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elNémo has been hacked on november 27th.
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* gp130M *

LOGs for ID: 2601221356393511805

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601221356393511805.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601221356393511805.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601221356393511805.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    209
            Number of atoms found    =   1689
            Mean number per residue  =      8.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.332806 +/-    19.691869 From:   -53.625000 To:    30.172000
 =    -1.125965 +/-     9.905646 From:   -29.297000 To:    21.219000
 =    -0.828213 +/-    16.093591 From:   -43.531000 To:    33.406000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.4158 % Filled.
 Pdbmat>       566977  non-zero elements.
 Pdbmat>        61952 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     73.36 +/-     24.96
         Maximum number =    131
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.239040E+06
 Pdbmat> Larger element =  491.714    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
209 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601221356393511805.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601221356393511805.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601221356393511805.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1689 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   209 residues.
 Blocpdb>    11 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    12 atoms in block      2
 Block first atom:     12
 Blocpdb>    12 atoms in block      3
 Block first atom:     24
 Blocpdb>    14 atoms in block      4
 Block first atom:     36
 Blocpdb>    18 atoms in block      5
 Block first atom:     50
 Blocpdb>    16 atoms in block      6
 Block first atom:     68
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:    100
 Blocpdb>    15 atoms in block      9
 Block first atom:    112
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    127
 Blocpdb>    18 atoms in block     11
 Block first atom:    140
 Blocpdb>    19 atoms in block     12
 Block first atom:    158
 Blocpdb>    15 atoms in block     13
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    22 atoms in block     14
 Block first atom:    192
 Blocpdb>     8 atoms in block     15
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    20 atoms in block     16
 Block first atom:    222
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    242
 Blocpdb>    17 atoms in block     18
 Block first atom:    259
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    18 atoms in block     20
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    17 atoms in block     21
 Block first atom:    309
 Blocpdb>    15 atoms in block     22
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    19 atoms in block     23
 Block first atom:    341
 Blocpdb>    17 atoms in block     24
 Block first atom:    360
 Blocpdb>    20 atoms in block     25
 Block first atom:    377
 Blocpdb>    13 atoms in block     26
 Block first atom:    397
 Blocpdb>    15 atoms in block     27
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    14 atoms in block     28
 Block first atom:    425
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    439
 Blocpdb>    14 atoms in block     30
 Block first atom:    458
 Blocpdb>    13 atoms in block     31
 Block first atom:    472
 Blocpdb>    13 atoms in block     32
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    18 atoms in block     34
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    14 atoms in block     35
 Block first atom:    531
 Blocpdb>    23 atoms in block     36
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    15 atoms in block     37
 Block first atom:    568
 Blocpdb>    17 atoms in block     38
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    21 atoms in block     39
 Block first atom:    600
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    621
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    637
 Blocpdb>    13 atoms in block     42
 Block first atom:    651
 Blocpdb>    12 atoms in block     43
 Block first atom:    664
 Blocpdb>    16 atoms in block     44
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    13 atoms in block     45
 Block first atom:    692
 Blocpdb>    18 atoms in block     46
 Block first atom:    705
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    723
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    739
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    758
 Blocpdb>    21 atoms in block     50
 Block first atom:    772
 Blocpdb>    14 atoms in block     51
 Block first atom:    793
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    807
 Blocpdb>    17 atoms in block     53
 Block first atom:    822
 Blocpdb>    16 atoms in block     54
 Block first atom:    839
 Blocpdb>    13 atoms in block     55
 Block first atom:    855
 Blocpdb>    16 atoms in block     56
 Block first atom:    868
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    884
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    899
 Blocpdb>    12 atoms in block     59
 Block first atom:    916
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    928
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    944
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    961
 Blocpdb>    15 atoms in block     63
 Block first atom:    982
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:    997
 Blocpdb>    17 atoms in block     65
 Block first atom:   1010
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:   1027
 Blocpdb>    16 atoms in block     67
 Block first atom:   1040
 Blocpdb>    20 atoms in block     68
 Block first atom:   1056
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1076
 Blocpdb>    21 atoms in block     70
 Block first atom:   1092
 Blocpdb>    18 atoms in block     71
 Block first atom:   1113
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>    12 atoms in block     73
 Block first atom:   1148
 Blocpdb>    20 atoms in block     74
 Block first atom:   1160
 Blocpdb>    17 atoms in block     75
 Block first atom:   1180
 Blocpdb>    14 atoms in block     76
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    17 atoms in block     77
 Block first atom:   1211
 Blocpdb>    12 atoms in block     78
 Block first atom:   1228
 Blocpdb>    13 atoms in block     79
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    17 atoms in block     80
 Block first atom:   1253
 Blocpdb>    17 atoms in block     81
 Block first atom:   1270
 Blocpdb>    14 atoms in block     82
 Block first atom:   1287
 Blocpdb>    17 atoms in block     83
 Block first atom:   1301
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1318
 Blocpdb>    18 atoms in block     85
 Block first atom:   1335
 Blocpdb>    19 atoms in block     86
 Block first atom:   1353
 Blocpdb>    18 atoms in block     87
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    19 atoms in block     88
 Block first atom:   1390
 Blocpdb>    17 atoms in block     89
 Block first atom:   1409
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:   1426
 Blocpdb>    17 atoms in block     91
 Block first atom:   1443
 Blocpdb>    13 atoms in block     92
 Block first atom:   1460
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    14 atoms in block     94
 Block first atom:   1499
 Blocpdb>    20 atoms in block     95
 Block first atom:   1513
 Blocpdb>    18 atoms in block     96
 Block first atom:   1533
 Blocpdb>    11 atoms in block     97
 Block first atom:   1551
 Blocpdb>    12 atoms in block     98
 Block first atom:   1562
 Blocpdb>    19 atoms in block     99
 Block first atom:   1574
 Blocpdb>    17 atoms in block    100
 Block first atom:   1593
 Blocpdb>    18 atoms in block    101
 Block first atom:   1610
 Blocpdb>    15 atoms in block    102
 Block first atom:   1628
 Blocpdb>    16 atoms in block    103
 Block first atom:   1643
 Blocpdb>    17 atoms in block    104
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    14 atoms in block    105
 Block first atom:   1675

 Blocpdb>   105 blocks.

 Blocpdb> At most,     26 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       567082 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5067

 Prepmat> Matrix trace    =    1239040.0000
 Prepmat> Last element read:    5067   5067       105.4179
 Prepmat>         5566 lines saved.
 Prepmat>         4643 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1689
 RTB> Total mass =        1689.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1689
 RTB> Number of blocks =   105
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  124874.6799
 RTB>     31617 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      630
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    31617
 Diagstd> Projected matrix trace =  124874.6799

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    630 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 124874.6799
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0505536      0.0851564      0.2545890      0.3063030
      0.4390818      0.5045731      0.5932165      1.2420336      1.4935520
      1.6817242      2.6433647      2.8166283      3.4631913      4.0329105
      4.6242259      5.4896529      5.9285905      6.1053606      7.4054662
      8.0739031      8.1254869      8.4030316     10.2478883     10.3243958
     10.9502015     11.9151520     12.6673985     13.1877841     13.7348001
     14.8675294     15.6101511     16.3319239     17.2911336     17.8538573
     19.2448487     20.7868736     21.1767799     22.5871624     23.2170858
     23.9914912     24.9189275     25.4707711     25.6160893     27.1858886
     28.6722142     28.9801205     29.5477547     31.1485407     31.8734249
     32.2357695     32.5402946     32.9745504     34.0298972     35.4496380
     36.7224541     37.3732977     37.9405433     38.7555871     39.5121766
     40.8080117     41.7967663     42.1182993     42.3706680     44.1421694
     44.5678451     45.7160537     46.7078913     47.4869791     48.3406660
     48.8183492     50.0109360     50.5487876     50.8476472     51.7931636
     52.4817664     53.2459431     54.3741284     54.9819836     55.1932159
     56.0874880     56.2338318     57.2090164     58.0652716     58.5604201
     59.1567028     59.5607598     59.8841862     60.4590238     60.6241621
     60.8109294     62.3028009     62.3862257     63.3657445     63.9267911
     64.3487181     65.6449849     67.4639273     67.6792905     68.2840420
     68.8551511

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034319      0.0034324      0.0034331      0.0034340      0.0034341
      0.0034366     24.4158203     31.6886611     54.7917403     60.0995060
     71.9561597     77.1360398     83.6376647    121.0213399    132.7105520
    140.8227000    176.5524815    182.2468582    202.0847393    218.0743430
    233.5150094    254.4296511    264.4058191    268.3186989    295.5095248
    308.5581673    309.5422799    314.7844551    347.6261766    348.9213976
    359.3406383    374.8392612    386.4906541    394.3494099    402.4449216
    418.7113012    429.0410368    438.8478292    451.5512132    458.8400408
    476.3789153    495.0965129    499.7182861    516.0907998    523.2378273
    531.8925427    542.0757180    548.0451354    549.6062907    566.1963255
    581.4681040    584.5819123    590.2792576    606.0579222    613.0694089
    616.5443199    619.4496621    623.5692940    633.4693381    646.5486102
    658.0533864    663.8592188    668.8782172    676.0245077    682.5913136
    693.6940949    702.0477012    704.7428743    706.8510963    721.4763791
    724.9467354    734.2258104    742.1478106    748.3117279    755.0080722
    758.7292468    767.9408531    772.0592878    774.3382475    781.5045302
    786.6825234    792.3891901    800.7398354    805.2031819    806.7484321
    813.2578709    814.3181581    821.3485991    827.4723889    830.9930129
    835.2130280    838.0605446    840.3328793    844.3564894    845.5088447
    846.8102394    857.1346776    857.7083463    864.4155113    868.2338879
    871.0944168    879.8245109    891.9306538    893.3531621    897.3355850
    901.0803068

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1689
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    105

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9881E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9908E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9948E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0015E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  5.0554E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  8.5156E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2546    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3063    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4391    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5046    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5932    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.242    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.494    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.682    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.643    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.817    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.463    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.033    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.624    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.490    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.403    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.73    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.59    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.22    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.99    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.92    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.81    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.86    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    630 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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 1.00003 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999
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 1.00003

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    30402 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001
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 1.00003 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999
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 1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003
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 0.99996 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999
 1.00003

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601221356393511805.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601221356393511805.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601221356393511805.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601221356393511805.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    209
            Number of atoms found    =   1689
            Mean number per residue  =      8.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9881E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9908E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9948E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0015E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  5.0554E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  8.5156E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2546    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3063    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4391    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5046    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5932    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.242    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.494    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.682    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.643    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.817    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.463    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.033    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.624    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.490    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.105    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.405    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.074    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.125    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.403    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.86    

 Bfactors>  106 vectors,   5067 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.050554
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.308 for    209 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.387 +/-   1.45
 Bfactors> =     89.463 +/-  11.40
 Bfactors> Shiftng-fct=     89.077
 Bfactors> Scaling-fct=      7.848

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601221356393511805.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601221356393511805.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4318E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4364E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   24.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   31.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   54.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   60.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   71.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   77.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   83.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   121.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   132.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   140.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   176.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   182.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   202.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   218.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   233.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   254.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   264.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   268.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   295.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   308.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   309.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   314.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   347.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   348.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   359.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   374.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   386.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   394.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   402.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   418.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   429.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   438.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   451.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   458.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   476.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   495.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   755.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   774.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   781.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   786.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   805.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   814.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   846.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   871.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   891.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   897.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   901.1    

 Chkmod>  106 vectors,   5067 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1689 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    39 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    45 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    47 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    66 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9584
      0.0034      0.8122
      0.0034      0.7048
      0.0034      0.6003
      0.0034      0.8884
      0.0034      0.7952
     24.4149      0.0632
     31.6872      0.0867
     54.7906      0.5302
     60.0966      0.4295
     71.9546      0.0500
     77.1348      0.2021
     83.6329      0.2761
    121.0145      0.1719
    132.7248      0.3353
    140.8282      0.1340
    176.5327      0.3929
    182.2511      0.4146
    202.0705      0.5543
    218.0674      0.0267
    233.4993      0.1061
    254.4268      0.1974
    264.4036      0.2702
    268.2993      0.5054
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    308.5468      0.3381
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    374.8994      0.2570
    386.5137      0.2094
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    402.3573      0.2950
    418.7281      0.2350
    429.0205      0.0995
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    451.5170      0.1726
    458.7708      0.3399
    476.2985      0.1008
    495.1125      0.2665
    499.7348      0.0916
    516.1011      0.1243
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    542.0641      0.0309
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    606.0461      0.1613
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    792.3854      0.4017
    800.6751      0.4463
    805.1541      0.3335
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    879.7533      0.4738
    891.8664      0.4043
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    897.2705      0.5190
    901.0734      0.3620
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221356393511805 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2601221356393511805.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2601221356393511805.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=0
2601221356393511805.eigenfacs
2601221356393511805.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2601221356393511805.eigenfacs
2601221356393511805.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2601221356393511805.eigenfacs
2601221356393511805.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2601221356393511805.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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2601221356393511805.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 2601221356393511805.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2601221356393511805 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
2601221356393511805.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
2601221356393511805.eigenfacs
2601221356393511805.atom
making animated gifs
11 models are in 2601221356393511805.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2601221356393511805.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
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MODEL 7 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2601221356393511805.8.pdb
2601221356393511805.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m3.940s
user	0m3.894s
sys	0m0.037s
rm: cannot remove '2601221356393511805.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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