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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* MEMBRANE PROTEIN 20-NOV-23 8X5Y *

LOGs for ID: 2601201921523260072

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601201921523260072.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601201921523260072.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601201921523260072.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    274
            First residue number     =     20
            Last  residue number     =    481
            Number of atoms found    =   4600
            Mean number per residue  =     16.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   178.775481 +/-     8.430935 From:   155.003000 To:   199.506000
 =   174.891282 +/-    13.999251 From:   139.607000 To:   209.748000
 =   146.026138 +/-    12.419822 From:   116.135000 To:   176.822000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.3150 % Filled.
 Pdbmat>      3156799  non-zero elements.
 Pdbmat>       347746 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    151.19 +/-     45.34
         Maximum number =    249
         Minimum number =     22

 Pdbmat> Matrix trace   = 6.954920E+06
 Pdbmat> Larger element =  903.520    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
274 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601201921523260072.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601201921523260072.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601201921523260072.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4600 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   274 residues.
 Blocpdb>    28 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    27 atoms in block      2
 Block first atom:     29
 Blocpdb>    25 atoms in block      3
 Block first atom:     56
 Blocpdb>    36 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    31 atoms in block      5
 Block first atom:    117
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    32 atoms in block      7
 Block first atom:    183
 Blocpdb>    30 atoms in block      8
 Block first atom:    215
 Blocpdb>    33 atoms in block      9
 Block first atom:    245
 Blocpdb>    30 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    30 atoms in block     11
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    23 atoms in block     12
 Block first atom:    338
 Blocpdb>    33 atoms in block     13
 Block first atom:    361
 Blocpdb>    38 atoms in block     14
 Block first atom:    394
 Blocpdb>    35 atoms in block     15
 Block first atom:    432
 Blocpdb>    31 atoms in block     16
 Block first atom:    467
 Blocpdb>    40 atoms in block     17
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    26 atoms in block     18
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    46 atoms in block     19
 Block first atom:    564
 Blocpdb>    36 atoms in block     20
 Block first atom:    610
 Blocpdb>    30 atoms in block     21
 Block first atom:    646
 Blocpdb>    21 atoms in block     22
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    40 atoms in block     23
 Block first atom:    697
 Blocpdb>    35 atoms in block     24
 Block first atom:    737
 Blocpdb>    30 atoms in block     25
 Block first atom:    772
 Blocpdb>    27 atoms in block     26
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    22 atoms in block     27
 Block first atom:    829
 Blocpdb>    38 atoms in block     28
 Block first atom:    851
 Blocpdb>    23 atoms in block     29
 Block first atom:    889
 Blocpdb>    26 atoms in block     30
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    33 atoms in block     31
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    31 atoms in block     32
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    33 atoms in block     33
 Block first atom:   1002
 Blocpdb>    40 atoms in block     34
 Block first atom:   1035
 Blocpdb>    38 atoms in block     35
 Block first atom:   1075
 Blocpdb>    28 atoms in block     36
 Block first atom:   1113
 Blocpdb>    46 atoms in block     37
 Block first atom:   1141
 Blocpdb>    30 atoms in block     38
 Block first atom:   1187
 Blocpdb>    31 atoms in block     39
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    33 atoms in block     40
 Block first atom:   1248
 Blocpdb>    29 atoms in block     41
 Block first atom:   1281
 Blocpdb>    44 atoms in block     42
 Block first atom:   1310
 Blocpdb>    30 atoms in block     43
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    29 atoms in block     44
 Block first atom:   1384
 Blocpdb>    37 atoms in block     45
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    21 atoms in block     46
 Block first atom:   1450
 Blocpdb>    24 atoms in block     47
 Block first atom:   1471
 Blocpdb>    30 atoms in block     48
 Block first atom:   1495
 Blocpdb>    31 atoms in block     49
 Block first atom:   1525
 Blocpdb>    36 atoms in block     50
 Block first atom:   1556
 Blocpdb>    38 atoms in block     51
 Block first atom:   1592
 Blocpdb>    30 atoms in block     52
 Block first atom:   1630
 Blocpdb>    36 atoms in block     53
 Block first atom:   1660
 Blocpdb>    45 atoms in block     54
 Block first atom:   1696
 Blocpdb>    27 atoms in block     55
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    34 atoms in block     56
 Block first atom:   1768
 Blocpdb>    33 atoms in block     57
 Block first atom:   1802
 Blocpdb>    45 atoms in block     58
 Block first atom:   1835
 Blocpdb>    41 atoms in block     59
 Block first atom:   1880
 Blocpdb>    45 atoms in block     60
 Block first atom:   1921
 Blocpdb>    36 atoms in block     61
 Block first atom:   1966
 Blocpdb>    38 atoms in block     62
 Block first atom:   2002
 Blocpdb>    21 atoms in block     63
 Block first atom:   2040
 Blocpdb>    24 atoms in block     64
 Block first atom:   2061
 Blocpdb>    38 atoms in block     65
 Block first atom:   2085
 Blocpdb>    17 atoms in block     66
 Block first atom:   2123
 Blocpdb>    44 atoms in block     67
 Block first atom:   2140
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2184
 Blocpdb>    39 atoms in block     69
 Block first atom:   2214
 Blocpdb>    40 atoms in block     70
 Block first atom:   2253
 Blocpdb>    33 atoms in block     71
 Block first atom:   2293
 Blocpdb>    38 atoms in block     72
 Block first atom:   2326
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2364
 Blocpdb>    31 atoms in block     74
 Block first atom:   2395
 Blocpdb>    37 atoms in block     75
 Block first atom:   2426
 Blocpdb>    34 atoms in block     76
 Block first atom:   2463
 Blocpdb>    40 atoms in block     77
 Block first atom:   2497
 Blocpdb>    39 atoms in block     78
 Block first atom:   2537
 Blocpdb>    34 atoms in block     79
 Block first atom:   2576
 Blocpdb>    25 atoms in block     80
 Block first atom:   2610
 Blocpdb>    26 atoms in block     81
 Block first atom:   2635
 Blocpdb>    41 atoms in block     82
 Block first atom:   2661
 Blocpdb>    28 atoms in block     83
 Block first atom:   2702
 Blocpdb>    38 atoms in block     84
 Block first atom:   2730
 Blocpdb>    42 atoms in block     85
 Block first atom:   2768
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2810
 Blocpdb>    24 atoms in block     87
 Block first atom:   2843
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2867
 Blocpdb>    34 atoms in block     89
 Block first atom:   2905
 Blocpdb>    40 atoms in block     90
 Block first atom:   2939
 Blocpdb>    28 atoms in block     91
 Block first atom:   2979
 Blocpdb>    38 atoms in block     92
 Block first atom:   3007
 Blocpdb>    36 atoms in block     93
 Block first atom:   3045
 Blocpdb>    44 atoms in block     94
 Block first atom:   3081
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   3125
 Blocpdb>    41 atoms in block     96
 Block first atom:   3156
 Blocpdb>    43 atoms in block     97
 Block first atom:   3197
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   3240
 Blocpdb>    46 atoms in block     99
 Block first atom:   3266
 Blocpdb>    36 atoms in block    100
 Block first atom:   3312
 Blocpdb>    38 atoms in block    101
 Block first atom:   3348
 Blocpdb>    39 atoms in block    102
 Block first atom:   3386
 Blocpdb>    32 atoms in block    103
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3457
 Blocpdb>    36 atoms in block    105
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    27 atoms in block    106
 Block first atom:   3525
 Blocpdb>    36 atoms in block    107
 Block first atom:   3552
 Blocpdb>    20 atoms in block    108
 Block first atom:   3588
 Blocpdb>    39 atoms in block    109
 Block first atom:   3608
 Blocpdb>    30 atoms in block    110
 Block first atom:   3647
 Blocpdb>    43 atoms in block    111
 Block first atom:   3677
 Blocpdb>    35 atoms in block    112
 Block first atom:   3720
 Blocpdb>    39 atoms in block    113
 Block first atom:   3755
 Blocpdb>    40 atoms in block    114
 Block first atom:   3794
 Blocpdb>    33 atoms in block    115
 Block first atom:   3834
 Blocpdb>    29 atoms in block    116
 Block first atom:   3867
 Blocpdb>    30 atoms in block    117
 Block first atom:   3896
 Blocpdb>    36 atoms in block    118
 Block first atom:   3926
 Blocpdb>    21 atoms in block    119
 Block first atom:   3962
 Blocpdb>    29 atoms in block    120
 Block first atom:   3983
 Blocpdb>    36 atoms in block    121
 Block first atom:   4012
 Blocpdb>    34 atoms in block    122
 Block first atom:   4048
 Blocpdb>    34 atoms in block    123
 Block first atom:   4082
 Blocpdb>    43 atoms in block    124
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   4159
 Blocpdb>    40 atoms in block    126
 Block first atom:   4185
 Blocpdb>    25 atoms in block    127
 Block first atom:   4225
 Blocpdb>    33 atoms in block    128
 Block first atom:   4250
 Blocpdb>    28 atoms in block    129
 Block first atom:   4283
 Blocpdb>    38 atoms in block    130
 Block first atom:   4311
 Blocpdb>    35 atoms in block    131
 Block first atom:   4349
 Blocpdb>    30 atoms in block    132
 Block first atom:   4384
 Blocpdb>    29 atoms in block    133
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    134
 Block first atom:   4443
 Blocpdb>    44 atoms in block    135
 Block first atom:   4477
 Blocpdb>    34 atoms in block    136
 Block first atom:   4521
 Blocpdb>    46 atoms in block    137
 Block first atom:   4554

 Blocpdb>   137 blocks.

 Blocpdb> At most,     46 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    17 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      3156936 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      13800

 Prepmat> Matrix trace    =    6954920.0000
 Prepmat> Last element read:   13800  13800       443.1977
 Prepmat>         9454 lines saved.
 Prepmat>         7874 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4600
 RTB> Total mass =        4600.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4600
 RTB> Number of blocks =   137
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  348121.9426
 RTB>     54789 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      822
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    54789
 Diagstd> Projected matrix trace =  348121.9426

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    822 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 348121.9426
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      3.9718926      5.8893838      7.0027202      8.5192596
     10.6209393     11.4377662     13.8606872     15.9422489     16.6762709
     18.5791252     19.2234845     20.6269627     21.8402393     22.4576151
     24.4488908     25.4168224     26.3871856     28.0543993     29.7933055
     31.0967555     32.0090732     34.6770455     36.7303384     37.5574016
     38.9010817     40.8793633     41.5391355     42.2539589     44.2871088
     46.0923582     46.5424551     47.3538759     48.2766983     51.5612350
     53.6372239     54.6417637     56.7118837     57.9321288     59.4729346
     59.9590238     60.6426444     62.3541893     63.1439535     68.9044765
     69.4630029     70.6468465     72.0697056     73.4989514     75.1759094
     75.8520513     76.9763713     77.9929011     78.8984030     81.0479273
     81.9439962     84.7510488     86.1327529     87.4921135     89.2204372
     90.7130145     91.8495004     92.8366199     93.6241545     93.7941937
     95.2390674     96.9764572    100.0046304    101.4749739    101.9259980
    103.0816114    103.3942200    106.1214943    106.8998021    109.8752682
    110.3681485    111.5185460    111.8568453    113.2926429    114.7993363
    117.5259475    118.6882366    119.2546012    122.3905320    122.8977158
    123.1385921    124.5818747    128.2714693    128.6844888    129.3784014
    130.4003111    133.3602125    133.8617585    134.6568277    136.1617389
    136.3236093    138.2223920    139.9973036    140.7190470    141.2976720
    143.6556074

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034314      0.0034332      0.0034333      0.0034336      0.0034339
      0.0034359    216.4183238    263.5300901    287.3615559    316.9539769
    353.8968886    367.2534529    404.2850308    433.5808301    443.4500933
    468.0668784    476.1144210    493.1884775    507.4858950    514.6086680
    536.9388897    547.4644300    557.8170903    575.1693927    592.7268835
    605.5539196    614.3725878    639.4643304    658.1240249    665.4923218
    677.2922702    694.3002823    699.8806837    705.8769218    722.6598808
    737.2414499    740.8323263    747.2622552    754.5083677    779.7527869
    795.2953187    802.7080799    817.7721512    826.5231535    837.4424365
    840.8577994    845.6377181    857.4880945    862.9013833    901.4029998
    905.0489257    912.7286240    921.8741864    930.9703548    941.5310040
    945.7556521    952.7391187    959.0092982    964.5603080    977.6113537
    983.0007522    999.6956930   1007.8118124   1015.7334015   1025.7167646
   1034.2608365   1040.7194698   1046.2969037   1050.7254091   1051.6791342
   1059.7485899   1069.3710862   1085.9387607   1093.8927762   1096.3210843
   1102.5184851   1104.1889863   1118.6570363   1122.7517246   1138.2699069
   1140.8200853   1146.7502130   1148.4882693   1155.8357798   1163.4961994
   1177.2322769   1183.0391558   1185.8584499   1201.3490011   1203.8356100
   1205.0147756   1212.0560708   1229.8731350   1231.8515692   1235.1683949
   1240.0368578   1254.0314252   1256.3873158   1260.1129353   1267.1348189
   1267.8877863   1276.6871360   1284.8579493   1288.1656761   1290.8113739
   1301.5371585

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4600
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    137

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9848E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.972    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.889    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.003    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.519    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   113.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   118.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   119.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   122.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   122.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   123.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   129.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   130.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   133.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   133.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   134.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   136.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   136.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   138.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   140.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   140.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.7    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    822 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
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 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
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 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
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 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
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 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    82800 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
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 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00004 0.99997 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601201921523260072.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601201921523260072.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601201921523260072.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601201921523260072.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    274
            First residue number     =     20
            Last  residue number     =    481
            Number of atoms found    =   4600
            Mean number per residue  =     16.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9848E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.972    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.889    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.003    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.519    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   113.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   119.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   129.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   130.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   133.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   133.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   134.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   136.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   136.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   140.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   140.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.7    

 Bfactors>  106 vectors,  13800 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     3.972000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.120 for    274 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.007 +/-   0.01
 Bfactors> =     95.785 +/-   8.13
 Bfactors> Shiftng-fct=     95.778
 Bfactors> Scaling-fct=   1135.801

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601201921523260072.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601201921523260072.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4312E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4357E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   216.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   263.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   287.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   316.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   353.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   404.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   433.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   443.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   468.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   999.6    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1069.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1096.    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1267.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1268.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1277.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1285.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1288.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1291.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1302.    

 Chkmod>  106 vectors,  13800 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4600 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    68 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9968
      0.0034      0.7351
      0.0034      0.6779
      0.0034      0.9942
      0.0034      0.9707
      0.0034      0.7000
    216.4120      0.4816
    263.5102      0.4891
    287.3550      0.5784
    316.9355      0.2310
    353.8660      0.4076
    367.2735      0.3097
    404.2577      0.4100
    433.5316      0.3981
    443.4806      0.2171
    468.0578      0.3795
    476.0508      0.2272
    493.2036      0.3878
    507.4613      0.2882
    514.6139      0.3677
    536.9280      0.3426
    547.4751      0.5034
    557.8229      0.4351
    575.0996      0.3615
    592.6686      0.3843
    605.5595      0.3156
    614.3551      0.3952
    639.4641      0.4356
    658.0927      0.4872
    665.4868      0.5053
    677.2538      0.4288
    694.2759      0.3765
    699.8579      0.3631
    705.8136      0.4224
    722.6524      0.4722
    737.1909      0.3270
    740.7810      0.3297
    747.1996      0.4109
    754.5018      0.4819
    779.7100      0.4150
    795.2818      0.4954
    802.6607      0.3636
    817.7235      0.3596
    826.4725      0.5690
    837.3858      0.4727
    840.8285      0.4809
    845.5830      0.4216
    857.4225      0.3203
    862.8373      0.2428
    901.3350      0.3841
    904.9905      0.4014
    912.7098      0.3376
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    930.9370      0.4167
    941.5162      0.4515
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    958.9503      0.3348
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   1290.7666      0.4228
   1301.6824      0.3728
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601201921523260072 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601201921523260072.eigenfacs
2601201921523260072.atom
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11 models are in 2601201921523260072.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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11 models are in 2601201921523260072.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601201921523260072 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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2601201921523260072.eigenfacs
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2601201921523260072.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2601201921523260072.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2601201921523260072 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2601201921523260072.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2601201921523260072.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601201921523260072.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2601201921523260072.10.pdb
2601201921523260072.11.pdb
2601201921523260072.7.pdb
2601201921523260072.8.pdb
2601201921523260072.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m15.205s
user	0m14.938s
sys	0m0.252s
rm: cannot remove '2601201921523260072.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Should you encounter any unexpected behaviour,
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It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* MEMBRANE PROTEIN 20-NOV-23 8X5Y *
