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LOGs for ID: 2602021513361103410

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602021513361103410.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602021513361103410.atom to be opened. Openam> File opened: 2602021513361103410.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 109 First residue number = 1 Last residue number = 113 Number of atoms found = 1670 Mean number per residue = 15.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.027437 +/- 6.462347 From: -17.866000 To: 14.370000 = -0.089500 +/- 9.690745 From: -27.345000 To: 20.300000 = 0.015476 +/- 6.669125 From: -19.387000 To: 15.689000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 9.3475 % Filled. Pdbmat> 1173346 non-zero elements. Pdbmat> 129274 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.82 +/- 54.99 Maximum number = 271 Minimum number = 26 Pdbmat> Matrix trace = 2.585480E+06 Pdbmat> Larger element = 938.336 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 109 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602021513361103410.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602021513361103410.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602021513361103410.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1670 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 109 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 11 atoms in block 3 Block first atom: 17 Blocpdb> 17 atoms in block 4 Block first atom: 28 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 45 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 69 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 83 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 97 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 116 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 135 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 154 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 171 Blocpdb> 10 atoms in block 13 Block first atom: 195 Blocpdb> 7 atoms in block 14 Block first atom: 205 Blocpdb> 22 atoms in block 15 Block first atom: 212 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 234 Blocpdb> 21 atoms in block 17 Block first atom: 256 Blocpdb> 7 atoms in block 18 Block first atom: 277 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 284 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 304 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 318 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 337 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 361 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 371 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 390 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 414 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 430 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 451 Blocpdb> 7 atoms in block 29 Block first atom: 468 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 475 Blocpdb> 11 atoms in block 31 Block first atom: 487 Blocpdb> 12 atoms in block 32 Block first atom: 498 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 510 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 526 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 547 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 561 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 577 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 594 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 611 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 628 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 644 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 668 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 685 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 701 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 716 Blocpdb> 7 atoms in block 46 Block first atom: 728 Blocpdb> 7 atoms in block 47 Block first atom: 735 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 742 Blocpdb> 10 atoms in block 49 Block first atom: 756 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 766 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 777 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 792 Blocpdb> 7 atoms in block 53 Block first atom: 802 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 809 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 828 Blocpdb> 17 atoms in block 56 Block first atom: 852 Blocpdb> 7 atoms in block 57 Block first atom: 869 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 876 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 888 Blocpdb> 19 atoms in block 60 Block first atom: 907 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 926 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 940 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 957 Blocpdb> 14 atoms in block 64 Block first atom: 973 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 987 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 994 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1009 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1023 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1039 Blocpdb> 7 atoms in block 70 Block first atom: 1056 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1063 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1082 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1098 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1115 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1129 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1144 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1160 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1176 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1191 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1210 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1229 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1248 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1270 Blocpdb> 7 atoms in block 84 Block first atom: 1281 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1288 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1302 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1324 Blocpdb> 10 atoms in block 88 Block first atom: 1340 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1350 Blocpdb> 11 atoms in block 90 Block first atom: 1369 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1380 Blocpdb> 14 atoms in block 92 Block first atom: 1394 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1408 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1422 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1441 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1456 Blocpdb> 13 atoms in block 97 Block first atom: 1471 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 1484 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1508 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1523 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1534 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1551 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1573 Blocpdb> 7 atoms in block 104 Block first atom: 1584 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 1591 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1598 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1613 Blocpdb> 24 atoms in block 108 Block first atom: 1627 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1650 Blocpdb> 109 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1173455 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5010 Prepmat> Matrix trace = 2585480.0000 Prepmat> Last element read: 5010 5010 707.0580 Prepmat> 5996 lines saved. Prepmat> 4491 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1670 RTB> Total mass = 1670.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1670 RTB> Number of blocks = 109 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 302491.3637 RTB> 52509 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 654 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52509 Diagstd> Projected matrix trace = 302491.3637 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 654 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 302491.3637 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.4824023 7.7890487 10.2825275 12.4427491 16.4165734 17.5989946 20.5234833 23.0773840 27.9797584 32.0807867 33.0386211 37.9428627 42.6283002 43.2940994 49.3524329 53.1890124 56.4616788 59.5123030 62.3247008 68.7003303 69.9344274 72.3841949 76.5257612 78.2409197 80.7848057 84.1355235 84.3796160 87.6571398 91.2428696 94.9394561 98.9650301 99.3923594 102.2959024 104.0413079 109.4561265 111.6948371 114.4979556 114.9872002 115.7348981 118.4196574 122.3130689 123.6256828 125.6771086 126.2335883 129.7436104 134.3743150 135.2999303 138.2406363 141.3423867 143.7721620 145.5602414 146.9445237 148.2580100 151.0261458 151.3506835 154.3623343 155.2852026 157.8954863 159.8966381 161.0735539 164.8064775 166.2914557 169.9096230 170.9285145 171.2197152 173.1443915 173.9126635 177.2452512 177.6866089 178.0602418 179.2743642 180.2371197 182.4103213 183.4997524 185.1022210 186.2913754 191.0134934 193.0631901 194.5878716 195.6208632 196.1912283 197.3136003 199.5703124 201.7942475 203.5179193 204.7495288 206.3619112 208.1265937 209.4571622 210.3306080 212.3208305 215.7151740 216.8540302 218.6402782 220.2999236 221.8393409 223.3867899 223.7657038 226.6695692 227.5778529 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034303 0.0034323 0.0034336 0.0034342 0.0034350 0.0034352 229.9062077 303.0661909 348.2131923 383.0482233 439.9836487 455.5533129 491.9498315 521.6612386 574.4037416 615.0604267 624.1748088 668.8986625 708.9968209 714.5121784 762.8682911 791.9654645 815.9662087 837.7195656 857.2853088 900.0666969 908.1148800 923.8833797 949.9464179 960.5329195 976.0231590 996.0588098 997.5026375 1016.6908805 1037.2769992 1058.0803524 1080.2795648 1082.6093668 1098.3086377 1107.6388543 1136.0967507 1147.6562594 1161.9679423 1164.4478145 1168.2275586 1181.6998501 1200.9687636 1207.3957196 1217.3721735 1220.0643691 1236.9104816 1258.7903704 1263.1184146 1276.7713900 1291.0156012 1302.0650510 1310.1368551 1316.3518345 1322.2219527 1334.5085173 1335.9415998 1349.1677423 1353.1947891 1364.5207299 1373.1404049 1378.1846254 1394.0630583 1400.3295317 1415.4817309 1419.7194738 1420.9283048 1428.8922954 1432.0589091 1445.7146584 1447.5135233 1449.0346134 1453.9664177 1457.8653015 1466.6280418 1471.0011817 1477.4102072 1482.1482817 1500.8154917 1508.8463593 1514.7925625 1518.8079642 1521.0205207 1525.3650481 1534.0631891 1542.5870145 1549.1611860 1553.8415691 1559.9477460 1566.6034135 1571.6031402 1574.8765593 1582.3100353 1594.9079694 1599.1125408 1605.6850578 1611.7677199 1617.3892917 1623.0205694 1624.3964889 1634.9026204 1638.1749404 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1670 Rtb_to_modes> Number of blocs = 109 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9786E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.482 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99996 1.00003 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00005 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00004 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00005 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602021513361103410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602021513361103410.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602021513361103410.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602021513361103410.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 109 First residue number = 1 Last residue number = 113 Number of atoms found = 1670 Mean number per residue = 15.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9786E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.482 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.7 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 196.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 210.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 226.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.6 Bfactors> 106 vectors, 5010 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.482000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.012 +/- 0.02 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.012 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602021513361103410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602021513361103410.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1477. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1482. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1501. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1509. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1515. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1519. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1521. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1525. 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Chkmod> That is: 1670 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 102 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9591 0.0034 0.6839 0.0034 0.7787 0.0034 0.8843 0.0034 0.9769 0.0034 0.9585 229.8860 0.0509 303.0522 0.2579 348.1554 0.2139 382.9895 0.2093 440.0107 0.0771 455.5468 0.1799 491.8870 0.0945 521.6684 0.1526 574.3816 0.3195 615.0265 0.4462 624.1610 0.2906 668.8447 0.3635 708.9805 0.1143 714.4477 0.4490 762.8167 0.0564 791.9388 0.3481 815.9191 0.3066 837.6674 0.2751 857.2162 0.4093 900.0259 0.1199 908.0472 0.2899 923.8169 0.2593 949.9319 0.4125 960.4860 0.5260 975.9522 0.3383 996.0425 0.2879 997.4621 0.2012 1016.6638 0.3090 1037.2162 0.2362 1058.0380 0.4833 1080.2603 0.5333 1082.5500 0.2159 1098.2835 0.3693 1107.3714 0.3808 1136.2756 0.4377 1147.6335 0.3553 1161.9284 0.3982 1164.4626 0.3454 1168.0013 0.3032 1181.5510 0.3399 1200.8530 0.2753 1207.2185 0.4269 1217.4308 0.3633 1219.8497 0.4094 1236.6495 0.5096 1258.8566 0.2675 1263.0645 0.2470 1276.5289 0.2043 1290.7666 0.3351 1302.1352 0.2861 1310.2595 0.5393 1316.0959 0.3387 1322.3524 0.1708 1334.3357 0.2614 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