*** nsrna ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602021432171097592.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602021432171097592.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602021432171097592.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 643
First residue number = 1
Last residue number = 702
Number of atoms found = 11636
Mean number per residue = 18.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 118.761748 +/- 12.021410 From: 89.314000 To: 152.347000
= 120.278157 +/- 17.665958 From: 79.718000 To: 157.796000
= 156.133945 +/- 18.232441 From: 115.265000 To: 200.084000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 74 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3259 % Filled.
Pdbmat> 8078656 non-zero elements.
Pdbmat> 890030 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 152.98 +/- 45.51
Maximum number = 243
Minimum number = 22
Pdbmat> Matrix trace = 1.780060E+07
Pdbmat> Larger element = 870.448
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
643 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602021432171097592.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602021432171097592.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602021432171097592.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 11636 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 643 residues.
Blocpdb> 122 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 125 atoms in block 2
Block first atom: 123
Blocpdb> 130 atoms in block 3
Block first atom: 248
Blocpdb> 127 atoms in block 4
Block first atom: 378
Blocpdb> 128 atoms in block 5
Block first atom: 505
Blocpdb> 130 atoms in block 6
Block first atom: 633
Blocpdb> 123 atoms in block 7
Block first atom: 763
Blocpdb> 127 atoms in block 8
Block first atom: 886
Blocpdb> 125 atoms in block 9
Block first atom: 1013
Blocpdb> 129 atoms in block 10
Block first atom: 1138
Blocpdb> 135 atoms in block 11
Block first atom: 1267
Blocpdb> 98 atoms in block 12
Block first atom: 1402
Blocpdb> 136 atoms in block 13
Block first atom: 1500
Blocpdb> 124 atoms in block 14
Block first atom: 1636
Blocpdb> 124 atoms in block 15
Block first atom: 1760
Blocpdb> 127 atoms in block 16
Block first atom: 1884
Blocpdb> 132 atoms in block 17
Block first atom: 2011
Blocpdb> 136 atoms in block 18
Block first atom: 2143
Blocpdb> 96 atoms in block 19
Block first atom: 2279
Blocpdb> 64 atoms in block 20
Block first atom: 2375
Blocpdb> 73 atoms in block 21
Block first atom: 2439
Blocpdb> 71 atoms in block 22
Block first atom: 2512
Blocpdb> 74 atoms in block 23
Block first atom: 2583
Blocpdb> 76 atoms in block 24
Block first atom: 2657
Blocpdb> 51 atoms in block 25
Block first atom: 2733
Blocpdb> 68 atoms in block 26
Block first atom: 2784
Blocpdb> 58 atoms in block 27
Block first atom: 2852
Blocpdb> 72 atoms in block 28
Block first atom: 2910
Blocpdb> 57 atoms in block 29
Block first atom: 2982
Blocpdb> 64 atoms in block 30
Block first atom: 3039
Blocpdb> 71 atoms in block 31
Block first atom: 3103
Blocpdb> 66 atoms in block 32
Block first atom: 3174
Blocpdb> 66 atoms in block 33
Block first atom: 3240
Blocpdb> 79 atoms in block 34
Block first atom: 3306
Blocpdb> 76 atoms in block 35
Block first atom: 3385
Blocpdb> 61 atoms in block 36
Block first atom: 3461
Blocpdb> 52 atoms in block 37
Block first atom: 3522
Blocpdb> 69 atoms in block 38
Block first atom: 3574
Blocpdb> 64 atoms in block 39
Block first atom: 3643
Blocpdb> 70 atoms in block 40
Block first atom: 3707
Blocpdb> 59 atoms in block 41
Block first atom: 3777
Blocpdb> 69 atoms in block 42
Block first atom: 3836
Blocpdb> 76 atoms in block 43
Block first atom: 3905
Blocpdb> 84 atoms in block 44
Block first atom: 3981
Blocpdb> 61 atoms in block 45
Block first atom: 4065
Blocpdb> 74 atoms in block 46
Block first atom: 4126
Blocpdb> 72 atoms in block 47
Block first atom: 4200
Blocpdb> 55 atoms in block 48
Block first atom: 4272
Blocpdb> 51 atoms in block 49
Block first atom: 4327
Blocpdb> 67 atoms in block 50
Block first atom: 4378
Blocpdb> 54 atoms in block 51
Block first atom: 4445
Blocpdb> 66 atoms in block 52
Block first atom: 4499
Blocpdb> 68 atoms in block 53
Block first atom: 4565
Blocpdb> 72 atoms in block 54
Block first atom: 4633
Blocpdb> 72 atoms in block 55
Block first atom: 4705
Blocpdb> 48 atoms in block 56
Block first atom: 4777
Blocpdb> 54 atoms in block 57
Block first atom: 4825
Blocpdb> 64 atoms in block 58
Block first atom: 4879
Blocpdb> 70 atoms in block 59
Block first atom: 4943
Blocpdb> 56 atoms in block 60
Block first atom: 5013
Blocpdb> 64 atoms in block 61
Block first atom: 5069
Blocpdb> 56 atoms in block 62
Block first atom: 5133
Blocpdb> 59 atoms in block 63
Block first atom: 5189
Blocpdb> 54 atoms in block 64
Block first atom: 5248
Blocpdb> 78 atoms in block 65
Block first atom: 5302
Blocpdb> 71 atoms in block 66
Block first atom: 5380
Blocpdb> 73 atoms in block 67
Block first atom: 5451
Blocpdb> 55 atoms in block 68
Block first atom: 5524
Blocpdb> 63 atoms in block 69
Block first atom: 5579
Blocpdb> 59 atoms in block 70
Block first atom: 5642
Blocpdb> 51 atoms in block 71
Block first atom: 5701
Blocpdb> 74 atoms in block 72
Block first atom: 5752
Blocpdb> 59 atoms in block 73
Block first atom: 5826
Blocpdb> 68 atoms in block 74
Block first atom: 5885
Blocpdb> 79 atoms in block 75
Block first atom: 5953
Blocpdb> 74 atoms in block 76
Block first atom: 6032
Blocpdb> 53 atoms in block 77
Block first atom: 6106
Blocpdb> 41 atoms in block 78
Block first atom: 6159
Blocpdb> 62 atoms in block 79
Block first atom: 6200
Blocpdb> 67 atoms in block 80
Block first atom: 6262
Blocpdb> 84 atoms in block 81
Block first atom: 6329
Blocpdb> 71 atoms in block 82
Block first atom: 6413
Blocpdb> 61 atoms in block 83
Block first atom: 6484
Blocpdb> 62 atoms in block 84
Block first atom: 6545
Blocpdb> 79 atoms in block 85
Block first atom: 6607
Blocpdb> 55 atoms in block 86
Block first atom: 6686
Blocpdb> 61 atoms in block 87
Block first atom: 6741
Blocpdb> 39 atoms in block 88
Block first atom: 6802
Blocpdb> 78 atoms in block 89
Block first atom: 6841
Blocpdb> 46 atoms in block 90
Block first atom: 6919
Blocpdb> 66 atoms in block 91
Block first atom: 6965
Blocpdb> 52 atoms in block 92
Block first atom: 7031
Blocpdb> 56 atoms in block 93
Block first atom: 7083
Blocpdb> 75 atoms in block 94
Block first atom: 7139
Blocpdb> 43 atoms in block 95
Block first atom: 7214
Blocpdb> 63 atoms in block 96
Block first atom: 7257
Blocpdb> 53 atoms in block 97
Block first atom: 7320
Blocpdb> 55 atoms in block 98
Block first atom: 7373
Blocpdb> 82 atoms in block 99
Block first atom: 7428
Blocpdb> 54 atoms in block 100
Block first atom: 7510
Blocpdb> 79 atoms in block 101
Block first atom: 7564
Blocpdb> 65 atoms in block 102
Block first atom: 7643
Blocpdb> 68 atoms in block 103
Block first atom: 7708
Blocpdb> 62 atoms in block 104
Block first atom: 7776
Blocpdb> 57 atoms in block 105
Block first atom: 7838
Blocpdb> 66 atoms in block 106
Block first atom: 7895
Blocpdb> 74 atoms in block 107
Block first atom: 7961
Blocpdb> 65 atoms in block 108
Block first atom: 8035
Blocpdb> 62 atoms in block 109
Block first atom: 8100
Blocpdb> 73 atoms in block 110
Block first atom: 8162
Blocpdb> 63 atoms in block 111
Block first atom: 8235
Blocpdb> 69 atoms in block 112
Block first atom: 8298
Blocpdb> 76 atoms in block 113
Block first atom: 8367
Blocpdb> 65 atoms in block 114
Block first atom: 8443
Blocpdb> 48 atoms in block 115
Block first atom: 8508
Blocpdb> 62 atoms in block 116
Block first atom: 8556
Blocpdb> 79 atoms in block 117
Block first atom: 8618
Blocpdb> 53 atoms in block 118
Block first atom: 8697
Blocpdb> 38 atoms in block 119
Block first atom: 8750
Blocpdb> 61 atoms in block 120
Block first atom: 8788
Blocpdb> 68 atoms in block 121
Block first atom: 8849
Blocpdb> 57 atoms in block 122
Block first atom: 8917
Blocpdb> 67 atoms in block 123
Block first atom: 8974
Blocpdb> 78 atoms in block 124
Block first atom: 9041
Blocpdb> 55 atoms in block 125
Block first atom: 9119
Blocpdb> 69 atoms in block 126
Block first atom: 9174
Blocpdb> 69 atoms in block 127
Block first atom: 9243
Blocpdb> 66 atoms in block 128
Block first atom: 9312
Blocpdb> 66 atoms in block 129
Block first atom: 9378
Blocpdb> 81 atoms in block 130
Block first atom: 9444
Blocpdb> 66 atoms in block 131
Block first atom: 9525
Blocpdb> 72 atoms in block 132
Block first atom: 9591
Blocpdb> 68 atoms in block 133
Block first atom: 9663
Blocpdb> 62 atoms in block 134
Block first atom: 9731
Blocpdb> 74 atoms in block 135
Block first atom: 9793
Blocpdb> 54 atoms in block 136
Block first atom: 9867
Blocpdb> 73 atoms in block 137
Block first atom: 9921
Blocpdb> 52 atoms in block 138
Block first atom: 9994
Blocpdb> 64 atoms in block 139
Block first atom: 10046
Blocpdb> 61 atoms in block 140
Block first atom: 10110
Blocpdb> 61 atoms in block 141
Block first atom: 10171
Blocpdb> 74 atoms in block 142
Block first atom: 10232
Blocpdb> 68 atoms in block 143
Block first atom: 10306
Blocpdb> 68 atoms in block 144
Block first atom: 10374
Blocpdb> 55 atoms in block 145
Block first atom: 10442
Blocpdb> 76 atoms in block 146
Block first atom: 10497
Blocpdb> 65 atoms in block 147
Block first atom: 10573
Blocpdb> 68 atoms in block 148
Block first atom: 10638
Blocpdb> 76 atoms in block 149
Block first atom: 10706
Blocpdb> 61 atoms in block 150
Block first atom: 10782
Blocpdb> 60 atoms in block 151
Block first atom: 10843
Blocpdb> 63 atoms in block 152
Block first atom: 10903
Blocpdb> 53 atoms in block 153
Block first atom: 10966
Blocpdb> 77 atoms in block 154
Block first atom: 11019
Blocpdb> 14 atoms in block 155
Block first atom: 11096
Blocpdb> 60 atoms in block 156
Block first atom: 11110
Blocpdb> 53 atoms in block 157
Block first atom: 11170
Blocpdb> 77 atoms in block 158
Block first atom: 11223
Blocpdb> 64 atoms in block 159
Block first atom: 11300
Blocpdb> 64 atoms in block 160
Block first atom: 11364
Blocpdb> 75 atoms in block 161
Block first atom: 11428
Blocpdb> 76 atoms in block 162
Block first atom: 11503
Blocpdb> 58 atoms in block 163
Block first atom: 11578
Blocpdb> 163 blocks.
Blocpdb> At most, 136 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 8078819 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 34908
Prepmat> Matrix trace = 17800600.0000
Prepmat> Last element read: 34908 34908 264.6730
Prepmat> 13367 lines saved.
Prepmat> 11678 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11636
RTB> Total mass = 11636.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 11636
RTB> Number of blocks = 163
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 370379.3153
RTB> 58323 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 978
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58323
Diagstd> Projected matrix trace = 370379.3153
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 978 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 370379.3153
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.1081577 2.3988569 3.1623303 4.7033196
4.9335317 6.7663200 8.7455480 9.4967637 10.4375594
11.0414455 11.6307573 12.6253999 13.1300040 14.3711567
15.0814534 17.0754976 17.6617317 18.9088480 19.6362257
20.3187692 21.5103834 22.2115094 22.9683241 23.4542206
24.7574469 26.2848840 26.5288488 27.2331575 29.1262301
29.3625297 30.3824475 31.4300642 32.3616771 33.4767855
34.2508565 35.8607014 37.2870521 38.5595170 39.6589912
40.5962078 41.3683957 43.1283694 43.5386816 43.7509726
46.7557353 47.4542130 48.4507451 50.1110114 50.2382308
50.8368296 52.1548536 53.2731585 53.5477684 54.4340607
54.9611122 57.0957743 57.9300729 59.7203242 60.7206451
60.9934512 62.2695278 63.0936153 63.9824388 64.4343237
65.0894577 65.7817913 67.0177032 68.7464854 69.1522051
70.3233761 71.7554826 72.1997477 72.7430381 73.7125431
74.1441338 74.5060347 76.3656018 76.5003967 77.8662006
78.7698578 79.5741562 80.9467643 81.1157122 82.2202764
83.5776905 84.9193442 85.8442693 86.7143325 87.2244677
87.7750568 88.4181412 90.3331098 91.3544237 92.5956455
93.3896082 93.9133647 95.3529125 96.0674336 97.1072570
97.4256914
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034314 0.0034345 0.0034350 0.0034351
0.0034376 157.6691852 168.1889470 193.1073917 235.5035857
241.1983007 282.4694902 321.1358526 334.6440420 350.8284141
360.8346595 370.3388528 385.8494202 393.4845721 411.6623445
421.7128932 448.7267550 456.3645709 472.2019932 481.1985260
489.4901747 503.6390037 511.7811858 520.4271371 525.9031635
540.3164728 556.7347276 559.3124449 566.6883430 586.0537081
588.4262180 598.5585767 608.7905671 617.7472071 628.3001383
635.5225991 650.2863983 663.0927890 674.3122865 683.8582832
691.8915296 698.4408304 713.1432887 716.5275898 718.2723294
742.5278130 748.0535151 755.8672181 768.7088208 769.6839822
774.2558748 784.2285445 792.5916696 794.6318502 801.1810098
805.0503379 820.5352895 826.5084875 839.1823841 846.1813879
848.0801225 856.9057687 862.5573638 868.6117010 871.6736498
876.0937997 880.7408255 888.9760281 900.3689928 903.0219292
910.6366733 919.8623109 922.7055230 926.1706155 932.3220974
935.0475105 937.3267369 948.9518342 949.7889746 958.2300196
963.7742329 968.6821597 977.0010422 978.0200838 984.6564870
992.7512972 1000.6877796 1006.1226692 1011.2085265 1014.1786042
1017.3744809 1021.0945789 1032.0928301 1037.9108964 1044.9380941
1049.4084505 1052.3470318 1060.3817919 1064.3473292 1070.0920154
1071.8451041
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11636
Rtb_to_modes> Number of blocs = 163
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9840E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0021E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.399
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.162
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.497
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.43
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 978 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99995
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 0.99996
0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00004
1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 1.00004 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 209448 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99995
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 0.99996
0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00004
1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 1.00004 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602021432171097592.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602021432171097592.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602021432171097592.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602021432171097592.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 643
First residue number = 1
Last residue number = 702
Number of atoms found = 11636
Mean number per residue = 18.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9840E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0021E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.399
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.162
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.497
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.43
Bfactors> 106 vectors, 34908 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.108000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.719 for 569 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 125.543 +/- 23.30
Bfactors> Shiftng-fct= 125.540
Bfactors> Scaling-fct= 5834.141
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602021432171097592.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602021432171097592.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4374E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Chkmod> 106 vectors, 34908 coordinates in file.
Chkmod> That is: 11636 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9181
0.0034 0.7650
0.0034 0.8787
0.0034 0.7516
0.0034 0.8904
0.0034 0.7594
157.6565 0.0372
168.1867 0.2315
193.0890 0.2716
235.4855 0.5049
241.1994 0.4152
282.4507 0.0402
321.1304 0.3872
334.6338 0.3409
350.8544 0.1851
360.7956 0.4586
370.3109 0.5153
385.9031 0.5079
393.4676 0.5585
411.6281 0.5523
421.6745 0.4038
448.7666 0.3044
456.3226 0.0669
472.1961 0.2450
481.2241 0.4897
489.4840 0.4145
503.6129 0.5026
511.7418 0.2228
520.4238 0.4641
525.8333 0.5557
540.3211 0.5113
556.6591 0.4066
559.3006 0.4436
566.6312 0.4834
586.0665 0.2613
588.3756 0.6035
598.5088 0.5640
608.7638 0.3441
617.7047 0.5854
628.3033 0.4338
635.4874 0.5822
650.2521 0.4194
663.0905 0.4774
674.2876 0.5027
683.8376 0.5313
691.8941 0.3894
698.4244 0.4502
713.1262 0.4575
716.5077 0.4308
718.2335 0.4870
742.5298 0.3895
747.9882 0.3763
755.8290 0.3345
768.6681 0.5089
769.6645 0.3705
774.2468 0.4243
784.1584 0.5192
792.5342 0.4435
794.6143 0.2913
801.1167 0.4807
805.0076 0.3726
820.5304 0.4039
826.4725 0.3201
839.1441 0.4611
846.1406 0.4576
848.0197 0.4354
856.8722 0.3751
862.4956 0.2856
868.5579 0.4082
871.6070 0.3302
876.0598 0.4195
880.6910 0.4880
888.9531 0.3274
900.3534 0.4712
902.9688 0.5168
910.5757 0.4631
919.8518 0.3179
922.6675 0.4271
926.1115 0.5286
932.2660 0.4547
934.9813 0.4312
937.3114 0.4202
948.9384 0.3163
949.7457 0.4331
958.2123 0.4392
963.7337 0.4269
968.6153 0.3586
976.9786 0.4426
978.0039 0.4503
984.6126 0.4568
992.7224 0.4893
1000.6487 0.3125
1006.0545 0.4588
1011.1399 0.2768
1014.1091 0.4961
1017.3595 0.4017
1021.0615 0.2026
1032.0308 0.3756
1037.8412 0.4962
1044.9178 0.5161
1049.3656 0.4950
1052.2830 0.4761
1060.3201 0.3918
1064.3159 0.3385
1070.0612 0.4946
1071.8228 0.4544
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021432171097592 7 -200 200 40 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021432171097592.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021432171097592 8 -200 200 40 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021432171097592.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021432171097592 9 -200 200 40 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021432171097592.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021432171097592 10 -200 200 40 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021432171097592.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021432171097592 11 -200 200 40 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
2602021432171097592.eigenfacs
2602021432171097592.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021432171097592.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021432171097592.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602021432171097592.10.pdb
2602021432171097592.11.pdb
2602021432171097592.7.pdb
2602021432171097592.8.pdb
2602021432171097592.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m4.950s
user 1m4.387s
sys 0m0.528s
rm: cannot remove '2602021432171097592.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
