Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* d42bis *

LOGs for ID: 2601131708162167723

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601131708162167723.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601131708162167723.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601131708162167723.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     42
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     42
            Number of atoms found    =    889
            Mean number per residue  =     21.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.421269 +/-     6.800422 From:   -16.731000 To:    16.855000
 =     1.186399 +/-    16.216804 From:   -30.802000 To:    36.230000
 =    -2.276773 +/-    12.774694 From:   -22.969000 To:    32.372000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'C   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........

%Pdbmat-W>     42 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.8750 % Filled.
 Pdbmat>       244597  non-zero elements.
 Pdbmat>        26592 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     59.82 +/-     17.63
         Maximum number =    102
         Minimum number =     18

 Pdbmat> Matrix trace   =  531840.    
 Pdbmat> Larger element =  443.515    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
42 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601131708162167723.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601131708162167723.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601131708162167723.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   889 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    42 residues.
 Blocpdb>    21 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     22
 Blocpdb>    20 atoms in block      3
 Block first atom:     42
 Blocpdb>    22 atoms in block      4
 Block first atom:     62
 Blocpdb>    22 atoms in block      5
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    22 atoms in block      6
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    22 atoms in block      7
 Block first atom:    128
 Blocpdb>    20 atoms in block      8
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    20 atoms in block      9
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    20 atoms in block     10
 Block first atom:    190
 Blocpdb>    22 atoms in block     11
 Block first atom:    210
 Blocpdb>    22 atoms in block     12
 Block first atom:    232
 Blocpdb>    22 atoms in block     13
 Block first atom:    254
 Blocpdb>    20 atoms in block     14
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    20 atoms in block     15
 Block first atom:    296
 Blocpdb>    23 atoms in block     16
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    22 atoms in block     17
 Block first atom:    339
 Blocpdb>    20 atoms in block     18
 Block first atom:    361
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    381
 Blocpdb>    22 atoms in block     20
 Block first atom:    403
 Blocpdb>    20 atoms in block     21
 Block first atom:    425
 Blocpdb>    20 atoms in block     22
 Block first atom:    445
 Blocpdb>    20 atoms in block     23
 Block first atom:    465
 Blocpdb>    22 atoms in block     24
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    22 atoms in block     25
 Block first atom:    507
 Blocpdb>    22 atoms in block     26
 Block first atom:    529
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    551
 Blocpdb>    20 atoms in block     28
 Block first atom:    571
 Blocpdb>    22 atoms in block     29
 Block first atom:    591
 Blocpdb>    22 atoms in block     30
 Block first atom:    613
 Blocpdb>    22 atoms in block     31
 Block first atom:    635
 Blocpdb>    22 atoms in block     32
 Block first atom:    657
 Blocpdb>    20 atoms in block     33
 Block first atom:    679
 Blocpdb>    20 atoms in block     34
 Block first atom:    699
 Blocpdb>    20 atoms in block     35
 Block first atom:    719
 Blocpdb>    22 atoms in block     36
 Block first atom:    739
 Blocpdb>    22 atoms in block     37
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    783
 Blocpdb>    22 atoms in block     39
 Block first atom:    806
 Blocpdb>    20 atoms in block     40
 Block first atom:    828
 Blocpdb>    20 atoms in block     41
 Block first atom:    848
 Blocpdb>    22 atoms in block     42
 Block first atom:    867

 Blocpdb>    42 blocks.

 Blocpdb> At most,     23 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    20 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       244639 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2667

 Prepmat> Matrix trace    =     531840.0000
 Prepmat> Last element read:    2667   2667       105.1674
 Prepmat>          904 lines saved.
 Prepmat>          706 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   889
 RTB> Total mass =         889.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   889
 RTB> Number of blocks =    42
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =   36254.0655
 RTB>      6462 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      252
 Diagstd> Nb of non-zero elements:     6462
 Diagstd> Projected matrix trace =   36254.0655

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    252 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues =  36254.0655
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0435140      0.0871847      0.1417709      0.2037533
      0.3303986      0.5986262      0.6499694      1.0685971      1.4475785
      1.5841265      2.1416304      2.9005611      3.8757192      4.2831702
      4.9839453      5.8358412      7.0761199      7.2938012      8.2720494
      9.6230552     10.6217128     11.0369427     11.8807031     12.7404177
     14.8847147     15.5638703     17.5224806     17.7894830     18.9422002
     19.2892613     19.5352514     20.5905793     21.3764527     22.1405088
     22.7505553     23.2017620     23.5273775     25.7522316     26.8971690
     27.2848516     28.4351281     29.5491594     30.1364800     32.7436473
     33.3450931     33.8497694     34.3949290     36.0479692     36.8841270
     38.5371867     40.1996711     41.6521115     42.4340109     43.3235046
     44.2006958     45.0713374     47.0200511     47.9922320     48.9177555
     49.5307663     49.7260122     51.1109801     52.4024486     53.0211540
     53.5798291     55.6000382     56.6518058     57.7773861     58.6809791
     59.7820907     61.4750726     61.9875806     63.0475136     65.1968311
     67.6725354     69.0187629     70.2076099     71.4448606     73.2150334
     74.5665261     75.4769171     76.4878064     79.1261831     79.6906412
     80.6200459     82.5884410     84.8719767     86.6458513     87.8152650
     90.2222247     91.2298525     92.0809479     94.0626238     95.9474404
     97.6290678     98.0587368     99.4774463    100.3755014    104.0620182
    104.8818945

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034328      0.0034337      0.0034338      0.0034339      0.0034340
      0.0034341     22.6521712     32.0638237     40.8873417     49.0170977
     62.4186504     84.0181572     87.5470913    112.2541188    130.6520823
    136.6753565    158.9159689    184.9423140    213.7821474    224.7387422
    242.4275163    262.3294285    288.8636347    293.2731075    312.3214698
    336.8618030    353.9097746    360.7610757    374.2970044    387.6029856
    418.9532247    428.4045564    454.5619444    458.0120913    472.6182534
    476.9282841    479.9597104    492.7533245    502.0686441    510.9625593
    517.9541075    523.0651239    526.7227069    551.0648558    563.1817413
    567.2259327    579.0590789    590.2932893    596.1307751    621.3821982
    627.0631029    631.7905675    636.8578241    651.9821140    659.5003568
    674.1170064    688.5040993    700.8317866    707.3792594    714.7547836
    721.9545093    729.0301723    744.6236551    752.2821456    759.5013347
    764.2453479    765.7501605    776.3407534    786.0878259    790.7148011
    794.8697004    809.7161942    817.3388818    825.4185512    831.8479605
    839.6162391    851.4218779    854.9635967    862.2421763    876.8161168
    893.3085777    902.1502332    909.8868208    917.8691579    929.1704995
    937.7071674    943.4140866    949.7108138    965.9516501    969.3909051
    975.0273565    986.8585641   1000.4086514   1010.8091550   1017.6074746
   1031.4591817   1037.2030058   1042.0298762   1053.1829624   1063.6824091
   1072.9632606   1075.3217435   1083.0726626   1087.9505203   1107.7490912
   1112.1043566

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    889
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     42

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9930E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9995E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.3514E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  8.7185E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1418    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2038    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3304    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5986    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6500    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.069    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.448    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.584    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.142    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.901    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.876    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.283    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.984    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.836    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.076    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.294    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.272    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.623    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.9    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    252 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996
 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001
 0.99998 0.99998 0.99995 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00003
 1.00004 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998
 0.99998 0.99996 1.00006 1.00002 1.00002
 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997
 0.99997 1.00000 1.00004 0.99998 1.00002
 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00003 0.99997 1.00001 1.00005 1.00002
 0.99997 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003
 0.99998 0.99998 0.99999 0.99995 1.00002
 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00003

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    16002 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996
 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001
 0.99998 0.99998 0.99995 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00003
 1.00004 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998
 0.99998 0.99996 1.00006 1.00002 1.00002
 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997
 0.99997 1.00000 1.00004 0.99998 1.00002
 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00003 0.99997 1.00001 1.00005 1.00002
 0.99997 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003
 0.99998 0.99998 0.99999 0.99995 1.00002
 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00003

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601131708162167723.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601131708162167723.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601131708162167723.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601131708162167723.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     42
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     42
            Number of atoms found    =    889
            Mean number per residue  =     21.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9930E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9995E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.3514E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  8.7185E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1418    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2038    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3304    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5986    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6500    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.069    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.448    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.584    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.142    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.901    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.876    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.283    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.984    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.836    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.076    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.294    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.272    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.623    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.9    

 Bfactors>  106 vectors,   2667 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.043514
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn>     0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601131708162167723.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601131708162167723.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4326E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   22.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   32.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   40.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   49.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   62.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   84.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   87.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   112.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   130.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   136.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   158.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   184.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   213.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   224.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   242.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   262.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   288.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   293.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   312.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   336.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   353.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   360.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   374.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   387.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   418.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   428.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   454.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   458.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   472.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   476.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   480.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   492.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   502.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   510.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   517.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   523.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   526.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   551.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   563.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   567.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   579.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   590.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   596.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   621.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   627.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   631.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   636.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   652.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   659.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   688.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   700.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   707.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   714.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   729.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   744.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   752.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   759.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   764.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   776.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   786.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   790.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   794.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   809.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   825.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   851.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   854.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   862.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   902.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   909.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   917.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   929.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   937.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   943.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   949.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   965.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   969.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   975.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   986.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1000.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1011.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1018.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1031.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1037.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1042.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1053.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1064.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1073.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1075.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1083.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1088.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1108.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1112.    

 Chkmod>  106 vectors,   2667 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    889 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    13 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    33 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.6591
      0.0034      0.6615
      0.0034      0.7605
      0.0034      0.9832
      0.0034      0.9356
      0.0034      0.5391
     22.6512      0.6006
     32.0625      0.5835
     40.8898      0.6547
     49.0206      0.4658
     62.4161      0.5481
     84.0127      0.5907
     87.5454      0.5789
    112.2705      0.6041
    130.6655      0.6041
    136.6640      0.5490
    158.9229      0.4592
    184.9484      0.4985
    213.7807      0.4839
    224.7246      0.6871
    242.4184      0.7130
    262.3217      0.6288
    288.8488      0.4543
    293.2645      0.6823
    312.3071      0.4349
    336.8464      0.5710
    353.8660      0.5225
    360.7956      0.4598
    374.2699      0.6396
    387.5800      0.6712
    418.8689      0.6015
    428.3329      0.5538
    454.5103      0.3902
    457.9991      0.5262
    472.5705      0.5516
    476.9169      0.4306
    479.9974      0.4031
    492.7252      0.5341
    502.0887      0.4844
    510.9348      0.3836
    517.9256      0.5816
    523.0228      0.5777
    526.7294      0.5107
    551.0173      0.6373
    563.1872      0.4451
    567.1512      0.3276
    579.0838      0.5591
    590.2763      0.6328
    596.1400      0.4662
    621.3209      0.5135
    627.0823      0.4319
    631.7656      0.5971
    636.7849      0.5569
    651.9725      0.5768
    659.4352      0.5410
    674.1127      0.6247
    688.4774      0.4127
    700.7839      0.6175
    707.3155      0.5634
    714.6952      0.6623
    721.9178      0.6582
    728.9881      0.5663
    744.5913      0.6166
    752.2324      0.5800
    759.4862      0.4429
    764.2066      0.4127
    765.7480      0.4278
    776.3000      0.5642
    786.0357      0.5517
    790.6723      0.4482
    794.8368      0.6142
    809.6812      0.4876
    817.2908      0.3081
    825.4018      0.6548
    831.8053      0.4550
    839.5655      0.5085
    851.4194      0.6463
    854.9436      0.6410
    862.2222      0.5373
    876.7998      0.5819
    893.2535      0.6031
    902.1196      0.5876
    909.8632      0.7081
    917.7985      0.5495
    929.1621      0.6305
    937.6888      0.4121
    943.3929      0.5375
    949.6837      0.5865
    965.9335      0.6404
    969.3454      0.4431
    974.9852      0.5784
    986.8255      0.5532
   1000.3541      0.5993
   1010.7900      0.6186
   1017.5912      0.5478
   1031.4022      0.5960
   1037.1593      0.6274
   1041.9798      0.3452
   1053.1231      0.5388
   1063.6509      0.5301
   1072.9223      0.5745
   1075.2825      0.5623
   1083.0401      0.6412
   1088.0366      0.5478
   1107.9037      0.4771
   1112.1526      0.5845
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131708162167723 7 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131708162167723 8 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131708162167723 9 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131708162167723 10 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131708162167723 11 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131708162167723.eigenfacs
2601131708162167723.atom
2601131708162167723.10.pdb
2601131708162167723.11.pdb
2601131708162167723.7.pdb
2601131708162167723.8.pdb
2601131708162167723.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m0.733s
user	0m0.709s
sys	0m0.024s
rm: cannot remove '2601131708162167723.sdijf': No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been hacked on november 27th. It has been moved away and runs again. **Still some additional cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** d42bis ***

LOGs for ID: 2601131708162167723

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* d42bis *
