*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2601170008472745190.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2601170008472745190.atom to be opened.
Openam> File opened: 2601170008472745190.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 106
First residue number = 3
Last residue number = 137
Number of atoms found = 850
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.302146 +/- 10.130533 From: -25.171000 To: 20.700000
= -5.852006 +/- 7.912058 From: -23.538000 To: 14.345000
= 3.723319 +/- 5.437737 From: -11.079000 To: 15.809000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.4130 % Filled.
Pdbmat> 273634 non-zero elements.
Pdbmat> 29841 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 70.21 +/- 22.14
Maximum number = 123
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 596820.
Pdbmat> Larger element = 487.788
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
106 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2601170008472745190.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2601170008472745190.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2601170008472745190.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 850 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 106 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 9 atoms in block 3
Block first atom: 16
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 25
Blocpdb> 5 atoms in block 5
Block first atom: 33
Blocpdb> 11 atoms in block 6
Block first atom: 38
Blocpdb> 5 atoms in block 7
Block first atom: 49
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 54
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 10
Block first atom: 69
Blocpdb> 5 atoms in block 11
Block first atom: 78
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 83
Blocpdb> 11 atoms in block 13
Block first atom: 94
Blocpdb> 5 atoms in block 14
Block first atom: 105
Blocpdb> 11 atoms in block 15
Block first atom: 110
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 121
Blocpdb> 9 atoms in block 17
Block first atom: 128
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 137
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 146
Blocpdb> 9 atoms in block 20
Block first atom: 154
Blocpdb> 9 atoms in block 21
Block first atom: 163
Blocpdb> 11 atoms in block 22
Block first atom: 172
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 183
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 191
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 200
Blocpdb> 9 atoms in block 26
Block first atom: 209
Blocpdb> 8 atoms in block 27
Block first atom: 218
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 226
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 235
Blocpdb> 5 atoms in block 30
Block first atom: 244
Blocpdb> 9 atoms in block 31
Block first atom: 249
Blocpdb> 5 atoms in block 32
Block first atom: 258
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 263
Blocpdb> 8 atoms in block 34
Block first atom: 271
Blocpdb> 9 atoms in block 35
Block first atom: 279
Blocpdb> 4 atoms in block 36
Block first atom: 288
Blocpdb> 7 atoms in block 37
Block first atom: 292
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 299
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 307
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 316
Blocpdb> 8 atoms in block 41
Block first atom: 324
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 332
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 341
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 350
Blocpdb> 10 atoms in block 45
Block first atom: 358
Blocpdb> 9 atoms in block 46
Block first atom: 368
Blocpdb> 9 atoms in block 47
Block first atom: 377
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 386
Blocpdb> 10 atoms in block 49
Block first atom: 394
Blocpdb> 11 atoms in block 50
Block first atom: 404
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 415
Blocpdb> 7 atoms in block 52
Block first atom: 424
Blocpdb> 4 atoms in block 53
Block first atom: 431
Blocpdb> 5 atoms in block 54
Block first atom: 435
Blocpdb> 8 atoms in block 55
Block first atom: 440
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 448
Blocpdb> 9 atoms in block 57
Block first atom: 458
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 467
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 478
Blocpdb> 10 atoms in block 60
Block first atom: 486
Blocpdb> 9 atoms in block 61
Block first atom: 496
Blocpdb> 8 atoms in block 62
Block first atom: 505
Blocpdb> 8 atoms in block 63
Block first atom: 513
Blocpdb> 5 atoms in block 64
Block first atom: 521
Blocpdb> 9 atoms in block 65
Block first atom: 526
Blocpdb> 12 atoms in block 66
Block first atom: 535
Blocpdb> 7 atoms in block 67
Block first atom: 547
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 554
Blocpdb> 5 atoms in block 69
Block first atom: 559
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 564
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 572
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 580
Blocpdb> 5 atoms in block 73
Block first atom: 591
Blocpdb> 9 atoms in block 74
Block first atom: 596
Blocpdb> 5 atoms in block 75
Block first atom: 605
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 610
Blocpdb> 11 atoms in block 77
Block first atom: 618
Blocpdb> 9 atoms in block 78
Block first atom: 629
Blocpdb> 9 atoms in block 79
Block first atom: 638
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 647
Blocpdb> 9 atoms in block 81
Block first atom: 655
Blocpdb> 11 atoms in block 82
Block first atom: 664
Blocpdb> 5 atoms in block 83
Block first atom: 675
Blocpdb> 8 atoms in block 84
Block first atom: 680
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 688
Blocpdb> 9 atoms in block 86
Block first atom: 697
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 706
Blocpdb> 8 atoms in block 88
Block first atom: 714
Blocpdb> 9 atoms in block 89
Block first atom: 722
Blocpdb> 11 atoms in block 90
Block first atom: 731
Blocpdb> 7 atoms in block 91
Block first atom: 742
Blocpdb> 5 atoms in block 92
Block first atom: 749
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 754
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 761
Blocpdb> 8 atoms in block 95
Block first atom: 769
Blocpdb> 5 atoms in block 96
Block first atom: 777
Blocpdb> 9 atoms in block 97
Block first atom: 782
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 791
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 799
Blocpdb> 5 atoms in block 100
Block first atom: 810
Blocpdb> 5 atoms in block 101
Block first atom: 815
Blocpdb> 5 atoms in block 102
Block first atom: 820
Blocpdb> 5 atoms in block 103
Block first atom: 825
Blocpdb> 8 atoms in block 104
Block first atom: 830
Blocpdb> 5 atoms in block 105
Block first atom: 838
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 842
Blocpdb> 106 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 273740 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2550
Prepmat> Matrix trace = 596820.0000
Prepmat> Last element read: 2550 2550 249.6992
Prepmat> 5672 lines saved.
Prepmat> 4484 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 850
RTB> Total mass = 850.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 850
RTB> Number of blocks = 106
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 133470.2864
RTB> 41142 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 636
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41142
Diagstd> Projected matrix trace = 133470.2864
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 636 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 133470.2864
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.3886538 3.2984622 5.9671474 6.6374310
8.7413890 8.9851488 10.7916710 11.3729745 12.2377688
12.5908259 14.3022313 15.5349911 16.3661688 17.0903181
17.9438581 18.1359113 18.9325789 21.9123522 22.9677826
24.1159005 24.5802154 26.3873915 27.2520600 28.1823667
29.8166733 30.5290596 32.1676475 33.5434543 34.2121983
34.8342624 35.5440346 36.5895878 36.7894845 37.2553722
37.8546571 39.1622806 40.3232072 40.7504601 41.4726378
42.5785648 42.9690966 44.0787522 44.1669511 44.9886035
46.5389937 47.5246848 48.7331333 49.9129833 50.5880343
50.8821657 52.9581882 55.1879905 55.6551133 56.6120015
57.1601470 58.0973996 59.3625275 60.4076763 61.1600445
62.2871515 62.7185860 63.6481262 64.9418302 65.6121246
66.6927350 67.4157992 69.2630256 69.7974168 70.2349804
70.4117703 70.7372654 72.1098273 73.3690947 74.3242318
75.3233336 75.3881674 76.7536127 77.8768645 78.0978031
79.2902717 80.5324774 80.6817622 81.7064141 82.9122422
83.4045486 84.0916041 84.8597964 85.8926786 87.5860209
87.5995105 88.4195222 89.2146031 90.3508798 91.3221136
91.6073057 92.5323563 93.3334816 94.0817986 94.8670856
95.6157271
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034335 0.0034339 0.0034340 0.0034341
0.0034341 167.8308851 197.2200382 265.2642129 279.7662304
321.0594839 325.5051902 356.7299958 366.2117829 379.8799769
385.3207438 410.6739717 428.0069138 439.3076777 448.9214469
459.9950871 462.4501999 472.4982110 508.3230227 520.4210016
533.2698403 538.3790132 557.8192669 566.8849772 576.4796898
592.9592850 600.0010273 615.8925217 628.9254549 635.1638473
640.9122755 647.4088652 656.8618495 658.6536931 662.8110396
668.1207168 679.5622841 689.5611952 693.2047641 699.3202590
708.5830994 711.8252543 720.9579354 721.6788708 728.3607532
740.8047773 748.6087568 758.0667496 767.1884300 772.3589479
774.6010372 790.2451505 806.7102419 810.1171309 817.0516944
820.9977154 827.7012810 836.6647503 843.9978599 849.2375264
857.0270220 859.9900161 866.3394513 875.0997145 879.6042738
886.8180910 891.6124497 903.7452123 907.2248864 910.0641634
911.2088143 913.3125253 922.1307572 930.1475800 936.1824488
942.4537494 942.8592656 951.3595746 958.2956331 959.6540244
966.9527065 974.4976810 975.4004868 981.5746990 988.7912400
991.7224588 995.7988006 1000.3368629 1006.4063159 1016.2783609
1016.3566193 1021.1025535 1025.6832285 1032.1943399 1037.7273370
1039.3464457 1044.5809253 1049.0930589 1053.2903033 1057.6769984
1061.8421144
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 850
Rtb_to_modes> Number of blocs = 106
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.298
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.967
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.637
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.741
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.85
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.62
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 636 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 0.99997
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1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
1.00003 0.99997 1.00003 1.00000 0.99998
1.00002 0.99997 0.99999 0.99997 1.00003
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99997 0.99995 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997
1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
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0.99999 0.99995 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 15300 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 0.99997
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00004
1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
1.00003 0.99997 1.00003 1.00000 0.99998
1.00002 0.99997 0.99999 0.99997 1.00003
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99997 0.99995 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997
1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
1.00005 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 0.99995 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601170008472745190.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601170008472745190.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2601170008472745190.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2601170008472745190.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 106
First residue number = 3
Last residue number = 137
Number of atoms found = 850
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.298
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.637
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.741
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.62
Bfactors> 106 vectors, 2550 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.389000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.237 for 106 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.043 +/- 0.04
Bfactors> = 89.163 +/- 5.34
Bfactors> Shiftng-fct= 89.120
Bfactors> Scaling-fct= 142.138
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601170008472745190.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601170008472745190.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062.
Chkmod> 106 vectors, 2550 coordinates in file.
Chkmod> That is: 850 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 80 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 91 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9672
0.0034 0.7831
0.0034 0.9882
0.0034 0.6981
0.0034 0.7886
0.0034 0.6941
167.8358 0.5899
197.1978 0.5742
265.2495 0.0811
279.7451 0.1240
321.0386 0.2603
325.4885 0.1220
356.6871 0.1797
366.1482 0.2795
379.8983 0.5023
385.2916 0.3207
410.6243 0.4019
427.9198 0.2511
439.3402 0.2579
448.8980 0.2290
459.9259 0.3281
462.4825 0.3472
472.4457 0.3086
508.2739 0.2563
520.4238 0.3117
533.2923 0.3125
538.3535 0.3518
557.8229 0.4739
566.8392 0.2198
576.4307 0.3089
592.9669 0.2722
599.9845 0.2398
615.8886 0.3627
628.8661 0.3509
635.1162 0.2717
640.8456 0.3880
647.3443 0.2756
656.8374 0.3510
658.6300 0.3680
662.8238 0.4649
668.0509 0.3779
679.5133 0.2610
689.5042 0.2779
693.1711 0.4601
699.2680 0.3537
708.5646 0.3698
711.8022 0.3891
720.9372 0.3944
721.6728 0.4156
728.3408 0.2425
740.7810 0.4627
748.5397 0.4222
758.0098 0.4003
767.1326 0.1636
772.3408 0.4379
774.5513 0.4444
790.2247 0.1624
806.6903 0.3457
810.1179 0.4793
817.0022 0.3089
820.9614 0.3636
827.6843 0.4279
836.6110 0.2855
843.9779 0.4193
849.2008 0.4915
857.0098 0.4529
859.9628 0.4358
866.3150 0.4652
875.0498 0.3205
879.5523 0.4473
886.7618 0.4757
891.6020 0.3335
903.6867 0.4034
907.2027 0.2621
909.9928 0.3774
911.1582 0.4496
913.2910 0.4747
922.0923 0.2393
930.1134 0.4020
936.1156 0.3097
942.3924 0.4981
942.8303 0.2993
951.2963 0.3555
958.2738 0.2209
959.6263 0.3978
966.9095 0.4781
974.4409 0.3118
975.3480 0.4202
981.5541 0.3528
988.7354 0.4793
991.6528 0.4161
995.7466 0.3784
1000.2951 0.4159
1006.3474 0.2966
1016.2578 0.4150
1016.3158 0.3947
1021.0615 0.4610
1025.6127 0.2945
1032.1450 0.3738
1037.6708 0.2773
1039.3171 0.3097
1044.5228 0.3822
1049.0285 0.3988
1053.2350 0.3894
1057.6478 0.4697
1061.8203 0.3476
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601170008472745190 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601170008472745190.eigenfacs
2601170008472745190.atom
making animated gifs
11 models are in 2601170008472745190.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601170008472745190.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m3.108s
user 0m3.079s
sys 0m0.025s
rm: cannot remove '2601170008472745190.sdijf': No such file or directory
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