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elNémo has been hacked on november 27th.
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* b45bis *

LOGs for ID: 2601131710002169610

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601131710002169610.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601131710002169610.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601131710002169610.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     45
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     45
            Number of atoms found    =    955
            Mean number per residue  =     21.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     0.345475 +/-    12.789719 From:   -22.252000 To:    29.417000
 =    -0.922253 +/-    11.228052 From:   -18.245000 To:    24.165000
 =    -1.700913 +/-    14.244360 From:   -32.393000 To:    24.263000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'C   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A   ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........

%Pdbmat-W>     45 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.7423 % Filled.
 Pdbmat>       276807  non-zero elements.
 Pdbmat>        30123 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     63.08 +/-     18.17
         Maximum number =    105
         Minimum number =     22

 Pdbmat> Matrix trace   =  602460.    
 Pdbmat> Larger element =  444.699    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
45 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601131710002169610.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601131710002169610.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601131710002169610.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   955 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    45 residues.
 Blocpdb>    21 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     22
 Blocpdb>    20 atoms in block      3
 Block first atom:     42
 Blocpdb>    22 atoms in block      4
 Block first atom:     62
 Blocpdb>    22 atoms in block      5
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    20 atoms in block      6
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    22 atoms in block      7
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    23 atoms in block      8
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    22 atoms in block      9
 Block first atom:    171
 Blocpdb>    23 atoms in block     10
 Block first atom:    193
 Blocpdb>    22 atoms in block     11
 Block first atom:    216
 Blocpdb>    22 atoms in block     12
 Block first atom:    238
 Blocpdb>    20 atoms in block     13
 Block first atom:    260
 Blocpdb>    22 atoms in block     14
 Block first atom:    280
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    302
 Blocpdb>    20 atoms in block     16
 Block first atom:    324
 Blocpdb>    20 atoms in block     17
 Block first atom:    344
 Blocpdb>    20 atoms in block     18
 Block first atom:    364
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    384
 Blocpdb>    22 atoms in block     20
 Block first atom:    406
 Blocpdb>    22 atoms in block     21
 Block first atom:    428
 Blocpdb>    20 atoms in block     22
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    20 atoms in block     23
 Block first atom:    470
 Blocpdb>    23 atoms in block     24
 Block first atom:    490
 Blocpdb>    22 atoms in block     25
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    20 atoms in block     26
 Block first atom:    535
 Blocpdb>    22 atoms in block     27
 Block first atom:    555
 Blocpdb>    22 atoms in block     28
 Block first atom:    577
 Blocpdb>    20 atoms in block     29
 Block first atom:    599
 Blocpdb>    20 atoms in block     30
 Block first atom:    619
 Blocpdb>    20 atoms in block     31
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    22 atoms in block     32
 Block first atom:    659
 Blocpdb>    22 atoms in block     33
 Block first atom:    681
 Blocpdb>    22 atoms in block     34
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    20 atoms in block     35
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    20 atoms in block     36
 Block first atom:    745
 Blocpdb>    20 atoms in block     37
 Block first atom:    765
 Blocpdb>    20 atoms in block     38
 Block first atom:    785
 Blocpdb>    22 atoms in block     39
 Block first atom:    805
 Blocpdb>    22 atoms in block     40
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    23 atoms in block     41
 Block first atom:    849
 Blocpdb>    22 atoms in block     42
 Block first atom:    872
 Blocpdb>    20 atoms in block     43
 Block first atom:    894
 Blocpdb>    20 atoms in block     44
 Block first atom:    914
 Blocpdb>    22 atoms in block     45
 Block first atom:    933

 Blocpdb>    45 blocks.

 Blocpdb> At most,     23 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    20 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       276852 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2865

 Prepmat> Matrix trace    =     602460.0000
 Prepmat> Last element read:    2865   2865       140.1782
 Prepmat>         1036 lines saved.
 Prepmat>          825 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   955
 RTB> Total mass =         955.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   955
 RTB> Number of blocks =    45
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =   41455.2754
 RTB>      6885 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      270
 Diagstd> Nb of non-zero elements:     6885
 Diagstd> Projected matrix trace =   41455.2754

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    270 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues =  41455.2754
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0415826      0.0698250      0.1084547      0.2437800
      0.3047805      0.4540065      0.7848017      0.8945642      1.1817112
      1.3995288      1.6809767      2.1427960      2.5943455      3.4449028
      3.8634328      4.5104806      5.3015077      6.9064462      7.1639043
      8.6271221      8.8778565     11.4096021     11.5798475     13.4554225
     14.6156237     16.0278318     16.2103718     17.4100510     18.8354472
     19.3622459     19.6072286     20.0729523     20.8067234     21.5854128
     22.2266343     23.0474616     23.8789750     24.9066014     26.0316063
     26.5120352     27.6779148     28.5405849     29.0535362     31.2362248
     32.1332460     32.6654058     33.0989408     34.7399098     36.5393999
     37.1310259     37.8253440     39.2836520     40.5459824     43.5075473
     43.6541455     43.8434031     44.2177837     47.3613801     48.2859512
     48.5739399     49.4411814     50.6119493     52.0477648     52.3226741
     53.0546503     54.5496879     55.0106707     56.8387091     57.6368369
     58.6220122     60.4906064     61.3368285     61.5451692     63.9957049
     66.2800607     66.4870671     67.9836304     69.3678539     69.7431988
     71.7094789     73.9578543     74.8313781     75.8922092     78.5779313
     79.1664229     80.3896947     81.8486110     83.3085002     84.7784104
     86.0430806     87.4924749     88.8536520     89.9230943     91.5045014
     93.6768246     94.6174724     95.5911891     97.0638841     98.9875221
    100.4805664

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034328      0.0034337      0.0034338      0.0034339      0.0034339
      0.0034340     22.1437450     28.6946313     35.7618089     53.6159886
     59.9499607     73.1688627     96.2000389    102.7072371    118.0459152
    128.4654094    140.7913996    158.9592092    174.9078053    201.5504488
    213.4430211    230.6251632    250.0316446    285.3793841    290.6498942
    318.9541464    323.5559126    366.8010160    369.5274463    398.3308558
    415.1489629    434.7430703    437.2116923    453.1012933    471.2845997
    477.8297057    480.8430980    486.5202332    495.3328451    504.5165993
    511.9554049    521.3229336    530.6438327    541.9416325    554.0459238
    559.1351748    571.2970271    580.1318573    585.3219082    606.9103585
    615.5631027    620.6393528    624.7443372    640.0436945    656.4112047
    661.7039916    667.8619845    680.6145167    691.4633944    716.2713507
    717.4770704    719.0306587    722.0940486    747.3214624    754.5806705
    756.8275730    763.5539007    772.5414892    783.4230081    785.4892505
    790.9645299    802.0314812    805.4132132    818.6860367    824.4139839
    831.4299046    844.5769982    850.4640074    851.9071539    868.7017450
    884.0701539    885.4496447    895.3595222    904.4288549    906.8724559
    919.5673939    933.8721662    939.3710070    946.0059714    962.5993761
    966.1972373    973.6334136    982.4284644    991.1512621    999.8570541
   1007.2870619   1015.7354992   1023.6062323   1029.7478684   1038.7630906
   1051.0209207   1056.2846080   1061.7058547   1069.8530108   1080.4023164
   1088.5197609

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    955
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     45

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9933E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.1583E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  6.9825E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.03    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.51    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.05    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.67    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.10    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.54    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.5    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    270 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 0.99998 1.00000 0.99995 1.00002
 0.99997 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 0.99996
 0.99994 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00002 0.99995 0.99997
 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997
 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 1.00003
 0.99998 1.00004 0.99995 0.99995 1.00000
 1.00001 0.99995 1.00000 0.99999 0.99997
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99996
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99997
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    17190 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 0.99998 1.00000 0.99995 1.00002
 0.99997 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 0.99996
 0.99994 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00002 0.99995 0.99997
 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997
 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 1.00003
 0.99998 1.00004 0.99995 0.99995 1.00000
 1.00001 0.99995 1.00000 0.99999 0.99997
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99996
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99997
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601131710002169610.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601131710002169610.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601131710002169610.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601131710002169610.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     45
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     45
            Number of atoms found    =    955
            Mean number per residue  =     21.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9933E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.1583E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  6.9825E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1085    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2438    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3048    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4540    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7848    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8946    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.182    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.400    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.681    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.143    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.594    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.445    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.863    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.510    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.302    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.906    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.164    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.627    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.878    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.5    

 Bfactors>  106 vectors,   2865 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.041583
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn>     0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601131710002169610.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601131710002169610.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   22.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   28.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   35.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   53.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   59.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   73.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   96.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   102.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   118.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   128.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   140.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   159.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   174.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   201.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   213.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   230.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   250.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   285.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   290.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   318.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   323.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   366.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   369.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   398.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   415.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   434.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   437.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   453.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   471.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   477.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   480.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   486.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   495.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   504.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   512.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   521.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   530.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   542.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   554.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   571.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   580.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   585.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   606.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   615.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   620.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   640.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   656.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   661.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   667.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   680.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   691.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   719.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   722.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   756.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   763.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   772.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   783.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   785.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   790.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   802.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   805.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   850.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   851.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   884.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   885.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   895.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   904.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   906.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   939.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   946.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   962.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   966.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   973.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   982.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   991.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   999.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1007.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1016.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1024.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1030.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1039.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1051.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1056.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1062.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1070.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1080.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1089.    

 Chkmod>  106 vectors,   2865 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    955 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     4 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    16 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    44 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    73 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    74 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.5993
      0.0034      0.9238
      0.0034      0.8475
      0.0034      0.8406
      0.0034      0.9464
      0.0034      0.7282
     22.1429      0.5582
     28.6934      0.7146
     35.7677      0.7117
     53.6159      0.6902
     59.9493      0.6521
     73.1652      0.5191
     96.1958      0.5699
    102.7049      0.5812
    118.0553      0.5980
    128.4815      0.6358
    140.7863      0.6601
    158.9600      0.5148
    174.8886      0.6087
    201.5446      0.3868
    213.4219      0.6606
    230.6030      0.6246
    250.0325      0.5491
    285.3579      0.6363
    290.6394      0.5687
    318.9382      0.5445
    323.5446      0.5733
    366.7917      0.6058
    369.5140      0.5544
    398.3815      0.4824
    415.1933      0.5566
    434.7538      0.6428
    437.1879      0.1560
    453.0812      0.5632
    471.3213      0.5641
    477.7815      0.5673
    480.8564      0.4817
    486.4636      0.5909
    495.3506      0.5267
    504.5485      0.5747
    511.9722      0.5256
    521.3293      0.4684
    530.6324      0.6112
    541.9553      0.5541
    554.0050      0.4375
    559.0897      0.5973
    571.2940      0.3925
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    624.7275      0.5001
    640.0171      0.6234
    656.3884      0.6032
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    754.5799      0.5624
    756.7644      0.5853
    763.5120      0.6409
    772.4934      0.5514
    783.4062      0.5033
    785.4355      0.3562
    790.8959      0.4872
    801.9993      0.5828
    805.3737      0.2958
    818.6602      0.4607
    824.4012      0.4734
    831.3799      0.5970
    844.5365      0.6477
    850.4495      0.5226
    851.9040      0.6143
    868.6936      0.5326
    884.0318      0.3363
    885.4312      0.4792
    895.2972      0.4602
    904.4040      0.4416
    906.8127      0.5880
    919.5313      0.4720
    933.8456      0.4506
    939.3220      0.5715
    945.9516      0.5191
    962.5707      0.4426
    966.1776      0.6648
    973.5935      0.4914
    982.3946      0.6613
    991.1176      0.6651
    999.8235      0.5484
   1007.2258      0.5377
   1015.6775      0.5757
   1023.5413      0.5845
   1029.6859      0.1674
   1038.6929      0.6009
   1050.9936      0.4881
   1056.2534      0.5337
   1061.6537      0.6310
   1069.7857      0.5660
   1080.3695      0.6206
   1088.5783      0.6095
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131710002169610 7 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601131710002169610 8 -150 150 10 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-150
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
2601131710002169610.eigenfacs
2601131710002169610.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2601131710002169610.eigenfacs
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getting mode 9
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m0.900s
user	0m0.870s
sys	0m0.029s
rm: cannot remove '2601131710002169610.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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