CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  PTHR  ***

LOGs for ID: 2601161635352676734

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601161635352676734.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601161635352676734.atom to be opened. Openam> File opened: 2601161635352676734.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 359 First residue number = 30 Last residue number = 36 Number of atoms found = 5649 Mean number per residue = 15.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.981146 +/- 15.289668 From: -40.842000 To: 31.068000 = 29.847513 +/- 15.461132 From: -2.468000 To: 70.284000 = 17.924303 +/- 9.317326 From: -1.813000 To: 40.128000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5786 % Filled. Pdbmat> 3703028 non-zero elements. Pdbmat> 407741 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 144.36 +/- 41.75 Maximum number = 232 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 8.154820E+06 Pdbmat> Larger element = 842.086 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 359 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601161635352676734.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601161635352676734.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601161635352676734.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5649 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 359 residues. Blocpdb> 27 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 31 atoms in block 2 Block first atom: 28 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 59 Blocpdb> 32 atoms in block 4 Block first atom: 96 Blocpdb> 39 atoms in block 5 Block first atom: 128 Blocpdb> 38 atoms in block 6 Block first atom: 167 Blocpdb> 41 atoms in block 7 Block first atom: 205 Blocpdb> 27 atoms in block 8 Block first atom: 246 Blocpdb> 27 atoms in block 9 Block first atom: 273 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 300 Blocpdb> 46 atoms in block 11 Block first atom: 325 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 371 Blocpdb> 31 atoms in block 13 Block first atom: 397 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 428 Blocpdb> 21 atoms in block 15 Block first atom: 454 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 475 Blocpdb> 38 atoms in block 17 Block first atom: 492 Blocpdb> 29 atoms in block 18 Block first atom: 530 Blocpdb> 29 atoms in block 19 Block first atom: 559 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 588 Blocpdb> 35 atoms in block 21 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 22 Block first atom: 659 Blocpdb> 38 atoms in block 23 Block first atom: 687 Blocpdb> 26 atoms in block 24 Block first atom: 725 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 751 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 775 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 797 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 829 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 855 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 879 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 905 Blocpdb> 33 atoms in block 32 Block first atom: 945 Blocpdb> 34 atoms in block 33 Block first atom: 978 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 1012 Blocpdb> 24 atoms in block 35 Block first atom: 1036 Blocpdb> 31 atoms in block 36 Block first atom: 1060 Blocpdb> 48 atoms in block 37 Block first atom: 1091 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 1139 Blocpdb> 38 atoms in block 39 Block first atom: 1161 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 1199 Blocpdb> 39 atoms in block 41 Block first atom: 1217 Blocpdb> 35 atoms in block 42 Block first atom: 1256 Blocpdb> 21 atoms in block 43 Block first atom: 1291 Blocpdb> 31 atoms in block 44 Block first atom: 1312 Blocpdb> 38 atoms in block 45 Block first atom: 1343 Blocpdb> 34 atoms in block 46 Block first atom: 1381 Blocpdb> 35 atoms in block 47 Block first atom: 1415 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1450 Blocpdb> 26 atoms in block 49 Block first atom: 1476 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 1502 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 1544 Blocpdb> 27 atoms in block 52 Block first atom: 1564 Blocpdb> 31 atoms in block 53 Block first atom: 1591 Blocpdb> 48 atoms in block 54 Block first atom: 1622 Blocpdb> 44 atoms in block 55 Block first atom: 1670 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 1714 Blocpdb> 34 atoms in block 57 Block first atom: 1734 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 1768 Blocpdb> 25 atoms in block 59 Block first atom: 1787 Blocpdb> 31 atoms in block 60 Block first atom: 1812 Blocpdb> 25 atoms in block 61 Block first atom: 1843 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1875 Blocpdb> 29 atoms in block 64 Block first atom: 1897 Blocpdb> 37 atoms in block 65 Block first atom: 1926 Blocpdb> 32 atoms in block 66 Block first atom: 1963 Blocpdb> 39 atoms in block 67 Block first atom: 1995 Blocpdb> 38 atoms in block 68 Block first atom: 2034 Blocpdb> 41 atoms in block 69 Block first atom: 2072 Blocpdb> 27 atoms in block 70 Block first atom: 2113 Blocpdb> 27 atoms in block 71 Block first atom: 2140 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 2167 Blocpdb> 31 atoms in block 73 Block first atom: 2192 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 2223 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2249 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 2280 Blocpdb> 38 atoms in block 77 Block first atom: 2316 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 2354 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2371 Blocpdb> 29 atoms in block 80 Block first atom: 2409 Blocpdb> 29 atoms in block 81 Block first atom: 2438 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 2467 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 2503 Blocpdb> 29 atoms in block 84 Block first atom: 2539 Blocpdb> 38 atoms in block 85 Block first atom: 2568 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 2606 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2632 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2656 Blocpdb> 32 atoms in block 89 Block first atom: 2678 Blocpdb> 26 atoms in block 90 Block first atom: 2710 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 2736 Blocpdb> 26 atoms in block 92 Block first atom: 2760 Blocpdb> 40 atoms in block 93 Block first atom: 2786 Blocpdb> 33 atoms in block 94 Block first atom: 2826 Blocpdb> 34 atoms in block 95 Block first atom: 2859 Blocpdb> 39 atoms in block 96 Block first atom: 2893 Blocpdb> 24 atoms in block 97 Block first atom: 2932 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 2956 Blocpdb> 48 atoms in block 99 Block first atom: 2987 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 3035 Blocpdb> 38 atoms in block 101 Block first atom: 3057 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 3095 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 3113 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 3152 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 3187 Blocpdb> 31 atoms in block 106 Block first atom: 3208 Blocpdb> 38 atoms in block 107 Block first atom: 3239 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 3277 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 3311 Blocpdb> 26 atoms in block 110 Block first atom: 3346 Blocpdb> 26 atoms in block 111 Block first atom: 3372 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 3398 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 3425 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 3445 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 3468 Blocpdb> 46 atoms in block 116 Block first atom: 3499 Blocpdb> 44 atoms in block 117 Block first atom: 3545 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 3589 Blocpdb> 34 atoms in block 119 Block first atom: 3609 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 3643 Blocpdb> 25 atoms in block 121 Block first atom: 3662 Blocpdb> 31 atoms in block 122 Block first atom: 3687 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 3718 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 3743 Blocpdb> 22 atoms in block 125 Block first atom: 3750 Blocpdb> 31 atoms in block 126 Block first atom: 3772 Blocpdb> 37 atoms in block 127 Block first atom: 3803 Blocpdb> 32 atoms in block 128 Block first atom: 3840 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 3872 Blocpdb> 38 atoms in block 130 Block first atom: 3911 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 3949 Blocpdb> 27 atoms in block 132 Block first atom: 3990 Blocpdb> 27 atoms in block 133 Block first atom: 4017 Blocpdb> 25 atoms in block 134 Block first atom: 4044 Blocpdb> 46 atoms in block 135 Block first atom: 4069 Blocpdb> 41 atoms in block 136 Block first atom: 4115 Blocpdb> 31 atoms in block 137 Block first atom: 4156 Blocpdb> 36 atoms in block 138 Block first atom: 4187 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 4223 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 4244 Blocpdb> 38 atoms in block 141 Block first atom: 4261 Blocpdb> 29 atoms in block 142 Block first atom: 4299 Blocpdb> 29 atoms in block 143 Block first atom: 4328 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 4357 Blocpdb> 36 atoms in block 145 Block first atom: 4393 Blocpdb> 29 atoms in block 146 Block first atom: 4429 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 4458 Blocpdb> 26 atoms in block 148 Block first atom: 4496 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 4522 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 4546 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 4568 Blocpdb> 26 atoms in block 152 Block first atom: 4600 Blocpdb> 24 atoms in block 153 Block first atom: 4626 Blocpdb> 26 atoms in block 154 Block first atom: 4650 Blocpdb> 40 atoms in block 155 Block first atom: 4676 Blocpdb> 33 atoms in block 156 Block first atom: 4716 Blocpdb> 34 atoms in block 157 Block first atom: 4749 Blocpdb> 39 atoms in block 158 Block first atom: 4783 Blocpdb> 24 atoms in block 159 Block first atom: 4822 Blocpdb> 31 atoms in block 160 Block first atom: 4846 Blocpdb> 48 atoms in block 161 Block first atom: 4877 Blocpdb> 22 atoms in block 162 Block first atom: 4925 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 4947 Blocpdb> 18 atoms in block 164 Block first atom: 4985 Blocpdb> 39 atoms in block 165 Block first atom: 5003 Blocpdb> 35 atoms in block 166 Block first atom: 5042 Blocpdb> 21 atoms in block 167 Block first atom: 5077 Blocpdb> 31 atoms in block 168 Block first atom: 5098 Blocpdb> 38 atoms in block 169 Block first atom: 5129 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 5167 Blocpdb> 35 atoms in block 171 Block first atom: 5201 Blocpdb> 26 atoms in block 172 Block first atom: 5236 Blocpdb> 26 atoms in block 173 Block first atom: 5262 Blocpdb> 42 atoms in block 174 Block first atom: 5288 Blocpdb> 20 atoms in block 175 Block first atom: 5330 Blocpdb> 28 atoms in block 176 Block first atom: 5350 Blocpdb> 43 atoms in block 177 Block first atom: 5378 Blocpdb> 48 atoms in block 178 Block first atom: 5421 Blocpdb> 40 atoms in block 179 Block first atom: 5469 Blocpdb> 34 atoms in block 180 Block first atom: 5509 Blocpdb> 19 atoms in block 181 Block first atom: 5543 Blocpdb> 25 atoms in block 182 Block first atom: 5562 Blocpdb> 31 atoms in block 183 Block first atom: 5587 Blocpdb> 25 atoms in block 184 Block first atom: 5618 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 5642 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3703213 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16947 Prepmat> Matrix trace = 8154820.0000 Prepmat> Last element read: 16947 16947 179.1065 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15276 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5649 RTB> Total mass = 5649.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5649 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 434442.8922 RTB> 66669 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66669 Diagstd> Projected matrix trace = 434442.8922 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 434442.8922 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0233515 2.3570996 2.5638399 2.7261994 2.7667757 4.5946549 6.0697537 7.6661405 8.0268982 10.8243641 10.9214143 13.4744541 14.2822823 15.1910428 15.5944881 16.4520789 17.0410452 20.1502129 20.5013299 21.6040425 23.4785645 24.5406471 24.6597575 25.0229191 26.6186738 26.8171020 27.7239436 28.4081253 29.5664458 30.4028230 30.7697710 31.5146739 31.9155019 32.8361475 34.3697337 35.3817707 35.9120694 36.6757396 37.7409228 39.4310853 39.9610061 40.9537733 41.5067317 43.5524701 44.7937204 45.2032380 46.4258410 46.9971995 47.9191563 49.5191828 50.0969524 51.5894181 52.0335633 52.2637391 54.7284393 54.8198706 56.9440764 58.2161805 59.0819417 59.6715730 60.2574148 62.3206918 63.4593157 64.4903504 66.6941844 67.2418322 67.8291946 68.9109592 70.2322578 70.6173694 71.3538243 72.1276027 73.1323276 73.9088088 75.2069208 75.4108597 76.2274821 77.9464423 78.4734335 80.2031492 80.8263828 82.8295833 84.1933609 84.8440420 85.8494670 86.5188076 87.7836227 88.1263805 89.8305159 90.4770087 91.2781301 91.7133855 92.1199179 93.3230368 93.9693085 94.5444233 95.1787094 97.2283735 97.3705276 98.3083257 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034311 0.0034321 0.0034331 0.0034331 0.0034333 0.0034360 154.4653037 166.7186752 173.8764368 179.2974415 180.6268276 232.7671718 267.5351278 300.6655485 307.6586699 357.2699397 358.8679893 398.6124606 410.3874641 423.2423075 428.8257364 440.4591860 448.2738392 487.4556401 491.6842504 504.7342687 526.1760182 537.9455085 539.2494125 543.2056347 560.2585425 562.3428816 571.7718682 578.7840675 590.4659253 598.7592503 602.3617855 609.6094475 613.4739413 622.2592760 636.6245233 645.9294149 650.7519769 657.6346999 667.1162780 681.8905094 686.4572361 694.9318892 699.6076495 716.6410409 726.7814724 730.0961411 739.9036510 744.4426906 751.7091934 764.1559773 768.6009793 779.9658624 783.3161198 785.0467478 803.3444763 804.0152449 819.4445229 828.5469718 834.6850985 838.8397914 842.9475021 857.2577363 865.0535097 872.0525346 886.8277276 890.4613003 894.3419666 901.4454016 910.0465244 912.5381884 917.2841886 922.2444048 928.6455419 933.5624638 941.7251827 943.0011582 948.0932782 958.7236244 961.9591008 972.5030920 976.2742889 988.2982319 996.4011121 1000.2440010 1006.1531283 1010.0678382 1017.4241218 1019.4084913 1029.2176546 1032.9145548 1037.4774060 1039.9480452 1042.2503543 1049.0343561 1052.6604248 1055.8767785 1059.4127273 1070.7591407 1071.5416143 1076.6893818 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5649 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9831E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.023 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.31 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 0.99996 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 101682 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 0.99996 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601161635352676734.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601161635352676734.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601161635352676734.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601161635352676734.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 359 First residue number = 30 Last residue number = 36 Number of atoms found = 5649 Mean number per residue = 15.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9831E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.023 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.31 Bfactors> 106 vectors, 16947 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.023000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.537 for 359 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.013 +/- 0.01 Bfactors> = 54.431 +/- 19.15 Bfactors> Shiftng-fct= 54.418 Bfactors> Scaling-fct= 1347.068 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601161635352676734.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601161635352676734.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077. Chkmod> 106 vectors, 16947 coordinates in file. Chkmod> That is: 5649 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8969 0.0034 0.7167 0.0034 0.7471 0.0034 0.6909 0.0034 0.8802 0.0034 0.8940 154.4453 0.2982 166.7080 0.3947 173.8744 0.6225 179.2832 0.6134 180.6264 0.5744 232.7659 0.3960 267.5291 0.5982 300.6499 0.3946 307.6474 0.4471 357.1826 0.6659 358.8293 0.6491 398.5295 0.5716 410.3371 0.4593 423.2096 0.5582 428.7456 0.6232 440.4125 0.4530 448.2408 0.3361 487.4321 0.2977 491.6472 0.1997 504.6654 0.3408 526.1695 0.4446 537.9153 0.2557 539.2289 0.3982 543.1506 0.2378 560.2484 0.0774 562.3491 0.2651 571.7067 0.2053 578.7783 0.1286 590.4761 0.3802 598.7057 0.1543 602.3382 0.2069 609.5381 0.1372 613.4908 0.1392 622.2691 0.1857 636.5997 0.3565 645.8855 0.2593 650.7053 0.5696 657.6447 0.3879 667.0795 0.4786 681.8519 0.3203 686.4191 0.4357 694.8700 0.2111 699.6052 0.2359 716.5900 0.2171 726.7201 0.3446 730.0387 0.2753 739.9050 0.4517 744.4329 0.4263 751.6835 0.3168 764.1295 0.4505 768.5914 0.3806 779.9368 0.2175 783.2557 0.4107 784.9850 0.3809 803.3214 0.2987 803.9817 0.0948 819.3800 0.3039 828.5386 0.2816 834.6356 0.2866 838.7927 0.2468 842.9294 0.2598 857.2162 0.4470 865.0210 0.4559 872.0127 0.3778 886.7618 0.4183 890.4109 0.3811 894.3089 0.5143 901.4004 0.4381 909.9928 0.4417 912.5160 0.3852 917.2202 0.3803 922.2201 0.4126 928.5909 0.3348 933.5299 0.3354 941.7040 0.4087 942.9553 0.3844 948.0682 0.4552 958.7043 0.4002 961.8968 0.4280 972.4423 0.4163 976.2542 0.3816 988.2583 0.4562 996.3385 0.3857 1000.1772 0.4229 1006.1131 0.1904 1010.0314 0.2576 1017.3595 0.1681 1019.3857 0.2209 1029.1705 0.3037 1032.8873 0.1312 1037.4435 0.1430 1039.8842 0.3836 1042.2061 0.3805 1048.9723 0.4250 1052.6191 0.2806 1055.8068 0.3727 1059.3744 0.3662 1070.7221 0.4229 1071.4927 0.4016 1076.6523 0.4405 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2601161635352676734 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom making animated gifs 11 models are in 2601161635352676734.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2601161635352676734 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom making animated gifs 11 models are in 2601161635352676734.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2601161635352676734 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom making animated gifs 11 models are in 2601161635352676734.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2601161635352676734 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom making animated gifs 11 models are in 2601161635352676734.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2601161635352676734 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601161635352676734.eigenfacs 2601161635352676734.atom making animated gifs 11 models are in 2601161635352676734.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601161635352676734.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2601161635352676734.10.pdb 2601161635352676734.11.pdb 2601161635352676734.7.pdb 2601161635352676734.8.pdb 2601161635352676734.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m26.379s user 0m26.181s sys 0m0.186s rm: cannot remove '2601161635352676734.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.