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LOGs for ID: 2601211214183354148

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601211214183354148.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601211214183354148.atom to be opened. Openam> File opened: 2601211214183354148.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 497 First residue number = 501 Last residue number = 788 Number of atoms found = 7923 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -11.104708 +/- 13.512590 From: -49.207000 To: 18.857000 = 3.532705 +/- 15.001009 From: -32.862000 To: 40.015000 = -23.619520 +/- 14.944122 From: -58.903000 To: 12.012000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9773 % Filled. Pdbmat> 5585820 non-zero elements. Pdbmat> 615458 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 155.36 +/- 48.78 Maximum number = 256 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.230916E+07 Pdbmat> Larger element = 913.527 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 497 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601211214183354148.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601211214183354148.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601211214183354148.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7923 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 497 residues. Blocpdb> 43 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 58 atoms in block 2 Block first atom: 44 Blocpdb> 60 atoms in block 3 Block first atom: 102 Blocpdb> 54 atoms in block 4 Block first atom: 162 Blocpdb> 61 atoms in block 5 Block first atom: 216 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 277 Blocpdb> 36 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 29 atoms in block 8 Block first atom: 332 Blocpdb> 48 atoms in block 9 Block first atom: 361 Blocpdb> 43 atoms in block 10 Block first atom: 409 Blocpdb> 52 atoms in block 11 Block first atom: 452 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 504 Blocpdb> 44 atoms in block 13 Block first atom: 518 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 562 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 578 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 625 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 675 Blocpdb> 49 atoms in block 18 Block first atom: 719 Blocpdb> 56 atoms in block 19 Block first atom: 768 Blocpdb> 44 atoms in block 20 Block first atom: 824 Blocpdb> 50 atoms in block 21 Block first atom: 868 Blocpdb> 53 atoms in block 22 Block first atom: 918 Blocpdb> 53 atoms in block 23 Block first atom: 971 Blocpdb> 60 atoms in block 24 Block first atom: 1024 Blocpdb> 43 atoms in block 25 Block first atom: 1084 Blocpdb> 40 atoms in block 26 Block first atom: 1127 Blocpdb> 45 atoms in block 27 Block first atom: 1167 Blocpdb> 55 atoms in block 28 Block first atom: 1212 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 1267 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 1283 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 1306 Blocpdb> 62 atoms in block 32 Block first atom: 1338 Blocpdb> 35 atoms in block 33 Block first atom: 1400 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1435 Blocpdb> 60 atoms in block 35 Block first atom: 1471 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 1531 Blocpdb> 43 atoms in block 37 Block first atom: 1555 Blocpdb> 31 atoms in block 38 Block first atom: 1598 Blocpdb> 40 atoms in block 39 Block first atom: 1629 Blocpdb> 43 atoms in block 40 Block first atom: 1669 Blocpdb> 48 atoms in block 41 Block first atom: 1712 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1760 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1797 Blocpdb> 34 atoms in block 44 Block first atom: 1840 Blocpdb> 56 atoms in block 45 Block first atom: 1874 Blocpdb> 36 atoms in block 46 Block first atom: 1930 Blocpdb> 53 atoms in block 47 Block first atom: 1966 Blocpdb> 53 atoms in block 48 Block first atom: 2019 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 2072 Blocpdb> 49 atoms in block 50 Block first atom: 2115 Blocpdb> 42 atoms in block 51 Block first atom: 2164 Blocpdb> 43 atoms in block 52 Block first atom: 2206 Blocpdb> 54 atoms in block 53 Block first atom: 2249 Blocpdb> 38 atoms in block 54 Block first atom: 2303 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 2341 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 2361 Blocpdb> 30 atoms in block 57 Block first atom: 2407 Blocpdb> 49 atoms in block 58 Block first atom: 2437 Blocpdb> 57 atoms in block 59 Block first atom: 2486 Blocpdb> 55 atoms in block 60 Block first atom: 2543 Blocpdb> 40 atoms in block 61 Block first atom: 2598 Blocpdb> 59 atoms in block 62 Block first atom: 2638 Blocpdb> 66 atoms in block 63 Block first atom: 2697 Blocpdb> 43 atoms in block 64 Block first atom: 2763 Blocpdb> 39 atoms in block 65 Block first atom: 2806 Blocpdb> 55 atoms in block 66 Block first atom: 2845 Blocpdb> 39 atoms in block 67 Block first atom: 2900 Blocpdb> 58 atoms in block 68 Block first atom: 2939 Blocpdb> 53 atoms in block 69 Block first atom: 2997 Blocpdb> 50 atoms in block 70 Block first atom: 3050 Blocpdb> 55 atoms in block 71 Block first atom: 3100 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3155 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 3193 Blocpdb> 40 atoms in block 74 Block first atom: 3206 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 3246 Blocpdb> 48 atoms in block 76 Block first atom: 3290 Blocpdb> 49 atoms in block 77 Block first atom: 3338 Blocpdb> 62 atoms in block 78 Block first atom: 3387 Blocpdb> 35 atoms in block 79 Block first atom: 3449 Blocpdb> 45 atoms in block 80 Block first atom: 3484 Blocpdb> 50 atoms in block 81 Block first atom: 3529 Blocpdb> 48 atoms in block 82 Block first atom: 3579 Blocpdb> 52 atoms in block 83 Block first atom: 3627 Blocpdb> 53 atoms in block 84 Block first atom: 3679 Blocpdb> 58 atoms in block 85 Block first atom: 3732 Blocpdb> 47 atoms in block 86 Block first atom: 3790 Blocpdb> 50 atoms in block 87 Block first atom: 3837 Blocpdb> 51 atoms in block 88 Block first atom: 3887 Blocpdb> 46 atoms in block 89 Block first atom: 3938 Blocpdb> 46 atoms in block 90 Block first atom: 3984 Blocpdb> 38 atoms in block 91 Block first atom: 4030 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 4068 Blocpdb> 43 atoms in block 93 Block first atom: 4084 Blocpdb> 58 atoms in block 94 Block first atom: 4127 Blocpdb> 60 atoms in block 95 Block first atom: 4185 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 4245 Blocpdb> 61 atoms in block 97 Block first atom: 4299 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 4360 Blocpdb> 31 atoms in block 99 Block first atom: 4379 Blocpdb> 49 atoms in block 100 Block first atom: 4410 Blocpdb> 48 atoms in block 101 Block first atom: 4459 Blocpdb> 43 atoms in block 102 Block first atom: 4507 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4550 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4602 Blocpdb> 35 atoms in block 105 Block first atom: 4652 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4687 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 4734 Blocpdb> 45 atoms in block 108 Block first atom: 4753 Blocpdb> 49 atoms in block 109 Block first atom: 4798 Blocpdb> 53 atoms in block 110 Block first atom: 4847 Blocpdb> 50 atoms in block 111 Block first atom: 4900 Blocpdb> 51 atoms in block 112 Block first atom: 4950 Blocpdb> 52 atoms in block 113 Block first atom: 5001 Blocpdb> 64 atoms in block 114 Block first atom: 5053 Blocpdb> 34 atoms in block 115 Block first atom: 5117 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 5151 Blocpdb> 57 atoms in block 117 Block first atom: 5187 Blocpdb> 52 atoms in block 118 Block first atom: 5244 Blocpdb> 32 atoms in block 119 Block first atom: 5296 Blocpdb> 62 atoms in block 120 Block first atom: 5328 Blocpdb> 35 atoms in block 121 Block first atom: 5390 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 5425 Blocpdb> 60 atoms in block 123 Block first atom: 5461 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 5521 Blocpdb> 43 atoms in block 125 Block first atom: 5545 Blocpdb> 31 atoms in block 126 Block first atom: 5588 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5619 Blocpdb> 43 atoms in block 128 Block first atom: 5659 Blocpdb> 48 atoms in block 129 Block first atom: 5702 Blocpdb> 37 atoms in block 130 Block first atom: 5750 Blocpdb> 43 atoms in block 131 Block first atom: 5787 Blocpdb> 34 atoms in block 132 Block first atom: 5830 Blocpdb> 56 atoms in block 133 Block first atom: 5864 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 5920 Blocpdb> 53 atoms in block 135 Block first atom: 5956 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 6009 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 6062 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 6105 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 6154 Blocpdb> 42 atoms in block 140 Block first atom: 6193 Blocpdb> 57 atoms in block 141 Block first atom: 6235 Blocpdb> 39 atoms in block 142 Block first atom: 6292 Blocpdb> 7 atoms in block 143 Block first atom: 6331 Blocpdb> 51 atoms in block 144 Block first atom: 6338 Blocpdb> 65 atoms in block 145 Block first atom: 6389 Blocpdb> 43 atoms in block 146 Block first atom: 6454 Blocpdb> 49 atoms in block 147 Block first atom: 6497 Blocpdb> 67 atoms in block 148 Block first atom: 6546 Blocpdb> 48 atoms in block 149 Block first atom: 6613 Blocpdb> 38 atoms in block 150 Block first atom: 6661 Blocpdb> 51 atoms in block 151 Block first atom: 6699 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 6750 Blocpdb> 59 atoms in block 153 Block first atom: 6793 Blocpdb> 54 atoms in block 154 Block first atom: 6852 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 6906 Blocpdb> 53 atoms in block 156 Block first atom: 6948 Blocpdb> 62 atoms in block 157 Block first atom: 7001 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 7063 Blocpdb> 40 atoms in block 159 Block first atom: 7076 Blocpdb> 44 atoms in block 160 Block first atom: 7116 Blocpdb> 48 atoms in block 161 Block first atom: 7160 Blocpdb> 49 atoms in block 162 Block first atom: 7208 Blocpdb> 62 atoms in block 163 Block first atom: 7257 Blocpdb> 35 atoms in block 164 Block first atom: 7319 Blocpdb> 45 atoms in block 165 Block first atom: 7354 Blocpdb> 50 atoms in block 166 Block first atom: 7399 Blocpdb> 48 atoms in block 167 Block first atom: 7449 Blocpdb> 52 atoms in block 168 Block first atom: 7497 Blocpdb> 53 atoms in block 169 Block first atom: 7549 Blocpdb> 58 atoms in block 170 Block first atom: 7602 Blocpdb> 47 atoms in block 171 Block first atom: 7660 Blocpdb> 50 atoms in block 172 Block first atom: 7707 Blocpdb> 51 atoms in block 173 Block first atom: 7757 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7808 Blocpdb> 46 atoms in block 175 Block first atom: 7854 Blocpdb> 24 atoms in block 176 Block first atom: 7899 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5585996 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23769 Prepmat> Matrix trace = 12309160.0000 Prepmat> Last element read: 23769 23769 334.1024 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13656 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7923 RTB> Total mass = 7923.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7923 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 426147.9615 RTB> 66480 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66480 Diagstd> Projected matrix trace = 426147.9615 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 426147.9615 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8735767 1.7986109 2.5397456 3.3617775 3.4670339 4.3296575 4.4390352 6.4468985 7.1130524 7.6040459 9.4813399 12.4390787 13.0265512 14.8260042 15.6514471 17.3815491 18.5878290 19.2790720 20.6375885 22.7223297 26.0295879 29.3553896 29.7498436 31.3875616 32.8666160 33.8300220 34.1168776 36.2183574 36.8672342 37.5555505 38.5288038 39.2121552 41.3985071 41.6964497 43.1274901 44.2988825 44.8346619 46.9527769 47.7718767 48.0266927 48.2453153 50.3793943 51.8803053 52.3156736 53.6709057 55.7369051 57.6453668 58.1094145 58.9047792 59.3487746 60.7752563 61.9732571 63.0104409 63.9685562 64.3979060 65.7317458 66.7487941 67.6439548 68.7079785 69.4293990 70.6592357 71.2704973 71.8585400 74.7133526 75.3736337 75.5040927 76.5233776 77.5480436 78.2684411 79.1410466 80.4116381 81.5197220 81.8058938 83.2887661 83.8607993 85.4240543 85.4806079 86.5518378 88.2327419 89.3392107 90.1216304 90.9492677 92.3177797 92.8193842 94.3113576 94.6923700 95.9181422 96.5828647 98.6777524 99.3097548 101.0374942 102.2522377 102.8613087 103.1293532 104.4964176 104.5326348 105.6625917 106.7033300 107.8797381 108.4447796 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034307 0.0034323 0.0034334 0.0034344 0.0034351 0.0034353 101.4952697 145.6343749 173.0574863 199.1038988 202.1968203 225.9550508 228.7913369 275.7215416 289.6164898 299.4453988 334.3721811 382.9917234 391.9313514 418.1261592 429.6081678 452.7302564 468.1765048 476.8023010 493.3154929 517.6327055 554.0244434 588.3546692 592.2943962 608.3787967 622.5479044 631.6062522 634.2783956 653.5211623 659.3493146 665.4759221 674.0436835 679.9948704 698.6949759 701.2047018 713.1360190 722.7559332 727.1135365 744.0907770 750.5531148 752.5521842 754.2630882 770.7645847 782.1616922 785.4367018 795.5449847 810.7121940 824.4749857 827.7868635 833.4327200 836.5678273 846.5618238 854.8648120 861.9886343 868.5174620 871.4272834 880.4057366 887.1907235 893.1199192 900.1167965 904.8299829 912.8086525 916.7484301 920.5226409 938.6299177 942.7683770 943.5839102 949.9316234 956.2703785 960.7018395 966.0423702 973.7662877 980.4526512 982.1720640 991.0338628 994.4312853 1003.6571206 1003.9892927 1010.2606261 1020.0234776 1026.3992731 1030.8840027 1035.6067766 1043.3690639 1046.1997736 1054.5745309 1056.7025940 1063.5199951 1067.1987838 1078.7104964 1082.1593973 1091.5322300 1098.0742076 1101.3397214 1102.7737691 1110.0587929 1110.2511427 1116.2357040 1121.7194925 1127.8860416 1130.8359472 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7923 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9812E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.799 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.113 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.481 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 142614 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601211214183354148.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601211214183354148.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601211214183354148.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601211214183354148.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 497 First residue number = 501 Last residue number = 788 Number of atoms found = 7923 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9812E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.799 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.439 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.113 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.481 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Bfactors> 106 vectors, 23769 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.873600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.043 for 497 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.010 +/- 0.01 Bfactors> = 8.274 +/- 14.76 Bfactors> Shiftng-fct= 8.264 Bfactors> Scaling-fct= 1506.345 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601211214183354148.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601211214183354148.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.7 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perturbed structure for DQ=-80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2601211214183354148 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom making animated gifs 11 models are in 2601211214183354148.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601211214183354148.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601211214183354148.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2601211214183354148 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601211214183354148.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2601211214183354148 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601211214183354148.eigenfacs 2601211214183354148.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601211214183354148.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601211214183354148.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2601211214183354148.10.pdb 2601211214183354148.11.pdb 2601211214183354148.7.pdb 2601211214183354148.8.pdb 2601211214183354148.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m41.976s user 0m41.621s sys 0m0.331s rm: cannot remove '2601211214183354148.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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