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***  TRANSFERASE 12-NOV-07 3BCE  ***

LOGs for ID: 2601111546461902225

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601111546461902225.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601111546461902225.atom to be opened. Openam> File opened: 2601111546461902225.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 857 First residue number = 678 Last residue number = 965 Number of atoms found = 6865 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -7.569078 +/- 21.516038 From: -60.159000 To: 32.842000 = 28.850052 +/- 16.937595 From: -17.061000 To: 68.554000 = 27.932849 +/- 20.327776 From: -15.797000 To: 77.692000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1887 % Filled. Pdbmat> 2521057 non-zero elements. Pdbmat> 275593 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.29 +/- 23.87 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 5.511860E+06 Pdbmat> Larger element = 498.351 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 857 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601111546461902225.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601111546461902225.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601111546461902225.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6865 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 857 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 42 atoms in block 3 Block first atom: 78 Blocpdb> 44 atoms in block 4 Block first atom: 120 Blocpdb> 29 atoms in block 5 Block first atom: 164 Blocpdb> 34 atoms in block 6 Block first atom: 193 Blocpdb> 47 atoms in block 7 Block first atom: 227 Blocpdb> 36 atoms in block 8 Block first atom: 274 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 310 Blocpdb> 37 atoms in block 10 Block first atom: 348 Blocpdb> 32 atoms in block 11 Block first atom: 385 Blocpdb> 36 atoms in block 12 Block first atom: 417 Blocpdb> 45 atoms in block 13 Block first atom: 453 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 498 Blocpdb> 39 atoms in block 15 Block first atom: 532 Blocpdb> 44 atoms in block 16 Block first atom: 571 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 615 Blocpdb> 37 atoms in block 18 Block first atom: 648 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 685 Blocpdb> 35 atoms in block 20 Block first atom: 724 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 759 Blocpdb> 46 atoms in block 22 Block first atom: 803 Blocpdb> 35 atoms in block 23 Block first atom: 849 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 884 Blocpdb> 35 atoms in block 25 Block first atom: 930 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 965 Blocpdb> 48 atoms in block 27 Block first atom: 1006 Blocpdb> 44 atoms in block 28 Block first atom: 1054 Blocpdb> 37 atoms in block 29 Block first atom: 1098 Blocpdb> 37 atoms in block 30 Block first atom: 1135 Blocpdb> 41 atoms in block 31 Block first atom: 1172 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1213 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1251 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1291 Blocpdb> 34 atoms in block 35 Block first atom: 1330 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1364 Blocpdb> 44 atoms in block 37 Block first atom: 1400 Blocpdb> 45 atoms in block 38 Block first atom: 1444 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1489 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1537 Blocpdb> 36 atoms in block 41 Block first atom: 1581 Blocpdb> 47 atoms in block 42 Block first atom: 1617 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1664 Blocpdb> 39 atoms in block 44 Block first atom: 1699 Blocpdb> 42 atoms in block 45 Block first atom: 1738 Blocpdb> 40 atoms in block 46 Block first atom: 1780 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 1820 Blocpdb> 38 atoms in block 48 Block first atom: 1861 Blocpdb> 36 atoms in block 49 Block first atom: 1899 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 1935 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 1977 Blocpdb> 38 atoms in block 52 Block first atom: 2022 Blocpdb> 45 atoms in block 53 Block first atom: 2060 Blocpdb> 38 atoms in block 54 Block first atom: 2105 Blocpdb> 41 atoms in block 55 Block first atom: 2143 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2184 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 2231 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 2267 Blocpdb> 36 atoms in block 59 Block first atom: 2283 Blocpdb> 41 atoms in block 60 Block first atom: 2319 Blocpdb> 42 atoms in block 61 Block first atom: 2360 Blocpdb> 44 atoms in block 62 Block first atom: 2402 Blocpdb> 29 atoms in block 63 Block first atom: 2446 Blocpdb> 34 atoms in block 64 Block first atom: 2475 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2509 Blocpdb> 36 atoms in block 66 Block first atom: 2556 Blocpdb> 38 atoms in block 67 Block first atom: 2592 Blocpdb> 37 atoms in block 68 Block first atom: 2630 Blocpdb> 32 atoms in block 69 Block first atom: 2667 Blocpdb> 38 atoms in block 70 Block first atom: 2699 Blocpdb> 41 atoms in block 71 Block first atom: 2737 Blocpdb> 35 atoms in block 72 Block first atom: 2778 Blocpdb> 43 atoms in block 73 Block first atom: 2813 Blocpdb> 42 atoms in block 74 Block first atom: 2856 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2898 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 2929 Blocpdb> 39 atoms in block 77 Block first atom: 2968 Blocpdb> 35 atoms in block 78 Block first atom: 3007 Blocpdb> 46 atoms in block 79 Block first atom: 3042 Blocpdb> 44 atoms in block 80 Block first atom: 3088 Blocpdb> 35 atoms in block 81 Block first atom: 3132 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3167 Blocpdb> 38 atoms in block 83 Block first atom: 3211 Blocpdb> 40 atoms in block 84 Block first atom: 3249 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 3289 Blocpdb> 44 atoms in block 86 Block first atom: 3337 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 3381 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3417 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 3454 Blocpdb> 38 atoms in block 90 Block first atom: 3496 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 3534 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 3575 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 3614 Blocpdb> 36 atoms in block 94 Block first atom: 3639 Blocpdb> 44 atoms in block 95 Block first atom: 3675 Blocpdb> 45 atoms in block 96 Block first atom: 3719 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 3764 Blocpdb> 44 atoms in block 98 Block first atom: 3812 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3856 Blocpdb> 47 atoms in block 100 Block first atom: 3892 Blocpdb> 35 atoms in block 101 Block first atom: 3939 Blocpdb> 39 atoms in block 102 Block first atom: 3974 Blocpdb> 42 atoms in block 103 Block first atom: 4013 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 4055 Blocpdb> 41 atoms in block 105 Block first atom: 4095 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 4136 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 4174 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 4210 Blocpdb> 45 atoms in block 109 Block first atom: 4252 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 4297 Blocpdb> 45 atoms in block 111 Block first atom: 4335 Blocpdb> 38 atoms in block 112 Block first atom: 4380 Blocpdb> 41 atoms in block 113 Block first atom: 4418 Blocpdb> 47 atoms in block 114 Block first atom: 4459 Blocpdb> 36 atoms in block 115 Block first atom: 4506 Blocpdb> 35 atoms in block 116 Block first atom: 4542 Blocpdb> 36 atoms in block 117 Block first atom: 4577 Blocpdb> 41 atoms in block 118 Block first atom: 4613 Blocpdb> 42 atoms in block 119 Block first atom: 4654 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 4696 Blocpdb> 29 atoms in block 121 Block first atom: 4740 Blocpdb> 34 atoms in block 122 Block first atom: 4769 Blocpdb> 47 atoms in block 123 Block first atom: 4803 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 4850 Blocpdb> 38 atoms in block 125 Block first atom: 4886 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 4924 Blocpdb> 39 atoms in block 127 Block first atom: 4961 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 5000 Blocpdb> 43 atoms in block 129 Block first atom: 5033 Blocpdb> 38 atoms in block 130 Block first atom: 5076 Blocpdb> 37 atoms in block 131 Block first atom: 5114 Blocpdb> 43 atoms in block 132 Block first atom: 5151 Blocpdb> 33 atoms in block 133 Block first atom: 5194 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 5227 Blocpdb> 40 atoms in block 135 Block first atom: 5263 Blocpdb> 37 atoms in block 136 Block first atom: 5303 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 5340 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 5383 Blocpdb> 34 atoms in block 139 Block first atom: 5428 Blocpdb> 41 atoms in block 140 Block first atom: 5462 Blocpdb> 44 atoms in block 141 Block first atom: 5503 Blocpdb> 34 atoms in block 142 Block first atom: 5547 Blocpdb> 49 atoms in block 143 Block first atom: 5581 Blocpdb> 47 atoms in block 144 Block first atom: 5630 Blocpdb> 37 atoms in block 145 Block first atom: 5677 Blocpdb> 39 atoms in block 146 Block first atom: 5714 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 5753 Blocpdb> 43 atoms in block 148 Block first atom: 5791 Blocpdb> 36 atoms in block 149 Block first atom: 5834 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 5870 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 5887 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 5934 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 5955 Blocpdb> 44 atoms in block 154 Block first atom: 5991 Blocpdb> 45 atoms in block 155 Block first atom: 6035 Blocpdb> 48 atoms in block 156 Block first atom: 6080 Blocpdb> 44 atoms in block 157 Block first atom: 6128 Blocpdb> 36 atoms in block 158 Block first atom: 6172 Blocpdb> 47 atoms in block 159 Block first atom: 6208 Blocpdb> 35 atoms in block 160 Block first atom: 6255 Blocpdb> 39 atoms in block 161 Block first atom: 6290 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 6329 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 6371 Blocpdb> 41 atoms in block 164 Block first atom: 6411 Blocpdb> 38 atoms in block 165 Block first atom: 6452 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 6490 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 6526 Blocpdb> 45 atoms in block 168 Block first atom: 6568 Blocpdb> 38 atoms in block 169 Block first atom: 6613 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 6651 Blocpdb> 38 atoms in block 171 Block first atom: 6696 Blocpdb> 41 atoms in block 172 Block first atom: 6734 Blocpdb> 47 atoms in block 173 Block first atom: 6775 Blocpdb> 36 atoms in block 174 Block first atom: 6822 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 6857 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 49 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2521232 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20595 Prepmat> Matrix trace = 5511860.0000 Prepmat> Last element read: 20595 20595 193.2842 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13977 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6865 RTB> Total mass = 6865.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6865 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 190703.4732 RTB> 48603 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48603 Diagstd> Projected matrix trace = 190703.4732 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 190703.4732 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0164967 0.0244664 0.0464792 0.1256656 0.1405606 0.2233309 0.6823710 0.7821667 1.0124185 1.4082085 2.2440181 2.2719944 2.4309629 2.6619921 2.8941395 2.9506193 3.1022653 3.3624210 3.4654949 4.3829191 5.0882291 5.3693955 5.9903014 7.1648629 7.7496943 8.5615759 8.8194008 9.0900870 9.7165708 9.9396788 10.1030609 10.5337705 10.9216687 11.0990390 11.7523428 12.2480597 12.7493772 13.1361829 13.3375121 13.5228222 13.6204940 14.5028703 14.9021813 15.5288291 15.6439442 16.0599696 16.2423361 16.4034018 16.6450028 17.4359856 17.7321327 17.9879126 18.6619207 19.6427348 19.8803362 20.3645179 20.7159942 21.3524996 21.7855178 22.5588952 23.2462780 23.3991755 23.6669310 23.8610413 24.2352102 24.7579277 24.9744893 25.2014274 26.0273292 26.6779548 27.1130437 27.7424864 28.1915291 28.2484682 28.7154419 29.4903205 29.8696773 30.1066613 30.1811678 30.4476169 30.9391734 32.1217235 32.5155035 32.9263491 33.0939462 33.7417872 34.1675453 34.3526230 35.1356120 35.2008708 35.6644703 35.8872769 36.2652136 36.6785356 36.9424059 37.0763554 37.4303973 37.6428655 37.8377383 38.4997400 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034334 0.0034337 0.0034340 0.0034340 0.0034346 13.9474209 16.9855839 23.4112416 38.4949241 40.7124415 51.3179909 89.7027092 96.0384057 109.2635509 128.8631538 162.6703715 163.6812425 169.3107146 177.1734569 184.7374784 186.5313659 191.2646660 199.1229532 202.1519398 227.3406036 244.9506576 251.6274263 265.7783597 290.6693391 302.2995958 317.7401781 322.4889368 327.4004716 338.4946359 342.3587688 345.1610381 352.4416341 358.8721694 361.7745140 372.2695419 380.0396663 387.7392489 393.5771475 396.5817216 399.3272516 400.7667748 413.5445123 419.1989652 427.9220211 429.5051835 435.1787095 437.6425365 439.8071056 443.0341630 453.4386456 457.2732187 460.5594153 469.1086592 481.2782744 484.1803300 490.0409203 494.2516988 501.7872725 506.8497351 515.7677631 523.5666722 525.2856752 528.2825342 530.4445314 534.5873470 540.3217198 542.6797151 545.1397496 554.0004062 560.8820566 565.4372525 571.9630474 576.5733920 577.1553583 581.9062640 589.7052943 593.4860911 595.8357794 596.5725963 599.2001777 604.0176559 615.4527270 619.2136513 623.1133695 624.6971988 630.7820430 634.7492114 636.4660339 643.6785566 644.2760451 648.5047616 650.5273096 653.9437602 657.6597671 660.0211734 661.2166770 664.3661535 666.2490738 667.9713955 673.7894061 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6865 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6497E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4466E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6479E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.431 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.465 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.383 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.990 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.090 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003 0.99996 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 123570 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003 0.99996 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601111546461902225.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601111546461902225.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601111546461902225.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601111546461902225.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 857 First residue number = 678 Last residue number = 965 Number of atoms found = 6865 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6497E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4466E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6479E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.244 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.465 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.383 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.090 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50 Bfactors> 106 vectors, 20595 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.016497 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.224 for 857 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.346 +/- 0.28 Bfactors> = 18.715 +/- 6.36 Bfactors> Shiftng-fct= 18.369 Bfactors> Scaling-fct= 23.024 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601111546461902225.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601111546461902225.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3 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Chkmod> That is: 6865 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2601111546461902225 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2601111546461902225 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601111546461902225.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601111546461902225.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2601111546461902225 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601111546461902225.eigenfacs 2601111546461902225.atom making animated gifs 11 models are in 2601111546461902225.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601111546461902225.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601111546461902225.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2601111546461902225.10.pdb 2601111546461902225.11.pdb 2601111546461902225.7.pdb 2601111546461902225.8.pdb 2601111546461902225.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m29.425s user 0m29.261s sys 0m0.156s rm: cannot remove '2601111546461902225.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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