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* 01-AUG-25 *

LOGs for ID: 2601110538131843093

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601110538131843093.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601110538131843093.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601110538131843093.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    264
            First residue number     =    717
            Last  residue number     =    980
            Number of atoms found    =   2077
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -15.962496 +/-    23.412903 From:   -48.771000 To:    37.332000
 =    20.582098 +/-    16.180715 From:   -14.644000 To:    53.521000
 =    14.868317 +/-    25.275351 From:   -38.690000 To:    51.744000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.0523 % Filled.
 Pdbmat>       592637  non-zero elements.
 Pdbmat>        64475 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     62.08 +/-     19.42
         Maximum number =    109
         Minimum number =      8

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.289500E+06
 Pdbmat> Larger element =  446.684    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
264 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601110538131843093.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601110538131843093.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601110538131843093.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2077 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   264 residues.
 Blocpdb>    16 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    16 atoms in block      3
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    12 atoms in block      4
 Block first atom:     48
 Blocpdb>    13 atoms in block      5
 Block first atom:     60
 Blocpdb>    17 atoms in block      6
 Block first atom:     73
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     90
 Blocpdb>    15 atoms in block      8
 Block first atom:    103
 Blocpdb>    17 atoms in block      9
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    135
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    164
 Blocpdb>    12 atoms in block     13
 Block first atom:    179
 Blocpdb>    20 atoms in block     14
 Block first atom:    191
 Blocpdb>    18 atoms in block     15
 Block first atom:    211
 Blocpdb>    17 atoms in block     16
 Block first atom:    229
 Blocpdb>    12 atoms in block     17
 Block first atom:    246
 Blocpdb>    13 atoms in block     18
 Block first atom:    258
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    271
 Blocpdb>    13 atoms in block     20
 Block first atom:    285
 Blocpdb>    20 atoms in block     21
 Block first atom:    298
 Blocpdb>    17 atoms in block     22
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    17 atoms in block     23
 Block first atom:    335
 Blocpdb>    12 atoms in block     24
 Block first atom:    352
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    364
 Blocpdb>    13 atoms in block     26
 Block first atom:    378
 Blocpdb>    17 atoms in block     27
 Block first atom:    391
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    408
 Blocpdb>    20 atoms in block     29
 Block first atom:    423
 Blocpdb>    18 atoms in block     30
 Block first atom:    443
 Blocpdb>    21 atoms in block     31
 Block first atom:    461
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    482
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    15 atoms in block     34
 Block first atom:    511
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    526
 Blocpdb>    14 atoms in block     36
 Block first atom:    543
 Blocpdb>    17 atoms in block     37
 Block first atom:    557
 Blocpdb>    17 atoms in block     38
 Block first atom:    574
 Blocpdb>    16 atoms in block     39
 Block first atom:    591
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    16 atoms in block     41
 Block first atom:    623
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    654
 Blocpdb>    19 atoms in block     44
 Block first atom:    669
 Blocpdb>    24 atoms in block     45
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    17 atoms in block     46
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    729
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    746
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    759
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    20 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    809
 Blocpdb>    16 atoms in block     53
 Block first atom:    824
 Blocpdb>    14 atoms in block     54
 Block first atom:    840
 Blocpdb>    18 atoms in block     55
 Block first atom:    854
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    872
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    889
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    904
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    918
 Blocpdb>    20 atoms in block     60
 Block first atom:    933
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    13 atoms in block     62
 Block first atom:    969
 Blocpdb>    15 atoms in block     63
 Block first atom:    982
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:    997
 Blocpdb>    17 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    17 atoms in block     66
 Block first atom:   1031
 Blocpdb>    17 atoms in block     67
 Block first atom:   1048
 Blocpdb>    13 atoms in block     68
 Block first atom:   1065
 Blocpdb>    14 atoms in block     69
 Block first atom:   1078
 Blocpdb>    21 atoms in block     70
 Block first atom:   1092
 Blocpdb>    14 atoms in block     71
 Block first atom:   1113
 Blocpdb>    14 atoms in block     72
 Block first atom:   1127
 Blocpdb>    16 atoms in block     73
 Block first atom:   1141
 Blocpdb>    13 atoms in block     74
 Block first atom:   1157
 Blocpdb>    14 atoms in block     75
 Block first atom:   1170
 Blocpdb>    16 atoms in block     76
 Block first atom:   1184
 Blocpdb>    14 atoms in block     77
 Block first atom:   1200
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1214
 Blocpdb>    20 atoms in block     79
 Block first atom:   1229
 Blocpdb>    20 atoms in block     80
 Block first atom:   1249
 Blocpdb>    21 atoms in block     81
 Block first atom:   1269
 Blocpdb>    17 atoms in block     82
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    15 atoms in block     83
 Block first atom:   1307
 Blocpdb>    13 atoms in block     84
 Block first atom:   1322
 Blocpdb>    17 atoms in block     85
 Block first atom:   1335
 Blocpdb>    13 atoms in block     86
 Block first atom:   1352
 Blocpdb>    17 atoms in block     87
 Block first atom:   1365
 Blocpdb>    12 atoms in block     88
 Block first atom:   1382
 Blocpdb>    12 atoms in block     89
 Block first atom:   1394
 Blocpdb>    15 atoms in block     90
 Block first atom:   1406
 Blocpdb>    15 atoms in block     91
 Block first atom:   1421
 Blocpdb>    17 atoms in block     92
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    15 atoms in block     93
 Block first atom:   1453
 Blocpdb>    17 atoms in block     94
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1485
 Blocpdb>    15 atoms in block     96
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1517
 Blocpdb>    14 atoms in block     98
 Block first atom:   1532
 Blocpdb>    14 atoms in block     99
 Block first atom:   1546
 Blocpdb>    15 atoms in block    100
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1575
 Blocpdb>    17 atoms in block    102
 Block first atom:   1590
 Blocpdb>    16 atoms in block    103
 Block first atom:   1607
 Blocpdb>    14 atoms in block    104
 Block first atom:   1623
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1637
 Blocpdb>    19 atoms in block    106
 Block first atom:   1650
 Blocpdb>    20 atoms in block    107
 Block first atom:   1669
 Blocpdb>    21 atoms in block    108
 Block first atom:   1689
 Blocpdb>    17 atoms in block    109
 Block first atom:   1710
 Blocpdb>    11 atoms in block    110
 Block first atom:   1727
 Blocpdb>    14 atoms in block    111
 Block first atom:   1738
 Blocpdb>    17 atoms in block    112
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    15 atoms in block    113
 Block first atom:   1769
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1784
 Blocpdb>    17 atoms in block    115
 Block first atom:   1798
 Blocpdb>    12 atoms in block    116
 Block first atom:   1815
 Blocpdb>    10 atoms in block    117
 Block first atom:   1827
 Blocpdb>    17 atoms in block    118
 Block first atom:   1837
 Blocpdb>    14 atoms in block    119
 Block first atom:   1854
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1868
 Blocpdb>    18 atoms in block    121
 Block first atom:   1883
 Blocpdb>    21 atoms in block    122
 Block first atom:   1901
 Blocpdb>    15 atoms in block    123
 Block first atom:   1922
 Blocpdb>    16 atoms in block    124
 Block first atom:   1937
 Blocpdb>    13 atoms in block    125
 Block first atom:   1953
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1966
 Blocpdb>    17 atoms in block    127
 Block first atom:   1981
 Blocpdb>    21 atoms in block    128
 Block first atom:   1998
 Blocpdb>    17 atoms in block    129
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    16 atoms in block    130
 Block first atom:   2036
 Blocpdb>    12 atoms in block    131
 Block first atom:   2052
 Blocpdb>    14 atoms in block    132
 Block first atom:   2063

 Blocpdb>   132 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    10 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       592769 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6231

 Prepmat> Matrix trace    =    1289500.0000
 Prepmat> Last element read:    6231   6231       151.8515
 Prepmat>         8779 lines saved.
 Prepmat>         7867 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2077
 RTB> Total mass =        2077.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2077
 RTB> Number of blocks =   132
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  129341.5481
 RTB>     30816 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      792
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    30816
 Diagstd> Projected matrix trace =  129341.5481

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    792 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 129341.5481
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0026860      0.0068964      0.0112254      0.0323132
      0.0482504      0.1025690      0.1370752      0.1929284      0.2662075
      0.3281933      0.4684673      0.5459861      0.7417620      0.8730282
      0.9435649      1.0748862      1.3250278      1.6687910      1.7195975
      2.0489477      2.3113643      2.4116496      2.5020566      2.7017223
      2.9771373      3.2146150      3.5501392      3.9808346      4.3253466
      4.4538374      4.6581321      4.7671967      5.0488238      5.4886234
      6.1043395      6.5464185      6.8004107      7.0174965      7.2242645
      7.4825418      8.2643341      8.5254463      8.7312432      9.6740572
      9.8792159     10.4002504     10.6738744     11.0359508     11.4064421
     12.0675960     12.1176620     13.4155796     13.5649767     13.6391120
     14.3562516     14.7657387     14.9670995     14.9956383     15.8349621
     15.9377174     16.3175568     16.7807583     16.8731335     17.3066839
     17.6904193     17.7052967     17.9731071     18.1352225     18.8567153
     19.3939735     19.8420626     20.2584771     20.8983697     21.7043219
     22.6278248     22.8465882     23.2029823     23.5669547     24.1328223
     24.6172311     24.8686739     25.1586800     25.7758242     26.1762778
     26.3543378     26.6060272     26.9146206     27.3184563     27.8700622
     28.5805114     28.6974165     29.1375725     29.5842386     29.6350013
     29.7707258     30.2904669     30.7264891     31.8423128     32.3556535
     33.0654742

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034326      0.0034329      0.0034337      0.0034337      0.0034338
      0.0034340      5.6278958      9.0179476     11.5052674     19.5202501
     23.8531523     34.7778914     40.2045056     47.6972570     56.0280369
     62.2099920     74.3250006     80.2391036     93.5249710    101.4634026
    105.4826808    112.5839591    124.9993554    140.2801598    142.3995725
    155.4392607    165.0933129    168.6368107    171.7686266    178.4907166
    187.3676957    194.6972245    204.6058147    216.6618008    225.8425338
    229.1724774    234.3695478    237.0974128    244.0003154    254.4057921
    268.2962599    277.8415318    283.1801784    287.6645750    291.8717759
    297.0433651    312.1757848    317.0690423    320.8731095    337.7533037
    341.3158987    350.2008365    354.7777093    360.7448659    366.7502173
    377.2295119    378.0112263    397.7406694    399.9491759    401.0405878
    411.4488099    417.2754839    420.1110482    420.5113848    432.1194297
    433.5192047    438.6547605    444.8371722    446.0598683    451.7542124
    456.7350524    456.9270664    460.3698372    462.4414184    471.5506006
    478.2210394    483.7140345    488.7634008    496.4225307    505.9043243
    516.5551360    519.0461299    523.0788794    527.1655408    533.4569014
    538.7842372    541.5288437    544.6772124    551.3172240    555.5833551
    557.4697858    560.1254371    563.3644152    567.5751304    573.2766449
    580.5374992    581.7235971    586.1678081    590.6435677    591.1500843
    592.5022333    597.6518446    601.9379849    612.7701234    617.6897122
    624.4284157

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2077
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    132

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9919E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.6860E-03

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  6.8964E-03

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.1225E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  3.2313E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.8250E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1026    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1371    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1929    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2662    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3282    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4685    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5460    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7418    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8730    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9436    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.075    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.325    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.669    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.720    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.049    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.311    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.412    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.502    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.702    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.977    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.215    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.550    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.981    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.325    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.454    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.658    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.767    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.049    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.489    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.104    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.546    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.800    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.017    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.224    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.483    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.264    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.525    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.731    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.674    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.879    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.07    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    792 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002
 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
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 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99996
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001
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 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    37386 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002
 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
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 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
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 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99996
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00005 1.00003 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601110538131843093.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601110538131843093.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601110538131843093.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601110538131843093.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    264
            First residue number     =    717
            Last  residue number     =    980
            Number of atoms found    =   2077
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9919E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.6860E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  6.8964E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.1225E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  3.2313E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.8250E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1026    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1371    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2662    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3282    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4685    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5460    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7418    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8730    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9436    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.075    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.325    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.669    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.720    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.049    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.311    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.412    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.502    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.702    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.977    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.215    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.550    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.981    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.325    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.454    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.658    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.767    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.049    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.489    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.104    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.546    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.800    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.017    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.224    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.483    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.264    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.525    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.731    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.674    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.879    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.07    

 Bfactors>  106 vectors,   6231 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.002686
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.246 for    264 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      5.186 +/-   4.55
 Bfactors> =     77.180 +/-   8.13
 Bfactors> Shiftng-fct=     71.995
 Bfactors> Scaling-fct=      1.785

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601110538131843093.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601110538131843093.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4324E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   5.628    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   9.018    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   11.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   19.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   23.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   34.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   40.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   47.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   56.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   62.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   74.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   80.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   93.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   101.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   105.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   601.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   612.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   617.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.4    

 Chkmod>  106 vectors,   6231 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2077 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    67 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    93 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9087
      0.0034      0.7415
      0.0034      0.7601
      0.0034      0.9932
      0.0034      0.8326
      0.0034      0.7034
      5.6277      0.5862
      9.0175      0.6067
     11.5046      0.7294
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     40.2064      0.7245
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    112.5851      0.3601
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    617.7047      0.2758
    624.4443      0.2643
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601110538131843093 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gif 300x300
getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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2601110538131843093.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601110538131843093.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2601110538131843093.11.pdb
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2601110538131843093.8.pdb
2601110538131843093.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m6.208s
user	0m6.147s
sys	0m0.059s
rm: cannot remove '2601110538131843093.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** 01-AUG-25 ***

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Still some additional cleaning from time to time
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* 01-AUG-25 *
