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* IMMUNE SYSTEM 03-JUL-23 8JYQ *

LOGs for ID: 2602022316101172576

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602022316101172576.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602022316101172576.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602022316101172576.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    649
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    618
            Number of atoms found    =   5399
            Mean number per residue  =      8.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -19.079552 +/-    23.792024 From:   -67.920000 To:    31.302000
 =    -6.116820 +/-    13.469688 From:   -40.392000 To:    28.717000
 =   -19.833189 +/-    13.640020 From:   -58.938000 To:     4.955000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.5543 % Filled.
 Pdbmat>      2038892  non-zero elements.
 Pdbmat>       222977 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.60 +/-     22.82
         Maximum number =    133
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   = 4.459540E+06
 Pdbmat> Larger element =  506.473    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
649 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602022316101172576.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602022316101172576.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602022316101172576.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  5399 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   649 residues.
 Blocpdb>    31 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    28 atoms in block      2
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    27 atoms in block      3
 Block first atom:     60
 Blocpdb>    31 atoms in block      4
 Block first atom:     87
 Blocpdb>    29 atoms in block      5
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    30 atoms in block      6
 Block first atom:    147
 Blocpdb>    27 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    39 atoms in block      8
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    243
 Blocpdb>    35 atoms in block     10
 Block first atom:    274
 Blocpdb>    23 atoms in block     11
 Block first atom:    309
 Blocpdb>    39 atoms in block     12
 Block first atom:    332
 Blocpdb>    34 atoms in block     13
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    38 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    40 atoms in block     15
 Block first atom:    443
 Blocpdb>    30 atoms in block     16
 Block first atom:    483
 Blocpdb>    32 atoms in block     17
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    31 atoms in block     18
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    32 atoms in block     19
 Block first atom:    576
 Blocpdb>    35 atoms in block     20
 Block first atom:    608
 Blocpdb>    52 atoms in block     21
 Block first atom:    643
 Blocpdb>    25 atoms in block     22
 Block first atom:    695
 Blocpdb>    37 atoms in block     23
 Block first atom:    720
 Blocpdb>    34 atoms in block     24
 Block first atom:    757
 Blocpdb>    64 atoms in block     25
 Block first atom:    791
 Blocpdb>    33 atoms in block     26
 Block first atom:    855
 Blocpdb>    30 atoms in block     27
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    27 atoms in block     28
 Block first atom:    918
 Blocpdb>    24 atoms in block     29
 Block first atom:    945
 Blocpdb>    40 atoms in block     30
 Block first atom:    969
 Blocpdb>    36 atoms in block     31
 Block first atom:   1009
 Blocpdb>    32 atoms in block     32
 Block first atom:   1045
 Blocpdb>    37 atoms in block     33
 Block first atom:   1077
 Blocpdb>    29 atoms in block     34
 Block first atom:   1114
 Blocpdb>    32 atoms in block     35
 Block first atom:   1143
 Blocpdb>    35 atoms in block     36
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    37 atoms in block     37
 Block first atom:   1210
 Blocpdb>    36 atoms in block     38
 Block first atom:   1247
 Blocpdb>    36 atoms in block     39
 Block first atom:   1283
 Blocpdb>    29 atoms in block     40
 Block first atom:   1319
 Blocpdb>     8 atoms in block     41
 Block first atom:   1348
 Blocpdb>    34 atoms in block     42
 Block first atom:   1356
 Blocpdb>    30 atoms in block     43
 Block first atom:   1390
 Blocpdb>    26 atoms in block     44
 Block first atom:   1420
 Blocpdb>    26 atoms in block     45
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    29 atoms in block     46
 Block first atom:   1472
 Blocpdb>    27 atoms in block     47
 Block first atom:   1501
 Blocpdb>    31 atoms in block     48
 Block first atom:   1528
 Blocpdb>    64 atoms in block     49
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    39 atoms in block     50
 Block first atom:   1623
 Blocpdb>    39 atoms in block     51
 Block first atom:   1662
 Blocpdb>    36 atoms in block     52
 Block first atom:   1701
 Blocpdb>    32 atoms in block     53
 Block first atom:   1737
 Blocpdb>    30 atoms in block     54
 Block first atom:   1769
 Blocpdb>    31 atoms in block     55
 Block first atom:   1799
 Blocpdb>    24 atoms in block     56
 Block first atom:   1830
 Blocpdb>    33 atoms in block     57
 Block first atom:   1854
 Blocpdb>    20 atoms in block     58
 Block first atom:   1887
 Blocpdb>    30 atoms in block     59
 Block first atom:   1907
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1937
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1967
 Blocpdb>    32 atoms in block     62
 Block first atom:   2000
 Blocpdb>    36 atoms in block     63
 Block first atom:   2032
 Blocpdb>    30 atoms in block     64
 Block first atom:   2068
 Blocpdb>    34 atoms in block     65
 Block first atom:   2098
 Blocpdb>    30 atoms in block     66
 Block first atom:   2132
 Blocpdb>    25 atoms in block     67
 Block first atom:   2162
 Blocpdb>    34 atoms in block     68
 Block first atom:   2187
 Blocpdb>    37 atoms in block     69
 Block first atom:   2221
 Blocpdb>    34 atoms in block     70
 Block first atom:   2258
 Blocpdb>    32 atoms in block     71
 Block first atom:   2292
 Blocpdb>    31 atoms in block     72
 Block first atom:   2324
 Blocpdb>    35 atoms in block     73
 Block first atom:   2355
 Blocpdb>    43 atoms in block     74
 Block first atom:   2390
 Blocpdb>    41 atoms in block     75
 Block first atom:   2433
 Blocpdb>    35 atoms in block     76
 Block first atom:   2474
 Blocpdb>    32 atoms in block     77
 Block first atom:   2509
 Blocpdb>    30 atoms in block     78
 Block first atom:   2541
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   2571
 Blocpdb>    37 atoms in block     80
 Block first atom:   2585
 Blocpdb>    36 atoms in block     81
 Block first atom:   2622
 Blocpdb>    31 atoms in block     82
 Block first atom:   2658
 Blocpdb>    28 atoms in block     83
 Block first atom:   2689
 Blocpdb>    27 atoms in block     84
 Block first atom:   2717
 Blocpdb>    31 atoms in block     85
 Block first atom:   2744
 Blocpdb>    29 atoms in block     86
 Block first atom:   2775
 Blocpdb>    30 atoms in block     87
 Block first atom:   2804
 Blocpdb>    27 atoms in block     88
 Block first atom:   2834
 Blocpdb>    39 atoms in block     89
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    31 atoms in block     90
 Block first atom:   2900
 Blocpdb>    35 atoms in block     91
 Block first atom:   2931
 Blocpdb>    23 atoms in block     92
 Block first atom:   2966
 Blocpdb>    39 atoms in block     93
 Block first atom:   2989
 Blocpdb>    34 atoms in block     94
 Block first atom:   3028
 Blocpdb>    38 atoms in block     95
 Block first atom:   3062
 Blocpdb>    40 atoms in block     96
 Block first atom:   3100
 Blocpdb>    30 atoms in block     97
 Block first atom:   3140
 Blocpdb>    32 atoms in block     98
 Block first atom:   3170
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   3202
 Blocpdb>    32 atoms in block    100
 Block first atom:   3233
 Blocpdb>    35 atoms in block    101
 Block first atom:   3265
 Blocpdb>    52 atoms in block    102
 Block first atom:   3300
 Blocpdb>    25 atoms in block    103
 Block first atom:   3352
 Blocpdb>    37 atoms in block    104
 Block first atom:   3377
 Blocpdb>    34 atoms in block    105
 Block first atom:   3414
 Blocpdb>    64 atoms in block    106
 Block first atom:   3448
 Blocpdb>    40 atoms in block    107
 Block first atom:   3512
 Blocpdb>    23 atoms in block    108
 Block first atom:   3552
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3575
 Blocpdb>    24 atoms in block    110
 Block first atom:   3602
 Blocpdb>    40 atoms in block    111
 Block first atom:   3626
 Blocpdb>    36 atoms in block    112
 Block first atom:   3666
 Blocpdb>    32 atoms in block    113
 Block first atom:   3702
 Blocpdb>    37 atoms in block    114
 Block first atom:   3734
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3771
 Blocpdb>    32 atoms in block    116
 Block first atom:   3800
 Blocpdb>    35 atoms in block    117
 Block first atom:   3832
 Blocpdb>    37 atoms in block    118
 Block first atom:   3867
 Blocpdb>    36 atoms in block    119
 Block first atom:   3904
 Blocpdb>    36 atoms in block    120
 Block first atom:   3940
 Blocpdb>    29 atoms in block    121
 Block first atom:   3976
 Blocpdb>    22 atoms in block    122
 Block first atom:   4005
 Blocpdb>    34 atoms in block    123
 Block first atom:   4027
 Blocpdb>    30 atoms in block    124
 Block first atom:   4061
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   4091
 Blocpdb>    26 atoms in block    126
 Block first atom:   4117
 Blocpdb>    29 atoms in block    127
 Block first atom:   4143
 Blocpdb>    27 atoms in block    128
 Block first atom:   4172
 Blocpdb>    31 atoms in block    129
 Block first atom:   4199
 Blocpdb>    64 atoms in block    130
 Block first atom:   4230
 Blocpdb>    39 atoms in block    131
 Block first atom:   4294
 Blocpdb>    39 atoms in block    132
 Block first atom:   4333
 Blocpdb>    27 atoms in block    133
 Block first atom:   4372
 Blocpdb>    32 atoms in block    134
 Block first atom:   4399
 Blocpdb>    30 atoms in block    135
 Block first atom:   4431
 Blocpdb>    31 atoms in block    136
 Block first atom:   4461
 Blocpdb>    30 atoms in block    137
 Block first atom:   4492
 Blocpdb>    33 atoms in block    138
 Block first atom:   4522
 Blocpdb>    20 atoms in block    139
 Block first atom:   4555
 Blocpdb>    30 atoms in block    140
 Block first atom:   4575
 Blocpdb>    30 atoms in block    141
 Block first atom:   4605
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4635
 Blocpdb>    32 atoms in block    143
 Block first atom:   4668
 Blocpdb>    36 atoms in block    144
 Block first atom:   4700
 Blocpdb>    36 atoms in block    145
 Block first atom:   4736
 Blocpdb>    34 atoms in block    146
 Block first atom:   4772
 Blocpdb>    30 atoms in block    147
 Block first atom:   4806
 Blocpdb>    25 atoms in block    148
 Block first atom:   4836
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4861
 Blocpdb>    11 atoms in block    150
 Block first atom:   4895
 Blocpdb>    40 atoms in block    151
 Block first atom:   4906
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4946
 Blocpdb>    32 atoms in block    153
 Block first atom:   4982
 Blocpdb>    37 atoms in block    154
 Block first atom:   5014
 Blocpdb>    29 atoms in block    155
 Block first atom:   5051
 Blocpdb>    32 atoms in block    156
 Block first atom:   5080
 Blocpdb>    35 atoms in block    157
 Block first atom:   5112
 Blocpdb>    37 atoms in block    158
 Block first atom:   5147
 Blocpdb>    36 atoms in block    159
 Block first atom:   5184
 Blocpdb>    36 atoms in block    160
 Block first atom:   5220
 Blocpdb>    29 atoms in block    161
 Block first atom:   5256
 Blocpdb>    31 atoms in block    162
 Block first atom:   5285
 Blocpdb>    19 atoms in block    163
 Block first atom:   5316
 Blocpdb>    38 atoms in block    164
 Block first atom:   5335
 Blocpdb>    27 atoms in block    165
 Block first atom:   5372

 Blocpdb>   165 blocks.

 Blocpdb> At most,     64 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      2039057 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      16197

 Prepmat> Matrix trace    =    4459540.0000
 Prepmat> Last element read:   16197  16197       184.9252
 Prepmat>        13696 lines saved.
 Prepmat>        12284 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  5399
 RTB> Total mass =        5399.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  5399
 RTB> Number of blocks =   165
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  196595.3441
 RTB>     48321 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      990
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    48321
 Diagstd> Projected matrix trace =  196595.3441

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    990 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 196595.3441
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.1997506      0.3137564      0.6002215      0.8660428
      1.0574188      1.2009561      1.5452308      1.7653875      2.1579733
      2.5252905      3.0013987      3.1955706      3.3562033      3.7722840
      4.2134172      4.4983807      4.7654937      5.4199380      5.9716814
      6.5625784      7.1378609      7.7944208      8.2242953      8.4357838
      8.6600151      8.7665262      9.5615662     10.1017094     11.0514802
     11.1515879     11.8217770     12.2120066     13.2034897     13.4003807
     13.8488947     14.1987584     14.4406955     14.9719564     15.4983497
     16.0558662     16.6530452     17.6161098     18.9355569     19.5819035
     19.9729469     20.5174707     21.7112211     22.2266365     22.6114652
     23.0323619     23.5982703     24.5163278     25.4091091     25.7421578
     26.5023328     26.7464312     27.6151589     28.1703963     28.5666058
     29.6830005     29.7877735     30.3636395     30.6309292     31.2973619
     31.6090045     31.9667424     32.7836821     33.3070587     34.0726922
     34.1507305     35.3183321     35.5126004     36.2327206     36.5378612
     36.7606514     38.0346787     38.4747592     38.6291006     39.0613536
     40.0243664     40.9737931     41.2705688     41.4557822     41.6130049
     42.5769622     42.7707369     43.4902962     44.1579918     44.7999095
     44.9456438     45.4455419     45.8560549     46.3234297     47.1881844
     47.3532023     47.8331816     48.9957741     49.1498445     49.7071116
     49.8596118

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034319      0.0034328      0.0034335      0.0034339      0.0034343
      0.0034350     48.5332401     60.8263260     84.1300354    101.0566660
    111.6654453    119.0032561    134.9870061    144.2830467    159.5211646
    172.5642996    188.1295979    194.1196458    198.9387618    210.9101445
    222.9012544    230.3156152    237.0550595    252.8089465    265.3649725
    278.1842465    290.1211038    303.1706839    311.4186575    315.3973210
    319.5616127    321.5207811    335.7838449    345.1379496    360.9985899
    362.6299213    373.3676289    379.4799158    394.5841584    397.5152993
    404.1130136    409.1857162    412.6571129    420.1792075    427.5018599
    435.1231108    443.1411815    455.7747739    472.5353700    480.5324644
    485.3067749    491.8777647    505.9847238    511.9554299    516.3683714
    521.1521318    527.5156712    537.6788951    547.3813535    550.9570628
    559.0328536    561.6014254    570.6489906    576.3572477    580.3962551
    591.6286268    592.6718521    598.3732818    601.0012374    607.5040065
    610.5211161    613.9662109    621.7619561    626.7053782    633.8675298
    634.5930025    645.3500870    647.1225257    653.6507333    656.3973837
    658.3955385    669.7074900    673.5707744    674.9204363    678.6860531
    687.0012276    695.1017238    697.6145140    699.1781331    700.5027092
    708.5697644    710.1803423    716.1293331    721.6056712    726.8316805
    728.0129138    732.0503011    735.3492004    739.0871193    745.9537720
    747.2569403    751.0345466    760.1067553    761.3009197    765.6046175
    766.7781460

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   5399
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    165

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9879E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9932E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9972E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9995E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1998    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3138    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6002    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8660    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.057    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.201    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.545    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.765    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.158    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.525    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.001    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.196    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.356    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.772    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.213    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.498    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.765    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.420    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.972    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.563    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.138    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.794    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.224    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.436    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.660    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.767    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.562    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.86    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    990 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00001 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003
 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005
 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    97182 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00001 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003
 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005
 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602022316101172576.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602022316101172576.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602022316101172576.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602022316101172576.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    649
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    618
            Number of atoms found    =   5399
            Mean number per residue  =      8.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9879E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9932E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9972E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9995E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1998    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3138    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6002    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8660    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.057    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.201    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.545    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.765    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.158    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.525    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.001    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.196    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.356    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.772    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.213    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.498    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.765    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.420    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.972    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.563    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.138    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.794    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.224    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.436    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.660    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.767    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.562    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.86    

 Bfactors>  106 vectors,  16197 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.199800
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.719 for    679 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.055 +/-   0.06
 Bfactors> =     50.994 +/-  15.99
 Bfactors> Shiftng-fct=     50.939
 Bfactors> Scaling-fct=    260.329

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602022316101172576.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602022316101172576.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   397.5    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   521.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   527.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   537.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   547.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   550.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   570.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   576.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   580.4    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   592.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   598.3    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   626.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   634.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   647.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   653.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   658.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   678.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   686.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   695.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   697.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   699.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   700.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   708.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   710.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   745.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   751.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   760.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   766.7    

 Chkmod>  106 vectors,  16197 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   5399 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    12 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    71 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7398
      0.0034      0.9954
      0.0034      0.7692
      0.0034      0.7202
      0.0034      0.9405
      0.0034      0.8117
     48.5372      0.6440
     60.8279      0.3703
     84.1249      0.4660
    101.0498      0.4133
    111.6385      0.3714
    119.0003      0.0035
    134.9711      0.5044
    144.2610      0.5686
    159.5153      0.5220
    172.5470      0.4275
    188.1090      0.0453
    194.1244      0.3321
    198.9242      0.5636
    210.8932      0.2534
    222.8807      0.3488
    230.2960      0.5937
    237.0326      0.6241
    252.7995      0.3255
    265.3607      0.2489
    278.1812      0.4335
    290.1115      0.2381
    303.1495      0.5847
    311.3997      0.1760
    315.3878      0.5148
    319.5476      0.4269
    321.5157      0.3552
    335.7770      0.3209
    345.0939      0.4934
    360.9589      0.3921
    362.5885      0.4567
    373.3235      0.4100
    379.4324      0.2198
    394.5151      0.2779
    397.4926      0.1418
    404.1118      0.2639
    409.1860      0.5262
    412.6295      0.2336
    420.1337      0.4236
    427.5063      0.5226
    435.1604      0.4171
    443.0816      0.4926
    455.8055      0.5889
    472.5705      0.5271
    480.4885      0.2820
    485.2501      0.4591
    491.8870      0.3275
    505.9488      0.5616
    511.9722      0.5049
    516.3295      0.3754
    521.1030      0.3675
    527.5124      0.5117
    537.6961      0.4119
    547.3675      0.3502
    550.9103      0.4705
    558.9843      0.4275
    561.6148      0.4172
    570.6745      0.5373
    576.3285      0.4890
    580.4058      0.4985
    591.5733      0.3153
    592.6686      0.2428
    598.3117      0.4915
    600.9663      0.4535
    607.5035      0.4503
    610.5045      0.1078
    613.9711      0.4619
    621.7003      0.4648
    626.7061      0.4337
    633.8153      0.2865
    634.5590      0.3647
    645.3376      0.2570
    647.0711      0.4372
    653.5981      0.3666
    656.3884      0.2586
    658.3614      0.4614
    669.6376      0.3521
    673.5002      0.3892
    674.8993      0.3620
    678.6452      0.2429
    686.9343      0.2293
    695.0397      0.3209
    697.5798      0.3677
    699.1837      0.3148
    700.4473      0.4707
    708.5646      0.3449
    710.1437      0.2996
    716.0962      0.3234
    721.5911      0.3120
    726.8012      0.3079
    728.0169      0.4951
    732.0548      0.4537
    735.3493      0.3194
    739.0280      0.3116
    745.9361      0.4650
    747.1996      0.3787
    750.9773      0.4027
    760.1069      0.3815
    761.2694      0.4766
    765.5940      0.4449
    766.7482      0.2398
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602022316101172576 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 9
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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2602022316101172576.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m21.322s
user	0m21.153s
sys	0m0.165s
rm: cannot remove '2602022316101172576.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** IMMUNE SYSTEM 03-JUL-23 8JYQ ***

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* IMMUNE SYSTEM 03-JUL-23 8JYQ *
