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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* SIGNALING PROTEIN/PEPTIDE BINDING PROTEI04-NOV-09 XXXX *

LOGs for ID: 2602021514001103477

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602021514001103477.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602021514001103477.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602021514001103477.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    109
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    113
            Number of atoms found    =   1670
            Mean number per residue  =     15.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.027437 +/-     6.462347 From:   -17.866000 To:    14.370000
 =    -0.089500 +/-     9.690745 From:   -27.345000 To:    20.300000
 =     0.015476 +/-     6.669125 From:   -19.387000 To:    15.689000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   9.3475 % Filled.
 Pdbmat>      1173346  non-zero elements.
 Pdbmat>       129274 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    154.82 +/-     54.99
         Maximum number =    271
         Minimum number =     26

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.585480E+06
 Pdbmat> Larger element =  938.336    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
109 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602021514001103477.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602021514001103477.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602021514001103477.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1670 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   109 residues.
 Blocpdb>     9 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     7 atoms in block      2
 Block first atom:     10
 Blocpdb>    11 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    17 atoms in block      4
 Block first atom:     28
 Blocpdb>    24 atoms in block      5
 Block first atom:     45
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     69
 Blocpdb>    14 atoms in block      7
 Block first atom:     83
 Blocpdb>    19 atoms in block      8
 Block first atom:     97
 Blocpdb>    19 atoms in block      9
 Block first atom:    116
 Blocpdb>    19 atoms in block     10
 Block first atom:    135
 Blocpdb>    17 atoms in block     11
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    24 atoms in block     12
 Block first atom:    171
 Blocpdb>    10 atoms in block     13
 Block first atom:    195
 Blocpdb>     7 atoms in block     14
 Block first atom:    205
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    22 atoms in block     16
 Block first atom:    234
 Blocpdb>    21 atoms in block     17
 Block first atom:    256
 Blocpdb>     7 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    20 atoms in block     19
 Block first atom:    284
 Blocpdb>    14 atoms in block     20
 Block first atom:    304
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    24 atoms in block     22
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    10 atoms in block     23
 Block first atom:    361
 Blocpdb>    19 atoms in block     24
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    390
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    21 atoms in block     27
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    17 atoms in block     28
 Block first atom:    451
 Blocpdb>     7 atoms in block     29
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    12 atoms in block     30
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    11 atoms in block     31
 Block first atom:    487
 Blocpdb>    12 atoms in block     32
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    510
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    526
 Blocpdb>    14 atoms in block     35
 Block first atom:    547
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    561
 Blocpdb>    17 atoms in block     37
 Block first atom:    577
 Blocpdb>    17 atoms in block     38
 Block first atom:    594
 Blocpdb>    17 atoms in block     39
 Block first atom:    611
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    628
 Blocpdb>    24 atoms in block     41
 Block first atom:    644
 Blocpdb>    17 atoms in block     42
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    685
 Blocpdb>    15 atoms in block     44
 Block first atom:    701
 Blocpdb>    12 atoms in block     45
 Block first atom:    716
 Blocpdb>     7 atoms in block     46
 Block first atom:    728
 Blocpdb>     7 atoms in block     47
 Block first atom:    735
 Blocpdb>    14 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    10 atoms in block     49
 Block first atom:    756
 Blocpdb>    11 atoms in block     50
 Block first atom:    766
 Blocpdb>    15 atoms in block     51
 Block first atom:    777
 Blocpdb>    10 atoms in block     52
 Block first atom:    792
 Blocpdb>     7 atoms in block     53
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    19 atoms in block     54
 Block first atom:    809
 Blocpdb>    24 atoms in block     55
 Block first atom:    828
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    852
 Blocpdb>     7 atoms in block     57
 Block first atom:    869
 Blocpdb>    12 atoms in block     58
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    19 atoms in block     59
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    19 atoms in block     60
 Block first atom:    907
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    926
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    940
 Blocpdb>    16 atoms in block     63
 Block first atom:    957
 Blocpdb>    14 atoms in block     64
 Block first atom:    973
 Blocpdb>     7 atoms in block     65
 Block first atom:    987
 Blocpdb>    15 atoms in block     66
 Block first atom:    994
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:   1009
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1023
 Blocpdb>    17 atoms in block     69
 Block first atom:   1039
 Blocpdb>     7 atoms in block     70
 Block first atom:   1056
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     72
 Block first atom:   1082
 Blocpdb>    17 atoms in block     73
 Block first atom:   1098
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1115
 Blocpdb>    15 atoms in block     75
 Block first atom:   1129
 Blocpdb>    16 atoms in block     76
 Block first atom:   1144
 Blocpdb>    16 atoms in block     77
 Block first atom:   1160
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1176
 Blocpdb>    19 atoms in block     79
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    19 atoms in block     80
 Block first atom:   1210
 Blocpdb>    19 atoms in block     81
 Block first atom:   1229
 Blocpdb>    22 atoms in block     82
 Block first atom:   1248
 Blocpdb>    11 atoms in block     83
 Block first atom:   1270
 Blocpdb>     7 atoms in block     84
 Block first atom:   1281
 Blocpdb>    14 atoms in block     85
 Block first atom:   1288
 Blocpdb>    22 atoms in block     86
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1324
 Blocpdb>    10 atoms in block     88
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    19 atoms in block     89
 Block first atom:   1350
 Blocpdb>    11 atoms in block     90
 Block first atom:   1369
 Blocpdb>    14 atoms in block     91
 Block first atom:   1380
 Blocpdb>    14 atoms in block     92
 Block first atom:   1394
 Blocpdb>    14 atoms in block     93
 Block first atom:   1408
 Blocpdb>    19 atoms in block     94
 Block first atom:   1422
 Blocpdb>    15 atoms in block     95
 Block first atom:   1441
 Blocpdb>    15 atoms in block     96
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    13 atoms in block     97
 Block first atom:   1471
 Blocpdb>    24 atoms in block     98
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1508
 Blocpdb>    11 atoms in block    100
 Block first atom:   1523
 Blocpdb>    17 atoms in block    101
 Block first atom:   1534
 Blocpdb>    22 atoms in block    102
 Block first atom:   1551
 Blocpdb>    11 atoms in block    103
 Block first atom:   1573
 Blocpdb>     7 atoms in block    104
 Block first atom:   1584
 Blocpdb>     7 atoms in block    105
 Block first atom:   1591
 Blocpdb>    15 atoms in block    106
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    14 atoms in block    107
 Block first atom:   1613
 Blocpdb>    24 atoms in block    108
 Block first atom:   1627
 Blocpdb>    20 atoms in block    109
 Block first atom:   1650

 Blocpdb>   109 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1173455 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5010

 Prepmat> Matrix trace    =    2585480.0000
 Prepmat> Last element read:    5010   5010       707.0580
 Prepmat>         5996 lines saved.
 Prepmat>         4491 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1670
 RTB> Total mass =        1670.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1670
 RTB> Number of blocks =   109
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  302491.3637
 RTB>     52509 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      654
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    52509
 Diagstd> Projected matrix trace =  302491.3637

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    654 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 302491.3637
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      4.4824023      7.7890487     10.2825275     12.4427491
     16.4165734     17.5989946     20.5234833     23.0773840     27.9797584
     32.0807867     33.0386211     37.9428627     42.6283002     43.2940994
     49.3524329     53.1890124     56.4616788     59.5123030     62.3247008
     68.7003303     69.9344274     72.3841949     76.5257612     78.2409197
     80.7848057     84.1355235     84.3796160     87.6571398     91.2428696
     94.9394561     98.9650301     99.3923594    102.2959024    104.0413079
    109.4561265    111.6948371    114.4979556    114.9872002    115.7348981
    118.4196574    122.3130689    123.6256828    125.6771086    126.2335883
    129.7436104    134.3743150    135.2999303    138.2406363    141.3423867
    143.7721620    145.5602414    146.9445237    148.2580100    151.0261458
    151.3506835    154.3623343    155.2852026    157.8954863    159.8966381
    161.0735539    164.8064775    166.2914557    169.9096230    170.9285145
    171.2197152    173.1443915    173.9126635    177.2452512    177.6866089
    178.0602418    179.2743642    180.2371197    182.4103213    183.4997524
    185.1022210    186.2913754    191.0134934    193.0631901    194.5878716
    195.6208632    196.1912283    197.3136003    199.5703124    201.7942475
    203.5179193    204.7495288    206.3619112    208.1265937    209.4571622
    210.3306080    212.3208305    215.7151740    216.8540302    218.6402782
    220.2999236    221.8393409    223.3867899    223.7657038    226.6695692
    227.5778529

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034313      0.0034317      0.0034322      0.0034335      0.0034340
      0.0034345    229.9062077    303.0661909    348.2131923    383.0482233
    439.9836487    455.5533129    491.9498315    521.6612386    574.4037416
    615.0604267    624.1748088    668.8986625    708.9968209    714.5121784
    762.8682911    791.9654645    815.9662087    837.7195656    857.2853088
    900.0666969    908.1148800    923.8833797    949.9464179    960.5329195
    976.0231590    996.0588098    997.5026375   1016.6908805   1037.2769992
   1058.0803524   1080.2795648   1082.6093668   1098.3086377   1107.6388543
   1136.0967507   1147.6562594   1161.9679423   1164.4478145   1168.2275586
   1181.6998501   1200.9687636   1207.3957196   1217.3721735   1220.0643691
   1236.9104816   1258.7903704   1263.1184146   1276.7713900   1291.0156012
   1302.0650510   1310.1368551   1316.3518345   1322.2219527   1334.5085173
   1335.9415998   1349.1677423   1353.1947891   1364.5207299   1373.1404049
   1378.1846254   1394.0630583   1400.3295317   1415.4817309   1419.7194738
   1420.9283048   1428.8922954   1432.0589091   1445.7146584   1447.5135233
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   1477.4102072   1482.1482817   1500.8154917   1508.8463593   1514.7925625
   1518.8079642   1521.0205207   1525.3650481   1534.0631891   1542.5870145
   1549.1611860   1553.8415691   1559.9477460   1566.6034135   1571.6031402
   1574.8765593   1582.3100353   1594.9079694   1599.1125408   1605.6850578
   1611.7677199   1617.3892917   1623.0205694   1624.3964889   1634.9026204
   1638.1749404

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1670
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    109

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9848E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.482    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.789    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.98    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.04    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.94    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.63    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.29    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.35    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.93    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.38    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.24    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.66    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.94    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.97    

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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.5    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   115.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   125.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   129.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   134.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.3    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   138.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   145.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   146.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   148.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   151.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   151.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   154.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   155.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   157.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   159.9    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   161.1    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   166.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   169.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   170.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   171.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   173.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   173.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   177.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   177.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   178.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   179.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   180.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   182.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   186.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   191.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   193.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   194.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   195.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   196.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   197.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   199.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   201.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   203.5    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   204.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   206.4    

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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   210.3    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   212.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   215.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   216.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   218.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   220.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   221.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   223.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   223.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   226.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   227.6    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    654 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995
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 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    30060 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998
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 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00003 1.00005 0.99998 1.00001 0.99997
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602021514001103477.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602021514001103477.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602021514001103477.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602021514001103477.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    109
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    113
            Number of atoms found    =   1670
            Mean number per residue  =     15.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9848E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.482    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.789    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   115.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   115.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   125.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   129.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   134.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   145.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   146.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   148.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   151.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   151.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   154.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   155.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   157.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   159.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   161.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   166.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   169.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   170.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   171.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   173.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   173.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   177.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   177.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   178.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   179.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   180.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   182.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   185.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   186.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   191.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   193.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   194.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   195.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   196.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   197.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   199.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   201.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   203.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   204.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   206.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   208.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   209.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   210.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   212.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   215.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   216.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   218.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   220.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   221.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   223.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   223.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   226.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   227.6    

 Bfactors>  106 vectors,   5010 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     4.482000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !

 Bfactors> =      0.012 +/-   0.02
 Bfactors> =      0.000 +/-   0.00
 Bfactors> Shiftng-fct=     -0.012
 Bfactors> Scaling-fct=      0.000

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602021514001103477.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602021514001103477.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4312E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4315E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4320E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   229.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   303.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   348.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   383.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   440.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   455.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   491.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   521.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   574.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   615.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   709.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   714.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   815.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   900.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   908.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   923.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   949.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   960.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   976.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   996.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   997.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1017.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1037.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1058.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1080.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1083.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1098.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1107.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1136.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1148.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1162.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1164.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1168.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1182.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1201.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1207.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1217.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1220.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1237.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1259.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1263.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1277.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1291.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1302.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1310.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1316.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1322.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1334.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1336.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1349.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1353.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1364.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1373.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1378.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1394.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1415.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1420.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1421.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1429.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1432.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1445.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1448.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1449.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1454.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1458.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1467.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1471.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1477.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1482.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1501.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1509.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1515.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1519.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1521.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1525.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1534.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1543.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1549.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1554.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1560.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1566.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1572.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1575.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1582.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1595.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1599.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1605.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1612.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1617.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1623.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1624.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1635.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1638.    

 Chkmod>  106 vectors,   5010 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1670 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     7 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   102 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.6882
      0.0034      0.7381
      0.0034      0.9438
      0.0034      0.7985
      0.0034      0.8309
      0.0034      0.9390
    229.8860      0.0509
    303.0522      0.2579
    348.1554      0.2139
    382.9895      0.2093
    440.0107      0.0771
    455.5468      0.1799
    491.8870      0.0945
    521.6684      0.1526
    574.3816      0.3195
    615.0265      0.4462
    624.1610      0.2906
    668.8447      0.3635
    708.9805      0.1143
    714.4477      0.4490
    762.8167      0.0564
    791.9388      0.3481
    815.9191      0.3066
    837.6674      0.2751
    857.2162      0.4093
    900.0259      0.1199
    908.0472      0.2899
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    960.4860      0.5260
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    997.4621      0.2012
   1016.6638      0.3090
   1037.2162      0.2362
   1058.0380      0.4833
   1080.2603      0.5333
   1082.5500      0.2159
   1098.2835      0.3693
   1107.3714      0.3808
   1136.2756      0.4377
   1147.6335      0.3553
   1161.9284      0.3982
   1164.4626      0.3454
   1168.0013      0.3032
   1181.5510      0.3399
   1200.8530      0.2753
   1207.2185      0.4269
   1217.4308      0.3633
   1219.8497      0.4094
   1236.6495      0.5096
   1258.8566      0.2675
   1263.0645      0.2470
   1276.5289      0.2043
   1290.7666      0.3351
   1302.1352      0.2861
   1310.2595      0.5393
   1316.0959      0.3387
   1322.3524      0.1708
   1334.3357      0.2614
   1336.1019      0.1726
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   1353.2012      0.2999
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   1373.0959      0.1535
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   1415.3809      0.3053
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   1518.6618      0.4113
   1520.9892      0.3641
   1525.2470      0.2818
   1534.1114      0.4002
   1542.5428      0.0812
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   1574.6944      0.1661
   1582.1645      0.3933
   1594.7834      0.2243
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   1605.4682      0.4506
   1611.6988      0.4303
   1617.1764      0.2601
   1622.9989      0.3143
   1624.4512      0.3792
   1634.9422      0.2849
   1638.1843      0.2826
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021514001103477 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021514001103477.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021514001103477.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021514001103477.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602021514001103477 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2602021514001103477.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2602021514001103477.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
2602021514001103477.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
2602021514001103477.eigenfacs
2602021514001103477.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602021514001103477.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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2602021514001103477.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021514001103477.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
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2602021514001103477.atom
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2602021514001103477.atom
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2602021514001103477.9.pdb, 1 models will be skipped
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getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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2602021514001103477.atom
making animated gifs
11 models are in 2602021514001103477.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021514001103477.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602021514001103477.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
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2602021514001103477.atom
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2602021514001103477.atom
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2602021514001103477.8.pdb
2602021514001103477.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m4.147s
user	0m4.091s
sys	0m0.046s
rm: cannot remove '2602021514001103477.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
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* SIGNALING PROTEIN/PEPTIDE BINDING PROTEI04-NOV-09 XXXX *
