CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  SIGNALING PROTEIN/PEPTIDE BINDING PROTEI04-NOV-09 2KQF  ***

<R2> analysis for 2602021513391103432

---  normal mode 31  ---

This page gives a visualization of the normalized mean square displacement <R2> of all C-alpha atoms in the protein that are associated to this mode (black bars). The three components of the corresponding eigenvector are shown on the left (colored bars). Here is the raw data for <R2> and for the eigenvector (shift-click on the links for download).

XYZresidue<R2><R2>max = 0.1336
GLY 10.0031
GLY 20.0021
SER 30.0030
MET 40.0040
ARG 50.0013
PRO 60.0017
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0005
LYS 160.0004
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0001
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0006
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0004
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0006
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0004
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0006
LYS 860.0005
VAL 870.0003
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0005
PRO 930.0005
LEU 940.0006
GLU 950.0009
ASN 960.0013
SER 1010.0004
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0003
HIS 1050.0002
LYS 1060.0004
SER 1070.0006
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0006
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.1336
GLY 20.0920
SER 30.0625
MET 40.0827
ARG 50.0200
PRO 60.0431
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0004
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0009
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0009
PHE 190.0003
THR 200.0003
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0002
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0004
ASP 320.0003
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0003
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0008
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0004
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0003
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0006
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0005
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0006
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0004
PRO 930.0004
LEU 940.0007
GLU 950.0010
ASN 960.0015
SER 1010.0005
TRP 1020.0004
GLU 1030.0003
SER 1040.0001
HIS 1050.0002
LYS 1060.0003
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.0750
GLY 20.0495
SER 30.0263
MET 40.0383
ARG 50.0083
PRO 60.0235
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0005
ALA 130.0008
GLY 140.0009
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0003
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0002
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0003
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0004
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0003
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0005
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0006
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0005
PRO 930.0013
LEU 940.0020
GLU 950.0024
ASN 960.0032
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0003
SER 1040.0001
HIS 1050.0002
LYS 1060.0003
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.0133
GLY 20.0098
SER 30.0055
MET 40.0067
ARG 50.0017
PRO 60.0041
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0003
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0008
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0004
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0005
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0006
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0006
LYS 860.0005
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0003
PRO 930.0004
LEU 940.0006
GLU 950.0006
ASN 960.0010
SER 1010.0006
TRP 1020.0004
GLU 1030.0003
SER 1040.0001
HIS 1050.0002
LYS 1060.0004
SER 1070.0006
GLY 1080.0006
GLY 1090.0006
GLU 1100.0006
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0005
GLY 10.0657
GLY 20.0443
SER 30.0237
MET 40.0347
ARG 50.0084
PRO 60.0196
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0002
ASP 300.0003
SER 310.0003
ASP 320.0003
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0003
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0003
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0004
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0004
PRO 930.0004
LEU 940.0005
GLU 950.0007
ASN 960.0011
SER 1010.0007
TRP 1020.0004
GLU 1030.0004
SER 1040.0003
HIS 1050.0003
LYS 1060.0006
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.0089
GLY 20.0061
SER 30.0030
MET 40.0052
ARG 50.0013
PRO 60.0025
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0007
GLY 140.0008
LYS 150.0005
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0002
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0003
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0003
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0004
VAL 760.0004
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0004
PRO 930.0005
LEU 940.0005
GLU 950.0005
ASN 960.0009
SER 1010.0007
TRP 1020.0005
GLU 1030.0004
SER 1040.0003
HIS 1050.0002
LYS 1060.0005
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0004
LEU 1130.0004
GLY 10.0077
GLY 20.0054
SER 30.0028
MET 40.0031
ARG 50.0009
PRO 60.0020
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0002
ASP 300.0003
SER 310.0003
ASP 320.0003
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0006
GLY 460.0008
GLY 470.0007
PRO 480.0003
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0005
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0009
THR 920.0006
PRO 930.0007
LEU 940.0013
GLU 950.0021
ASN 960.0030
SER 1010.0007
TRP 1020.0005
GLU 1030.0004
SER 1040.0002
HIS 1050.0002
LYS 1060.0005
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.0022
GLY 20.0018
SER 30.0015
MET 40.0016
ARG 50.0008
PRO 60.0011
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0005
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0004
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0008
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0004
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0004
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0006
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0005
PRO 930.0006
LEU 940.0010
GLU 950.0015
ASN 960.0021
SER 1010.0004
TRP 1020.0003
GLU 1030.0002
SER 1040.0001
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004
GLY 10.0059
GLY 20.0043
SER 30.0040
MET 40.0057
ARG 50.0017
PRO 60.0021
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0004
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0006
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0003
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0002
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0003
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0003
ASP 300.0004
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0003
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0008
ASP 450.0007
GLY 460.0010
GLY 470.0008
PRO 480.0004
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0004
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0005
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0003
PRO 930.0005
LEU 940.0007
GLU 950.0007
ASN 960.0011
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0004
SER 1040.0003
HIS 1050.0003
LYS 1060.0005
SER 1070.0005
GLY 1080.0005
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0005
GLY 10.0039
GLY 20.0024
SER 30.0023
MET 40.0035
ARG 50.0011
PRO 60.0013
PRO 70.0003
ILE 80.0003
ILE 90.0003
ILE 100.0003
HIS 110.0004
ARG 120.0004
ALA 130.0008
GLY 140.0008
LYS 150.0005
LYS 160.0003
TYR 170.0004
GLY 180.0008
PHE 190.0003
THR 200.0002
LEU 210.0002
ARG 220.0002
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0003
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0001
GLY 290.0001
ASP 300.0002
SER 310.0004
ASP 320.0004
VAL 330.0003
TYR 340.0003
THR 350.0003
VAL 360.0004
HIS 370.0001
HIS 380.0001
MET 390.0002
VAL 400.0002
TRP 410.0002
HIS 420.0003
VAL 430.0007
GLU 440.0007
ASP 450.0007
GLY 460.0009
GLY 470.0007
PRO 480.0003
ALA 490.0000
SER 500.0000
GLU 510.0003
ALA 520.0003
GLY 530.0004
LEU 540.0003
ARG 550.0004
GLN 560.0005
GLY 570.0005
ASP 580.0004
LEU 590.0003
ILE 600.0003
THR 610.0006
HIS 620.0004
VAL 630.0003
ASN 640.0005
GLY 650.0006
GLU 660.0006
PRO 670.0003
VAL 680.0003
HIS 690.0005
GLY 700.0004
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0004
THR 740.0003
GLU 750.0005
VAL 760.0004
VAL 770.0003
GLU 780.0004
LEU 790.0007
ILE 800.0005
LEU 810.0005
LYS 820.0006
SER 830.0006
GLY 840.0005
ASN 850.0007
LYS 860.0006
VAL 870.0004
ALA 880.0003
ILE 890.0002
SER 900.0002
THR 910.0007
THR 920.0004
PRO 930.0010
LEU 940.0013
GLU 950.0014
ASN 960.0019
SER 1010.0006
TRP 1020.0004
GLU 1030.0002
SER 1040.0001
HIS 1050.0002
LYS 1060.0004
SER 1070.0004
GLY 1080.0004
GLY 1090.0005
GLU 1100.0005
THR 1110.0005
ARG 1120.0005
LEU 1130.0004

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.