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***  lig_1.pdb  ***

LOGs for ID: 2601120106271953753

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601120106271953753.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601120106271953753.atom to be opened. Openam> File opened: 2601120106271953753.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1423 First residue number = 1 Last residue number = 115 Number of atoms found = 11184 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -3.801474 +/- 23.051106 From: -60.986000 To: 63.237000 = 0.634353 +/- 27.156238 From: -65.007000 To: 81.820000 = -1.337596 +/- 22.989884 From: -55.523000 To: 69.933000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6154 % Filled. Pdbmat> 3463725 non-zero elements. Pdbmat> 377474 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 67.50 +/- 27.84 Maximum number = 129 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 7.549480E+06 Pdbmat> Larger element = 503.027 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1423 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601120106271953753.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601120106271953753.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601120106271953753.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11184 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1423 residues. Blocpdb> 62 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 62 atoms in block 2 Block first atom: 63 Blocpdb> 53 atoms in block 3 Block first atom: 125 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 178 Blocpdb> 60 atoms in block 5 Block first atom: 228 Blocpdb> 71 atoms in block 6 Block first atom: 288 Blocpdb> 75 atoms in block 7 Block first atom: 359 Blocpdb> 60 atoms in block 8 Block first atom: 434 Blocpdb> 67 atoms in block 9 Block first atom: 494 Blocpdb> 65 atoms in block 10 Block first atom: 561 Blocpdb> 65 atoms in block 11 Block first atom: 626 Blocpdb> 71 atoms in block 12 Block first atom: 691 Blocpdb> 67 atoms in block 13 Block first atom: 762 Blocpdb> 68 atoms in block 14 Block first atom: 829 Blocpdb> 68 atoms in block 15 Block first atom: 897 Blocpdb> 68 atoms in block 16 Block first atom: 965 Blocpdb> 61 atoms in block 17 Block first atom: 1033 Blocpdb> 65 atoms in block 18 Block first atom: 1094 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1159 Blocpdb> 66 atoms in block 20 Block first atom: 1218 Blocpdb> 75 atoms in block 21 Block first atom: 1284 Blocpdb> 65 atoms in block 22 Block first atom: 1359 Blocpdb> 52 atoms in block 23 Block first atom: 1424 Blocpdb> 56 atoms in block 24 Block first atom: 1476 Blocpdb> 59 atoms in block 25 Block first atom: 1532 Blocpdb> 64 atoms in block 26 Block first atom: 1591 Blocpdb> 61 atoms in block 27 Block first atom: 1655 Blocpdb> 58 atoms in block 28 Block first atom: 1716 Blocpdb> 66 atoms in block 29 Block first atom: 1774 Blocpdb> 44 atoms in block 30 Block first atom: 1840 Blocpdb> 61 atoms in block 31 Block first atom: 1884 Blocpdb> 59 atoms in block 32 Block first atom: 1945 Blocpdb> 56 atoms in block 33 Block first atom: 2004 Blocpdb> 66 atoms in block 34 Block first atom: 2060 Blocpdb> 74 atoms in block 35 Block first atom: 2126 Blocpdb> 65 atoms in block 36 Block first atom: 2200 Blocpdb> 62 atoms in block 37 Block first atom: 2265 Blocpdb> 57 atoms in block 38 Block first atom: 2327 Blocpdb> 57 atoms in block 39 Block first atom: 2384 Blocpdb> 62 atoms in block 40 Block first atom: 2441 Blocpdb> 60 atoms in block 41 Block first atom: 2503 Blocpdb> 53 atoms in block 42 Block first atom: 2563 Blocpdb> 51 atoms in block 43 Block first atom: 2616 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2667 Blocpdb> 65 atoms in block 45 Block first atom: 2723 Blocpdb> 64 atoms in block 46 Block first atom: 2788 Blocpdb> 56 atoms in block 47 Block first atom: 2852 Blocpdb> 62 atoms in block 48 Block first atom: 2908 Blocpdb> 67 atoms in block 49 Block first atom: 2970 Blocpdb> 64 atoms in block 50 Block first atom: 3037 Blocpdb> 71 atoms in block 51 Block first atom: 3101 Blocpdb> 62 atoms in block 52 Block first atom: 3172 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 3234 Blocpdb> 60 atoms in block 54 Block first atom: 3293 Blocpdb> 65 atoms in block 55 Block first atom: 3353 Blocpdb> 62 atoms in block 56 Block first atom: 3418 Blocpdb> 55 atoms in block 57 Block first atom: 3480 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 3535 Blocpdb> 71 atoms in block 59 Block first atom: 3600 Blocpdb> 68 atoms in block 60 Block first atom: 3671 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 3739 Blocpdb> 64 atoms in block 62 Block first atom: 3809 Blocpdb> 54 atoms in block 63 Block first atom: 3873 Blocpdb> 54 atoms in block 64 Block first atom: 3927 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 3981 Blocpdb> 70 atoms in block 66 Block first atom: 4040 Blocpdb> 58 atoms in block 67 Block first atom: 4110 Blocpdb> 71 atoms in block 68 Block first atom: 4168 Blocpdb> 61 atoms in block 69 Block first atom: 4239 Blocpdb> 61 atoms in block 70 Block first atom: 4300 Blocpdb> 61 atoms in block 71 Block first atom: 4361 Blocpdb> 54 atoms in block 72 Block first atom: 4422 Blocpdb> 64 atoms in block 73 Block first atom: 4476 Blocpdb> 58 atoms in block 74 Block first atom: 4540 Blocpdb> 51 atoms in block 75 Block first atom: 4598 Blocpdb> 70 atoms in block 76 Block first atom: 4649 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 4719 Blocpdb> 57 atoms in block 78 Block first atom: 4785 Blocpdb> 56 atoms in block 79 Block first atom: 4842 Blocpdb> 70 atoms in block 80 Block first atom: 4898 Blocpdb> 62 atoms in block 81 Block first atom: 4968 Blocpdb> 55 atoms in block 82 Block first atom: 5030 Blocpdb> 58 atoms in block 83 Block first atom: 5085 Blocpdb> 57 atoms in block 84 Block first atom: 5143 Blocpdb> 71 atoms in block 85 Block first atom: 5200 Blocpdb> 73 atoms in block 86 Block first atom: 5271 Blocpdb> 68 atoms in block 87 Block first atom: 5344 Blocpdb> 51 atoms in block 88 Block first atom: 5412 Blocpdb> 65 atoms in block 89 Block first atom: 5463 Blocpdb> 70 atoms in block 90 Block first atom: 5528 Blocpdb> 50 atoms in block 91 Block first atom: 5598 Blocpdb> 62 atoms in block 92 Block first atom: 5648 Blocpdb> 64 atoms in block 93 Block first atom: 5710 Blocpdb> 61 atoms in block 94 Block first atom: 5774 Blocpdb> 59 atoms in block 95 Block first atom: 5835 Blocpdb> 65 atoms in block 96 Block first atom: 5894 Blocpdb> 56 atoms in block 97 Block first atom: 5959 Blocpdb> 69 atoms in block 98 Block first atom: 6015 Blocpdb> 53 atoms in block 99 Block first atom: 6084 Blocpdb> 63 atoms in block 100 Block first atom: 6137 Blocpdb> 64 atoms in block 101 Block first atom: 6200 Blocpdb> 66 atoms in block 102 Block first atom: 6264 Blocpdb> 67 atoms in block 103 Block first atom: 6330 Blocpdb> 58 atoms in block 104 Block first atom: 6397 Blocpdb> 75 atoms in block 105 Block first atom: 6455 Blocpdb> 66 atoms in block 106 Block first atom: 6530 Blocpdb> 62 atoms in block 107 Block first atom: 6596 Blocpdb> 62 atoms in block 108 Block first atom: 6658 Blocpdb> 62 atoms in block 109 Block first atom: 6720 Blocpdb> 59 atoms in block 110 Block first atom: 6782 Blocpdb> 68 atoms in block 111 Block first atom: 6841 Blocpdb> 73 atoms in block 112 Block first atom: 6909 Blocpdb> 72 atoms in block 113 Block first atom: 6982 Blocpdb> 67 atoms in block 114 Block first atom: 7054 Blocpdb> 58 atoms in block 115 Block first atom: 7121 Blocpdb> 66 atoms in block 116 Block first atom: 7179 Blocpdb> 61 atoms in block 117 Block first atom: 7245 Blocpdb> 66 atoms in block 118 Block first atom: 7306 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 7372 Blocpdb> 68 atoms in block 120 Block first atom: 7435 Blocpdb> 66 atoms in block 121 Block first atom: 7503 Blocpdb> 64 atoms in block 122 Block first atom: 7569 Blocpdb> 71 atoms in block 123 Block first atom: 7633 Blocpdb> 63 atoms in block 124 Block first atom: 7704 Blocpdb> 61 atoms in block 125 Block first atom: 7767 Blocpdb> 70 atoms in block 126 Block first atom: 7828 Blocpdb> 67 atoms in block 127 Block first atom: 7898 Blocpdb> 66 atoms in block 128 Block first atom: 7965 Blocpdb> 62 atoms in block 129 Block first atom: 8031 Blocpdb> 67 atoms in block 130 Block first atom: 8093 Blocpdb> 64 atoms in block 131 Block first atom: 8160 Blocpdb> 58 atoms in block 132 Block first atom: 8224 Blocpdb> 60 atoms in block 133 Block first atom: 8282 Blocpdb> 62 atoms in block 134 Block first atom: 8342 Blocpdb> 54 atoms in block 135 Block first atom: 8404 Blocpdb> 63 atoms in block 136 Block first atom: 8458 Blocpdb> 53 atoms in block 137 Block first atom: 8521 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 8574 Blocpdb> 56 atoms in block 139 Block first atom: 8635 Blocpdb> 61 atoms in block 140 Block first atom: 8691 Blocpdb> 68 atoms in block 141 Block first atom: 8752 Blocpdb> 56 atoms in block 142 Block first atom: 8820 Blocpdb> 64 atoms in block 143 Block first atom: 8876 Blocpdb> 65 atoms in block 144 Block first atom: 8940 Blocpdb> 68 atoms in block 145 Block first atom: 9005 Blocpdb> 69 atoms in block 146 Block first atom: 9073 Blocpdb> 70 atoms in block 147 Block first atom: 9142 Blocpdb> 58 atoms in block 148 Block first atom: 9212 Blocpdb> 65 atoms in block 149 Block first atom: 9270 Blocpdb> 57 atoms in block 150 Block first atom: 9335 Blocpdb> 72 atoms in block 151 Block first atom: 9392 Blocpdb> 62 atoms in block 152 Block first atom: 9464 Blocpdb> 64 atoms in block 153 Block first atom: 9526 Blocpdb> 63 atoms in block 154 Block first atom: 9590 Blocpdb> 62 atoms in block 155 Block first atom: 9653 Blocpdb> 73 atoms in block 156 Block first atom: 9715 Blocpdb> 65 atoms in block 157 Block first atom: 9788 Blocpdb> 71 atoms in block 158 Block first atom: 9853 Blocpdb> 74 atoms in block 159 Block first atom: 9924 Blocpdb> 66 atoms in block 160 Block first atom: 9998 Blocpdb> 70 atoms in block 161 Block first atom: 10064 Blocpdb> 56 atoms in block 162 Block first atom: 10134 Blocpdb> 72 atoms in block 163 Block first atom: 10190 Blocpdb> 30 atoms in block 164 Block first atom: 10262 Blocpdb> 65 atoms in block 165 Block first atom: 10292 Blocpdb> 59 atoms in block 166 Block first atom: 10357 Blocpdb> 56 atoms in block 167 Block first atom: 10416 Blocpdb> 57 atoms in block 168 Block first atom: 10472 Blocpdb> 70 atoms in block 169 Block first atom: 10529 Blocpdb> 58 atoms in block 170 Block first atom: 10599 Blocpdb> 59 atoms in block 171 Block first atom: 10657 Blocpdb> 63 atoms in block 172 Block first atom: 10716 Blocpdb> 58 atoms in block 173 Block first atom: 10779 Blocpdb> 63 atoms in block 174 Block first atom: 10837 Blocpdb> 70 atoms in block 175 Block first atom: 10900 Blocpdb> 65 atoms in block 176 Block first atom: 10970 Blocpdb> 61 atoms in block 177 Block first atom: 11035 Blocpdb> 60 atoms in block 178 Block first atom: 11096 Blocpdb> 29 atoms in block 179 Block first atom: 11155 Blocpdb> 179 blocks. Blocpdb> At most, 75 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3463904 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 33552 Prepmat> Matrix trace = 7549480.0000 Prepmat> Last element read: 33552 33552 73.6566 Prepmat> 16111 lines saved. Prepmat> 15010 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11184 RTB> Total mass = 11184.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11184 RTB> Number of blocks = 179 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 134478.0901 RTB> 36915 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1074 Diagstd> Nb of non-zero elements: 36915 Diagstd> Projected matrix trace = 134478.0901 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1074 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 134478.0901 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0001535 0.0003617 0.0010324 0.0021088 0.0039276 0.0051076 0.0053319 0.0079487 0.0105904 0.0117524 0.0119379 0.0131604 0.0151586 0.0162541 0.0174062 0.0223570 0.0313932 0.0332628 0.0434127 0.0464341 0.0551262 0.0611807 0.0614223 0.0638345 0.0690555 0.0778994 0.0796854 0.0809927 0.0892209 0.1054524 0.1072876 0.1143328 0.1233046 0.1267071 0.1381814 0.1454981 0.1533401 0.1697271 0.1875893 0.1973774 0.2008973 0.2153321 0.2336555 0.2553941 0.2794488 0.3161592 0.3320561 0.3509512 0.3754147 0.3778973 0.3986486 0.4445632 0.4485383 0.4749169 0.4811449 0.5402136 0.5435457 0.5637900 0.6082717 0.6275622 0.6576279 0.7161209 0.7390116 0.7720011 0.7817114 0.8147345 0.8450044 0.8802566 0.9159722 0.9515032 0.9725680 0.9945240 1.0950688 1.1352083 1.1822228 1.1994594 1.2364301 1.2903707 1.2991009 1.3157702 1.3716185 1.4730142 1.5182674 1.5242636 1.5693899 1.6118256 1.6391526 1.7564597 1.7606703 1.7816624 1.7957270 1.8370337 1.9825647 2.0387028 2.1982082 2.2458351 2.3032826 2.3624184 2.3965732 2.4939028 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034341 1.3453426 2.0652351 3.4891716 4.9866923 6.8054529 7.7607848 7.9293336 9.6815350 11.1750866 11.7722187 11.8647594 12.4574826 13.3697920 13.8444867 14.3267396 16.2368668 19.2403398 19.8049960 22.6257824 23.3998967 25.4961424 26.8597865 26.9127633 27.4361294 28.5360770 30.3083475 30.6538246 30.9042489 32.4360902 35.2633526 35.5688722 36.7181476 38.1315949 38.6541196 40.3664122 41.4213185 42.5229226 44.7374103 47.0326338 48.2440714 48.6723531 50.3906150 52.4908163 54.8783069 57.4045614 61.0587881 62.5750214 64.3307530 66.5351124 66.7547476 68.5630899 72.4039102 72.7268991 74.8348833 75.3239734 79.8138073 80.0595824 81.5368551 84.6923302 86.0247988 88.0613603 91.8942756 93.3514148 95.4122716 96.0104483 98.0174370 99.8216533 101.8825772 103.9289208 105.9254725 107.0915666 108.2936287 113.6360119 115.6999192 118.0714635 118.9290782 120.7480314 123.3537974 123.7703776 124.5619240 127.1779864 131.7949410 133.8040972 134.0680596 136.0381468 137.8650877 139.0288619 143.9177545 144.0901516 144.9465867 145.5175695 147.1817102 152.9005214 155.0501686 161.0014131 162.7362150 164.8044330 166.9066670 168.1088718 171.4885144 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11184 Rtb_to_modes> Number of blocs = 179 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5349E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6170E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0324E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1088E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9276E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1076E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3319E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9487E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0590E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1752E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1938E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3160E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5159E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6254E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7406E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2357E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1393E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3263E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3413E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6434E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5126E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1181E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1422E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3834E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9055E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7899E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9685E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0993E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9221E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1073 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1382 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1974 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2337 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6576 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.569 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.039 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.246 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.397 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.494 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1074 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 1.00002 1.00004 0.99998 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00003 1.00003 0.99998 0.99997 0.99995 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 1.00005 1.00001 1.00004 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 1.00005 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99996 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99995 1.00000 1.00005 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 1.00004 0.99997 1.00000 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998 0.99996 1.00003 1.00005 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 201312 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 1.00002 1.00004 0.99998 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00003 1.00003 0.99998 0.99997 0.99995 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 1.00005 1.00001 1.00004 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 1.00005 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99996 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99995 1.00000 1.00005 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 1.00004 0.99997 1.00000 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998 0.99996 1.00003 1.00005 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601120106271953753.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601120106271953753.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601120106271953753.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601120106271953753.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1423 First residue number = 1 Last residue number = 115 Number of atoms found = 11184 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5349E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6170E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1088E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9276E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1076E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9487E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0590E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1752E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1938E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3160E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5159E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6254E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7406E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2357E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1393E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3263E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3413E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6434E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5126E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1181E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1422E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3834E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9055E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7899E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9685E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0993E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9221E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1073 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1382 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1974 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2337 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6576 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.095 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.569 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.039 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.246 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.397 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.494 Bfactors> 106 vectors, 33552 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000153 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 18.062 +/- 74.30 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -18.062 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601120106271953753.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601120106271953753.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 11184 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 65 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601120106271953753.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601120106271953753.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2601120106271953753 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2601120106271953753 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601120106271953753.eigenfacs 2601120106271953753.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601120106271953753.eigenfacs 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