CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  SIGNALING PROTEIN/PEPTIDE BINDING PROTEI04-NOV-09 2KQF  ***

<R2> analysis for 2602021513261103364

---  normal mode 53  ---

This page gives a visualization of the normalized mean square displacement <R2> of all C-alpha atoms in the protein that are associated to this mode (black bars). The three components of the corresponding eigenvector are shown on the left (colored bars). Here is the raw data for <R2> and for the eigenvector (shift-click on the links for download).

XYZresidue<R2><R2>max = 0.1078
GLY 10.0007
GLY 20.0009
SER 30.0014
MET 40.0015
ARG 50.0005
PRO 60.0009
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0004
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0003
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0000
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0002
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0003
ASN 960.0003
SER 1010.0003
TRP 1020.0002
GLU 1030.0001
SER 1040.0003
HIS 1050.0004
LYS 1060.0005
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0003
GLU 1100.0004
THR 1110.0003
ARG 1120.0003
LEU 1130.0001
GLY 10.1078
GLY 20.0891
SER 30.0986
MET 40.0783
ARG 50.0325
PRO 60.0579
PRO 70.0004
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0004
ALA 130.0004
GLY 140.0005
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0000
ILE 240.0002
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0000
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0002
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0001
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0004
THR 920.0002
PRO 930.0004
LEU 940.0006
GLU 950.0007
ASN 960.0010
SER 1010.0004
TRP 1020.0003
GLU 1030.0004
SER 1040.0003
HIS 1050.0002
LYS 1060.0003
SER 1070.0003
GLY 1080.0001
GLY 1090.0003
GLU 1100.0004
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0001
GLY 10.0006
GLY 20.0012
SER 30.0020
MET 40.0021
ARG 50.0007
PRO 60.0013
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0004
ALA 130.0004
GLY 140.0005
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0003
VAL 330.0002
TYR 340.0002
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0001
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0002
PRO 930.0003
LEU 940.0004
GLU 950.0004
ASN 960.0004
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0006
SER 1040.0004
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0003
GLY 1080.0001
GLY 1090.0003
GLU 1100.0004
THR 1110.0004
ARG 1120.0004
LEU 1130.0001
GLY 10.0241
GLY 20.0214
SER 30.0217
MET 40.0171
ARG 50.0076
PRO 60.0115
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0001
SER 310.0003
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0002
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0002
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0003
ASN 960.0004
SER 1010.0003
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0002
HIS 1050.0002
LYS 1060.0003
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0003
GLU 1100.0004
THR 1110.0003
ARG 1120.0004
LEU 1130.0001
GLY 10.0016
GLY 20.0012
SER 30.0008
MET 40.0008
ARG 50.0006
PRO 60.0007
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0005
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0003
VAL 260.0001
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0003
ASP 300.0004
SER 310.0002
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0001
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0003
ASN 960.0003
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0002
SER 1040.0002
HIS 1050.0004
LYS 1060.0007
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0004
GLU 1100.0005
THR 1110.0004
ARG 1120.0003
LEU 1130.0001
GLY 10.0682
GLY 20.0667
SER 30.0717
MET 40.0617
ARG 50.0266
PRO 60.0415
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0002
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0003
VAL 260.0001
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0002
LEU 590.0001
ILE 600.0002
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0001
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0004
THR 920.0002
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0003
ASN 960.0004
SER 1010.0006
TRP 1020.0003
GLU 1030.0002
SER 1040.0001
HIS 1050.0003
LYS 1060.0006
SER 1070.0003
GLY 1080.0002
GLY 1090.0004
GLU 1100.0006
THR 1110.0006
ARG 1120.0006
LEU 1130.0001
GLY 10.0018
GLY 20.0015
SER 30.0013
MET 40.0011
ARG 50.0009
PRO 60.0009
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0003
VAL 260.0001
TYR 270.0001
MET 280.0002
GLY 290.0004
ASP 300.0005
SER 310.0002
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0000
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0005
THR 920.0004
PRO 930.0004
LEU 940.0011
GLU 950.0014
ASN 960.0020
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0003
SER 1040.0001
HIS 1050.0003
LYS 1060.0004
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0005
GLU 1100.0006
THR 1110.0005
ARG 1120.0004
LEU 1130.0001
GLY 10.0143
GLY 20.0114
SER 30.0118
MET 40.0096
ARG 50.0045
PRO 60.0071
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0000
ILE 240.0002
ARG 250.0003
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0003
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0000
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0001
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0001
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0003
ASN 960.0003
SER 1010.0003
TRP 1020.0002
GLU 1030.0003
SER 1040.0002
HIS 1050.0003
LYS 1060.0002
SER 1070.0003
GLY 1080.0001
GLY 1090.0006
GLU 1100.0008
THR 1110.0007
ARG 1120.0006
LEU 1130.0001
GLY 10.0024
GLY 20.0020
SER 30.0014
MET 40.0013
ARG 50.0006
PRO 60.0007
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0003
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0001
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0003
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0003
GLY 290.0005
ASP 300.0006
SER 310.0003
ASP 320.0002
VAL 330.0002
TYR 340.0002
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0001
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0002
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0002
VAL 720.0002
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0004
THR 920.0002
PRO 930.0005
LEU 940.0008
GLU 950.0010
ASN 960.0013
SER 1010.0002
TRP 1020.0001
GLU 1030.0004
SER 1040.0003
HIS 1050.0003
LYS 1060.0006
SER 1070.0004
GLY 1080.0002
GLY 1090.0007
GLU 1100.0009
THR 1110.0008
ARG 1120.0008
LEU 1130.0001
GLY 10.0071
GLY 20.0069
SER 30.0074
MET 40.0059
ARG 50.0023
PRO 60.0044
PRO 70.0003
ILE 80.0002
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0004
ALA 130.0004
GLY 140.0004
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0002
GLY 180.0002
PHE 190.0002
THR 200.0002
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0002
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0000
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0002
VAL 330.0001
TYR 340.0001
THR 350.0001
VAL 360.0001
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0000
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0002
GLU 440.0002
ASP 450.0002
GLY 460.0003
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0003
SER 500.0002
GLU 510.0004
ALA 520.0003
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0002
GLN 560.0002
GLY 570.0001
ASP 580.0001
LEU 590.0001
ILE 600.0002
THR 610.0001
HIS 620.0001
VAL 630.0001
ASN 640.0001
GLY 650.0002
GLU 660.0001
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0004
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0001
THR 740.0001
GLU 750.0001
VAL 760.0001
VAL 770.0002
GLU 780.0002
LEU 790.0002
ILE 800.0003
LEU 810.0004
LYS 820.0003
SER 830.0004
GLY 840.0005
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0002
SER 900.0003
THR 910.0003
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0003
GLU 950.0002
ASN 960.0002
SER 1010.0005
TRP 1020.0004
GLU 1030.0007
SER 1040.0005
HIS 1050.0002
LYS 1060.0003
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0003
GLU 1100.0004
THR 1110.0004
ARG 1120.0004
LEU 1130.0001

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.