***  dim4  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260130170218557043.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260130170218557043.atom to be opened.
Openam> File opened: 260130170218557043.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 644
First residue number = 1
Last residue number = 322
Number of atoms found = 4866
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -5.256264 +/- 22.072098 From: -64.156000 To: 53.951000
= 5.723797 +/- 11.588519 From: -26.016000 To: 36.244000
= -3.364036 +/- 11.103808 From: -37.323000 To: 21.497000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7464 % Filled.
Pdbmat> 1860974 non-zero elements.
Pdbmat> 203552 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.66 +/- 24.62
Maximum number = 132
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 4.071040E+06
Pdbmat> Larger element = 498.332
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
644 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260130170218557043.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260130170218557043.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260130170218557043.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4866 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 644 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 33 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 21 atoms in block 3
Block first atom: 65
Blocpdb> 30 atoms in block 4
Block first atom: 86
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 116
Blocpdb> 30 atoms in block 6
Block first atom: 146
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 176
Blocpdb> 35 atoms in block 8
Block first atom: 206
Blocpdb> 40 atoms in block 9
Block first atom: 241
Blocpdb> 31 atoms in block 10
Block first atom: 281
Blocpdb> 33 atoms in block 11
Block first atom: 312
Blocpdb> 38 atoms in block 12
Block first atom: 345
Blocpdb> 29 atoms in block 13
Block first atom: 383
Blocpdb> 26 atoms in block 14
Block first atom: 412
Blocpdb> 35 atoms in block 15
Block first atom: 438
Blocpdb> 31 atoms in block 16
Block first atom: 473
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 504
Blocpdb> 28 atoms in block 18
Block first atom: 528
Blocpdb> 31 atoms in block 19
Block first atom: 556
Blocpdb> 23 atoms in block 20
Block first atom: 587
Blocpdb> 33 atoms in block 21
Block first atom: 610
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 643
Blocpdb> 25 atoms in block 23
Block first atom: 675
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 700
Blocpdb> 28 atoms in block 25
Block first atom: 736
Blocpdb> 33 atoms in block 26
Block first atom: 764
Blocpdb> 30 atoms in block 27
Block first atom: 797
Blocpdb> 29 atoms in block 28
Block first atom: 827
Blocpdb> 38 atoms in block 29
Block first atom: 856
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 894
Blocpdb> 38 atoms in block 31
Block first atom: 922
Blocpdb> 26 atoms in block 32
Block first atom: 960
Blocpdb> 27 atoms in block 33
Block first atom: 986
Blocpdb> 31 atoms in block 34
Block first atom: 1013
Blocpdb> 30 atoms in block 35
Block first atom: 1044
Blocpdb> 27 atoms in block 36
Block first atom: 1074
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 1101
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 1125
Blocpdb> 32 atoms in block 39
Block first atom: 1149
Blocpdb> 34 atoms in block 40
Block first atom: 1181
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 1215
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 1240
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1261
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1287
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1315
Blocpdb> 31 atoms in block 46
Block first atom: 1342
Blocpdb> 35 atoms in block 47
Block first atom: 1373
Blocpdb> 27 atoms in block 48
Block first atom: 1408
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1435
Blocpdb> 41 atoms in block 50
Block first atom: 1462
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1503
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 1536
Blocpdb> 33 atoms in block 53
Block first atom: 1565
Blocpdb> 32 atoms in block 54
Block first atom: 1598
Blocpdb> 32 atoms in block 55
Block first atom: 1630
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1662
Blocpdb> 28 atoms in block 57
Block first atom: 1695
Blocpdb> 31 atoms in block 58
Block first atom: 1723
Blocpdb> 28 atoms in block 59
Block first atom: 1754
Blocpdb> 30 atoms in block 60
Block first atom: 1782
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1812
Blocpdb> 31 atoms in block 62
Block first atom: 1842
Blocpdb> 33 atoms in block 63
Block first atom: 1873
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1906
Blocpdb> 28 atoms in block 65
Block first atom: 1931
Blocpdb> 37 atoms in block 66
Block first atom: 1959
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1996
Blocpdb> 31 atoms in block 68
Block first atom: 2020
Blocpdb> 31 atoms in block 69
Block first atom: 2051
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2082
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2110
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 2141
Blocpdb> 35 atoms in block 73
Block first atom: 2172
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 2207
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 2232
Blocpdb> 29 atoms in block 76
Block first atom: 2268
Blocpdb> 41 atoms in block 77
Block first atom: 2297
Blocpdb> 33 atoms in block 78
Block first atom: 2338
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 2371
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 2394
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 2417
Blocpdb> 31 atoms in block 82
Block first atom: 2434
Blocpdb> 33 atoms in block 83
Block first atom: 2465
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 2498
Blocpdb> 30 atoms in block 85
Block first atom: 2519
Blocpdb> 30 atoms in block 86
Block first atom: 2549
Blocpdb> 30 atoms in block 87
Block first atom: 2579
Blocpdb> 30 atoms in block 88
Block first atom: 2609
Blocpdb> 35 atoms in block 89
Block first atom: 2639
Blocpdb> 40 atoms in block 90
Block first atom: 2674
Blocpdb> 31 atoms in block 91
Block first atom: 2714
Blocpdb> 33 atoms in block 92
Block first atom: 2745
Blocpdb> 38 atoms in block 93
Block first atom: 2778
Blocpdb> 29 atoms in block 94
Block first atom: 2816
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2845
Blocpdb> 35 atoms in block 96
Block first atom: 2871
Blocpdb> 31 atoms in block 97
Block first atom: 2906
Blocpdb> 24 atoms in block 98
Block first atom: 2937
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 2961
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 2989
Blocpdb> 23 atoms in block 101
Block first atom: 3020
Blocpdb> 33 atoms in block 102
Block first atom: 3043
Blocpdb> 32 atoms in block 103
Block first atom: 3076
Blocpdb> 25 atoms in block 104
Block first atom: 3108
Blocpdb> 36 atoms in block 105
Block first atom: 3133
Blocpdb> 28 atoms in block 106
Block first atom: 3169
Blocpdb> 33 atoms in block 107
Block first atom: 3197
Blocpdb> 30 atoms in block 108
Block first atom: 3230
Blocpdb> 29 atoms in block 109
Block first atom: 3260
Blocpdb> 38 atoms in block 110
Block first atom: 3289
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 3327
Blocpdb> 38 atoms in block 112
Block first atom: 3355
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 3393
Blocpdb> 27 atoms in block 114
Block first atom: 3419
Blocpdb> 31 atoms in block 115
Block first atom: 3446
Blocpdb> 30 atoms in block 116
Block first atom: 3477
Blocpdb> 27 atoms in block 117
Block first atom: 3507
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 3534
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 3558
Blocpdb> 32 atoms in block 120
Block first atom: 3582
Blocpdb> 34 atoms in block 121
Block first atom: 3614
Blocpdb> 25 atoms in block 122
Block first atom: 3648
Blocpdb> 21 atoms in block 123
Block first atom: 3673
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 3694
Blocpdb> 28 atoms in block 125
Block first atom: 3720
Blocpdb> 27 atoms in block 126
Block first atom: 3748
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 3775
Blocpdb> 35 atoms in block 128
Block first atom: 3806
Blocpdb> 27 atoms in block 129
Block first atom: 3841
Blocpdb> 27 atoms in block 130
Block first atom: 3868
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 3895
Blocpdb> 33 atoms in block 132
Block first atom: 3936
Blocpdb> 29 atoms in block 133
Block first atom: 3969
Blocpdb> 33 atoms in block 134
Block first atom: 3998
Blocpdb> 32 atoms in block 135
Block first atom: 4031
Blocpdb> 32 atoms in block 136
Block first atom: 4063
Blocpdb> 33 atoms in block 137
Block first atom: 4095
Blocpdb> 28 atoms in block 138
Block first atom: 4128
Blocpdb> 31 atoms in block 139
Block first atom: 4156
Blocpdb> 28 atoms in block 140
Block first atom: 4187
Blocpdb> 30 atoms in block 141
Block first atom: 4215
Blocpdb> 30 atoms in block 142
Block first atom: 4245
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 4275
Blocpdb> 33 atoms in block 144
Block first atom: 4306
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 4339
Blocpdb> 28 atoms in block 146
Block first atom: 4364
Blocpdb> 37 atoms in block 147
Block first atom: 4392
Blocpdb> 24 atoms in block 148
Block first atom: 4429
Blocpdb> 31 atoms in block 149
Block first atom: 4453
Blocpdb> 31 atoms in block 150
Block first atom: 4484
Blocpdb> 28 atoms in block 151
Block first atom: 4515
Blocpdb> 31 atoms in block 152
Block first atom: 4543
Blocpdb> 31 atoms in block 153
Block first atom: 4574
Blocpdb> 35 atoms in block 154
Block first atom: 4605
Blocpdb> 25 atoms in block 155
Block first atom: 4640
Blocpdb> 36 atoms in block 156
Block first atom: 4665
Blocpdb> 29 atoms in block 157
Block first atom: 4701
Blocpdb> 41 atoms in block 158
Block first atom: 4730
Blocpdb> 33 atoms in block 159
Block first atom: 4771
Blocpdb> 23 atoms in block 160
Block first atom: 4804
Blocpdb> 23 atoms in block 161
Block first atom: 4827
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 4849
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1861136 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14598
Prepmat> Matrix trace = 4071040.0000
Prepmat> Last element read: 14598 14598 71.7762
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11684 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4866
RTB> Total mass = 4866.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4866
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 201491.3843
RTB> 52254 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52254
Diagstd> Projected matrix trace = 201491.3843
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 201491.3843
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1995211 0.2400225 0.2785426 0.3102441
0.7766375 0.7914457 1.2736011 1.4048353 1.5964955
2.0387741 2.1550131 2.6600797 2.7493216 3.3260069
3.5459446 4.1063272 4.6086397 5.2500656 5.9273121
6.4263791 7.0902371 7.2154854 8.8067966 9.3915829
10.4507837 10.6780793 11.0406768 11.5726677 12.0971388
12.8275503 13.2968374 13.6180152 14.2629243 14.3861276
14.5060343 16.1032714 16.6034079 16.7162451 17.6040321
17.8826611 18.5143657 18.7196607 19.3286043 19.8629717
19.9215944 21.1168114 21.4504476 21.9457035 22.3054906
22.4676482 22.8700983 23.2640701 24.3359815 24.5639048
25.3418333 25.6503745 25.8516621 26.6511515 27.1292132
27.5992515 28.3433121 28.5187031 29.3923509 29.7397436
30.2846005 30.5152396 31.3632056 31.7314934 32.0903490
32.2539615 33.4953736 33.9868077 35.2122321 35.3837366
35.8428460 36.0616363 36.7507319 37.5451829 38.7369694
39.0773482 39.7551885 40.6934004 41.0037811 41.5352382
41.8636146 42.5314380 42.8971666 43.4354361 43.7229457
44.0529965 44.1994090 44.7537439 45.4024541 45.6735461
46.1761619 46.5128459 47.6526358 47.9813644 48.2718365
48.9961156
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034311 0.0034324 0.0034330 0.0034337 0.0034350
0.0034353 48.5053571 53.2011754 57.3114099 60.4849155
95.6983549 96.6063846 122.5496270 128.7087235 137.2079026
155.0528788 159.4117146 177.1098052 180.0561896 198.0417947
204.4849046 220.0503449 233.1211403 248.8156219 264.3773081
275.2824032 289.1516403 291.6943774 322.2584130 332.7857167
351.0505925 354.8475825 360.8220989 369.4128705 377.6909791
388.9261487 395.9765418 400.7303049 410.1092537 411.8767095
413.5896193 435.7649909 442.4802580 443.9812665 455.6185071
459.2100175 467.2504191 469.8338103 477.4144150 483.9688300
484.6824868 499.0102322 502.9368522 508.7097172 512.8627654
514.7236082 519.3131210 523.7669968 535.6976157 538.2003585
546.6562211 549.9739701 552.1276744 560.6002267 565.6058327
570.4846095 578.1234425 579.9094234 588.7249505 592.1938459
597.5939679 599.8652064 608.1427072 611.7028953 615.1520849
616.7182666 628.4745470 633.0681542 644.3800084 645.9473592
650.1244861 652.1056978 658.3067019 665.3840595 675.8621113
678.8249914 684.6871684 692.7192738 695.3560436 699.8478505
702.6088921 708.1908542 711.2292091 715.6775162 718.0422301
720.7472728 721.9440001 726.4570892 731.7031832 733.8843827
737.9113601 740.5966391 749.6158208 752.1969653 754.4703746
760.1094040
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4866
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9834E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2400
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2785
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.405
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.596
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.039
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.660
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.326
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.106
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.609
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.250
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.807
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.392
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99995 0.99995 1.00004 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00000 0.99997 0.99999
1.00003 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001
0.99996 0.99999 0.99995 1.00001 1.00002
0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
1.00004 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002
0.99999 0.99996 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 87588 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99995 0.99995 1.00004 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00000 0.99997 0.99999
1.00003 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001
0.99996 0.99999 0.99995 1.00001 1.00002
0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001
1.00004 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002
0.99999 0.99996 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260130170218557043.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260130170218557043.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260130170218557043.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260130170218557043.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 644
First residue number = 1
Last residue number = 322
Number of atoms found = 4866
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9834E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2400
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.405
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.660
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.326
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.106
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.807
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.392
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00
Bfactors> 106 vectors, 14598 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.199500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.489 for 644 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.075 +/- 0.44
Bfactors> = 86.867 +/- 15.30
Bfactors> Shiftng-fct= 86.792
Bfactors> Scaling-fct= 34.466
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260130170218557043.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260130170218557043.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1
Chkmod> 106 vectors, 14598 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4866 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7279
0.0034 0.6388
0.0034 0.7194
0.0034 0.8711
0.0034 0.8700
0.0034 0.8510
48.5007 0.0074
53.1964 0.0084
57.3046 0.0132
60.4780 0.0119
95.6919 0.7157
96.5995 0.7152
122.5636 0.0470
128.7107 0.0288
137.1807 0.1374
155.0548 0.0130
159.4044 0.0070
177.0995 0.0321
180.0379 0.0364
198.0331 0.5515
204.4777 0.6270
220.0321 0.0150
233.1202 0.0307
248.8034 0.2740
264.3590 0.0331
275.2625 0.0357
289.1344 0.0263
291.6720 0.0399
322.2483 0.4497
332.7788 0.4042
351.0224 0.3562
354.8643 0.0786
360.7956 0.1145
369.3544 0.1075
377.7194 0.0550
388.9466 0.1387
396.0066 0.1929
400.7423 0.3135
410.0496 0.3133
411.9145 0.2408
413.6284 0.2316
435.7020 0.4798
442.4159 0.3224
444.0121 0.4259
455.5468 0.1576
459.1561 0.1496
467.1753 0.4317
469.8179 0.3760
477.4112 0.3343
483.9119 0.4783
484.6423 0.4608
499.0265 0.4120
502.9100 0.0787
508.7377 0.4919
512.8926 0.4540
514.7284 0.3725
519.2897 0.4092
523.6987 0.1480
535.7188 0.3518
538.1345 0.3792
546.6130 0.5556
549.9463 0.5617
552.0862 0.4554
560.5641 0.6533
565.5898 0.5357
570.4679 0.4914
578.0648 0.4599
579.8977 0.5208
588.6761 0.6283
592.1710 0.1784
597.5229 0.4397
599.8862 0.4732
608.0855 0.1758
611.6622 0.0759
615.1223 0.1605
616.6539 0.3039
628.4910 0.2944
633.0707 0.5680
644.3319 0.5168
645.8855 0.3200
650.0708 0.4420
652.0629 0.4115
658.2719 0.4032
665.3982 0.4232
675.8595 0.4270
678.8189 0.4418
684.6992 0.3498
692.6606 0.4352
695.2941 0.4545
699.8579 0.3429
702.5484 0.3010
708.1485 0.4977
711.2222 0.3563
715.6844 0.3885
717.9872 0.4433
720.6918 0.4976
721.9178 0.4576
726.3955 0.4039
731.6520 0.4388
733.8244 0.5179
737.9103 0.3580
740.5422 0.3036
749.5629 0.3853
752.1540 0.4165
754.4236 0.3902
760.1069 0.3505
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260130170218557043 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
making animated gifs
11 models are in 260130170218557043.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260130170218557043 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
making animated gifs
11 models are in 260130170218557043.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260130170218557043 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
making animated gifs
11 models are in 260130170218557043.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260130170218557043 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
making animated gifs
11 models are in 260130170218557043.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260130170218557043 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130170218557043.eigenfacs
260130170218557043.atom
making animated gifs
11 models are in 260130170218557043.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130170218557043.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260130170218557043.10.pdb
260130170218557043.11.pdb
260130170218557043.7.pdb
260130170218557043.8.pdb
260130170218557043.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m19.819s
user 0m19.669s
sys 0m0.142s
rm: cannot remove '260130170218557043.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|