15 Block first atom: 718 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 775 Blocpdb> 51 atoms in block 17 Block first atom: 825 Blocpdb> 65 atoms in block 18 Block first atom: 876 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 941 Blocpdb> 54 atoms in block 20 Block first atom: 988 Blocpdb> 62 atoms in block 21 Block first atom: 1042 Blocpdb> 55 atoms in block 22 Block first atom: 1104 Blocpdb> 54 atoms in block 23 Block first atom: 1159 Blocpdb> 50 atoms in block 24 Block first atom: 1213 Blocpdb> 54 atoms in block 25 Block first atom: 1263 Blocpdb> 45 atoms in block 26 Block first atom: 1317 Blocpdb> 63 atoms in block 27 Block first atom: 1362 Blocpdb> 47 atoms in block 28 Block first atom: 1425 Blocpdb> 55 atoms in block 29 Block first atom: 1472 Blocpdb> 68 atoms in block 30 Block first atom: 1527 Blocpdb> 53 atoms in block 31 Block first atom: 1595 Blocpdb> 53 atoms in block 32 Block first atom: 1648 Blocpdb> 62 atoms in block 33 Block first atom: 1701 Blocpdb> 45 atoms in block 34 Block first atom: 1763 Blocpdb> 53 atoms in block 35 Block first atom: 1808 Blocpdb> 51 atoms in block 36 Block first atom: 1861 Blocpdb> 55 atoms in block 37 Block first atom: 1912 Blocpdb> 54 atoms in block 38 Block first atom: 1967 Blocpdb> 51 atoms in block 39 Block first atom: 2021 Blocpdb> 59 atoms in block 40 Block first atom: 2072 Blocpdb> 58 atoms in block 41 Block first atom: 2131 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 2189 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 2233 Blocpdb> 47 atoms in block 44 Block first atom: 2281 Blocpdb> 57 atoms in block 45 Block first atom: 2328 Blocpdb> 51 atoms in block 46 Block first atom: 2385 Blocpdb> 66 atoms in block 47 Block first atom: 2436 Blocpdb> 50 atoms in block 48 Block first atom: 2502 Blocpdb> 51 atoms in block 49 Block first atom: 2552 Blocpdb> 57 atoms in block 50 Block first atom: 2603 Blocpdb> 49 atoms in block 51 Block first atom: 2660 Blocpdb> 53 atoms in block 52 Block first atom: 2709 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2762 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2814 Blocpdb> 54 atoms in block 55 Block first atom: 2858 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2912 Blocpdb> 44 atoms in block 57 Block first atom: 2956 Blocpdb> 62 atoms in block 58 Block first atom: 3000 Blocpdb> 48 atoms in block 59 Block first atom: 3062 Blocpdb> 56 atoms in block 60 Block first atom: 3110 Blocpdb> 47 atoms in block 61 Block first atom: 3166 Blocpdb> 55 atoms in block 62 Block first atom: 3213 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 3268 Blocpdb> 55 atoms in block 64 Block first atom: 3315 Blocpdb> 50 atoms in block 65 Block first atom: 3370 Blocpdb> 52 atoms in block 66 Block first atom: 3420 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 3472 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3529 Blocpdb> 49 atoms in block 69 Block first atom: 3579 Blocpdb> 52 atoms in block 70 Block first atom: 3628 Blocpdb> 49 atoms in block 71 Block first atom: 3680 Blocpdb> 52 atoms in block 72 Block first atom: 3729 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 3781 Blocpdb> 55 atoms in block 74 Block first atom: 3846 Blocpdb> 54 atoms in block 75 Block first atom: 3901 Blocpdb> 52 atoms in block 76 Block first atom: 3955 Blocpdb> 50 atoms in block 77 Block first atom: 4007 Blocpdb> 62 atoms in block 78 Block first atom: 4057 Blocpdb> 65 atoms in block 79 Block first atom: 4119 Blocpdb> 62 atoms in block 80 Block first atom: 4184 Blocpdb> 52 atoms in block 81 Block first atom: 4246 Blocpdb> 57 atoms in block 82 Block first atom: 4298 Blocpdb> 47 atoms in block 83 Block first atom: 4355 Blocpdb> 61 atoms in block 84 Block first atom: 4402 Blocpdb> 58 atoms in block 85 Block first atom: 4463 Blocpdb> 47 atoms in block 86 Block first atom: 4521 Blocpdb> 52 atoms in block 87 Block first atom: 4568 Blocpdb> 48 atoms in block 88 Block first atom: 4620 Blocpdb> 43 atoms in block 89 Block first atom: 4668 Blocpdb> 59 atoms in block 90 Block first atom: 4711 Blocpdb> 52 atoms in block 91 Block first atom: 4770 Blocpdb> 52 atoms in block 92 Block first atom: 4822 Blocpdb> 53 atoms in block 93 Block first atom: 4874 Blocpdb> 53 atoms in block 94 Block first atom: 4927 Blocpdb> 53 atoms in block 95 Block first atom: 4980 Blocpdb> 58 atoms in block 96 Block first atom: 5033 Blocpdb> 52 atoms in block 97 Block first atom: 5091 Blocpdb> 56 atoms in block 98 Block first atom: 5143 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 5199 Blocpdb> 60 atoms in block 100 Block first atom: 5258 Blocpdb> 53 atoms in block 101 Block first atom: 5318 Blocpdb> 66 atoms in block 102 Block first atom: 5371 Blocpdb> 57 atoms in block 103 Block first atom: 5437 Blocpdb> 64 atoms in block 104 Block first atom: 5494 Blocpdb> 57 atoms in block 105 Block first atom: 5558 Blocpdb> 55 atoms in block 106 Block first atom: 5615 Blocpdb> 52 atoms in block 107 Block first atom: 5670 Blocpdb> 59 atoms in block 108 Block first atom: 5722 Blocpdb> 55 atoms in block 109 Block first atom: 5781 Blocpdb> 58 atoms in block 110 Block first atom: 5836 Blocpdb> 54 atoms in block 111 Block first atom: 5894 Blocpdb> 54 atoms in block 112 Block first atom: 5948 Blocpdb> 52 atoms in block 113 Block first atom: 6002 Blocpdb> 60 atoms in block 114 Block first atom: 6054 Blocpdb> 53 atoms in block 115 Block first atom: 6114 Blocpdb> 56 atoms in block 116 Block first atom: 6167 Blocpdb> 54 atoms in block 117 Block first atom: 6223 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 6277 Blocpdb> 48 atoms in block 119 Block first atom: 6327 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 6375 Blocpdb> 60 atoms in block 121 Block first atom: 6419 Blocpdb> 58 atoms in block 122 Block first atom: 6479 Blocpdb> 56 atoms in block 123 Block first atom: 6537 Blocpdb> 42 atoms in block 124 Block first atom: 6593 Blocpdb> 50 atoms in block 125 Block first atom: 6635 Blocpdb> 54 atoms in block 126 Block first atom: 6685 Blocpdb> 59 atoms in block 127 Block first atom: 6739 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 6798 Blocpdb> 56 atoms in block 129 Block first atom: 6863 Blocpdb> 55 atoms in block 130 Block first atom: 6919 Blocpdb> 56 atoms in block 131 Block first atom: 6974 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 7030 Blocpdb> 57 atoms in block 133 Block first atom: 7094 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 7151 Blocpdb> 48 atoms in block 135 Block first atom: 7194 Blocpdb> 58 atoms in block 136 Block first atom: 7242 Blocpdb> 50 atoms in block 137 Block first atom: 7300 Blocpdb> 54 atoms in block 138 Block first atom: 7350 Blocpdb> 47 atoms in block 139 Block first atom: 7404 Blocpdb> 62 atoms in block 140 Block first atom: 7451 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 7513 Blocpdb> 52 atoms in block 142 Block first atom: 7556 Blocpdb> 50 atoms in block 143 Block first atom: 7608 Blocpdb> 58 atoms in block 144 Block first atom: 7658 Blocpdb> 54 atoms in block 145 Block first atom: 7716 Blocpdb> 56 atoms in block 146 Block first atom: 7770 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 7826 Blocpdb> 57 atoms in block 148 Block first atom: 7883 Blocpdb> 49 atoms in block 149 Block first atom: 7940 Blocpdb> 48 atoms in block 150 Block first atom: 7989 Blocpdb> 53 atoms in block 151 Block first atom: 8037 Blocpdb> 63 atoms in block 152 Block first atom: 8090 Blocpdb> 51 atoms in block 153 Block first atom: 8153 Blocpdb> 63 atoms in block 154 Block first atom: 8204 Blocpdb> 57 atoms in block 155 Block first atom: 8267 Blocpdb> 64 atoms in block 156 Block first atom: 8324 Blocpdb> 56 atoms in block 157 Block first atom: 8388 Blocpdb> 52 atoms in block 158 Block first atom: 8444 Blocpdb> 52 atoms in block 159 Block first atom: 8496 Blocpdb> 51 atoms in block 160 Block first atom: 8548 Blocpdb> 55 atoms in block 161 Block first atom: 8599 Blocpdb> 48 atoms in block 162 Block first atom: 8654 Blocpdb> 58 atoms in block 163 Block first atom: 8702 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 8760 Blocpdb> 58 atoms in block 165 Block first atom: 8805 Blocpdb> 49 atoms in block 166 Block first atom: 8863 Blocpdb> 66 atoms in block 167 Block first atom: 8912 Blocpdb> 45 atoms in block 168 Block first atom: 8978 Blocpdb> 57 atoms in block 169 Block first atom: 9023 Blocpdb> 44 atoms in block 170 Block first atom: 9080 Blocpdb> 46 atoms in block 171 Block first atom: 9124 Blocpdb> 56 atoms in block 172 Block first atom: 9170 Blocpdb> 50 atoms in block 173 Block first atom: 9226 Blocpdb> 47 atoms in block 174 Block first atom: 9276 Blocpdb> 60 atoms in block 175 Block first atom: 9323 Blocpdb> 8 atoms in block 176 Block first atom: 9382 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3459987 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 28170 Prepmat> Matrix trace = 7564480.0000 Prepmat> Last element read: 28170 28170 251.7833 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 14094 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9390 RTB> Total mass = 9390.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9390 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 189979.0518 RTB> 50712 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50712 Diagstd> Projected matrix trace = 189979.0518 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 189979.0518 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0479380 0.0648533 0.1598449 0.2017954 0.3674484 0.5294498 0.7043457 0.8925384 0.9995018 1.0579095 1.4171032 1.4711401 1.7327519 2.0158554 2.1912184 2.5123473 3.1260173 3.4146869 3.7338951 4.0033504 4.5221797 4.5970414 4.8933114 5.5229001 5.8429376 6.4751128 6.7884411 7.6534078 7.7824548 8.3512689 8.4731541 8.8567895 9.5084854 9.9889499 10.2807626 10.5671102 11.0921299 11.8695804 12.4017877 12.8211665 13.2540365 13.9157094 14.4523864 14.8833132 15.0344217 15.7343452 15.9070593 16.3373349 16.9933017 17.3771711 17.6458831 17.8546814 18.0081614 18.9212222 19.2543427 19.4114103 20.0666976 20.3881381 20.6370489 20.8651565 21.7347732 22.3248833 22.6283505 23.4654858 24.0453247 24.0596770 25.0264810 25.3590132 25.7148968 26.3431969 27.1753232 28.1180996 28.7151928 29.0772334 29.2422137 29.4037020 29.9384287 30.6444365 30.7455677 31.2464346 31.2976204 31.8763800 32.0581580 32.3790085 33.0061236 33.2094487 33.6153216 33.7914513 34.3519637 34.9353142 34.9764908 35.7680976 36.1350144 36.7780998 36.8583051 37.3066495 37.3824433 37.5613650 38.2968426 38.6942516 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034311 0.0034314 0.0034330 0.0034338 0.0034339 0.0034349 23.7758001 27.6542144 43.4154876 48.7810228 65.8253903 79.0146597 91.1356308 102.5908763 108.5643089 111.6913505 129.2694841 131.7110749 142.9431908 154.1789082 160.7452361 172.1214979 191.9954657 200.6645806 209.8342316 217.2736610 230.9240623 232.8276146 240.2131118 255.1989446 262.4888767 276.3242184 282.9308523 300.4157559 302.9378804 313.8134220 316.0951507 323.1717887 334.8505003 343.2062571 348.1833072 352.9989377 361.6618956 374.1217558 382.4172076 388.8293599 395.3387293 405.0866731 412.8241189 418.9335009 421.0548201 430.7443771 433.1020405 438.9205208 447.6454388 452.6732376 456.1597683 458.8506310 460.8185657 472.3564755 476.4964057 478.4359716 486.4444276 490.3250297 493.3090427 496.0278981 506.2590927 513.0856629 516.5611363 526.0294452 532.4889539 532.6478482 543.2442946 546.8414862 550.6652531 557.3519426 566.0862933 575.8220118 581.9037397 585.5605655 587.2194115 588.8386203 594.1687160 601.1337342 602.1248321 607.0095372 607.5065147 613.0978285 614.8434666 617.9126029 623.8677572 625.7863893 629.5988351 631.2460924 636.4599261 641.8412232 642.2193656 649.4462314 652.7688117 658.5517736 659.2694640 663.2670207 663.9404404 665.5274355 672.0115932 675.4893497 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9390 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9832E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9853E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7938E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4853E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5294 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.417 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.471 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.733 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.597 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.893 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.523 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99995 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99996 1.00005 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 169020 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99995 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99996 1.00005 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601091652381667111.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601091652381667111.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601091652381667111.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601091652381667111.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1224 First residue number = 1 Last residue number = 1509 Number of atoms found = 9390 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9832E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7938E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4853E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3674 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5294 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.417 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.471 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.733 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.597 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.893 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Bfactors> 106 vectors, 28170 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.047938 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.845 for 1224 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.108 +/- 0.15 Bfactors> = 144.256 +/- 87.19 Bfactors> Shiftng-fct= 144.148 Bfactors> Scaling-fct= 573.809 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601091652381667111.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601091652381667111.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 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Chkmod> That is: 9390 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601091652381667111.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2601091652381667111 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom making animated gifs 11 models are in 2601091652381667111.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601091652381667111.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601091652381667111.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2601091652381667111 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601091652381667111.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2601091652381667111 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601091652381667111.eigenfacs 2601091652381667111.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601091652381667111.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601091652381667111.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2601091652381667111.10.pdb 2601091652381667111.11.pdb 2601091652381667111.7.pdb 2601091652381667111.8.pdb 2601091652381667111.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m50.528s user 0m50.124s sys 0m0.370s rm: cannot remove '2601091652381667111.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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