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* TRANSFERASE 18-APR-07 2PL0 *

LOGs for ID: 260201014444812257

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260201014444812257.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260201014444812257.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260201014444812257.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    268
            First residue number     =    231
            Last  residue number     =    498
            Number of atoms found    =   2182
            Mean number per residue  =      8.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    31.690665 +/-    12.687647 From:    -1.595000 To:    58.175000
 =    19.257712 +/-     9.963505 From:   -10.931000 To:    43.623000
 =    16.334202 +/-    11.136437 From:    -9.838000 To:    44.435000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.6861 % Filled.
 Pdbmat>       789880  non-zero elements.
 Pdbmat>        86327 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     79.13 +/-     22.82
         Maximum number =    133
         Minimum number =     16

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.726540E+06
 Pdbmat> Larger element =  480.930    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
268 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260201014444812257.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260201014444812257.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260201014444812257.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2182 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   268 residues.
 Blocpdb>    12 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    28 atoms in block      2
 Block first atom:     13
 Blocpdb>    17 atoms in block      3
 Block first atom:     41
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     58
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    18 atoms in block      6
 Block first atom:     97
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    17 atoms in block      8
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    15 atoms in block      9
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    20 atoms in block     10
 Block first atom:    163
 Blocpdb>    12 atoms in block     11
 Block first atom:    183
 Blocpdb>     9 atoms in block     12
 Block first atom:    195
 Blocpdb>    20 atoms in block     13
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    13 atoms in block     14
 Block first atom:    224
 Blocpdb>    21 atoms in block     15
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    12 atoms in block     16
 Block first atom:    258
 Blocpdb>    24 atoms in block     17
 Block first atom:    270
 Blocpdb>    12 atoms in block     18
 Block first atom:    294
 Blocpdb>    17 atoms in block     19
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    323
 Blocpdb>    12 atoms in block     21
 Block first atom:    339
 Blocpdb>    15 atoms in block     22
 Block first atom:    351
 Blocpdb>    17 atoms in block     23
 Block first atom:    366
 Blocpdb>    13 atoms in block     24
 Block first atom:    383
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    396
 Blocpdb>    13 atoms in block     26
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    13 atoms in block     27
 Block first atom:    423
 Blocpdb>    19 atoms in block     28
 Block first atom:    436
 Blocpdb>    14 atoms in block     29
 Block first atom:    455
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    469
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    482
 Blocpdb>    18 atoms in block     32
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    17 atoms in block     33
 Block first atom:    516
 Blocpdb>    19 atoms in block     34
 Block first atom:    533
 Blocpdb>    19 atoms in block     35
 Block first atom:    552
 Blocpdb>    18 atoms in block     36
 Block first atom:    571
 Blocpdb>    20 atoms in block     37
 Block first atom:    589
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    14 atoms in block     39
 Block first atom:    621
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:    635
 Blocpdb>    15 atoms in block     41
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    20 atoms in block     42
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    21 atoms in block     44
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    724
 Blocpdb>    12 atoms in block     46
 Block first atom:    741
 Blocpdb>    14 atoms in block     47
 Block first atom:    753
 Blocpdb>    15 atoms in block     48
 Block first atom:    767
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    782
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    801
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    12 atoms in block     52
 Block first atom:    830
 Blocpdb>    17 atoms in block     53
 Block first atom:    842
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    859
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    874
 Blocpdb>    16 atoms in block     56
 Block first atom:    891
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    907
 Blocpdb>    10 atoms in block     58
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    17 atoms in block     59
 Block first atom:    933
 Blocpdb>    14 atoms in block     60
 Block first atom:    950
 Blocpdb>    12 atoms in block     61
 Block first atom:    964
 Blocpdb>    16 atoms in block     62
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    17 atoms in block     63
 Block first atom:    992
 Blocpdb>    20 atoms in block     64
 Block first atom:   1009
 Blocpdb>    20 atoms in block     65
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1049
 Blocpdb>    19 atoms in block     67
 Block first atom:   1067
 Blocpdb>    19 atoms in block     68
 Block first atom:   1086
 Blocpdb>    10 atoms in block     69
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1115
 Blocpdb>    15 atoms in block     71
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>    14 atoms in block     72
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1160
 Blocpdb>    12 atoms in block     74
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    17 atoms in block     75
 Block first atom:   1187
 Blocpdb>    13 atoms in block     76
 Block first atom:   1204
 Blocpdb>    15 atoms in block     77
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    13 atoms in block     78
 Block first atom:   1232
 Blocpdb>    19 atoms in block     79
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    17 atoms in block     80
 Block first atom:   1264
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1281
 Blocpdb>    21 atoms in block     82
 Block first atom:   1297
 Blocpdb>    12 atoms in block     83
 Block first atom:   1318
 Blocpdb>    20 atoms in block     84
 Block first atom:   1330
 Blocpdb>     9 atoms in block     85
 Block first atom:   1350
 Blocpdb>    20 atoms in block     86
 Block first atom:   1359
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1379
 Blocpdb>    23 atoms in block     88
 Block first atom:   1394
 Blocpdb>    12 atoms in block     89
 Block first atom:   1417
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   1429
 Blocpdb>    13 atoms in block     91
 Block first atom:   1445
 Blocpdb>    20 atoms in block     92
 Block first atom:   1458
 Blocpdb>    11 atoms in block     93
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1489
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1507
 Blocpdb>    14 atoms in block     96
 Block first atom:   1524
 Blocpdb>    21 atoms in block     97
 Block first atom:   1538
 Blocpdb>    17 atoms in block     98
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    12 atoms in block     99
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1588
 Blocpdb>    16 atoms in block    101
 Block first atom:   1604
 Blocpdb>    15 atoms in block    102
 Block first atom:   1620
 Blocpdb>    17 atoms in block    103
 Block first atom:   1635
 Blocpdb>    15 atoms in block    104
 Block first atom:   1652
 Blocpdb>    15 atoms in block    105
 Block first atom:   1667
 Blocpdb>    19 atoms in block    106
 Block first atom:   1682
 Blocpdb>    12 atoms in block    107
 Block first atom:   1701
 Blocpdb>    15 atoms in block    108
 Block first atom:   1713
 Blocpdb>    16 atoms in block    109
 Block first atom:   1728
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1744
 Blocpdb>    17 atoms in block    111
 Block first atom:   1759
 Blocpdb>    17 atoms in block    112
 Block first atom:   1776
 Blocpdb>    15 atoms in block    113
 Block first atom:   1793
 Blocpdb>    23 atoms in block    114
 Block first atom:   1808
 Blocpdb>    15 atoms in block    115
 Block first atom:   1831
 Blocpdb>    18 atoms in block    116
 Block first atom:   1846
 Blocpdb>    16 atoms in block    117
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    13 atoms in block    118
 Block first atom:   1880
 Blocpdb>    18 atoms in block    119
 Block first atom:   1893
 Blocpdb>    20 atoms in block    120
 Block first atom:   1911
 Blocpdb>    17 atoms in block    121
 Block first atom:   1931
 Blocpdb>    19 atoms in block    122
 Block first atom:   1948
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1967
 Blocpdb>    23 atoms in block    124
 Block first atom:   1981
 Blocpdb>    20 atoms in block    125
 Block first atom:   2004
 Blocpdb>    16 atoms in block    126
 Block first atom:   2024
 Blocpdb>    19 atoms in block    127
 Block first atom:   2040
 Blocpdb>    14 atoms in block    128
 Block first atom:   2059
 Blocpdb>    19 atoms in block    129
 Block first atom:   2073
 Blocpdb>    20 atoms in block    130
 Block first atom:   2092
 Blocpdb>    17 atoms in block    131
 Block first atom:   2112
 Blocpdb>    15 atoms in block    132
 Block first atom:   2129
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2144
 Blocpdb>    22 atoms in block    134
 Block first atom:   2160

 Blocpdb>   134 blocks.

 Blocpdb> At most,     28 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       790014 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6546

 Prepmat> Matrix trace    =    1726540.0000
 Prepmat> Last element read:    6546   6546       250.7290
 Prepmat>         9046 lines saved.
 Prepmat>         7682 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2182
 RTB> Total mass =        2182.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2182
 RTB> Number of blocks =   134
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  177874.6393
 RTB>     47058 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      804
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    47058
 Diagstd> Projected matrix trace =  177874.6393

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    804 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 177874.6393
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.8352941      1.5255751      1.9880052      2.5825843
      2.8819130      4.0590096      4.8377265      6.2816127      7.3956625
      7.8959896      8.7397000      9.6306528      9.9743648     10.9557153
     11.4943798     13.1637985     14.0530449     14.8916792     15.9355162
     16.7636305     17.5645934     18.6296739     19.0083675     20.3974414
     21.6757118     22.6415299     23.0641781     23.3341352     24.2462963
     24.4930265     25.6018260     26.0459002     26.7292284     27.5928280
     28.2437924     28.6315338     30.3002438     30.7417447     31.4259627
     31.8117627     32.4761656     32.7776327     33.6425124     34.7991228
     34.9126644     35.6487269     36.3777362     37.2093216     37.5022488
     38.6011094     38.8442121     41.2932175     41.5198203     41.7247113
     42.2721605     43.6149362     43.7418396     45.0217002     45.7325860
     46.6492888     47.4650875     48.0330416     48.7253913     49.9130253
     50.1979908     50.6097619     51.6569013     52.8653043     53.5309173
     53.6390128     53.9705321     54.4418540     55.0765109     56.2285229
     56.7085312     56.8938496     57.5443912     58.3648402     58.8034574
     59.3857994     60.4169353     60.9930277     61.8626838     63.0705799
     64.1747115     64.7762759     65.1861201     65.8913523     67.0893187
     67.6141775     68.4111466     69.4168782     69.7683784     70.1558871
     71.2322706     71.4699131     72.2665671     72.8196060     73.1504691
     74.0712041

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034327      0.0034331      0.0034337      0.0034338      0.0034338
      0.0034341     99.2464502    134.1257238    153.1101686    174.5108912
    184.3468461    218.7788415    238.8448791    272.1641123    295.3138547
    305.1395943    321.0284658    336.9947572    342.9556037    359.4310976
    368.1612294    393.9906296    407.0806853    419.0512266    433.4892662
    444.6100960    455.1078544    468.7031873    473.4429891    490.4368877
    505.5707784    516.7115450    521.5119589    524.5551256    534.7096032
    537.4233192    549.4532555    554.1980154    561.4207904    570.4182174
    577.1075895    581.0554608    597.7482887    602.0873962    608.7508429
    612.4761017    618.8389693    621.7045882    629.8534188    640.5889289
    641.6331252    648.3616112    654.9574930    662.4012700    665.0035068
    674.6758632    676.7970214    697.8059080    699.7179466    701.4422971
    706.0289394    717.1547862    718.1973562    728.6286205    734.3585577
    741.6820932    748.1392208    752.6019241    758.0065321    767.1887524
    769.3756685    772.5247950    780.4758253    789.5518370    794.5068078
    795.3085814    797.7625229    801.2383607    805.8950538    814.2797180
    817.7479794    819.0830534    823.7525651    829.6041782    832.7156196
    836.8287337    844.0625393    848.0771777    854.1018427    862.3998898
    869.9158481    873.9835696    876.7440886    881.4739672    889.4508838
    892.9233195    898.1703516    904.7483918    907.0361469    909.5515966
    916.5025430    918.0300714    923.1323968    926.6579214    928.7607166
    934.5875309

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2182
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    134

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9926E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9950E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8353    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.526    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.988    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.583    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.882    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.059    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.838    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.282    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.396    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.896    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.740    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.631    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.974    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.07    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    804 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
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 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997
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 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
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 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00003
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 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    39276 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00003
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 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
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 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99996
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000
 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997
 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260201014444812257.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260201014444812257.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260201014444812257.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260201014444812257.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    268
            First residue number     =    231
            Last  residue number     =    498
            Number of atoms found    =   2182
            Mean number per residue  =      8.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9926E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9950E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8353    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.526    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.988    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.583    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.882    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.059    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.838    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.282    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.396    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.896    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.740    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.631    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.974    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.07    

 Bfactors>  106 vectors,   6546 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.835300
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.556 for    268 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.040 +/-   0.07
 Bfactors> =     54.720 +/-  15.62
 Bfactors> Shiftng-fct=     54.679
 Bfactors> Scaling-fct=    220.418

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260201014444812257.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260201014444812257.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4325E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   99.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   134.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   153.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   174.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   184.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   218.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   238.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   272.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   295.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   305.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   321.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   337.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   342.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   923.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   928.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   934.5    

 Chkmod>  106 vectors,   6546 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2182 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     7 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    17 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7757
      0.0034      0.7207
      0.0034      0.9169
      0.0034      0.9229
      0.0034      0.9498
      0.0034      0.8103
     99.2425      0.0414
    134.1386      0.1997
    153.1034      0.3098
    174.5174      0.6936
    184.3417      0.3969
    218.7692      0.0867
    238.8414      0.1696
    272.1608      0.6130
    295.3079      0.4088
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    359.4859      0.2081
    368.0753      0.4141
    393.9169      0.2344
    407.0191      0.2751
    419.0096      0.3850
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    621.7003      0.3953
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    640.5695      0.5388
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    934.5398      0.4405
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260201014444812257 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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260201014444812257.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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260201014444812257.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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260201014444812257.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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260201014444812257.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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260201014444812257.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
260201014444812257.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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11 models are in 260201014444812257.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 260201014444812257.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 260201014444812257.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260201014444812257.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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generate a series of perturbations for mode 11
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making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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260201014444812257.11.pdb
260201014444812257.7.pdb
260201014444812257.8.pdb
260201014444812257.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.288s
user	0m7.190s
sys	0m0.095s
rm: cannot remove '260201014444812257.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** TRANSFERASE 18-APR-07 2PL0 ***

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Still some additional cleaning from time to time
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* TRANSFERASE 18-APR-07 2PL0 *
