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* HYDROLASE 06-SEP-12 4H01 *

LOGs for ID: 2601261848464192948

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2601261848464192948.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2601261848464192948.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2601261848464192948.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    484
            First residue number     =      4
            Last  residue number     =    488
            Number of atoms found    =   3747
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     6.863487 +/-    12.968597 From:   -27.594000 To:    33.981000
 =    22.872810 +/-    13.919143 From:   -30.296000 To:    54.599000
 =    31.525907 +/-    11.164537 From:     4.722000 To:    57.906000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.4199 % Filled.
 Pdbmat>      1529033  non-zero elements.
 Pdbmat>       167424 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     89.36 +/-     24.22
         Maximum number =    137
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.348480E+06
 Pdbmat> Larger element =  511.043    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
484 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2601261848464192948.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2601261848464192948.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601261848464192948.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3747 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   484 residues.
 Blocpdb>    18 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    24 atoms in block      2
 Block first atom:     19
 Blocpdb>    17 atoms in block      3
 Block first atom:     43
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     60
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     83
 Blocpdb>    23 atoms in block      6
 Block first atom:    108
 Blocpdb>    25 atoms in block      7
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    25 atoms in block      8
 Block first atom:    156
 Blocpdb>    19 atoms in block      9
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    24 atoms in block     10
 Block first atom:    200
 Blocpdb>    20 atoms in block     11
 Block first atom:    224
 Blocpdb>    23 atoms in block     12
 Block first atom:    244
 Blocpdb>    25 atoms in block     13
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    16 atoms in block     14
 Block first atom:    292
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    20 atoms in block     16
 Block first atom:    334
 Blocpdb>    27 atoms in block     17
 Block first atom:    354
 Blocpdb>    22 atoms in block     18
 Block first atom:    381
 Blocpdb>    16 atoms in block     19
 Block first atom:    403
 Blocpdb>    25 atoms in block     20
 Block first atom:    419
 Blocpdb>    25 atoms in block     21
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    22 atoms in block     22
 Block first atom:    469
 Blocpdb>    23 atoms in block     23
 Block first atom:    491
 Blocpdb>    23 atoms in block     24
 Block first atom:    514
 Blocpdb>    23 atoms in block     25
 Block first atom:    537
 Blocpdb>    29 atoms in block     26
 Block first atom:    560
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    589
 Blocpdb>    18 atoms in block     28
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    627
 Blocpdb>    22 atoms in block     30
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    24 atoms in block     31
 Block first atom:    662
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    686
 Blocpdb>    25 atoms in block     33
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    19 atoms in block     34
 Block first atom:    737
 Blocpdb>    25 atoms in block     35
 Block first atom:    756
 Blocpdb>    25 atoms in block     36
 Block first atom:    781
 Blocpdb>    33 atoms in block     37
 Block first atom:    806
 Blocpdb>    21 atoms in block     38
 Block first atom:    839
 Blocpdb>    24 atoms in block     39
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    19 atoms in block     40
 Block first atom:    884
 Blocpdb>    26 atoms in block     41
 Block first atom:    903
 Blocpdb>    25 atoms in block     42
 Block first atom:    929
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    954
 Blocpdb>    34 atoms in block     44
 Block first atom:    973
 Blocpdb>    24 atoms in block     45
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    26 atoms in block     46
 Block first atom:   1031
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1057
 Blocpdb>    22 atoms in block     48
 Block first atom:   1083
 Blocpdb>    24 atoms in block     49
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    21 atoms in block     50
 Block first atom:   1129
 Blocpdb>    11 atoms in block     51
 Block first atom:   1150
 Blocpdb>    27 atoms in block     52
 Block first atom:   1161
 Blocpdb>    26 atoms in block     53
 Block first atom:   1188
 Blocpdb>    23 atoms in block     54
 Block first atom:   1214
 Blocpdb>    27 atoms in block     55
 Block first atom:   1237
 Blocpdb>    25 atoms in block     56
 Block first atom:   1264
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>    24 atoms in block     58
 Block first atom:   1314
 Blocpdb>    25 atoms in block     59
 Block first atom:   1338
 Blocpdb>    20 atoms in block     60
 Block first atom:   1363
 Blocpdb>    18 atoms in block     61
 Block first atom:   1383
 Blocpdb>    26 atoms in block     62
 Block first atom:   1401
 Blocpdb>    22 atoms in block     63
 Block first atom:   1427
 Blocpdb>    20 atoms in block     64
 Block first atom:   1449
 Blocpdb>    22 atoms in block     65
 Block first atom:   1469
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1491
 Blocpdb>    25 atoms in block     67
 Block first atom:   1509
 Blocpdb>    18 atoms in block     68
 Block first atom:   1534
 Blocpdb>    19 atoms in block     69
 Block first atom:   1552
 Blocpdb>    20 atoms in block     70
 Block first atom:   1571
 Blocpdb>    27 atoms in block     71
 Block first atom:   1591
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   1618
 Blocpdb>    21 atoms in block     73
 Block first atom:   1642
 Blocpdb>    23 atoms in block     74
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    21 atoms in block     75
 Block first atom:   1686
 Blocpdb>    24 atoms in block     76
 Block first atom:   1707
 Blocpdb>    20 atoms in block     77
 Block first atom:   1731
 Blocpdb>    18 atoms in block     78
 Block first atom:   1751
 Blocpdb>    21 atoms in block     79
 Block first atom:   1769
 Blocpdb>    27 atoms in block     80
 Block first atom:   1790
 Blocpdb>    24 atoms in block     81
 Block first atom:   1817
 Blocpdb>    23 atoms in block     82
 Block first atom:   1841
 Blocpdb>    16 atoms in block     83
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    22 atoms in block     84
 Block first atom:   1880
 Blocpdb>    20 atoms in block     85
 Block first atom:   1902
 Blocpdb>    28 atoms in block     86
 Block first atom:   1922
 Blocpdb>    22 atoms in block     87
 Block first atom:   1950
 Blocpdb>    22 atoms in block     88
 Block first atom:   1972
 Blocpdb>    24 atoms in block     89
 Block first atom:   1994
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   2018
 Blocpdb>    19 atoms in block     91
 Block first atom:   2034
 Blocpdb>    19 atoms in block     92
 Block first atom:   2053
 Blocpdb>    34 atoms in block     93
 Block first atom:   2072
 Blocpdb>    27 atoms in block     94
 Block first atom:   2106
 Blocpdb>    29 atoms in block     95
 Block first atom:   2133
 Blocpdb>    19 atoms in block     96
 Block first atom:   2162
 Blocpdb>    27 atoms in block     97
 Block first atom:   2181
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   2208
 Blocpdb>    26 atoms in block     99
 Block first atom:   2226
 Blocpdb>    21 atoms in block    100
 Block first atom:   2252
 Blocpdb>    18 atoms in block    101
 Block first atom:   2273
 Blocpdb>    28 atoms in block    102
 Block first atom:   2291
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   2319
 Blocpdb>    21 atoms in block    104
 Block first atom:   2343
 Blocpdb>    23 atoms in block    105
 Block first atom:   2364
 Blocpdb>    19 atoms in block    106
 Block first atom:   2387
 Blocpdb>    23 atoms in block    107
 Block first atom:   2406
 Blocpdb>    24 atoms in block    108
 Block first atom:   2429
 Blocpdb>    23 atoms in block    109
 Block first atom:   2453
 Blocpdb>    23 atoms in block    110
 Block first atom:   2476
 Blocpdb>    21 atoms in block    111
 Block first atom:   2499
 Blocpdb>    27 atoms in block    112
 Block first atom:   2520
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   2547
 Blocpdb>    19 atoms in block    114
 Block first atom:   2573
 Blocpdb>    19 atoms in block    115
 Block first atom:   2592
 Blocpdb>    24 atoms in block    116
 Block first atom:   2611
 Blocpdb>    25 atoms in block    117
 Block first atom:   2635
 Blocpdb>    29 atoms in block    118
 Block first atom:   2660
 Blocpdb>    22 atoms in block    119
 Block first atom:   2689
 Blocpdb>    23 atoms in block    120
 Block first atom:   2711
 Blocpdb>    21 atoms in block    121
 Block first atom:   2734
 Blocpdb>    25 atoms in block    122
 Block first atom:   2755
 Blocpdb>    29 atoms in block    123
 Block first atom:   2780
 Blocpdb>    19 atoms in block    124
 Block first atom:   2809
 Blocpdb>    20 atoms in block    125
 Block first atom:   2828
 Blocpdb>    19 atoms in block    126
 Block first atom:   2848
 Blocpdb>    27 atoms in block    127
 Block first atom:   2867
 Blocpdb>    30 atoms in block    128
 Block first atom:   2894
 Blocpdb>    22 atoms in block    129
 Block first atom:   2924
 Blocpdb>    24 atoms in block    130
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    23 atoms in block    131
 Block first atom:   2970
 Blocpdb>    21 atoms in block    132
 Block first atom:   2993
 Blocpdb>    22 atoms in block    133
 Block first atom:   3014
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   3036
 Blocpdb>    23 atoms in block    135
 Block first atom:   3065
 Blocpdb>    28 atoms in block    136
 Block first atom:   3088
 Blocpdb>    20 atoms in block    137
 Block first atom:   3116
 Blocpdb>    27 atoms in block    138
 Block first atom:   3136
 Blocpdb>    21 atoms in block    139
 Block first atom:   3163
 Blocpdb>    28 atoms in block    140
 Block first atom:   3184
 Blocpdb>    28 atoms in block    141
 Block first atom:   3212
 Blocpdb>    21 atoms in block    142
 Block first atom:   3240
 Blocpdb>    20 atoms in block    143
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    21 atoms in block    144
 Block first atom:   3281
 Blocpdb>    21 atoms in block    145
 Block first atom:   3302
 Blocpdb>    21 atoms in block    146
 Block first atom:   3323
 Blocpdb>    25 atoms in block    147
 Block first atom:   3344
 Blocpdb>    30 atoms in block    148
 Block first atom:   3369
 Blocpdb>    23 atoms in block    149
 Block first atom:   3399
 Blocpdb>    22 atoms in block    150
 Block first atom:   3422
 Blocpdb>    20 atoms in block    151
 Block first atom:   3444
 Blocpdb>    26 atoms in block    152
 Block first atom:   3464
 Blocpdb>    29 atoms in block    153
 Block first atom:   3490
 Blocpdb>    27 atoms in block    154
 Block first atom:   3519
 Blocpdb>    26 atoms in block    155
 Block first atom:   3546
 Blocpdb>    28 atoms in block    156
 Block first atom:   3572
 Blocpdb>    30 atoms in block    157
 Block first atom:   3600
 Blocpdb>    28 atoms in block    158
 Block first atom:   3630
 Blocpdb>    20 atoms in block    159
 Block first atom:   3658
 Blocpdb>    21 atoms in block    160
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    22 atoms in block    161
 Block first atom:   3699
 Blocpdb>    27 atoms in block    162
 Block first atom:   3720

 Blocpdb>   162 blocks.

 Blocpdb> At most,     34 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    11 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1529195 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      11241

 Prepmat> Matrix trace    =    3348480.0000
 Prepmat> Last element read:   11241  11241       100.2758
 Prepmat>        13204 lines saved.
 Prepmat>        11413 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3747
 RTB> Total mass =        3747.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3747
 RTB> Number of blocks =   162
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  235399.6264
 RTB>     62010 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      972
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    62010
 Diagstd> Projected matrix trace =  235399.6264

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    972 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 235399.6264
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0336209      0.0580453      0.2554118      1.0209269
      1.2866894      3.2739255      4.1595129      4.8087115      5.4089320
      6.7324188      7.7583124      7.9544675      9.3549061      9.9098933
     11.4701079     12.2612822     14.3825834     14.5803529     15.5093626
     15.6521814     17.0303346     17.6532563     18.4782334     19.3427779
     20.2114313     21.0231464     22.2786710     23.0066980     23.5169755
     24.3463139     25.0598723     25.3225447     26.2261795     26.8537501
     27.8282546     28.3727604     29.4737131     30.4096780     31.5413332
     31.9469535     32.1964824     34.0784389     34.9054645     35.8275803
     36.2607759     37.7284167     38.1948618     39.0414778     39.9103967
     40.0413406     40.3688498     41.1069730     42.2254359     42.9971412
     43.3660852     44.2038767     44.8411433     45.9890644     46.6051528
     47.2942676     47.9940370     48.0952046     49.1989793     50.2644561
     51.7044254     52.2762959     52.7471757     53.1602260     54.0284356
     54.3485679     55.4091104     56.0642357     57.1322683     57.5222813
     58.0519732     58.6585828     59.2261461     59.7207048     60.9046314
     61.1759645     62.1509902     62.8993778     63.0499486     63.9266925
     64.4247724     64.9173464     65.7613495     66.7677110     66.8795016
     67.7254307     68.6940973     68.9733004     70.0980523     70.4443034
     71.0137840     72.0621165     72.6590922     73.2856158     73.5873210
     73.9711787

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034328      0.0034330      0.0034331      0.0034334      0.0034336
      0.0034339     19.9113137     26.1624776     54.8802145    109.7217217
    123.1777124    196.4851253    221.4708231    238.1275480    252.5521325
    281.7609762    302.4676360    306.2674462    332.1352697    341.8454228
    367.7723140    380.2447486    411.8259709    414.6477356    427.6537216
    429.6182448    448.1329422    456.2550590    466.7942575    477.5894263
    488.1955484    497.9023053    512.5543464    520.8617027    526.6062549
    535.8113252    543.6065829    546.4481420    556.1126770    562.7269981
    572.8465009    578.4236954    589.5392248    598.8267483    609.8672377
    613.7761447    616.1685012    633.9209817    641.5669611    649.9860251
    653.9037483    667.0057384    671.1162456    678.5133620    686.0224098
    687.1468894    689.9513491    696.2304752    705.6386351    712.0575093
    715.1059470    721.9804862    727.1660911    736.4149009    741.3311486
    746.7917861    752.2962918    753.0887646    761.6813587    769.8848505
    780.8347602    785.1410494    788.6692090    791.7511258    798.1903567
    800.5516051    808.3247362    813.0892766    820.7974789    823.5942978
    827.3776278    831.6892025    835.7031075    839.1850577    847.4624021
    849.3480475    856.0897682    861.2286226    862.2588264    868.2332181
    871.6090414    874.9347379    880.6039695    887.3164316    888.0589476
    893.6576310    900.0258656    901.8530619    909.1766132    911.4192973
    915.0958964    921.8256472    925.6360575    929.6182711    931.5298507
    933.9562869

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3747
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    162

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9934E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9969E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  3.3621E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  5.8045E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2554    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.021    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.287    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.274    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.160    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.809    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.409    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.732    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.758    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.954    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.355    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.910    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.97    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    972 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00002 0.99996 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999
 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00003 0.99999 1.00002 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99996 0.99998 0.99999 0.99997 0.99997
 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    67446 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00002 0.99996 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999
 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00003 0.99999 1.00002 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99996 0.99998 0.99999 0.99997 0.99997
 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601261848464192948.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601261848464192948.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2601261848464192948.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2601261848464192948.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    484
            First residue number     =      4
            Last  residue number     =    488
            Number of atoms found    =   3747
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9934E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9969E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  3.3621E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  5.8045E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2554    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.021    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.287    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.274    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.160    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.809    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.409    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.732    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.758    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.954    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.355    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.910    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.97    

 Bfactors>  106 vectors,  11241 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.033621
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.566 for    484 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.198 +/-   1.71
 Bfactors> =     17.371 +/-   6.21
 Bfactors> Shiftng-fct=     17.172
 Bfactors> Scaling-fct=      3.634

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2601261848464192948.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2601261848464192948.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.9    

 Chkmod>  106 vectors,  11241 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3747 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9702
      0.0034      0.8481
      0.0034      0.6834
      0.0034      0.9641
      0.0034      0.8038
      0.0034      0.6821
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     26.1613      0.0233
     54.8766      0.0084
    109.7209      0.0184
    123.1873      0.0204
    196.4789      0.0947
    221.4743      0.1785
    238.1245      0.5039
    252.5429      0.3055
    281.7401      0.4803
    302.4486      0.0440
    306.2453      0.4142
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    380.2085      0.2028
    411.7713      0.5868
    414.6249      0.3971
    427.6442      0.5334
    429.5699      0.6381
    448.1093      0.6008
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    798.1676      0.4312
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    808.2965      0.5237
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    931.5068      0.2526
    933.9088      0.3248
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2601261848464192948 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2601261848464192948.eigenfacs
2601261848464192948.atom
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.968s
user	0m13.884s
sys	0m0.081s
rm: cannot remove '2601261848464192948.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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