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***  dim19  ***

LOGs for ID: 2602030521321302569

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602030521321302569.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602030521321302569.atom to be opened. Openam> File opened: 2602030521321302569.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 630 First residue number = 1 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4770 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.113342 +/- 20.595193 From: -41.302000 To: 41.127000 = -1.029873 +/- 10.982931 From: -30.223000 To: 26.890000 = -0.231244 +/- 11.423879 From: -29.329000 To: 29.630000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8387 % Filled. Pdbmat> 1882756 non-zero elements. Pdbmat> 206039 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.39 +/- 23.92 Maximum number = 132 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 4.120780E+06 Pdbmat> Larger element = 496.721 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 630 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602030521321302569.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602030521321302569.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602030521321302569.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4770 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 630 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 33 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 21 atoms in block 3 Block first atom: 65 Blocpdb> 30 atoms in block 4 Block first atom: 86 Blocpdb> 30 atoms in block 5 Block first atom: 116 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 146 Blocpdb> 30 atoms in block 7 Block first atom: 176 Blocpdb> 35 atoms in block 8 Block first atom: 206 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 241 Blocpdb> 31 atoms in block 10 Block first atom: 281 Blocpdb> 33 atoms in block 11 Block first atom: 312 Blocpdb> 38 atoms in block 12 Block first atom: 345 Blocpdb> 29 atoms in block 13 Block first atom: 383 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 412 Blocpdb> 35 atoms in block 15 Block first atom: 438 Blocpdb> 31 atoms in block 16 Block first atom: 473 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 504 Blocpdb> 28 atoms in block 18 Block first atom: 528 Blocpdb> 31 atoms in block 19 Block first atom: 556 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 587 Blocpdb> 33 atoms in block 21 Block first atom: 610 Blocpdb> 32 atoms in block 22 Block first atom: 643 Blocpdb> 25 atoms in block 23 Block first atom: 675 Blocpdb> 36 atoms in block 24 Block first atom: 700 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 736 Blocpdb> 33 atoms in block 26 Block first atom: 764 Blocpdb> 30 atoms in block 27 Block first atom: 797 Blocpdb> 29 atoms in block 28 Block first atom: 827 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 856 Blocpdb> 28 atoms in block 30 Block first atom: 894 Blocpdb> 38 atoms in block 31 Block first atom: 922 Blocpdb> 26 atoms in block 32 Block first atom: 960 Blocpdb> 27 atoms in block 33 Block first atom: 986 Blocpdb> 31 atoms in block 34 Block first atom: 1013 Blocpdb> 30 atoms in block 35 Block first atom: 1044 Blocpdb> 27 atoms in block 36 Block first atom: 1074 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 1101 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 1125 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1149 Blocpdb> 34 atoms in block 40 Block first atom: 1181 Blocpdb> 25 atoms in block 41 Block first atom: 1215 Blocpdb> 21 atoms in block 42 Block first atom: 1240 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 1261 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1287 Blocpdb> 27 atoms in block 45 Block first atom: 1315 Blocpdb> 31 atoms in block 46 Block first atom: 1342 Blocpdb> 35 atoms in block 47 Block first atom: 1373 Blocpdb> 27 atoms in block 48 Block first atom: 1408 Blocpdb> 27 atoms in block 49 Block first atom: 1435 Blocpdb> 41 atoms in block 50 Block first atom: 1462 Blocpdb> 33 atoms in block 51 Block first atom: 1503 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 1536 Blocpdb> 33 atoms in block 53 Block first atom: 1565 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 1598 Blocpdb> 32 atoms in block 55 Block first atom: 1630 Blocpdb> 33 atoms in block 56 Block first atom: 1662 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1695 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1723 Blocpdb> 28 atoms in block 59 Block first atom: 1754 Blocpdb> 30 atoms in block 60 Block first atom: 1782 Blocpdb> 30 atoms in block 61 Block first atom: 1812 Blocpdb> 31 atoms in block 62 Block first atom: 1842 Blocpdb> 33 atoms in block 63 Block first atom: 1873 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1906 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1931 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 1959 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 1996 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 2020 Blocpdb> 31 atoms in block 69 Block first atom: 2051 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2082 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 2110 Blocpdb> 31 atoms in block 72 Block first atom: 2141 Blocpdb> 35 atoms in block 73 Block first atom: 2172 Blocpdb> 25 atoms in block 74 Block first atom: 2207 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2232 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 2268 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 2297 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2338 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 2371 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 2386 Blocpdb> 33 atoms in block 81 Block first atom: 2417 Blocpdb> 21 atoms in block 82 Block first atom: 2450 Blocpdb> 30 atoms in block 83 Block first atom: 2471 Blocpdb> 30 atoms in block 84 Block first atom: 2501 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2531 Blocpdb> 30 atoms in block 86 Block first atom: 2561 Blocpdb> 35 atoms in block 87 Block first atom: 2591 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2626 Blocpdb> 31 atoms in block 89 Block first atom: 2666 Blocpdb> 33 atoms in block 90 Block first atom: 2697 Blocpdb> 38 atoms in block 91 Block first atom: 2730 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2768 Blocpdb> 26 atoms in block 93 Block first atom: 2797 Blocpdb> 35 atoms in block 94 Block first atom: 2823 Blocpdb> 31 atoms in block 95 Block first atom: 2858 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2889 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2913 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 2941 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2972 Blocpdb> 33 atoms in block 100 Block first atom: 2995 Blocpdb> 32 atoms in block 101 Block first atom: 3028 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 3060 Blocpdb> 36 atoms in block 103 Block first atom: 3085 Blocpdb> 28 atoms in block 104 Block first atom: 3121 Blocpdb> 33 atoms in block 105 Block first atom: 3149 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 3182 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 3212 Blocpdb> 38 atoms in block 108 Block first atom: 3241 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 3279 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 3307 Blocpdb> 26 atoms in block 111 Block first atom: 3345 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 3371 Blocpdb> 31 atoms in block 113 Block first atom: 3398 Blocpdb> 30 atoms in block 114 Block first atom: 3429 Blocpdb> 27 atoms in block 115 Block first atom: 3459 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 3486 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 3510 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3534 Blocpdb> 34 atoms in block 119 Block first atom: 3566 Blocpdb> 25 atoms in block 120 Block first atom: 3600 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 3625 Blocpdb> 26 atoms in block 122 Block first atom: 3646 Blocpdb> 28 atoms in block 123 Block first atom: 3672 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3700 Blocpdb> 31 atoms in block 125 Block first atom: 3727 Blocpdb> 35 atoms in block 126 Block first atom: 3758 Blocpdb> 27 atoms in block 127 Block first atom: 3793 Blocpdb> 27 atoms in block 128 Block first atom: 3820 Blocpdb> 41 atoms in block 129 Block first atom: 3847 Blocpdb> 33 atoms in block 130 Block first atom: 3888 Blocpdb> 29 atoms in block 131 Block first atom: 3921 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 3950 Blocpdb> 32 atoms in block 133 Block first atom: 3983 Blocpdb> 32 atoms in block 134 Block first atom: 4015 Blocpdb> 33 atoms in block 135 Block first atom: 4047 Blocpdb> 28 atoms in block 136 Block first atom: 4080 Blocpdb> 31 atoms in block 137 Block first atom: 4108 Blocpdb> 28 atoms in block 138 Block first atom: 4139 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 4167 Blocpdb> 30 atoms in block 140 Block first atom: 4197 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4227 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4258 Blocpdb> 25 atoms in block 143 Block first atom: 4291 Blocpdb> 28 atoms in block 144 Block first atom: 4316 Blocpdb> 37 atoms in block 145 Block first atom: 4344 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 4381 Blocpdb> 31 atoms in block 147 Block first atom: 4405 Blocpdb> 31 atoms in block 148 Block first atom: 4436 Blocpdb> 28 atoms in block 149 Block first atom: 4467 Blocpdb> 31 atoms in block 150 Block first atom: 4495 Blocpdb> 31 atoms in block 151 Block first atom: 4526 Blocpdb> 35 atoms in block 152 Block first atom: 4557 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 4592 Blocpdb> 36 atoms in block 154 Block first atom: 4617 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 4653 Blocpdb> 41 atoms in block 156 Block first atom: 4682 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 4723 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 4755 Blocpdb> 158 blocks. Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1882914 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 14310 Prepmat> Matrix trace = 4120780.0000 Prepmat> Last element read: 14310 14310 31.7867 Prepmat> 12562 lines saved. Prepmat> 11010 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4770 RTB> Total mass = 4770.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4770 RTB> Number of blocks = 158 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 206315.5007 RTB> 53466 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 948 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53466 Diagstd> Projected matrix trace = 206315.5007 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 948 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 206315.5007 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3926246 1.4636972 2.3085784 4.4357604 5.3390800 5.7180314 6.3916042 7.3444619 9.5740381 10.4231341 11.5530926 11.6362257 12.1241015 12.5817205 13.9640123 14.3452098 14.9345034 15.0943398 15.4345731 15.6423954 17.5556861 17.6419703 18.1507236 18.5021910 18.8083138 19.2392132 19.8232210 20.7356326 21.6673603 22.1177129 22.5754045 23.0250451 23.3557799 23.5752301 23.6995842 24.5157179 24.8611307 25.5517530 25.7242889 26.6923558 27.1453325 27.4300320 27.7416668 28.9522008 29.1649739 30.6707627 30.8095478 31.2933073 31.7182268 33.4819909 34.3714931 34.7541718 35.0242903 35.4236755 36.9549889 37.5808783 37.6821214 38.4650607 38.7187453 40.0556333 40.1139200 41.3405456 42.0179840 42.8397912 43.1052955 43.1518488 43.9849245 44.1436968 44.5085097 44.8226245 45.6445056 45.8027750 46.7048112 47.2387773 47.3162264 47.9887266 48.0887358 48.9625455 49.8411450 50.3526420 50.9768096 51.1451763 51.4040486 52.2807060 52.3499093 52.6397509 53.0685990 53.4229677 53.4913256 53.9328022 54.4119787 54.8793468 55.0694221 55.8992311 56.2070412 56.5956368 56.6524395 57.6847345 57.8393514 58.3562915 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034320 0.0034323 0.0034325 0.0034338 0.0034360 128.1481407 131.3774706 164.9937878 228.7069273 250.9160808 259.6680686 274.5365778 294.2898419 336.0027690 350.5858975 369.1003073 370.4259033 378.1116529 385.1813900 405.7891133 411.2905506 419.6533302 421.8930206 426.6213560 429.4839217 454.9924435 456.1091909 462.6390127 467.0967662 470.9450226 476.3091609 483.4843169 494.4859137 505.4733724 510.6994483 515.9564554 521.0693461 524.7983574 527.2580881 528.6468433 537.6722074 541.4467096 548.9156718 550.7658056 561.0334206 565.7738403 568.7330122 571.9545981 584.3002486 586.4433636 601.3918918 602.7510041 607.4646538 611.5750085 628.3489838 636.6408176 640.1750616 642.6580507 646.3118084 660.1335694 665.7002855 666.5963826 673.4858740 675.7031102 687.2695169 687.7693731 698.2056880 703.9031131 710.7534115 712.9524959 713.3373823 720.1901968 721.4888606 724.4639952 727.0159206 733.6510339 734.9218771 742.1233402 746.3535527 746.9651344 752.2546716 753.0381177 759.8489619 766.6361349 770.5599128 775.3211052 776.6004186 778.5633269 785.1741666 785.6936569 787.8656990 791.0684998 793.7053088 794.2129434 797.4836229 801.0184881 804.4512802 805.8431896 811.8918787 814.1241585 816.9335943 817.3434526 824.7564662 825.8610567 829.5434202 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4770 Rtb_to_modes> Number of blocs = 158 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9863E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.574 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> 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Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.36 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 948 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 85860 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602030521321302569.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602030521321302569.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602030521321302569.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602030521321302569.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 630 First residue number = 1 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4770 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9863E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.574 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.51 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.65 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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vecteur en lecture: 524.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.2 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Chkmod> That is: 4770 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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