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***  SIGNALING PROTEIN/TRANSFERASE/INHIBITOR 03-JUN-13 4L1B  ***

LOGs for ID: 260130171349561081

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260130171349561081.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260130171349561081.atom to be opened. Openam> File opened: 260130171349561081.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1271 First residue number = 8 Last residue number = 598 Number of atoms found = 10486 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 17.672340 +/- 17.382661 From: -22.801000 To: 62.990000 = 34.369544 +/- 22.565841 From: -17.226000 To: 96.005000 = 29.655304 +/- 19.322115 From: -11.037000 To: 78.805000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8009 % Filled. Pdbmat> 3962763 non-zero elements. Pdbmat> 433388 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.66 +/- 20.85 Maximum number = 133 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 8.667760E+06 Pdbmat> Larger element = 500.503 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1271 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260130171349561081.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260130171349561081.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260130171349561081.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10486 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1271 residues. Blocpdb> 57 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 57 atoms in block 2 Block first atom: 58 Blocpdb> 53 atoms in block 3 Block first atom: 115 Blocpdb> 51 atoms in block 4 Block first atom: 168 Blocpdb> 54 atoms in block 5 Block first atom: 219 Blocpdb> 59 atoms in block 6 Block first atom: 273 Blocpdb> 60 atoms in block 7 Block first atom: 332 Blocpdb> 59 atoms in block 8 Block first atom: 392 Blocpdb> 60 atoms in block 9 Block first atom: 451 Blocpdb> 50 atoms in block 10 Block first atom: 511 Blocpdb> 68 atoms in block 11 Block first atom: 561 Blocpdb> 60 atoms in block 12 Block first atom: 629 Blocpdb> 65 atoms in block 13 Block first atom: 689 Blocpdb> 55 atoms in block 14 Block first atom: 754 Blocpdb> 58 atoms in block 15 Block first atom: 809 Blocpdb> 59 atoms in block 16 Block first atom: 867 Blocpdb> 45 atoms in block 17 Block first atom: 926 Blocpdb> 60 atoms in block 18 Block first atom: 971 Blocpdb> 62 atoms in block 19 Block first atom: 1031 Blocpdb> 56 atoms in block 20 Block first atom: 1093 Blocpdb> 57 atoms in block 21 Block first atom: 1149 Blocpdb> 53 atoms in block 22 Block first atom: 1206 Blocpdb> 62 atoms in block 23 Block first atom: 1259 Blocpdb> 50 atoms in block 24 Block first atom: 1321 Blocpdb> 63 atoms in block 25 Block first atom: 1371 Blocpdb> 55 atoms in block 26 Block first atom: 1434 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1489 Blocpdb> 52 atoms in block 28 Block first atom: 1548 Blocpdb> 63 atoms in block 29 Block first atom: 1600 Blocpdb> 54 atoms in block 30 Block first atom: 1663 Blocpdb> 52 atoms in block 31 Block first atom: 1717 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 1769 Blocpdb> 55 atoms in block 33 Block first atom: 1788 Blocpdb> 59 atoms in block 34 Block first atom: 1843 Blocpdb> 58 atoms in block 35 Block first atom: 1902 Blocpdb> 60 atoms in block 36 Block first atom: 1960 Blocpdb> 64 atoms in block 37 Block first atom: 2020 Blocpdb> 54 atoms in block 38 Block first atom: 2084 Blocpdb> 54 atoms in block 39 Block first atom: 2138 Blocpdb> 58 atoms in block 40 Block first atom: 2192 Blocpdb> 55 atoms in block 41 Block first atom: 2250 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 2305 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 2336 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2384 Blocpdb> 58 atoms in block 45 Block first atom: 2440 Blocpdb> 54 atoms in block 46 Block first atom: 2498 Blocpdb> 60 atoms in block 47 Block first atom: 2552 Blocpdb> 61 atoms in block 48 Block first atom: 2612 Blocpdb> 48 atoms in block 49 Block first atom: 2673 Blocpdb> 58 atoms in block 50 Block first atom: 2721 Blocpdb> 52 atoms in block 51 Block first atom: 2779 Blocpdb> 73 atoms in block 52 Block first atom: 2831 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 2904 Blocpdb> 53 atoms in block 54 Block first atom: 2963 Blocpdb> 50 atoms in block 55 Block first atom: 3016 Blocpdb> 52 atoms in block 56 Block first atom: 3066 Blocpdb> 54 atoms in block 57 Block first atom: 3118 Blocpdb> 62 atoms in block 58 Block first atom: 3172 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 3234 Blocpdb> 57 atoms in block 60 Block first atom: 3283 Blocpdb> 54 atoms in block 61 Block first atom: 3340 Blocpdb> 49 atoms in block 62 Block first atom: 3394 Blocpdb> 51 atoms in block 63 Block first atom: 3443 Blocpdb> 54 atoms in block 64 Block first atom: 3494 Blocpdb> 63 atoms in block 65 Block first atom: 3548 Blocpdb> 56 atoms in block 66 Block first atom: 3611 Blocpdb> 56 atoms in block 67 Block first atom: 3667 Blocpdb> 44 atoms in block 68 Block first atom: 3723 Blocpdb> 61 atoms in block 69 Block first atom: 3767 Blocpdb> 57 atoms in block 70 Block first atom: 3828 Blocpdb> 53 atoms in block 71 Block first atom: 3885 Blocpdb> 60 atoms in block 72 Block first atom: 3938 Blocpdb> 68 atoms in block 73 Block first atom: 3998 Blocpdb> 57 atoms in block 74 Block first atom: 4066 Blocpdb> 57 atoms in block 75 Block first atom: 4123 Blocpdb> 58 atoms in block 76 Block first atom: 4180 Blocpdb> 57 atoms in block 77 Block first atom: 4238 Blocpdb> 64 atoms in block 78 Block first atom: 4295 Blocpdb> 56 atoms in block 79 Block first atom: 4359 Blocpdb> 52 atoms in block 80 Block first atom: 4415 Blocpdb> 57 atoms in block 81 Block first atom: 4467 Blocpdb> 55 atoms in block 82 Block first atom: 4524 Blocpdb> 61 atoms in block 83 Block first atom: 4579 Blocpdb> 60 atoms in block 84 Block first atom: 4640 Blocpdb> 56 atoms in block 85 Block first atom: 4700 Blocpdb> 67 atoms in block 86 Block first atom: 4756 Blocpdb> 61 atoms in block 87 Block first atom: 4823 Blocpdb> 54 atoms in block 88 Block first atom: 4884 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 4938 Blocpdb> 67 atoms in block 90 Block first atom: 5002 Blocpdb> 55 atoms in block 91 Block first atom: 5069 Blocpdb> 59 atoms in block 92 Block first atom: 5124 Blocpdb> 55 atoms in block 93 Block first atom: 5183 Blocpdb> 59 atoms in block 94 Block first atom: 5238 Blocpdb> 57 atoms in block 95 Block first atom: 5297 Blocpdb> 57 atoms in block 96 Block first atom: 5354 Blocpdb> 60 atoms in block 97 Block first atom: 5411 Blocpdb> 58 atoms in block 98 Block first atom: 5471 Blocpdb> 61 atoms in block 99 Block first atom: 5529 Blocpdb> 65 atoms in block 100 Block first atom: 5590 Blocpdb> 53 atoms in block 101 Block first atom: 5655 Blocpdb> 49 atoms in block 102 Block first atom: 5708 Blocpdb> 58 atoms in block 103 Block first atom: 5757 Blocpdb> 59 atoms in block 104 Block first atom: 5815 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 5874 Blocpdb> 68 atoms in block 106 Block first atom: 5926 Blocpdb> 55 atoms in block 107 Block first atom: 5994 Blocpdb> 61 atoms in block 108 Block first atom: 6049 Blocpdb> 56 atoms in block 109 Block first atom: 6110 Blocpdb> 59 atoms in block 110 Block first atom: 6166 Blocpdb> 61 atoms in block 111 Block first atom: 6225 Blocpdb> 60 atoms in block 112 Block first atom: 6286 Blocpdb> 58 atoms in block 113 Block first atom: 6346 Blocpdb> 48 atoms in block 114 Block first atom: 6404 Blocpdb> 50 atoms in block 115 Block first atom: 6452 Blocpdb> 56 atoms in block 116 Block first atom: 6502 Blocpdb> 48 atoms in block 117 Block first atom: 6558 Blocpdb> 58 atoms in block 118 Block first atom: 6606 Blocpdb> 65 atoms in block 119 Block first atom: 6664 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 6729 Blocpdb> 59 atoms in block 121 Block first atom: 6780 Blocpdb> 45 atoms in block 122 Block first atom: 6839 Blocpdb> 50 atoms in block 123 Block first atom: 6884 Blocpdb> 59 atoms in block 124 Block first atom: 6934 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 6993 Blocpdb> 60 atoms in block 126 Block first atom: 7046 Blocpdb> 65 atoms in block 127 Block first atom: 7106 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 7171 Blocpdb> 60 atoms in block 129 Block first atom: 7236 Blocpdb> 58 atoms in block 130 Block first atom: 7296 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 7354 Blocpdb> 60 atoms in block 132 Block first atom: 7404 Blocpdb> 63 atoms in block 133 Block first atom: 7464 Blocpdb> 59 atoms in block 134 Block first atom: 7527 Blocpdb> 62 atoms in block 135 Block first atom: 7586 Blocpdb> 57 atoms in block 136 Block first atom: 7648 Blocpdb> 46 atoms in block 137 Block first atom: 7705 Blocpdb> 58 atoms in block 138 Block first atom: 7751 Blocpdb> 60 atoms in block 139 Block first atom: 7809 Blocpdb> 55 atoms in block 140 Block first atom: 7869 Blocpdb> 62 atoms in block 141 Block first atom: 7924 Blocpdb> 57 atoms in block 142 Block first atom: 7986 Blocpdb> 55 atoms in block 143 Block first atom: 8043 Blocpdb> 35 atoms in block 144 Block first atom: 8098 Blocpdb> 54 atoms in block 145 Block first atom: 8133 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 8187 Blocpdb> 55 atoms in block 147 Block first atom: 8258 Blocpdb> 60 atoms in block 148 Block first atom: 8313 Blocpdb> 50 atoms in block 149 Block first atom: 8373 Blocpdb> 53 atoms in block 150 Block first atom: 8423 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 8476 Blocpdb> 51 atoms in block 152 Block first atom: 8533 Blocpdb> 61 atoms in block 153 Block first atom: 8584 Blocpdb> 58 atoms in block 154 Block first atom: 8645 Blocpdb> 58 atoms in block 155 Block first atom: 8703 Blocpdb> 51 atoms in block 156 Block first atom: 8761 Blocpdb> 64 atoms in block 157 Block first atom: 8812 Blocpdb> 58 atoms in block 158 Block first atom: 8876 Blocpdb> 60 atoms in block 159 Block first atom: 8934 Blocpdb> 59 atoms in block 160 Block first atom: 8994 Blocpdb> 57 atoms in block 161 Block first atom: 9053 Blocpdb> 50 atoms in block 162 Block first atom: 9110 Blocpdb> 63 atoms in block 163 Block first atom: 9160 Blocpdb> 64 atoms in block 164 Block first atom: 9223 Blocpdb> 69 atoms in block 165 Block first atom: 9287 Blocpdb> 61 atoms in block 166 Block first atom: 9356 Blocpdb> 61 atoms in block 167 Block first atom: 9417 Blocpdb> 55 atoms in block 168 Block first atom: 9478 Blocpdb> 61 atoms in block 169 Block first atom: 9533 Blocpdb> 60 atoms in block 170 Block first atom: 9594 Blocpdb> 65 atoms in block 171 Block first atom: 9654 Blocpdb> 61 atoms in block 172 Block first atom: 9719 Blocpdb> 63 atoms in block 173 Block first atom: 9780 Blocpdb> 63 atoms in block 174 Block first atom: 9843 Blocpdb> 57 atoms in block 175 Block first atom: 9906 Blocpdb> 63 atoms in block 176 Block first atom: 9963 Blocpdb> 61 atoms in block 177 Block first atom: 10026 Blocpdb> 59 atoms in block 178 Block first atom: 10087 Blocpdb> 58 atoms in block 179 Block first atom: 10146 Blocpdb> 57 atoms in block 180 Block first atom: 10204 Blocpdb> 67 atoms in block 181 Block first atom: 10261 Blocpdb> 63 atoms in block 182 Block first atom: 10328 Blocpdb> 57 atoms in block 183 Block first atom: 10391 Blocpdb> 39 atoms in block 184 Block first atom: 10447 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 73 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3962947 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 31458 Prepmat> Matrix trace = 8667760.0000 Prepmat> Last element read: 31458 31458 373.1186 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15510 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10486 RTB> Total mass = 10486.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10486 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 187670.1790 RTB> 51600 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51600 Diagstd> Projected matrix trace = 187670.1790 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 187670.1790 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6982672 0.9041261 1.2805608 1.7498482 2.0668439 2.3099001 2.5203685 2.9252161 2.9850887 3.4658488 3.6535766 3.8275802 4.0783372 4.2840487 4.6263032 4.9681964 5.2842201 5.4656146 6.0527893 6.1829065 6.4567068 6.7091188 7.2400740 7.2855805 7.7306979 7.9957546 8.4183346 8.7150771 9.0670538 9.4145252 9.5175181 10.1387642 10.4050848 10.5280207 10.7467170 11.4734008 11.6009974 11.9854119 12.1267153 12.4066867 12.5789160 13.0339770 13.4058844 14.0860092 14.1413670 14.8254430 14.9774129 15.2837183 15.7420953 15.7831322 16.2623508 16.7355628 16.8115491 17.7580662 17.8200326 18.2909792 18.8500289 19.2160286 19.2956605 19.7942640 20.7148713 20.8115728 20.9325171 21.2772540 21.5836322 22.0816340 22.5674673 22.7298467 23.1324100 23.5579129 23.8496533 24.4365521 24.7278741 25.4137951 25.6623091 26.4069396 26.9154340 27.3072386 27.9142792 28.0373549 28.3840891 29.0000706 29.1880484 29.9196476 30.0949808 30.5923690 31.0371481 31.3583587 31.5439415 32.3114811 32.4246455 32.8803779 33.0234017 33.8059841 34.0815337 34.6700526 34.7892202 35.6696486 35.7114133 36.0504178 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034326 0.0034329 0.0034329 0.0034331 0.0034333 90.7415318 103.2546911 122.8840096 143.6466369 156.1166119 165.0410137 172.3960478 185.7266642 187.6177400 202.1622605 207.5651258 212.4503388 219.2990986 224.7617876 233.5674542 242.0441881 249.6236513 253.8719870 267.1609981 270.0173175 275.9312019 281.2729852 292.1909648 293.1077900 301.9288624 307.0612469 315.0709574 320.5759194 326.9854117 333.1919439 335.0095106 345.7703838 350.2822191 352.3454322 355.9862199 367.8251005 369.8647517 375.9427918 378.1524088 382.4927329 385.1384592 392.0430460 397.5969231 407.5578519 408.3579136 418.1182459 420.2557672 424.5313756 430.8504480 431.4116581 437.9120972 444.2377294 445.2450988 457.6074804 458.4051916 464.4230416 471.4669898 476.0220804 477.0073871 483.1310610 494.2383038 495.3905657 496.8279354 500.9023496 504.4957902 510.2827464 515.8657464 517.7183201 522.2827961 527.0644030 530.3179359 536.8033837 539.9936727 547.4318257 550.1019014 558.0258488 563.3729283 567.4585881 573.7312283 574.9946446 578.5391605 584.7830933 586.6753073 593.9823189 595.7201846 600.6228286 604.9732678 608.0957136 609.8924532 617.2679290 618.3479123 622.6782276 624.0310275 631.3818189 633.9497657 639.3998509 640.4977778 648.5518403 648.9314152 652.0042572 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10486 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.310 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.466 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.466 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.709 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.731 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.418 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.05 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00005 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 188748 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00005 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260130171349561081.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260130171349561081.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260130171349561081.atom Openam> file on opening on unit 11: 260130171349561081.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1271 First residue number = 8 Last residue number = 598 Number of atoms found = 10486 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.310 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.466 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.466 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.731 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.418 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.05 Bfactors> 106 vectors, 31458 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.698300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.608 for 1271 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.02 Bfactors> = 68.582 +/- 22.75 Bfactors> Shiftng-fct= 68.563 Bfactors> Scaling-fct= 949.429 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260130171349561081.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260130171349561081.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 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vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.0 Chkmod> 106 vectors, 31458 coordinates in file. Chkmod> That is: 10486 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7555 0.0034 0.7714 0.0034 0.7242 0.0034 0.9954 0.0034 0.8588 0.0034 0.7163 90.7398 0.3259 103.2488 0.3840 122.8998 0.5984 143.6467 0.6030 156.1158 0.3356 165.0375 0.4129 172.3760 0.0229 185.7118 0.2617 187.6069 0.5121 202.1580 0.5309 207.5682 0.4507 212.4529 0.4551 219.2806 0.4391 224.7509 0.4644 233.5498 0.4039 242.0290 0.5984 249.6077 0.4486 253.8700 0.2314 267.1542 0.4423 270.0078 0.4137 275.9256 0.5144 281.2584 0.2502 292.1769 0.0316 293.1036 0.3370 301.9218 0.4672 307.0528 0.3483 315.0512 0.2094 320.5607 0.3192 326.9704 0.2656 333.1860 0.4170 335.0036 0.5452 345.7766 0.3847 350.3499 0.5585 352.3634 0.3467 356.0253 0.3992 367.7548 0.3419 369.8330 0.3318 375.9986 0.2224 378.1874 0.4875 382.5274 0.2979 385.1385 0.3281 391.9664 0.4944 397.6409 0.4481 407.5981 0.3093 408.3206 0.3854 418.1645 0.3157 420.2740 0.5236 424.4615 0.3447 430.8033 0.4037 431.3503 0.4684 437.8616 0.3381 444.2775 0.3258 445.2055 0.3602 457.6128 0.4317 458.3851 0.4249 464.3907 0.4456 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260130171349561081.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260130171349561081.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260130171349561081 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260130171349561081 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom making animated gifs 11 models are in 260130171349561081.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260130171349561081.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260130171349561081.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260130171349561081 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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260130171349561081.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260130171349561081 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260130171349561081.eigenfacs 260130171349561081.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260130171349561081.eigenfacs 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260130171349561081.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260130171349561081.10.pdb 260130171349561081.11.pdb 260130171349561081.7.pdb 260130171349561081.8.pdb 260130171349561081.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m3.016s user 1m2.676s sys 0m0.307s rm: cannot remove '260130171349561081.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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