*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2601162354032738995.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2601162354032738995.atom to be opened.
Openam> File opened: 2601162354032738995.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 105
First residue number = 3
Last residue number = 137
Number of atoms found = 841
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.121196 +/- 10.528071 From: -25.185000 To: 20.887000
= -8.237732 +/- 6.948455 From: -23.862000 To: 7.214000
= 0.625345 +/- 6.197352 From: -15.122000 To: 15.744000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.6463 % Filled.
Pdbmat> 275302 non-zero elements.
Pdbmat> 30034 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 71.42 +/- 22.42
Maximum number = 126
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 600680.
Pdbmat> Larger element = 499.711
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
105 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2601162354032738995.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2601162354032738995.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2601162354032738995.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 841 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 105 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 9 atoms in block 3
Block first atom: 16
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 25
Blocpdb> 5 atoms in block 5
Block first atom: 33
Blocpdb> 11 atoms in block 6
Block first atom: 38
Blocpdb> 5 atoms in block 7
Block first atom: 49
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 54
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 10
Block first atom: 69
Blocpdb> 5 atoms in block 11
Block first atom: 78
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 83
Blocpdb> 11 atoms in block 13
Block first atom: 94
Blocpdb> 5 atoms in block 14
Block first atom: 105
Blocpdb> 11 atoms in block 15
Block first atom: 110
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 121
Blocpdb> 9 atoms in block 17
Block first atom: 128
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 137
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 146
Blocpdb> 9 atoms in block 20
Block first atom: 154
Blocpdb> 9 atoms in block 21
Block first atom: 163
Blocpdb> 11 atoms in block 22
Block first atom: 172
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 183
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 191
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 200
Blocpdb> 9 atoms in block 26
Block first atom: 209
Blocpdb> 8 atoms in block 27
Block first atom: 218
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 226
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 235
Blocpdb> 5 atoms in block 30
Block first atom: 244
Blocpdb> 9 atoms in block 31
Block first atom: 249
Blocpdb> 5 atoms in block 32
Block first atom: 258
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 263
Blocpdb> 8 atoms in block 34
Block first atom: 271
Blocpdb> 9 atoms in block 35
Block first atom: 279
Blocpdb> 4 atoms in block 36
Block first atom: 288
Blocpdb> 7 atoms in block 37
Block first atom: 292
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 299
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 307
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 316
Blocpdb> 8 atoms in block 41
Block first atom: 324
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 332
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 341
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 350
Blocpdb> 10 atoms in block 45
Block first atom: 358
Blocpdb> 9 atoms in block 46
Block first atom: 368
Blocpdb> 9 atoms in block 47
Block first atom: 377
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 386
Blocpdb> 10 atoms in block 49
Block first atom: 394
Blocpdb> 11 atoms in block 50
Block first atom: 404
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 415
Blocpdb> 4 atoms in block 52
Block first atom: 422
Blocpdb> 5 atoms in block 53
Block first atom: 426
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 431
Blocpdb> 10 atoms in block 55
Block first atom: 439
Blocpdb> 9 atoms in block 56
Block first atom: 449
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 458
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 469
Blocpdb> 10 atoms in block 59
Block first atom: 477
Blocpdb> 9 atoms in block 60
Block first atom: 487
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 496
Blocpdb> 8 atoms in block 62
Block first atom: 504
Blocpdb> 5 atoms in block 63
Block first atom: 512
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 517
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 526
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 538
Blocpdb> 5 atoms in block 67
Block first atom: 545
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 550
Blocpdb> 8 atoms in block 69
Block first atom: 555
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 563
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 571
Blocpdb> 5 atoms in block 72
Block first atom: 582
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 587
Blocpdb> 5 atoms in block 74
Block first atom: 596
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 601
Blocpdb> 11 atoms in block 76
Block first atom: 609
Blocpdb> 9 atoms in block 77
Block first atom: 620
Blocpdb> 9 atoms in block 78
Block first atom: 629
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 638
Blocpdb> 9 atoms in block 80
Block first atom: 646
Blocpdb> 11 atoms in block 81
Block first atom: 655
Blocpdb> 5 atoms in block 82
Block first atom: 666
Blocpdb> 8 atoms in block 83
Block first atom: 671
Blocpdb> 9 atoms in block 84
Block first atom: 679
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 688
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 697
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 705
Blocpdb> 9 atoms in block 88
Block first atom: 713
Blocpdb> 11 atoms in block 89
Block first atom: 722
Blocpdb> 7 atoms in block 90
Block first atom: 733
Blocpdb> 5 atoms in block 91
Block first atom: 740
Blocpdb> 7 atoms in block 92
Block first atom: 745
Blocpdb> 8 atoms in block 93
Block first atom: 752
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 760
Blocpdb> 5 atoms in block 95
Block first atom: 768
Blocpdb> 9 atoms in block 96
Block first atom: 773
Blocpdb> 8 atoms in block 97
Block first atom: 782
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 790
Blocpdb> 5 atoms in block 99
Block first atom: 801
Blocpdb> 5 atoms in block 100
Block first atom: 806
Blocpdb> 5 atoms in block 101
Block first atom: 811
Blocpdb> 5 atoms in block 102
Block first atom: 816
Blocpdb> 8 atoms in block 103
Block first atom: 821
Blocpdb> 5 atoms in block 104
Block first atom: 829
Blocpdb> 8 atoms in block 105
Block first atom: 833
Blocpdb> 105 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 275407 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2523
Prepmat> Matrix trace = 600680.0000
Prepmat> Last element read: 2523 2523 114.2953
Prepmat> 5566 lines saved.
Prepmat> 4362 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 841
RTB> Total mass = 841.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 841
RTB> Number of blocks = 105
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 135150.9560
RTB> 41733 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 630
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41733
Diagstd> Projected matrix trace = 135150.9560
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 630 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 135150.9560
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.4990498 3.7162806 4.8540609 8.3812696
10.6228191 12.9063431 13.4926979 14.4301807 14.6885542
15.4270384 16.4257427 17.5568464 18.6526617 19.3553420
20.0003238 21.1744002 21.6450509 22.7400601 24.2090273
26.2590819 26.5897311 28.3817989 29.7599297 30.6606867
32.7265315 33.6629377 34.2253230 34.3388248 35.9301140
37.3429934 37.9665475 38.8949722 39.2461929 39.9086350
40.7357481 41.1880157 42.3757443 43.4602371 43.9366844
45.8511333 46.9655166 47.5786226 48.5979019 49.2156952
51.5482998 52.5889556 53.6721320 54.8355110 55.4864353
55.6861900 56.6886576 57.1652428 58.4764377 59.2743217
60.7291026 61.2256847 62.1777106 63.8231533 64.4213191
65.2689533 65.8754392 66.7332995 67.0717716 67.7694476
69.7190040 70.3997917 71.2900387 72.5995006 73.5264387
74.3497210 75.2712793 75.7510095 76.4146985 77.5995828
78.5237136 79.1429430 79.4714600 80.2630745 80.8580548
81.5664655 82.8339404 84.5435009 84.9765636 86.0959949
86.8602535 87.5055081 87.9435613 88.6957254 89.5484818
91.2407019 93.0173321 93.1851359 93.6137211 94.6070101
95.8090245 96.7191053 97.8524537 97.9414676 99.0598193
100.2265449
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034328 0.0034332 0.0034345 0.0034345
0.0034347 171.6653855 209.3387033 239.2477649 314.3765795
353.9282043 390.1188027 398.8822205 412.5068499 416.1834498
426.5172102 440.1065054 455.0074792 468.9922721 477.7445099
485.6392657 499.6902078 505.2130805 517.8346224 534.2984949
556.4614062 559.9538728 578.5158199 592.3947904 601.2930981
621.2197722 630.0445902 635.2856684 636.3381989 650.9154471
663.5900174 669.1074002 677.2390829 680.2899381 686.0072686
693.0796195 696.9164489 706.8934378 715.8818076 719.7951576
735.3097379 744.1917175 749.0334506 757.0142245 761.8107425
779.6549726 787.4854772 795.5540733 804.1299316 808.8885589
810.3432759 817.6046761 821.0343108 830.3969293 836.0429263
846.2403165 849.6931273 856.2737763 867.5298145 871.5856815
877.3009592 881.3675205 887.0877443 889.3345589 893.9479918
906.7151396 911.1313024 916.8741012 925.2563982 931.1444220
936.3429648 942.1280383 945.1255256 949.2568334 956.5880992
962.2672286 966.0539445 968.0568807 972.8663366 976.4655480
980.7337074 988.3242259 998.4708591 1001.0248589 1007.5967425
1012.0589887 1015.8111502 1018.3505554 1022.6961598 1027.6007060
1037.2646780 1047.3147496 1048.2590048 1050.6668611 1056.2262071
1062.9148864 1067.9512180 1074.1900874 1074.6785580 1080.7967896
1087.1429650
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 841
Rtb_to_modes> Number of blocs = 105
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.499
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.716
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.854
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.381
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 630 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
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1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
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1.00003 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 1.00005 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996
1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 1.00001
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1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
0.99995
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 15138 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
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1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
0.99996 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002
1.00003 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 1.00005 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996
1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003
0.99998 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
0.99995
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601162354032738995.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601162354032738995.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2601162354032738995.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2601162354032738995.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 105
First residue number = 3
Last residue number = 137
Number of atoms found = 841
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.716
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.854
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.381
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2
Bfactors> 106 vectors, 2523 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.499000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.550 for 105 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.043 +/- 0.04
Bfactors> = 95.252 +/- 2.41
Bfactors> Shiftng-fct= 95.208
Bfactors> Scaling-fct= 66.381
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601162354032738995.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601162354032738995.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Chkmod> 106 vectors, 2523 coordinates in file.
Chkmod> That is: 841 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 56 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 87 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7776
0.0034 0.9964
0.0034 0.7537
0.0034 0.8802
0.0034 0.7855
0.0034 0.9301
171.6563 0.6375
209.3218 0.6712
239.2360 0.6725
314.3580 0.4116
353.8660 0.4632
390.1573 0.1518
398.8252 0.3949
412.4866 0.2088
416.1861 0.2481
426.5398 0.1930
440.1446 0.2946
455.0288 0.2909
468.9387 0.3133
477.7815 0.2808
485.6145 0.3055
499.6168 0.4128
505.2491 0.1231
517.8117 0.2109
534.2863 0.1957
556.4472 0.3113
559.9327 0.2975
578.4727 0.2252
592.3701 0.2610
601.2606 0.2990
621.2260 0.3477
629.9901 0.2201
635.3018 0.3169
636.3218 0.4036
650.8865 0.3376
663.5349 0.3232
669.1091 0.3381
677.1667 0.5153
680.2937 0.3811
685.9896 0.1997
693.0860 0.2090
696.9033 0.1841
706.8986 0.3681
715.8491 0.4252
719.7914 0.3440
735.2691 0.5255
744.1953 0.4543
749.0121 0.4111
756.9981 0.4405
761.8114 0.5447
779.6344 0.2210
787.4595 0.3640
795.5041 0.6015
804.1283 0.4441
808.8798 0.3723
810.3362 0.2672
817.5793 0.3264
821.0332 0.3622
830.3866 0.4615
835.9766 0.4213
846.2102 0.3366
849.6866 0.2990
856.2528 0.3283
867.4711 0.4696
871.5393 0.3631
877.2703 0.3385
881.3602 0.3366
887.0277 0.4271
889.2846 0.3311
893.9133 0.3784
906.6827 0.3161
911.0935 0.1134
916.8345 0.3922
925.2199 0.4408
931.1270 0.3923
936.3045 0.4187
942.0796 0.2938
945.0787 0.3931
949.1869 0.3394
956.5496 0.3530
962.2032 0.3933
965.9945 0.3565
968.0064 0.4159
972.8059 0.4116
976.4354 0.4441
980.7129 0.4338
988.2583 0.3422
998.4073 0.3636
1001.0021 0.3325
1007.5769 0.2742
1012.0141 0.3603
1015.7936 0.3259
1018.2862 0.3961
1022.6769 0.4747
1027.5653 0.2237
1037.2162 0.3234
1047.2848 0.4149
1048.2414 0.4183
1050.6009 0.1869
1056.1976 0.2193
1062.8747 0.2359
1067.9103 0.2199
1074.1305 0.2892
1074.6244 0.2924
1080.7514 0.3665
1086.9523 0.2412
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601162354032738995 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601162354032738995.eigenfacs
2601162354032738995.atom
making animated gifs
11 models are in 2601162354032738995.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601162354032738995.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m2.856s
user 0m2.834s
sys 0m0.021s
rm: cannot remove '2601162354032738995.sdijf': No such file or directory
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