***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260128101717238326.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260128101717238326.atom to be opened.
Openam> File opened: 260128101717238326.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 1
Last residue number = 285
Number of atoms found = 2187
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.337839 +/- 13.222393 From: -29.283000 To: 26.142000
= -0.377842 +/- 8.820595 From: -20.040000 To: 25.493000
= -0.279067 +/- 11.661075 From: -31.401000 To: 22.205000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.8112 % Filled.
Pdbmat> 820421 non-zero elements.
Pdbmat> 89716 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.04 +/- 24.07
Maximum number = 134
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.794320E+06
Pdbmat> Larger element = 500.150
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
285 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260128101717238326.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260128101717238326.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260128101717238326.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2187 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 285 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 35
Blocpdb> 13 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 15 atoms in block 5
Block first atom: 67
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 82
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 96
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 16 atoms in block 9
Block first atom: 132
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 148
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 164
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 181
Blocpdb> 10 atoms in block 13
Block first atom: 197
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 207
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 221
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 237
Blocpdb> 10 atoms in block 17
Block first atom: 253
Blocpdb> 13 atoms in block 18
Block first atom: 263
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 276
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 292
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 304
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 318
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 328
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 347
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 365
Blocpdb> 20 atoms in block 26
Block first atom: 384
Blocpdb> 24 atoms in block 27
Block first atom: 404
Blocpdb> 18 atoms in block 28
Block first atom: 428
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 446
Blocpdb> 11 atoms in block 30
Block first atom: 460
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 471
Blocpdb> 17 atoms in block 32
Block first atom: 484
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 501
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 523
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 541
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 561
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 572
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 587
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 602
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 623
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 640
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 660
Blocpdb> 18 atoms in block 43
Block first atom: 673
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 691
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 706
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 718
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 735
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 748
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 761
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 778
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 795
Blocpdb> 14 atoms in block 52
Block first atom: 809
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 823
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 840
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 869
Blocpdb> 18 atoms in block 57
Block first atom: 888
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 906
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 922
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 942
Blocpdb> 18 atoms in block 61
Block first atom: 955
Blocpdb> 26 atoms in block 62
Block first atom: 973
Blocpdb> 13 atoms in block 63
Block first atom: 999
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 1012
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 1023
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1037
Blocpdb> 12 atoms in block 67
Block first atom: 1051
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 1063
Blocpdb> 8 atoms in block 69
Block first atom: 1071
Blocpdb> 10 atoms in block 70
Block first atom: 1079
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 1089
Blocpdb> 10 atoms in block 72
Block first atom: 1097
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 1107
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 1115
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1123
Blocpdb> 17 atoms in block 76
Block first atom: 1137
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1154
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1169
Blocpdb> 13 atoms in block 79
Block first atom: 1184
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1197
Blocpdb> 11 atoms in block 81
Block first atom: 1211
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1222
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1235
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1247
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1265
Blocpdb> 13 atoms in block 86
Block first atom: 1280
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1293
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1307
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1322
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1337
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1349
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 1364
Blocpdb> 21 atoms in block 93
Block first atom: 1383
Blocpdb> 18 atoms in block 94
Block first atom: 1404
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1422
Blocpdb> 14 atoms in block 96
Block first atom: 1433
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1447
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1463
Blocpdb> 14 atoms in block 99
Block first atom: 1477
Blocpdb> 11 atoms in block 100
Block first atom: 1491
Blocpdb> 18 atoms in block 101
Block first atom: 1502
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 1520
Blocpdb> 10 atoms in block 103
Block first atom: 1543
Blocpdb> 14 atoms in block 104
Block first atom: 1553
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1567
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1584
Blocpdb> 10 atoms in block 107
Block first atom: 1601
Blocpdb> 10 atoms in block 108
Block first atom: 1611
Blocpdb> 11 atoms in block 109
Block first atom: 1621
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 1632
Blocpdb> 15 atoms in block 111
Block first atom: 1651
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1666
Blocpdb> 12 atoms in block 113
Block first atom: 1681
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1693
Blocpdb> 16 atoms in block 115
Block first atom: 1710
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1726
Blocpdb> 12 atoms in block 117
Block first atom: 1745
Blocpdb> 23 atoms in block 118
Block first atom: 1757
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1780
Blocpdb> 21 atoms in block 120
Block first atom: 1795
Blocpdb> 15 atoms in block 121
Block first atom: 1816
Blocpdb> 19 atoms in block 122
Block first atom: 1831
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 1850
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1868
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1883
Blocpdb> 16 atoms in block 126
Block first atom: 1896
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 1912
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 1928
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 1945
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1961
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 1977
Blocpdb> 19 atoms in block 132
Block first atom: 1992
Blocpdb> 18 atoms in block 133
Block first atom: 2011
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 2029
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2046
Blocpdb> 18 atoms in block 136
Block first atom: 2060
Blocpdb> 16 atoms in block 137
Block first atom: 2078
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 2094
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2108
Blocpdb> 18 atoms in block 140
Block first atom: 2120
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2138
Blocpdb> 20 atoms in block 142
Block first atom: 2158
Blocpdb> 10 atoms in block 143
Block first atom: 2177
Blocpdb> 143 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 820564 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6561
Prepmat> Matrix trace = 1794320.0000
Prepmat> Last element read: 6561 6561 126.4508
Prepmat> 10297 lines saved.
Prepmat> 8777 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2187
RTB> Total mass = 2187.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2187
RTB> Number of blocks = 143
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 195012.2405
RTB> 52539 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 858
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52539
Diagstd> Projected matrix trace = 195012.2405
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 858 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 195012.2405
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0601561 1.5211040 2.3769075 4.0094055
4.5850293 5.6273631 6.7803939 7.3402613 8.3141644
9.8991048 11.0452608 11.6365844 12.6489342 12.9408741
13.3052881 13.7180887 15.6905022 16.9093619 18.0157313
18.1809776 18.7774084 19.1169363 20.1895496 21.2424041
22.1643098 23.2030440 24.5050113 25.0547662 25.5517948
26.9676110 27.9396529 28.5490110 29.9375920 30.3831975
31.3283687 31.9398149 32.0654669 33.3959883 34.8736251
35.7278602 36.7990918 37.6370322 37.9381332 38.9434283
39.2477742 40.5492583 41.5325613 42.3725980 42.9296924
43.7190016 44.3930507 45.3367541 45.7303188 46.0475483
46.3938514 46.7313507 49.3992055 49.7636140 50.3523576
51.4665449 51.6539407 53.0851903 53.6214453 54.4562711
55.5333670 55.9099926 56.4945453 56.6960989 57.7833198
58.5412339 58.9286099 59.5603737 60.1923875 60.7937168
61.7928159 62.4296642 62.8945292 63.5817864 64.1385279
64.4901756 65.2617651 65.6666143 66.8534389 66.9819611
67.4859747 68.9478015 70.2723016 70.9116753 71.5530880
72.7433401 73.6689239 74.3389629 74.6124391 75.1561248
75.6386123 76.5511848 77.0246305 78.2838063 78.5792098
78.9660228
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034332 0.0034333 0.0034336 0.0034338
0.0034348 111.8098831 133.9290342 167.4177205 217.4379126
232.5232262 257.6011204 282.7631050 294.2056715 313.1155124
341.6592949 360.8969958 370.4316129 386.2088724 390.6403370
396.1023532 402.2000159 430.1438344 446.5384796 460.9154093
463.0244192 470.5579404 474.7931308 487.9312069 500.4919692
511.2371274 523.0795750 537.5547872 543.5511982 548.9161210
563.9187279 573.9919258 580.2174879 594.1604130 598.5659649
607.8048637 613.7075667 614.9135520 627.5414695 641.2742882
649.0808310 658.7396893 666.1974495 668.8569724 677.6608106
680.3036430 691.4913277 699.8252974 706.8671945 711.4987945
718.0098430 723.5237234 731.1735831 734.3403541 736.8829980
739.6486923 742.3341621 763.2297003 766.0396276 770.5577366
779.0364664 780.4534592 791.1921496 795.1783336 801.3444439
809.2305746 811.9700266 816.2036620 817.6583363 825.4609349
830.8568720 833.6012909 838.0578283 842.4925419 846.6903854
853.6193936 858.0068983 861.1954281 865.8878447 869.6705713
872.0513525 877.2526488 879.9694456 887.8858937 888.7389412
892.0763846 901.6863424 910.3059246 914.4377644 918.5641059
926.1725380 932.0462067 936.2752200 937.9958112 941.4071008
944.4240901 950.1042017 953.0377252 960.7961345 962.6072072
964.9735570
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2187
Rtb_to_modes> Number of blocs = 143
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.060
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.377
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.585
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.780
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.314
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.899
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.97
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000
1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 1.00004
1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998
1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 0.99997 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99998 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 39366 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000
1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 1.00004
1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998
1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 0.99997 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99998 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260128101717238326.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260128101717238326.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260128101717238326.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260128101717238326.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 1
Last residue number = 285
Number of atoms found = 2187
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.377
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.009
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.585
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.780
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.314
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.899
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.97
Bfactors> 106 vectors, 6561 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.060000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.567 for 285 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.039 +/- 0.06
Bfactors> = 85.688 +/- 17.42
Bfactors> Shiftng-fct= 85.649
Bfactors> Scaling-fct= 309.251
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260128101717238326.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260128101717238326.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.0
Chkmod> 106 vectors, 6561 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2187 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 104 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7905
0.0034 0.6869
0.0034 0.8216
0.0034 0.9853
0.0034 0.8382
0.0034 0.7796
111.7969 0.3798
133.9187 0.3572
167.4138 0.3139
217.4176 0.4390
232.5125 0.0359
257.5818 0.2939
282.7428 0.2894
294.1878 0.4870
313.0990 0.2204
341.6428 0.5330
360.9589 0.3085
370.4701 0.3814
386.2086 0.5284
390.6104 0.3238
396.1555 0.3507
402.2108 0.3031
430.1185 0.1207
446.5277 0.4442
460.9502 0.3734
462.9921 0.3560
470.5702 0.4415
474.8108 0.4105
487.9157 0.3295
500.4422 0.1847
511.1655 0.4161
523.0228 0.5131
537.5864 0.2419
543.4762 0.5453
548.8733 0.3487
563.9195 0.1451
573.9709 0.3185
580.2026 0.3871
594.1588 0.4310
598.5088 0.3087
607.7946 0.2258
613.6830 0.2657
614.9306 0.3558
627.5522 0.3634
641.2134 0.3737
649.0724 0.3343
658.7195 0.3591
666.1951 0.1177
668.8447 0.1635
677.6019 0.4607
680.2937 0.4275
691.4680 0.3958
699.7737 0.3824
706.8152 0.3854
711.4708 0.3980
717.9872 0.3234
723.4678 0.2648
731.1684 0.2696
734.3063 0.3009
736.8710 0.4566
739.5862 0.3012
742.2916 0.4829
763.2031 0.4375
765.9789 0.5446
770.5066 0.4563
779.0292 0.2849
780.3902 0.4545
791.1940 0.2596
795.1335 0.4393
801.3375 0.2964
809.1713 0.4057
811.9352 0.2817
816.1358 0.2726
817.6514 0.3778
825.4018 0.4643
830.8124 0.4372
833.5753 0.5331
838.0192 0.3710
842.4397 0.3522
846.6282 0.4023
853.5633 0.3733
857.9724 0.2870
861.1275 0.4575
865.8385 0.1938
869.6432 0.4852
872.0127 0.2970
877.2031 0.4388
879.9544 0.4113
887.8249 0.3840
888.6878 0.4249
892.0647 0.2795
901.6620 0.5225
910.2519 0.4517
914.3877 0.4248
918.5049 0.2285
926.1115 0.3447
932.0130 0.4692
936.2416 0.5317
937.9402 0.3752
941.3910 0.4630
944.3922 0.3777
950.0561 0.4961
952.9682 0.4681
960.7315 0.1299
962.5707 0.4665
964.9564 0.5222
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260128101717238326 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
making animated gifs
11 models are in 260128101717238326.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260128101717238326 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
making animated gifs
11 models are in 260128101717238326.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260128101717238326 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
making animated gifs
11 models are in 260128101717238326.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260128101717238326 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
making animated gifs
11 models are in 260128101717238326.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260128101717238326 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260128101717238326.eigenfacs
260128101717238326.atom
making animated gifs
11 models are in 260128101717238326.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260128101717238326.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260128101717238326.10.pdb
260128101717238326.11.pdb
260128101717238326.7.pdb
260128101717238326.8.pdb
260128101717238326.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.924s
user 0m8.817s
sys 0m0.104s
rm: cannot remove '260128101717238326.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|