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***  55555  ***

LOGs for ID: 2601231135003640220

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2601231135003640220.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2601231135003640220.atom to be opened. Openam> File opened: 2601231135003640220.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 75 Number of atoms found = 4348 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.528743 +/- 11.007958 From: -2.782000 To: 51.097000 = 13.119621 +/- 15.396973 From: -27.020000 To: 47.359000 = 44.329402 +/- 17.122291 From: 10.158000 To: 95.243000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8699 % Filled. Pdbmat> 1590937 non-zero elements. Pdbmat> 173901 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.99 +/- 21.43 Maximum number = 125 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.478020E+06 Pdbmat> Larger element = 499.292 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 559 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2601231135003640220.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2601231135003640220.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2601231135003640220.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4348 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 559 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 30 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 55 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 74 Blocpdb> 28 atoms in block 5 Block first atom: 98 Blocpdb> 27 atoms in block 6 Block first atom: 126 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 153 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 179 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 202 Blocpdb> 31 atoms in block 10 Block first atom: 220 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 251 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 271 Blocpdb> 18 atoms in block 13 Block first atom: 293 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 311 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 335 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 361 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 389 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 412 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 429 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 451 Blocpdb> 25 atoms in block 21 Block first atom: 475 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 500 Blocpdb> 31 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 25 atoms in block 24 Block first atom: 547 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 572 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 596 Blocpdb> 27 atoms in block 27 Block first atom: 616 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 643 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 660 Blocpdb> 25 atoms in block 30 Block first atom: 684 Blocpdb> 21 atoms in block 31 Block first atom: 709 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 730 Blocpdb> 26 atoms in block 33 Block first atom: 749 Blocpdb> 23 atoms in block 34 Block first atom: 775 Blocpdb> 22 atoms in block 35 Block first atom: 798 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 820 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 844 Blocpdb> 29 atoms in block 38 Block first atom: 871 Blocpdb> 26 atoms in block 39 Block first atom: 900 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 926 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 942 Blocpdb> 25 atoms in block 42 Block first atom: 959 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 984 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 1010 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 1030 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 1054 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 1072 Blocpdb> 27 atoms in block 48 Block first atom: 1091 Blocpdb> 25 atoms in block 49 Block first atom: 1118 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 1143 Blocpdb> 29 atoms in block 51 Block first atom: 1160 Blocpdb> 32 atoms in block 52 Block first atom: 1189 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1221 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1242 Blocpdb> 17 atoms in block 55 Block first atom: 1265 Blocpdb> 21 atoms in block 56 Block first atom: 1282 Blocpdb> 30 atoms in block 57 Block first atom: 1303 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1333 Blocpdb> 24 atoms in block 59 Block first atom: 1358 Blocpdb> 24 atoms in block 60 Block first atom: 1382 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 1406 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1422 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1443 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 1470 Blocpdb> 23 atoms in block 65 Block first atom: 1487 Blocpdb> 29 atoms in block 66 Block first atom: 1510 Blocpdb> 25 atoms in block 67 Block first atom: 1539 Blocpdb> 26 atoms in block 68 Block first atom: 1564 Blocpdb> 20 atoms in block 69 Block first atom: 1590 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1610 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 1632 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1656 Blocpdb> 30 atoms in block 73 Block first atom: 1676 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1706 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 1730 Blocpdb> 24 atoms in block 76 Block first atom: 1756 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1780 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1797 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1814 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 1837 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1868 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1890 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1916 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1943 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 1958 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1988 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2005 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2029 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2052 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 2077 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 2091 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2113 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 2140 Blocpdb> 25 atoms in block 94 Block first atom: 2155 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2180 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2203 Blocpdb> 23 atoms in block 97 Block first atom: 2227 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2250 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2275 Blocpdb> 21 atoms in block 100 Block first atom: 2297 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 2318 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2342 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2368 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 2393 Blocpdb> 28 atoms in block 105 Block first atom: 2411 Blocpdb> 23 atoms in block 106 Block first atom: 2439 Blocpdb> 23 atoms in block 107 Block first atom: 2462 Blocpdb> 30 atoms in block 108 Block first atom: 2485 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2515 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2541 Blocpdb> 26 atoms in block 111 Block first atom: 2562 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 2588 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 2616 Blocpdb> 28 atoms in block 114 Block first atom: 2636 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 2664 Blocpdb> 26 atoms in block 116 Block first atom: 2684 Blocpdb> 23 atoms in block 117 Block first atom: 2710 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 2733 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 2753 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2774 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 2802 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2829 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 2853 Blocpdb> 23 atoms in block 124 Block first atom: 2876 Blocpdb> 27 atoms in block 125 Block first atom: 2899 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 2926 Blocpdb> 23 atoms in block 127 Block first atom: 2945 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 2968 Blocpdb> 25 atoms in block 129 Block first atom: 2992 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 3017 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 3036 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3060 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 3084 Blocpdb> 20 atoms in block 134 Block first atom: 3102 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 3122 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 3144 Blocpdb> 23 atoms in block 137 Block first atom: 3160 Blocpdb> 28 atoms in block 138 Block first atom: 3183 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 3211 Blocpdb> 25 atoms in block 140 Block first atom: 3233 Blocpdb> 25 atoms in block 141 Block first atom: 3258 Blocpdb> 5 atoms in block 142 Block first atom: 3283 Blocpdb> 24 atoms in block 143 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 144 Block first atom: 3312 Blocpdb> 34 atoms in block 145 Block first atom: 3339 Blocpdb> 23 atoms in block 146 Block first atom: 3373 Blocpdb> 25 atoms in block 147 Block first atom: 3396 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 3421 Blocpdb> 28 atoms in block 149 Block first atom: 3445 Blocpdb> 25 atoms in block 150 Block first atom: 3473 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3498 Blocpdb> 20 atoms in block 152 Block first atom: 3523 Blocpdb> 21 atoms in block 153 Block first atom: 3543 Blocpdb> 24 atoms in block 154 Block first atom: 3564 Blocpdb> 26 atoms in block 155 Block first atom: 3588 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 3614 Blocpdb> 23 atoms in block 157 Block first atom: 3638 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 3661 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3685 Blocpdb> 33 atoms in block 160 Block first atom: 3707 Blocpdb> 20 atoms in block 161 Block first atom: 3740 Blocpdb> 28 atoms in block 162 Block first atom: 3760 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 3788 Blocpdb> 27 atoms in block 164 Block first atom: 3812 Blocpdb> 23 atoms in block 165 Block first atom: 3839 Blocpdb> 31 atoms in block 166 Block first atom: 3862 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3893 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 3912 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 3929 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 3956 Blocpdb> 25 atoms in block 171 Block first atom: 3979 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 4004 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 4029 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 4042 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 4066 Blocpdb> 21 atoms in block 176 Block first atom: 4080 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 4101 Blocpdb> 22 atoms in block 178 Block first atom: 4123 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 4145 Blocpdb> 31 atoms in block 180 Block first atom: 4160 Blocpdb> 22 atoms in block 181 Block first atom: 4191 Blocpdb> 20 atoms in block 182 Block first atom: 4213 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 4233 Blocpdb> 18 atoms in block 184 Block first atom: 4258 Blocpdb> 20 atoms in block 185 Block first atom: 4276 Blocpdb> 20 atoms in block 186 Block first atom: 4296 Blocpdb> 33 atoms in block 187 Block first atom: 4315 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1591124 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13044 Prepmat> Matrix trace = 3478020.0000 Prepmat> Last element read: 13044 13044 147.4509 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15738 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4348 RTB> Total mass = 4348.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4348 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 233221.7265 RTB> 63435 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63435 Diagstd> Projected matrix trace = 233221.7265 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 233221.7265 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3955881 0.6077337 1.1583466 1.7621671 1.8344728 1.9966222 2.3291595 2.4495448 2.7553128 2.8914285 3.2486724 3.6387224 3.9965503 4.0809587 4.3108339 4.8637137 5.4844896 5.8529511 6.5462401 7.2435828 7.4582363 7.8007262 8.1646791 8.3076927 8.7628737 9.3456330 9.8217601 9.8885623 10.3307643 11.0827011 11.6119473 11.8929341 12.6285575 13.1375836 13.2458011 13.9041126 14.2045846 14.5408587 15.4720941 15.5878973 16.1449314 16.5477953 16.7784600 17.1730555 18.3497354 19.1349336 19.5140862 19.9038448 20.1858669 20.4885233 20.6490710 21.0374043 21.5815850 22.5786873 23.6652471 23.9683645 24.6275668 25.0002499 25.1517428 25.2339620 25.8654850 26.3544773 26.5339945 27.4537480 27.7043646 27.9696969 28.4250009 29.1542361 29.6238514 30.0113169 30.2947648 31.0911979 31.5037496 32.0239789 32.7636277 32.9094629 33.5716191 33.9494389 34.2018846 34.6868439 34.9372815 35.6909838 35.9517104 36.9868809 37.4162395 37.4418156 38.2272310 38.6903103 39.7573855 40.0079024 40.4355248 41.1729807 41.2552908 41.7870834 42.5128743 43.0394141 43.2260192 44.1991145 44.7382522 44.9041649 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034338 0.0034341 0.0034342 0.0034345 0.0034346 68.2993971 84.6548667 116.8730923 144.1513878 147.0790840 153.4416406 165.7276199 169.9565758 180.2522684 184.6509340 195.7258747 207.1427511 217.0890526 219.3695689 225.4633341 239.4855310 254.3099720 262.7137035 277.8377444 292.2617594 296.5605311 303.2932867 310.2878997 312.9936251 321.4537945 331.9706130 340.3219340 341.4773138 349.0289956 361.5081490 370.0392645 374.4896221 385.8976676 393.5981304 395.2158878 404.9178462 409.2696592 414.0857704 427.1395933 428.7351075 436.3283005 441.7385994 444.8067080 450.0067903 465.1683770 475.0165708 479.6996376 484.4665189 487.8867038 491.5306561 493.4527106 498.0711159 504.4718634 515.9939677 528.2637399 531.6361206 538.8973320 542.9595238 544.6021131 545.4915189 552.2752654 557.4712612 559.3666857 568.9788215 571.5699359 574.3004550 578.9559526 586.3353969 591.0388657 594.8915594 597.6942433 605.4998049 609.5037802 614.5156194 621.5717555 622.9535678 629.1894385 632.7200264 635.0681012 639.5546677 641.8592947 648.7457710 651.1110393 660.4183542 664.2404949 664.4674791 671.4005623 675.4549467 684.7060873 686.8599142 690.5208909 696.7892382 697.4853769 701.9663761 708.0362851 712.4074555 713.9501699 721.9415947 726.3313453 727.6769063 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4348 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.329 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.864 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.458 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.801 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.308 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.90 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 0.99996 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 78264 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 0.99996 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601231135003640220.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601231135003640220.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2601231135003640220.atom Openam> file on opening on unit 11: 2601231135003640220.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 75 Number of atoms found = 4348 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.329 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.891 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.864 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.244 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.458 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.801 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.308 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90 Bfactors> 106 vectors, 13044 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.395600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.353 for 559 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.046 +/- 0.08 Bfactors> = 57.723 +/- 27.43 Bfactors> Shiftng-fct= 57.676 Bfactors> Scaling-fct= 355.114 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2601231135003640220.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2601231135003640220.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4 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Chkmod> That is: 4348 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7285 0.0034 0.7628 0.0034 0.8724 0.0034 0.9727 0.0034 0.8857 0.0034 0.9813 68.2975 0.2740 84.6489 0.3365 116.8506 0.2428 144.1384 0.1140 147.0538 0.1438 153.4496 0.2272 165.7148 0.1361 169.9651 0.2013 180.2343 0.3936 184.6293 0.2757 195.7273 0.2714 207.1418 0.0379 217.0919 0.3501 219.3613 0.2222 225.4580 0.4763 239.4823 0.3644 254.2877 0.3411 262.7035 0.2610 277.8207 0.1594 292.2576 0.1597 296.5431 0.4025 303.2856 0.2274 310.2807 0.3450 312.9860 0.3633 321.4423 0.3196 331.9629 0.3196 340.3115 0.1483 341.4702 0.2754 349.0011 0.3949 361.4486 0.3480 369.9924 0.4756 374.4273 0.4196 385.9031 0.3641 393.6174 0.4656 395.2616 0.4304 404.8406 0.2908 409.1860 0.4188 414.0558 0.3753 427.0924 0.3964 428.7456 0.4595 436.2429 0.4753 441.7491 0.5440 444.8080 0.3256 449.9474 0.3360 465.1518 0.4163 474.9349 0.3556 479.6288 0.1876 484.3989 0.2948 487.9157 0.3872 491.5273 0.4979 493.4426 0.4505 498.0805 0.4111 504.4317 0.3613 515.9868 0.4397 528.2941 0.4004 531.6314 0.2751 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DQ=-80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom making animated gifs 11 models are in 2601231135003640220.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2601231135003640220 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601231135003640220.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2601231135003640220 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom making animated gifs 11 models are in 2601231135003640220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2601231135003640220 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2601231135003640220 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2601231135003640220.eigenfacs 2601231135003640220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2601231135003640220.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2601231135003640220.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2601231135003640220.10.pdb 2601231135003640220.11.pdb 2601231135003640220.7.pdb 2601231135003640220.8.pdb 2601231135003640220.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m23.214s user 0m23.087s sys 0m0.117s rm: cannot remove '2601231135003640220.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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