CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  SIGNALING PROTEIN/PEPTIDE BINDING PROTEI04-NOV-09 2KQF  ***

<R2> analysis for 2602021513391103432

---  normal mode 56  ---

This page gives a visualization of the normalized mean square displacement <R2> of all C-alpha atoms in the protein that are associated to this mode (black bars). The three components of the corresponding eigenvector are shown on the left (colored bars). Here is the raw data for <R2> and for the eigenvector (shift-click on the links for download).

XYZresidue<R2><R2>max = 0.1178
GLY 10.0049
GLY 20.0035
SER 30.0022
MET 40.0012
ARG 50.0009
PRO 60.0012
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0001
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0001
ASP 320.0000
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0003
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0002
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0004
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0002
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0002
THR 920.0003
PRO 930.0004
LEU 940.0005
GLU 950.0006
ASN 960.0008
SER 1010.0002
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0003
HIS 1050.0004
LYS 1060.0004
SER 1070.0002
GLY 1080.0002
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0001
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0019
GLY 20.0018
SER 30.0025
MET 40.0021
ARG 50.0006
PRO 60.0015
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0001
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0001
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0002
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0003
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0004
PRO 480.0003
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0002
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0003
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0005
THR 920.0004
PRO 930.0004
LEU 940.0009
GLU 950.0014
ASN 960.0019
SER 1010.0002
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0002
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0002
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0030
GLY 20.0023
SER 30.0015
MET 40.0010
ARG 50.0008
PRO 60.0009
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0001
GLY 180.0002
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0004
ASP 300.0005
SER 310.0001
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0002
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0003
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0004
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0004
THR 920.0004
PRO 930.0003
LEU 940.0008
GLU 950.0012
ASN 960.0018
SER 1010.0003
TRP 1020.0003
GLU 1030.0003
SER 1040.0003
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0002
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0001
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0194
GLY 20.0171
SER 30.0168
MET 40.0130
ARG 50.0059
PRO 60.0088
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0001
ASP 320.0000
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0002
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0003
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0003
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0004
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0003
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0005
GLU 950.0007
ASN 960.0010
SER 1010.0002
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0002
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0002
GLY 1080.0002
GLY 1090.0002
GLU 1100.0002
THR 1110.0002
ARG 1120.0002
LEU 1130.0000
GLY 10.0028
GLY 20.0020
SER 30.0010
MET 40.0008
ARG 50.0006
PRO 60.0007
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0002
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0002
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0002
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0004
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0005
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0002
THR 920.0003
PRO 930.0004
LEU 940.0006
GLU 950.0007
ASN 960.0008
SER 1010.0009
TRP 1020.0005
GLU 1030.0003
SER 1040.0005
HIS 1050.0005
LYS 1060.0011
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0001
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0162
GLY 20.0152
SER 30.0155
MET 40.0129
ARG 50.0059
PRO 60.0087
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0001
GLY 180.0002
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0001
ASP 320.0000
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0002
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0002
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0003
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0002
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0005
LYS 860.0004
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0003
THR 920.0002
PRO 930.0002
LEU 940.0004
GLU 950.0005
ASN 960.0007
SER 1010.0004
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0002
HIS 1050.0004
LYS 1060.0005
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0002
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0034
GLY 20.0024
SER 30.0013
MET 40.0008
ARG 50.0006
PRO 60.0007
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0001
GLY 180.0002
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0001
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0002
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0001
ARG 550.0003
GLN 560.0002
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0004
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0005
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0008
THR 920.0010
PRO 930.0006
LEU 940.0022
GLU 950.0028
ASN 960.0043
SER 1010.0005
TRP 1020.0003
GLU 1030.0001
SER 1040.0001
HIS 1050.0003
LYS 1060.0005
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0002
THR 1110.0002
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.1178
GLY 20.0940
SER 30.0998
MET 40.0802
ARG 50.0342
PRO 60.0593
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0002
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0002
SER 310.0001
ASP 320.0000
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0001
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0003
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0004
THR 920.0003
PRO 930.0001
LEU 940.0004
GLU 950.0006
ASN 960.0009
SER 1010.0002
TRP 1020.0002
GLU 1030.0002
SER 1040.0003
HIS 1050.0003
LYS 1060.0003
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0002
THR 1110.0002
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001
GLY 10.0011
GLY 20.0011
SER 30.0012
MET 40.0008
ARG 50.0002
PRO 60.0007
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0001
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0001
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0001
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0003
ASP 300.0003
SER 310.0002
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0003
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0003
ALA 490.0002
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0003
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0003
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0002
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0004
THR 920.0003
PRO 930.0003
LEU 940.0006
GLU 950.0009
ASN 960.0012
SER 1010.0001
TRP 1020.0001
GLU 1030.0002
SER 1040.0003
HIS 1050.0004
LYS 1060.0006
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0002
THR 1110.0002
ARG 1120.0003
LEU 1130.0001
GLY 10.0775
GLY 20.0705
SER 30.0684
MET 40.0519
ARG 50.0237
PRO 60.0380
PRO 70.0001
ILE 80.0001
ILE 90.0001
ILE 100.0001
HIS 110.0002
ARG 120.0002
ALA 130.0002
GLY 140.0003
LYS 150.0003
LYS 160.0002
TYR 170.0001
GLY 180.0003
PHE 190.0001
THR 200.0001
LEU 210.0000
ARG 220.0000
ALA 230.0001
ILE 240.0001
ARG 250.0001
VAL 260.0002
TYR 270.0002
MET 280.0002
GLY 290.0002
ASP 300.0001
SER 310.0001
ASP 320.0001
VAL 330.0001
TYR 340.0002
THR 350.0002
VAL 360.0003
HIS 370.0002
HIS 380.0001
MET 390.0001
VAL 400.0001
TRP 410.0001
HIS 420.0002
VAL 430.0001
GLU 440.0002
ASP 450.0003
GLY 460.0004
GLY 470.0003
PRO 480.0002
ALA 490.0002
SER 500.0001
GLU 510.0001
ALA 520.0002
GLY 530.0002
LEU 540.0002
ARG 550.0003
GLN 560.0002
GLY 570.0002
ASP 580.0002
LEU 590.0002
ILE 600.0002
THR 610.0002
HIS 620.0002
VAL 630.0002
ASN 640.0003
GLY 650.0003
GLU 660.0004
PRO 670.0004
VAL 680.0003
HIS 690.0003
GLY 700.0003
LEU 710.0003
VAL 720.0003
HIS 730.0003
THR 740.0002
GLU 750.0002
VAL 760.0002
VAL 770.0002
GLU 780.0001
LEU 790.0001
ILE 800.0002
LEU 810.0003
LYS 820.0004
SER 830.0004
GLY 840.0006
ASN 850.0004
LYS 860.0003
VAL 870.0002
ALA 880.0001
ILE 890.0001
SER 900.0002
THR 910.0002
THR 920.0004
PRO 930.0006
LEU 940.0009
GLU 950.0011
ASN 960.0014
SER 1010.0004
TRP 1020.0003
GLU 1030.0006
SER 1040.0005
HIS 1050.0002
LYS 1060.0006
SER 1070.0001
GLY 1080.0001
GLY 1090.0001
GLU 1100.0001
THR 1110.0001
ARG 1120.0002
LEU 1130.0001

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.