*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260130172737565491.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260130172737565491.atom to be opened.
Openam> File opened: 260130172737565491.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 632
First residue number = 1
Last residue number = 316
Number of atoms found = 4786
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -5.253523 +/- 21.249907 From: -50.897000 To: 40.487000
= 5.717173 +/- 11.540353 From: -26.016000 To: 36.244000
= -3.446127 +/- 11.140773 From: -37.323000 To: 21.497000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7926 % Filled.
Pdbmat> 1847863 non-zero elements.
Pdbmat> 202148 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.47 +/- 23.96
Maximum number = 132
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 4.042960E+06
Pdbmat> Larger element = 498.332
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
632 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260130172737565491.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260130172737565491.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260130172737565491.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4786 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 632 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 33 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 21 atoms in block 3
Block first atom: 65
Blocpdb> 30 atoms in block 4
Block first atom: 86
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 116
Blocpdb> 30 atoms in block 6
Block first atom: 146
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 176
Blocpdb> 35 atoms in block 8
Block first atom: 206
Blocpdb> 40 atoms in block 9
Block first atom: 241
Blocpdb> 31 atoms in block 10
Block first atom: 281
Blocpdb> 33 atoms in block 11
Block first atom: 312
Blocpdb> 38 atoms in block 12
Block first atom: 345
Blocpdb> 29 atoms in block 13
Block first atom: 383
Blocpdb> 26 atoms in block 14
Block first atom: 412
Blocpdb> 35 atoms in block 15
Block first atom: 438
Blocpdb> 31 atoms in block 16
Block first atom: 473
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 504
Blocpdb> 28 atoms in block 18
Block first atom: 528
Blocpdb> 31 atoms in block 19
Block first atom: 556
Blocpdb> 23 atoms in block 20
Block first atom: 587
Blocpdb> 33 atoms in block 21
Block first atom: 610
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 643
Blocpdb> 25 atoms in block 23
Block first atom: 675
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 700
Blocpdb> 28 atoms in block 25
Block first atom: 736
Blocpdb> 33 atoms in block 26
Block first atom: 764
Blocpdb> 30 atoms in block 27
Block first atom: 797
Blocpdb> 29 atoms in block 28
Block first atom: 827
Blocpdb> 38 atoms in block 29
Block first atom: 856
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 894
Blocpdb> 38 atoms in block 31
Block first atom: 922
Blocpdb> 26 atoms in block 32
Block first atom: 960
Blocpdb> 27 atoms in block 33
Block first atom: 986
Blocpdb> 31 atoms in block 34
Block first atom: 1013
Blocpdb> 30 atoms in block 35
Block first atom: 1044
Blocpdb> 27 atoms in block 36
Block first atom: 1074
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 1101
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 1125
Blocpdb> 32 atoms in block 39
Block first atom: 1149
Blocpdb> 34 atoms in block 40
Block first atom: 1181
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 1215
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 1240
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1261
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1287
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1315
Blocpdb> 31 atoms in block 46
Block first atom: 1342
Blocpdb> 35 atoms in block 47
Block first atom: 1373
Blocpdb> 27 atoms in block 48
Block first atom: 1408
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1435
Blocpdb> 41 atoms in block 50
Block first atom: 1462
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1503
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 1536
Blocpdb> 33 atoms in block 53
Block first atom: 1565
Blocpdb> 32 atoms in block 54
Block first atom: 1598
Blocpdb> 32 atoms in block 55
Block first atom: 1630
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1662
Blocpdb> 28 atoms in block 57
Block first atom: 1695
Blocpdb> 31 atoms in block 58
Block first atom: 1723
Blocpdb> 28 atoms in block 59
Block first atom: 1754
Blocpdb> 30 atoms in block 60
Block first atom: 1782
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1812
Blocpdb> 31 atoms in block 62
Block first atom: 1842
Blocpdb> 33 atoms in block 63
Block first atom: 1873
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1906
Blocpdb> 28 atoms in block 65
Block first atom: 1931
Blocpdb> 37 atoms in block 66
Block first atom: 1959
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1996
Blocpdb> 31 atoms in block 68
Block first atom: 2020
Blocpdb> 31 atoms in block 69
Block first atom: 2051
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2082
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2110
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 2141
Blocpdb> 35 atoms in block 73
Block first atom: 2172
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 2207
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 2232
Blocpdb> 29 atoms in block 76
Block first atom: 2268
Blocpdb> 41 atoms in block 77
Block first atom: 2297
Blocpdb> 33 atoms in block 78
Block first atom: 2338
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 2371
Blocpdb> 31 atoms in block 80
Block first atom: 2394
Blocpdb> 33 atoms in block 81
Block first atom: 2425
Blocpdb> 21 atoms in block 82
Block first atom: 2458
Blocpdb> 30 atoms in block 83
Block first atom: 2479
Blocpdb> 30 atoms in block 84
Block first atom: 2509
Blocpdb> 30 atoms in block 85
Block first atom: 2539
Blocpdb> 30 atoms in block 86
Block first atom: 2569
Blocpdb> 35 atoms in block 87
Block first atom: 2599
Blocpdb> 40 atoms in block 88
Block first atom: 2634
Blocpdb> 31 atoms in block 89
Block first atom: 2674
Blocpdb> 33 atoms in block 90
Block first atom: 2705
Blocpdb> 38 atoms in block 91
Block first atom: 2738
Blocpdb> 29 atoms in block 92
Block first atom: 2776
Blocpdb> 26 atoms in block 93
Block first atom: 2805
Blocpdb> 35 atoms in block 94
Block first atom: 2831
Blocpdb> 31 atoms in block 95
Block first atom: 2866
Blocpdb> 24 atoms in block 96
Block first atom: 2897
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2921
Blocpdb> 31 atoms in block 98
Block first atom: 2949
Blocpdb> 23 atoms in block 99
Block first atom: 2980
Blocpdb> 33 atoms in block 100
Block first atom: 3003
Blocpdb> 32 atoms in block 101
Block first atom: 3036
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 3068
Blocpdb> 36 atoms in block 103
Block first atom: 3093
Blocpdb> 28 atoms in block 104
Block first atom: 3129
Blocpdb> 33 atoms in block 105
Block first atom: 3157
Blocpdb> 30 atoms in block 106
Block first atom: 3190
Blocpdb> 29 atoms in block 107
Block first atom: 3220
Blocpdb> 38 atoms in block 108
Block first atom: 3249
Blocpdb> 28 atoms in block 109
Block first atom: 3287
Blocpdb> 38 atoms in block 110
Block first atom: 3315
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 3353
Blocpdb> 27 atoms in block 112
Block first atom: 3379
Blocpdb> 31 atoms in block 113
Block first atom: 3406
Blocpdb> 30 atoms in block 114
Block first atom: 3437
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 3467
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 3494
Blocpdb> 24 atoms in block 117
Block first atom: 3518
Blocpdb> 32 atoms in block 118
Block first atom: 3542
Blocpdb> 34 atoms in block 119
Block first atom: 3574
Blocpdb> 25 atoms in block 120
Block first atom: 3608
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 3633
Blocpdb> 26 atoms in block 122
Block first atom: 3654
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 3680
Blocpdb> 27 atoms in block 124
Block first atom: 3708
Blocpdb> 31 atoms in block 125
Block first atom: 3735
Blocpdb> 35 atoms in block 126
Block first atom: 3766
Blocpdb> 27 atoms in block 127
Block first atom: 3801
Blocpdb> 27 atoms in block 128
Block first atom: 3828
Blocpdb> 41 atoms in block 129
Block first atom: 3855
Blocpdb> 33 atoms in block 130
Block first atom: 3896
Blocpdb> 29 atoms in block 131
Block first atom: 3929
Blocpdb> 33 atoms in block 132
Block first atom: 3958
Blocpdb> 32 atoms in block 133
Block first atom: 3991
Blocpdb> 32 atoms in block 134
Block first atom: 4023
Blocpdb> 33 atoms in block 135
Block first atom: 4055
Blocpdb> 28 atoms in block 136
Block first atom: 4088
Blocpdb> 31 atoms in block 137
Block first atom: 4116
Blocpdb> 28 atoms in block 138
Block first atom: 4147
Blocpdb> 30 atoms in block 139
Block first atom: 4175
Blocpdb> 30 atoms in block 140
Block first atom: 4205
Blocpdb> 31 atoms in block 141
Block first atom: 4235
Blocpdb> 33 atoms in block 142
Block first atom: 4266
Blocpdb> 25 atoms in block 143
Block first atom: 4299
Blocpdb> 28 atoms in block 144
Block first atom: 4324
Blocpdb> 37 atoms in block 145
Block first atom: 4352
Blocpdb> 24 atoms in block 146
Block first atom: 4389
Blocpdb> 31 atoms in block 147
Block first atom: 4413
Blocpdb> 31 atoms in block 148
Block first atom: 4444
Blocpdb> 28 atoms in block 149
Block first atom: 4475
Blocpdb> 31 atoms in block 150
Block first atom: 4503
Blocpdb> 31 atoms in block 151
Block first atom: 4534
Blocpdb> 35 atoms in block 152
Block first atom: 4565
Blocpdb> 25 atoms in block 153
Block first atom: 4600
Blocpdb> 36 atoms in block 154
Block first atom: 4625
Blocpdb> 29 atoms in block 155
Block first atom: 4661
Blocpdb> 41 atoms in block 156
Block first atom: 4690
Blocpdb> 33 atoms in block 157
Block first atom: 4731
Blocpdb> 23 atoms in block 158
Block first atom: 4763
Blocpdb> 158 blocks.
Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1848021 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14358
Prepmat> Matrix trace = 4042960.0000
Prepmat> Last element read: 14358 14358 53.7862
Prepmat> 12562 lines saved.
Prepmat> 11054 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4786
RTB> Total mass = 4786.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4786
RTB> Number of blocks = 158
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 200228.7420
RTB> 51882 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 948
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51882
Diagstd> Projected matrix trace = 200228.7420
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 948 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 200228.7420
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.7505826 0.7881313 1.4661077 2.0356506
2.1551566 2.6583031 2.7499389 3.3699073 3.6378588
5.3795702 8.7031528 8.7732516 9.3384380 9.4365338
10.5497550 10.6678683 11.0283895 11.5656279 12.7123749
12.8882048 13.6984017 14.0081146 14.3616743 15.6941227
15.9452181 16.2982461 17.3303924 17.6363510 18.3730967
18.5164144 19.0512319 19.2437662 19.9086304 20.1973631
20.9462590 21.2105624 22.1431144 22.3900859 22.5156084
22.7975411 24.1659477 24.2491513 25.3344680 25.5692030
26.1317806 26.4614789 26.7361078 27.6640892 27.9667384
28.8140382 29.0060914 30.2189976 30.4014209 31.5688161
31.9737958 32.7294887 33.4491843 34.5439483 34.8073785
35.2544925 35.7527761 36.5494253 36.8664177 37.8830702
38.1189640 38.9342234 39.3209215 40.1273726 40.8723644
42.0509482 42.2908572 42.8129145 42.9548514 43.5753341
43.9347191 44.5641375 44.8422409 44.9621557 45.0777694
46.1180071 46.3751974 47.8579115 48.3009747 49.0198445
49.4583769 49.7593407 49.8843976 50.0787505 50.4195048
50.7323513 50.8769472 51.3069889 51.4465597 51.8995643
52.4013912 52.6328455 53.3250970 53.8748708 54.0513754
54.1999401
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034314 0.0034333 0.0034335 0.0034336 0.0034342
0.0034345 94.0793985 96.4038926 131.4856076 154.9340599
159.4170234 177.0506511 180.0764027 199.3445005 207.1181697
251.8657239 320.3565334 321.6440874 331.8428008 333.5811717
352.7089392 354.6778786 360.6212623 369.3004937 387.1761755
389.8445752 401.9113119 406.4294066 411.5265099 430.1934582
433.6212047 438.3951254 452.0635369 456.0365455 465.4643890
467.2762697 473.9765029 476.3655163 484.5247568 488.0256145
496.9909894 500.1167175 510.9926245 513.8343808 515.2726881
518.4886855 533.8228951 534.7410835 546.5767760 549.1030746
555.1109347 558.6018078 561.4930334 571.1543231 574.2700806
582.9044138 584.8437943 596.9463582 598.7454429 610.1328778
614.0339425 621.2478389 628.0410715 638.2359569 640.6649109
644.7665727 649.3071196 656.5012484 659.3420131 668.3714105
670.4491196 677.5807178 680.9372991 687.8846882 694.2408445
704.1791738 706.1850579 710.5304212 711.7072510 716.8291262
719.7790589 724.9165799 727.1749905 728.1466286 729.0821896
737.4465468 739.4999786 751.2286654 754.6980493 760.2934431
763.6866698 766.0067365 766.9687100 768.4613374 771.0713529
773.4598524 774.5613148 777.8279484 778.8851957 782.3068556
786.0798949 787.8140203 792.9779430 797.0552030 798.3597893
799.4562160
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4786
Rtb_to_modes> Number of blocs = 158
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.466
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.036
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.658
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.638
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.380
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.20
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 948 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 86148 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260130172737565491.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260130172737565491.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260130172737565491.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260130172737565491.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 632
First residue number = 1
Last residue number = 316
Number of atoms found = 4786
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.466
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.036
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.638
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.380
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.20
Bfactors> 106 vectors, 14358 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.750600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.560 for 632 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.028 +/- 0.06
Bfactors> = 87.997 +/- 13.02
Bfactors> Shiftng-fct= 87.969
Bfactors> Scaling-fct= 232.272
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260130172737565491.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260130172737565491.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.4
Chkmod> 106 vectors, 14358 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4786 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8930
0.0034 0.8249
0.0034 0.7571
0.0034 0.8264
0.0034 0.7962
0.0034 0.9854
94.0764 0.7430
96.3978 0.7212
131.4751 0.5457
154.9407 0.0120
159.4044 0.0071
177.0330 0.0314
180.0707 0.0351
199.3387 0.5657
207.1133 0.6533
251.8650 0.7831
320.3400 0.0106
321.6257 0.4561
331.8208 0.3640
333.5751 0.0269
352.6979 0.2998
354.6981 0.0901
360.6321 0.1106
369.3544 0.0959
387.1234 0.3324
389.8550 0.2713
401.9175 0.3061
406.4393 0.4887
411.4849 0.1608
430.1185 0.4121
433.6676 0.3825
438.3999 0.3096
452.0390 0.2356
456.0641 0.1749
465.4052 0.2962
467.3014 0.4276
473.9408 0.2910
476.2985 0.3776
484.5206 0.4127
488.0365 0.2806
497.0140 0.3538
500.0886 0.3292
510.9348 0.4386
513.8113 0.3112
515.3008 0.3856
518.4944 0.5377
533.8447 0.3824
534.7275 0.3693
546.5051 0.6037
549.0881 0.4447
555.0682 0.4742
558.5622 0.5305
561.5098 0.6624
571.0876 0.4822
574.2789 0.3826
582.8385 0.5616
584.8581 0.6197
596.9306 0.4967
598.7057 0.4216
610.1181 0.2981
613.9711 0.4409
621.2260 0.3183
628.0218 0.2904
638.1721 0.4661
640.6615 0.5271
644.6978 0.3471
649.2540 0.3164
656.4782 0.3504
659.3457 0.4508
668.3156 0.4090
670.4294 0.4680
677.5149 0.4681
680.9001 0.4416
687.8777 0.5139
694.1910 0.4849
704.1410 0.4312
706.1476 0.4151
710.4757 0.5072
711.6365 0.4275
716.8367 0.5132
719.7095 0.5036
724.8518 0.4427
727.1256 0.4241
728.0979 0.5306
729.0689 0.4723
737.4308 0.2403
739.5065 0.2495
751.2128 0.3544
754.6580 0.3609
760.2620 0.2998
763.6664 0.5223
765.9789 0.5067
766.9020 0.5511
768.4379 0.4026
771.0420 0.3701
773.4087 0.4913
774.5513 0.4383
777.8174 0.5753
778.8778 0.5804
782.2766 0.5307
786.0357 0.4563
787.7589 0.4977
792.9804 0.4191
796.9850 0.4941
798.3154 0.5009
799.4223 0.5650
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260130172737565491 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
making animated gifs
11 models are in 260130172737565491.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260130172737565491 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
making animated gifs
11 models are in 260130172737565491.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260130172737565491 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
making animated gifs
11 models are in 260130172737565491.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260130172737565491 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
making animated gifs
11 models are in 260130172737565491.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260130172737565491 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260130172737565491.eigenfacs
260130172737565491.atom
making animated gifs
11 models are in 260130172737565491.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260130172737565491.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260130172737565491.10.pdb
260130172737565491.11.pdb
260130172737565491.7.pdb
260130172737565491.8.pdb
260130172737565491.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.941s
user 0m18.800s
sys 0m0.131s
rm: cannot remove '260130172737565491.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
