*** gp130wt ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2601221240153497519.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2601221240153497519.atom to be opened.
Openam> File opened: 2601221240153497519.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 423
First residue number = 5
Last residue number = 215
Number of atoms found = 4118
Mean number per residue = 9.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 33.379384 +/- 17.246513 From: -3.572000 To: 83.133000
= 28.974716 +/- 15.460467 From: -2.424000 To: 74.666000
= 7.647074 +/- 14.492512 From: -34.499000 To: 43.709000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.3145 % Filled.
Pdbmat> 1766346 non-zero elements.
Pdbmat> 193552 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 94.00 +/- 28.02
Maximum number = 156
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 3.871040E+06
Pdbmat> Larger element = 596.393
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
423 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2601221240153497519.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2601221240153497519.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2601221240153497519.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4118 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 423 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 30 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 31 atoms in block 3
Block first atom: 54
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 85
Blocpdb> 28 atoms in block 5
Block first atom: 109
Blocpdb> 28 atoms in block 6
Block first atom: 137
Blocpdb> 39 atoms in block 7
Block first atom: 165
Blocpdb> 33 atoms in block 8
Block first atom: 204
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 237
Blocpdb> 36 atoms in block 10
Block first atom: 256
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 292
Blocpdb> 32 atoms in block 12
Block first atom: 324
Blocpdb> 31 atoms in block 13
Block first atom: 356
Blocpdb> 34 atoms in block 14
Block first atom: 387
Blocpdb> 28 atoms in block 15
Block first atom: 421
Blocpdb> 31 atoms in block 16
Block first atom: 449
Blocpdb> 29 atoms in block 17
Block first atom: 480
Blocpdb> 25 atoms in block 18
Block first atom: 509
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 534
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 556
Blocpdb> 26 atoms in block 21
Block first atom: 580
Blocpdb> 31 atoms in block 22
Block first atom: 606
Blocpdb> 34 atoms in block 23
Block first atom: 637
Blocpdb> 28 atoms in block 24
Block first atom: 671
Blocpdb> 34 atoms in block 25
Block first atom: 699
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 733
Blocpdb> 27 atoms in block 27
Block first atom: 757
Blocpdb> 27 atoms in block 28
Block first atom: 784
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 811
Blocpdb> 31 atoms in block 30
Block first atom: 836
Blocpdb> 32 atoms in block 31
Block first atom: 867
Blocpdb> 29 atoms in block 32
Block first atom: 899
Blocpdb> 34 atoms in block 33
Block first atom: 928
Blocpdb> 25 atoms in block 34
Block first atom: 962
Blocpdb> 31 atoms in block 35
Block first atom: 987
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 1018
Blocpdb> 28 atoms in block 37
Block first atom: 1043
Blocpdb> 27 atoms in block 38
Block first atom: 1071
Blocpdb> 31 atoms in block 39
Block first atom: 1098
Blocpdb> 34 atoms in block 40
Block first atom: 1129
Blocpdb> 27 atoms in block 41
Block first atom: 1163
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1190
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 1220
Blocpdb> 31 atoms in block 44
Block first atom: 1245
Blocpdb> 34 atoms in block 45
Block first atom: 1276
Blocpdb> 43 atoms in block 46
Block first atom: 1310
Blocpdb> 31 atoms in block 47
Block first atom: 1353
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1384
Blocpdb> 36 atoms in block 49
Block first atom: 1407
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1443
Blocpdb> 28 atoms in block 51
Block first atom: 1466
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1494
Blocpdb> 33 atoms in block 53
Block first atom: 1517
Blocpdb> 29 atoms in block 54
Block first atom: 1550
Blocpdb> 30 atoms in block 55
Block first atom: 1579
Blocpdb> 32 atoms in block 56
Block first atom: 1609
Blocpdb> 33 atoms in block 57
Block first atom: 1641
Blocpdb> 37 atoms in block 58
Block first atom: 1674
Blocpdb> 33 atoms in block 59
Block first atom: 1711
Blocpdb> 32 atoms in block 60
Block first atom: 1744
Blocpdb> 27 atoms in block 61
Block first atom: 1776
Blocpdb> 35 atoms in block 62
Block first atom: 1803
Blocpdb> 33 atoms in block 63
Block first atom: 1838
Blocpdb> 28 atoms in block 64
Block first atom: 1871
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1899
Blocpdb> 32 atoms in block 66
Block first atom: 1918
Blocpdb> 36 atoms in block 67
Block first atom: 1950
Blocpdb> 18 atoms in block 68
Block first atom: 1986
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 2004
Blocpdb> 6 atoms in block 70
Block first atom: 2026
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 2032
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 2054
Blocpdb> 24 atoms in block 73
Block first atom: 2076
Blocpdb> 33 atoms in block 74
Block first atom: 2100
Blocpdb> 28 atoms in block 75
Block first atom: 2133
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 2161
Blocpdb> 26 atoms in block 77
Block first atom: 2185
Blocpdb> 35 atoms in block 78
Block first atom: 2211
Blocpdb> 34 atoms in block 79
Block first atom: 2246
Blocpdb> 30 atoms in block 80
Block first atom: 2280
Blocpdb> 32 atoms in block 81
Block first atom: 2310
Blocpdb> 31 atoms in block 82
Block first atom: 2342
Blocpdb> 30 atoms in block 83
Block first atom: 2373
Blocpdb> 30 atoms in block 84
Block first atom: 2403
Blocpdb> 31 atoms in block 85
Block first atom: 2433
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 2464
Blocpdb> 38 atoms in block 87
Block first atom: 2495
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 2533
Blocpdb> 32 atoms in block 89
Block first atom: 2555
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 2587
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 2611
Blocpdb> 24 atoms in block 92
Block first atom: 2635
Blocpdb> 31 atoms in block 93
Block first atom: 2659
Blocpdb> 31 atoms in block 94
Block first atom: 2690
Blocpdb> 31 atoms in block 95
Block first atom: 2721
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2752
Blocpdb> 34 atoms in block 97
Block first atom: 2779
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2813
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 2840
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 2860
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 2890
Blocpdb> 32 atoms in block 102
Block first atom: 2920
Blocpdb> 24 atoms in block 103
Block first atom: 2952
Blocpdb> 35 atoms in block 104
Block first atom: 2976
Blocpdb> 31 atoms in block 105
Block first atom: 3011
Blocpdb> 27 atoms in block 106
Block first atom: 3042
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 3069
Blocpdb> 28 atoms in block 108
Block first atom: 3097
Blocpdb> 28 atoms in block 109
Block first atom: 3125
Blocpdb> 25 atoms in block 110
Block first atom: 3153
Blocpdb> 31 atoms in block 111
Block first atom: 3178
Blocpdb> 34 atoms in block 112
Block first atom: 3209
Blocpdb> 27 atoms in block 113
Block first atom: 3243
Blocpdb> 30 atoms in block 114
Block first atom: 3270
Blocpdb> 25 atoms in block 115
Block first atom: 3300
Blocpdb> 31 atoms in block 116
Block first atom: 3325
Blocpdb> 34 atoms in block 117
Block first atom: 3356
Blocpdb> 43 atoms in block 118
Block first atom: 3390
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 3433
Blocpdb> 23 atoms in block 120
Block first atom: 3464
Blocpdb> 36 atoms in block 121
Block first atom: 3487
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 3523
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 3546
Blocpdb> 23 atoms in block 124
Block first atom: 3574
Blocpdb> 33 atoms in block 125
Block first atom: 3597
Blocpdb> 29 atoms in block 126
Block first atom: 3630
Blocpdb> 30 atoms in block 127
Block first atom: 3659
Blocpdb> 32 atoms in block 128
Block first atom: 3689
Blocpdb> 33 atoms in block 129
Block first atom: 3721
Blocpdb> 37 atoms in block 130
Block first atom: 3754
Blocpdb> 33 atoms in block 131
Block first atom: 3791
Blocpdb> 32 atoms in block 132
Block first atom: 3824
Blocpdb> 27 atoms in block 133
Block first atom: 3856
Blocpdb> 35 atoms in block 134
Block first atom: 3883
Blocpdb> 33 atoms in block 135
Block first atom: 3918
Blocpdb> 28 atoms in block 136
Block first atom: 3951
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 3979
Blocpdb> 32 atoms in block 138
Block first atom: 3998
Blocpdb> 36 atoms in block 139
Block first atom: 4030
Blocpdb> 18 atoms in block 140
Block first atom: 4066
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 4084
Blocpdb> 13 atoms in block 142
Block first atom: 4105
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 43 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1766488 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12354
Prepmat> Matrix trace = 3871040.0000
Prepmat> Last element read: 12354 12354 70.3826
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8925 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4118
RTB> Total mass = 4118.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4118
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 200584.5843
RTB> 42078 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 42078
Diagstd> Projected matrix trace = 200584.5843
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 200584.5843
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1778408 0.2432884 0.5693628 0.7441305
0.8534876 0.9519877 1.3981033 1.6278242 1.9256100
2.1572902 2.3845991 2.7297574 3.3627380 3.6871251
4.3560579 5.0593330 5.1941906 5.6489621 5.9911260
7.0111829 7.1453738 8.3432040 8.4181197 9.6841065
9.8323923 11.7539819 11.8465664 12.7077142 13.5814312
15.1633599 15.3480881 15.5201185 16.6839572 17.1085530
18.1687905 19.5496410 20.4031003 21.1927430 22.0099332
22.2221495 22.9493320 24.0009272 24.5222176 25.3910016
26.4370072 27.9880593 28.8728817 29.3067178 29.3892510
30.7005986 31.0943823 32.6552437 32.9707515 34.1712492
35.6401093 37.2345792 37.8220824 38.9758953 39.3138975
40.0289788 40.6398712 41.3147964 42.2238705 42.6668517
43.3329878 44.2814080 46.5532058 46.9258828 48.0011016
48.2603702 49.7266530 50.0062815 50.2793658 51.3199815
51.8415497 52.4819951 52.6758104 53.2151744 53.8882347
54.7926320 54.9840403 56.2951310 56.6125867 58.8149773
58.9463563 59.5644171 59.8129645 61.1480973 61.3452638
62.1581379 62.7007067 62.8849591 64.2207258 64.8621729
65.5486615 65.6997579 66.6102636 67.3768092 67.7381058
68.7143464
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034321 0.0034322 0.0034330 0.0034337 0.0034341
0.0034347 45.7942556 53.5619006 81.9388425 93.6741630
100.3214678 105.9524369 128.3999653 138.5476056 150.6882710
159.4959168 167.6883792 179.4144046 199.1323387 208.5159198
226.6428923 244.2541290 247.4880418 258.0950124 265.7966533
287.5351399 290.2737464 313.6618581 315.0669350 337.9286852
340.5060862 372.2955024 373.7588867 387.1051954 400.1916744
422.8564919 425.4244261 427.8019860 443.5522777 449.1608761
462.8692061 480.1364463 490.5049140 499.9065954 509.4536086
511.9037520 520.2119267 531.9971313 537.7434768 547.1862768
558.3434485 574.4889407 583.4993092 587.8667156 588.6939052
601.6843311 605.5308127 620.5428052 623.5333731 634.7836150
648.2832402 662.6260499 667.8331893 677.9432330 680.8764779
687.0408112 692.2635130 697.9882132 705.6255550 709.3173441
714.8330070 722.6133668 740.9178822 743.8776428 752.3516582
754.3807626 765.7550943 767.9051159 769.9990261 777.9264283
781.8694930 786.6842375 788.1355058 792.1602122 797.1540536
803.8154723 805.2182415 814.7618718 817.0559174 832.7971822
833.7268012 838.0862748 839.8330164 849.1545761 850.5224853
856.1389940 859.8674284 861.1299055 870.2276639 874.5628536
879.1787737 880.1914893 886.2696075 891.3545799 893.7412526
900.1585071
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4118
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1778
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5694
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7441
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8535
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.628
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.926
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.157
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.385
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.730
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.363
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.356
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.059
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.991
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.145
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.343
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.418
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.832
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.71
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00003 1.00001 0.99998
0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99997
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99996
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 74124 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00003 1.00001 0.99998
0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99997
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99996
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601221240153497519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601221240153497519.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2601221240153497519.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2601221240153497519.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 423
First residue number = 5
Last residue number = 215
Number of atoms found = 4118
Mean number per residue = 9.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1778
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5694
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7441
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9520
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.398
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.628
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.926
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.157
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.385
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.730
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.363
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.649
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.991
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.343
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.832
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.71
Bfactors> 106 vectors, 12354 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.177800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.645 for 423 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.090 +/- 0.15
Bfactors> = 19.092 +/- 10.34
Bfactors> Shiftng-fct= 19.002
Bfactors> Scaling-fct= 70.977
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2601221240153497519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2601221240153497519.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.1
Chkmod> 106 vectors, 12354 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4118 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 95 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9947
0.0034 0.6807
0.0034 0.9300
0.0034 0.6926
0.0034 0.9747
0.0034 0.7426
45.7870 0.4891
53.5609 0.3711
81.9380 0.1763
93.6682 0.2324
100.3179 0.4331
105.9486 0.2464
128.3897 0.3159
138.5491 0.1876
150.6971 0.6931
159.4783 0.3638
167.6953 0.3974
179.4147 0.2067
199.1315 0.1938
208.5034 0.2291
226.6317 0.4244
244.2356 0.2519
247.4729 0.2271
258.0848 0.2934
265.7824 0.3528
287.5190 0.3992
290.2537 0.1994
313.6446 0.4014
315.0512 0.2756
337.9123 0.2864
340.4847 0.4320
372.2165 0.3359
373.7970 0.5152
387.1234 0.2854
400.1534 0.3621
422.7915 0.4159
425.4327 0.3514
427.7820 0.1878
443.4806 0.1973
449.1606 0.3498
462.8647 0.4451
480.1202 0.2916
490.4466 0.4072
499.8528 0.1399
509.4325 0.2749
511.8570 0.2609
520.1972 0.2747
531.9640 0.4525
537.6961 0.2336
547.1520 0.3441
558.3511 0.2882
574.4842 0.2999
583.4451 0.1340
587.8744 0.2427
588.6761 0.2854
601.6526 0.2901
605.4621 0.2448
620.5614 0.2146
623.4995 0.0799
634.7448 0.3595
648.2544 0.1689
662.5569 0.2619
667.7861 0.2795
677.9498 0.1363
680.8135 0.4451
687.0201 0.2639
692.2349 0.1526
697.9177 0.1703
705.5629 0.2161
709.3131 0.4315
714.7777 0.2251
722.5709 0.3593
740.8606 0.2249
743.8783 0.2113
752.3107 0.3298
754.3455 0.2518
765.7480 0.4121
767.9007 0.4320
769.9708 0.4737
777.8932 0.3209
781.8242 0.3387
786.6355 0.3690
788.1330 0.4883
792.1621 0.3576
797.1329 0.4564
803.7617 0.3782
805.1541 0.4052
814.7621 0.4084
817.0022 0.2839
832.7262 0.3520
833.7168 0.3551
838.0192 0.2602
839.7762 0.3141
849.1313 0.4719
850.5188 0.1304
856.1151 0.4105
859.8257 0.4780
861.0590 0.5220
870.1854 0.3911
874.5107 0.4006
879.1500 0.5016
880.1553 0.4037
886.2298 0.3241
891.3374 0.2910
893.7154 0.4221
900.0914 0.4370
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221240153497519 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221240153497519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221240153497519 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221240153497519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221240153497519 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221240153497519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221240153497519 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221240153497519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221240153497519 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2601221240153497519.eigenfacs
2601221240153497519.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221240153497519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221240153497519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2601221240153497519.10.pdb
2601221240153497519.11.pdb
2601221240153497519.7.pdb
2601221240153497519.8.pdb
2601221240153497519.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.013s
user 0m12.905s
sys 0m0.103s
rm: cannot remove '2601221240153497519.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
