***  d37  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2601131537342151601.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2601131537342151601.atom to be opened.
Openam> File opened: 2601131537342151601.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 37
First residue number = 1
Last residue number = 37
Number of atoms found = 781
Mean number per residue = 21.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.425556 +/- 12.050613 From: -26.115000 To: 22.422000
= 2.052781 +/- 10.501367 From: -24.396000 To: 22.730000
= 0.644219 +/- 11.240519 From: -19.873000 To: 24.587000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 37 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.6828 % Filled.
Pdbmat> 238428 non-zero elements.
Pdbmat> 25978 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 66.52 +/- 19.90
Maximum number = 108
Minimum number = 22
Pdbmat> Matrix trace = 519560.
Pdbmat> Larger element = 446.577
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
37 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2601131537342151601.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2601131537342151601.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2601131537342151601.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 781 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 37 residues.
Blocpdb> 21 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 22
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 42
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 62
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 84
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 106
Blocpdb> 22 atoms in block 7
Block first atom: 128
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 150
Blocpdb> 20 atoms in block 9
Block first atom: 170
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 190
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 210
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 232
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 254
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 276
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 296
Blocpdb> 23 atoms in block 16
Block first atom: 316
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 339
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 361
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 381
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 403
Blocpdb> 20 atoms in block 21
Block first atom: 425
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 445
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 465
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 485
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 529
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 551
Blocpdb> 20 atoms in block 28
Block first atom: 571
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 591
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 611
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 631
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 653
Blocpdb> 23 atoms in block 33
Block first atom: 675
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 698
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 720
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 740
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 759
Blocpdb> 37 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 238465 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2343
Prepmat> Matrix trace = 519560.0000
Prepmat> Last element read: 2343 2343 174.9850
Prepmat> 704 lines saved.
Prepmat> 519 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 781
RTB> Total mass = 781.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 781
RTB> Number of blocks = 37
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 36659.8117
RTB> 6069 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 222
Diagstd> Nb of non-zero elements: 6069
Diagstd> Projected matrix trace = 36659.8117
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 222 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 36659.8117
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0946784 0.1065641 0.2424053 0.4596715
0.5869874 1.0303039 1.5518125 2.0890235 3.1139755
4.1080186 4.7662298 6.4600738 7.6534963 9.8830167
11.3620908 12.3461441 14.2969190 15.7195313 17.0908784
17.7977904 18.6112750 20.2395209 21.4652114 22.0616317
22.5184911 23.6936864 23.8492595 25.8954545 26.8316896
28.1253256 29.8209209 30.1345632 33.3476631 33.6957096
34.8569531 35.4705352 38.4052972 39.7799209 41.4304199
42.3460696 43.4615903 46.2307304 46.6669163 48.2991645
49.2624263 51.8218574 52.6667158 53.2603608 54.2589399
56.9233795 57.9102922 58.3435354 58.5026451 63.3122700
64.4152968 65.5937111 67.9619412 72.1622039 73.1347710
75.5025110 76.5357107 76.9960313 78.1860026 83.4733991
84.4554146 86.3086979 86.9773913 90.5805522 91.4041467
93.6843507 96.8023624 99.1715728 101.5156879 102.1766848
103.2119683 106.0388547 110.6955106 111.2822526 115.9357447
117.3469192 119.2619876 119.9034345 120.8484467 122.8538064
124.0220875 126.3450253 127.3949827 128.2900844 129.5065301
131.6315184 132.1258508 133.3818560 135.9724227 136.3936574
138.1160517 139.6123360 141.5886111 142.7724057 144.3261720
144.6960093
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034336 0.0034338 0.0034339 0.0034341
0.0034341 33.4134134 35.4487317 53.4645990 73.6239456
83.1973818 110.2244541 135.2741762 156.9520309 191.6253126
220.0956606 237.0733686 276.0031379 300.4174946 341.3815485
366.0365115 381.5583404 410.5976967 430.5415569 448.9288047
458.1190212 468.4716810 488.5346746 503.1099029 510.0515772
515.3056728 528.5810611 530.3135574 552.5951244 562.4958086
575.8959966 593.0015189 596.1118164 627.0872674 630.3511994
641.1209833 646.7391495 672.9624708 684.9001126 698.9642250
706.6458840 715.8929521 738.3472430 741.8222105 754.6839075
762.1723321 781.7209796 788.0674663 792.4964622 799.8912247
819.2955916 826.3673665 829.4527502 830.5829880 864.0506931
871.5449412 879.4808379 895.2166847 922.4655888 928.6610557
943.5740268 950.0081696 952.8607774 960.1957624 992.1317080
997.9505676 1008.8406255 1012.7411789 1033.5054289 1038.1933188
1051.0631400 1068.4107727 1081.4062634 1094.1122014 1097.6684560
1103.2153871 1118.2213873 1142.5107215 1145.5346607 1169.2407917
1176.3352907 1185.8951743 1189.0800478 1193.7566849 1203.6205350
1209.3299226 1220.6027767 1225.6640339 1229.9623727 1235.7798625
1245.8771646 1248.2143720 1254.1331816 1266.2536147 1268.2134883
1276.1959372 1283.0901682 1292.1396137 1297.5300332 1304.5713200
1306.2417395
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 781
Rtb_to_modes> Number of blocs = 37
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4678E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2424
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4597
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5870
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.030
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.552
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.089
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 222 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 1.00005
0.99997 1.00001 1.00002 1.00006 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 1.00004 0.99997 0.99995
1.00004 1.00004 0.99997 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998
1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00001 0.99996 0.99996 0.99999
1.00003 1.00005 1.00001 0.99999 0.99996
1.00001 1.00002 0.99996 1.00002 0.99998
1.00002 0.99996 0.99996 1.00000 1.00002
0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00005 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 14058 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 1.00005
0.99997 1.00001 1.00002 1.00006 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 1.00004 0.99997 0.99995
1.00004 1.00004 0.99997 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998
1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00001 0.99996 0.99996 0.99999
1.00003 1.00005 1.00001 0.99999 0.99996
1.00001 1.00002 0.99996 1.00002 0.99998
1.00002 0.99996 0.99996 1.00000 1.00002
0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00005 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601131537342151601.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601131537342151601.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2601131537342151601.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2601131537342151601.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 37
First residue number = 1
Last residue number = 37
Number of atoms found = 781
Mean number per residue = 21.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4678E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2424
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4597
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5870
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.089
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.7
Bfactors> 106 vectors, 2343 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.094678
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> 0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601131537342151601.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601131537342151601.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.41
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1306.
Chkmod> 106 vectors, 2343 coordinates in file.
Chkmod> That is: 781 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 5 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9266
0.0034 0.7574
0.0034 0.7733
0.0034 0.8220
0.0034 0.8675
0.0034 0.7121
33.4119 0.6980
35.4532 0.6837
53.4617 0.6587
73.6231 0.5624
83.1947 0.5967
110.2035 0.5437
135.2765 0.5759
156.9444 0.6437
191.6178 0.5497
220.0857 0.6589
237.0575 0.3298
275.9897 0.5631
300.3949 0.4883
341.3666 0.5962
365.9871 0.7344
381.6015 0.5048
410.6243 0.5717
430.5295 0.3423
448.8980 0.5571
458.1278 0.6053
468.4355 0.6162
488.5195 0.4951
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510.0108 0.4908
515.3008 0.5396
528.5173 0.6403
530.2990 0.5187
552.6199 0.4987
562.4540 0.4433
575.9191 0.6481
592.9669 0.6765
596.0411 0.5275
627.0823 0.6204
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641.1215 0.6052
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863.9981 0.6653
871.5393 0.5252
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131537342151601 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making animated gif 300x300
11 models are in 2601131537342151601.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601131537342151601.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131537342151601 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m0.563s
user 0m0.533s
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rm: cannot remove '2601131537342151601.sdijf': No such file or directory
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