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* SIGNALING PROTEIN 20-OCT-09 3KB3 *

LOGs for ID: 2602031626281395717

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602031626281395717.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602031626281395717.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602031626281395717.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    294
            First residue number     =    186
            Last  residue number     =    506
            Number of atoms found    =   2286
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     9.109826 +/-    10.426281 From:   -19.906000 To:    31.187000
 =   -18.898703 +/-    10.347731 From:   -43.436000 To:     8.804000
 =   -42.110563 +/-    12.093147 From:   -68.827000 To:   -17.035000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.6578 % Filled.
 Pdbmat>       860299  non-zero elements.
 Pdbmat>        94082 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.31 +/-     24.29
         Maximum number =    127
         Minimum number =     11

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.881640E+06
 Pdbmat> Larger element =  484.139    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
294 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602031626281395717.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602031626281395717.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602031626281395717.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2286 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   294 residues.
 Blocpdb>    14 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     15
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     30
 Blocpdb>    14 atoms in block      4
 Block first atom:     48
 Blocpdb>    14 atoms in block      5
 Block first atom:     62
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     76
 Blocpdb>    19 atoms in block      7
 Block first atom:     89
 Blocpdb>    15 atoms in block      8
 Block first atom:    108
 Blocpdb>    17 atoms in block      9
 Block first atom:    123
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    140
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:    153
 Blocpdb>    13 atoms in block     12
 Block first atom:    169
 Blocpdb>    17 atoms in block     13
 Block first atom:    182
 Blocpdb>    19 atoms in block     14
 Block first atom:    199
 Blocpdb>    17 atoms in block     15
 Block first atom:    218
 Blocpdb>    15 atoms in block     16
 Block first atom:    235
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    250
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    275
 Blocpdb>    14 atoms in block     20
 Block first atom:    290
 Blocpdb>    22 atoms in block     21
 Block first atom:    304
 Blocpdb>    11 atoms in block     22
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    20 atoms in block     23
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    14 atoms in block     24
 Block first atom:    357
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    19 atoms in block     26
 Block first atom:    379
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    398
 Blocpdb>    20 atoms in block     28
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    17 atoms in block     29
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    19 atoms in block     30
 Block first atom:    447
 Blocpdb>    18 atoms in block     31
 Block first atom:    466
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    484
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    500
 Blocpdb>    18 atoms in block     34
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    531
 Blocpdb>    11 atoms in block     36
 Block first atom:    548
 Blocpdb>    20 atoms in block     37
 Block first atom:    559
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    579
 Blocpdb>    22 atoms in block     39
 Block first atom:    595
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    617
 Blocpdb>    18 atoms in block     41
 Block first atom:    633
 Blocpdb>    12 atoms in block     42
 Block first atom:    651
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    682
 Blocpdb>    12 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    17 atoms in block     46
 Block first atom:    708
 Blocpdb>    13 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    17 atoms in block     48
 Block first atom:    738
 Blocpdb>    15 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    12 atoms in block     50
 Block first atom:    770
 Blocpdb>     7 atoms in block     51
 Block first atom:    782
 Blocpdb>    12 atoms in block     52
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    17 atoms in block     53
 Block first atom:    801
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    818
 Blocpdb>    14 atoms in block     55
 Block first atom:    833
 Blocpdb>    12 atoms in block     56
 Block first atom:    847
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    859
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    874
 Blocpdb>    10 atoms in block     59
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    12 atoms in block     60
 Block first atom:    898
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    910
 Blocpdb>    13 atoms in block     62
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    13 atoms in block     63
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:    950
 Blocpdb>    18 atoms in block     65
 Block first atom:    962
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:    980
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:    994
 Blocpdb>    10 atoms in block     68
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    14 atoms in block     69
 Block first atom:   1018
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1032
 Blocpdb>    15 atoms in block     71
 Block first atom:   1048
 Blocpdb>    22 atoms in block     72
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1085
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1098
 Blocpdb>    15 atoms in block     75
 Block first atom:   1112
 Blocpdb>    14 atoms in block     76
 Block first atom:   1127
 Blocpdb>    15 atoms in block     77
 Block first atom:   1141
 Blocpdb>    19 atoms in block     78
 Block first atom:   1156
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    20 atoms in block     80
 Block first atom:   1190
 Blocpdb>    17 atoms in block     81
 Block first atom:   1210
 Blocpdb>    17 atoms in block     82
 Block first atom:   1227
 Blocpdb>    19 atoms in block     83
 Block first atom:   1244
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1263
 Blocpdb>     9 atoms in block     85
 Block first atom:   1280
 Blocpdb>    13 atoms in block     86
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    23 atoms in block     88
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    13 atoms in block     89
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   1353
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1369
 Blocpdb>    11 atoms in block     92
 Block first atom:   1387
 Blocpdb>    13 atoms in block     93
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    14 atoms in block     94
 Block first atom:   1411
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1425
 Blocpdb>    12 atoms in block     96
 Block first atom:   1442
 Blocpdb>    19 atoms in block     97
 Block first atom:   1454
 Blocpdb>    20 atoms in block     98
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    16 atoms in block     99
 Block first atom:   1493
 Blocpdb>    19 atoms in block    100
 Block first atom:   1509
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1528
 Blocpdb>    16 atoms in block    102
 Block first atom:   1543
 Blocpdb>    16 atoms in block    103
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1575
 Blocpdb>    15 atoms in block    105
 Block first atom:   1593
 Blocpdb>    17 atoms in block    106
 Block first atom:   1608
 Blocpdb>    20 atoms in block    107
 Block first atom:   1625
 Blocpdb>    17 atoms in block    108
 Block first atom:   1645
 Blocpdb>    14 atoms in block    109
 Block first atom:   1662
 Blocpdb>    16 atoms in block    110
 Block first atom:   1676
 Blocpdb>    11 atoms in block    111
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    12 atoms in block    112
 Block first atom:   1703
 Blocpdb>    22 atoms in block    113
 Block first atom:   1715
 Blocpdb>    15 atoms in block    114
 Block first atom:   1737
 Blocpdb>    16 atoms in block    115
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    17 atoms in block    116
 Block first atom:   1768
 Blocpdb>    16 atoms in block    117
 Block first atom:   1785
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1801
 Blocpdb>    13 atoms in block    119
 Block first atom:   1816
 Blocpdb>    22 atoms in block    120
 Block first atom:   1829
 Blocpdb>    19 atoms in block    121
 Block first atom:   1851
 Blocpdb>    16 atoms in block    122
 Block first atom:   1870
 Blocpdb>    24 atoms in block    123
 Block first atom:   1886
 Blocpdb>    18 atoms in block    124
 Block first atom:   1910
 Blocpdb>    12 atoms in block    125
 Block first atom:   1928
 Blocpdb>    12 atoms in block    126
 Block first atom:   1940
 Blocpdb>    15 atoms in block    127
 Block first atom:   1952
 Blocpdb>    14 atoms in block    128
 Block first atom:   1967
 Blocpdb>    15 atoms in block    129
 Block first atom:   1981
 Blocpdb>    13 atoms in block    130
 Block first atom:   1996
 Blocpdb>    16 atoms in block    131
 Block first atom:   2009
 Blocpdb>    12 atoms in block    132
 Block first atom:   2025
 Blocpdb>    15 atoms in block    133
 Block first atom:   2037
 Blocpdb>    10 atoms in block    134
 Block first atom:   2052
 Blocpdb>    13 atoms in block    135
 Block first atom:   2062
 Blocpdb>    20 atoms in block    136
 Block first atom:   2075
 Blocpdb>    14 atoms in block    137
 Block first atom:   2095
 Blocpdb>    13 atoms in block    138
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    17 atoms in block    139
 Block first atom:   2122
 Blocpdb>    13 atoms in block    140
 Block first atom:   2139
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2152
 Blocpdb>    16 atoms in block    142
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    14 atoms in block    143
 Block first atom:   2183
 Blocpdb>    16 atoms in block    144
 Block first atom:   2197
 Blocpdb>    15 atoms in block    145
 Block first atom:   2213
 Blocpdb>    16 atoms in block    146
 Block first atom:   2228
 Blocpdb>    14 atoms in block    147
 Block first atom:   2244
 Blocpdb>    20 atoms in block    148
 Block first atom:   2258
 Blocpdb>     9 atoms in block    149
 Block first atom:   2277

 Blocpdb>   149 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       860448 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6858

 Prepmat> Matrix trace    =    1881640.0000
 Prepmat> Last element read:    6858   6858       100.0822
 Prepmat>        11176 lines saved.
 Prepmat>         9528 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2286
 RTB> Total mass =        2286.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2286
 RTB> Number of blocks =   149
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  208785.6060
 RTB>     57057 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      894
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    57057
 Diagstd> Projected matrix trace =  208785.6060

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    894 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 208785.6060
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.1276394      2.7924679      3.2221199      3.4548758
      4.1975900      5.0937345      7.6721455      8.0697512      8.2884875
      8.9344195      9.2688221      9.9232656     10.4556874     11.5155990
     12.2725491     13.3384180     13.5402009     14.2025729     14.8974051
     16.0105142     16.9192679     17.7913229     18.7460949     19.9012190
     20.9489197     21.0556667     22.8460266     23.4580098     23.8946743
     23.9914917     25.9056122     26.1422857     27.3184494     28.3888221
     28.6804673     29.4419932     29.9352979     30.5938442     31.2891598
     31.9000222     33.3724439     33.7944789     34.7277578     35.3328309
     36.1760136     37.6216951     38.8599523     39.1390677     39.7230919
     39.7492430     41.5694170     42.3893048     43.0325844     43.2962494
     45.1244612     46.0547076     47.0312854     47.2803906     47.8112001
     48.1803505     49.3600359     50.1902154     50.6872261     51.5600755
     51.6961575     52.5732688     53.3449316     53.8266983     53.9879675
     55.2351341     56.1304796     56.7608968     57.3297676     57.5040553
     57.8011601     59.3940533     59.5279147     61.0425232     61.0998644
     61.7239268     62.5848007     63.3501867     64.1959054     64.8540409
     65.1177952     66.0390335     66.6027845     66.8594162     67.8898223
     68.3590827     69.6572102     70.0498746     71.2524458     71.5389228
     72.7346895     72.8788034     72.9776330     73.5787473     73.8254651
     74.9696598

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034335      0.0034336      0.0034338      0.0034345      0.0034347
      0.0034354    158.3960312    181.4635382    194.9243648    201.8419805
    222.4822083    245.0831380    300.7832840    308.4788206    312.6316364
    324.5850036    330.6035806    342.0759862    351.1329416    368.5008956
    380.4194123    396.5951896    399.5837644    409.2406766    419.1317825
    434.5081435    446.6692582    458.0357759    470.1654213    484.4345609
    497.0225538    498.2872547    519.0397505    525.9456439    530.8182403
    531.8925487    552.7034945    555.2225013    567.5750591    578.5873939
    581.5517837    589.2219054    594.1376477    600.6373100    607.4243964
    613.3251491    627.3202202    631.2743699    639.9317418    645.4825373
    653.1390267    666.0616973    676.9341315    679.3608545    684.4107193
    684.6359680    700.1357387    707.0065338    712.3509286    714.5299195
    729.4596856    736.9402795    744.7126047    746.6822169    750.8619602
    753.7550902    762.9270504    769.3160800    773.1157885    779.7440194
    780.7723267    787.3680185    793.1254058    796.6987776    797.8913726
    807.0547293    813.5694963    818.1254533    822.2149536    823.4638090
    825.5883532    836.8868859    837.8294363    848.4212130    848.8196086
    853.1434366    859.0723027    864.3093871    870.0594824    874.5080282
    876.2844880    882.4612306    886.2198503    887.9255857    894.7415721
    897.8285126    906.3132281    908.8641255    916.6323251    918.4731783
    926.1174664    927.0345000    927.6628541    931.4755830    933.0359473
    940.2385430

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2286
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    149

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9988E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.128    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.792    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.222    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.455    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.198    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.094    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.672    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.070    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.288    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.934    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.269    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.923    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.97    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    894 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99996
 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997
 0.99996 1.00005 0.99998 0.99997 1.00001
 1.00003 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001
 0.99996 1.00000 0.99996 1.00001 0.99997
 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
 0.99996 1.00000 0.99997 0.99996 0.99997
 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996
 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    41148 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99996
 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997
 0.99996 1.00005 0.99998 0.99997 1.00001
 1.00003 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001
 0.99996 1.00000 0.99996 1.00001 0.99997
 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
 0.99996 1.00000 0.99997 0.99996 0.99997
 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996
 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602031626281395717.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602031626281395717.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602031626281395717.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602031626281395717.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    294
            First residue number     =    186
            Last  residue number     =    506
            Number of atoms found    =   2286
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9988E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.128    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.792    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.222    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.455    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.198    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.094    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.672    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.070    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.288    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.934    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.269    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.923    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.97    

 Bfactors>  106 vectors,   6858 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.128000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.478 for    294 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.028 +/-   0.05
 Bfactors> =     56.418 +/-  30.12
 Bfactors> Shiftng-fct=     56.390
 Bfactors> Scaling-fct=    590.613

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602031626281395717.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602031626281395717.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4354E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   158.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   181.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   700.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   707.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   712.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   714.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   729.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   744.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   746.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   769.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   773.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   780.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   787.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   793.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   797.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   807.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   823.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   825.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   836.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   848.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   848.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   870.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   874.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   882.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   886.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   887.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   894.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   897.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   906.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   908.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   916.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   918.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   931.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   940.2    

 Chkmod>  106 vectors,   6858 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2286 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    10 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    17 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7491
      0.0034      0.9653
      0.0034      0.7011
      0.0034      0.8429
      0.0034      0.6830
      0.0034      0.8544
    158.4027      0.1180
    181.4405      0.2796
    194.9124      0.1697
    201.8369      0.0263
    222.4835      0.1921
    245.0790      0.3955
    300.7675      0.3293
    308.4703      0.3738
    312.6090      0.2272
    324.5634      0.0561
    330.5926      0.0240
    342.0567      0.1715
    351.1903      0.0594
    368.5555      0.3360
    380.3636      0.2486
    396.6017      0.3981
    399.5636      0.2522
    409.1860      0.3209
    419.1503      0.4286
    434.4825      0.6051
    446.6597      0.4855
    457.9991      0.2892
    470.1942      0.4316
    484.3989      0.1759
    497.0140      0.4503
    498.3171      0.3024
    519.0626      0.4376
    525.9454      0.1897
    530.7435      0.4068
    531.8532      0.4853
    552.7266      0.3498
    555.1744      0.3142
    567.5668      0.5075
    578.5746      0.3831
    581.5221      0.4112
    589.1767      0.4841
    594.1588      0.3144
    600.5738      0.4822
    607.4065      0.2004
    613.2986      0.3992
    627.2703      0.4849
    631.2054      0.4661
    639.9249      0.3666
    645.4290      0.2258
    653.1470      0.4512
    666.0181      0.1608
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    700.1106      0.3635
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    712.2990      0.4731
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    744.6705      0.3808
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    779.7100      0.3611
    780.7678      0.3103
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    807.0556      0.3894
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    822.1813      0.3171
    823.3994      0.4141
    825.5446      0.4602
    836.8224      0.4489
    837.8081      0.3734
    848.3673      0.4225
    848.7841      0.2908
    853.0797      0.3061
    859.0025      0.5289
    864.2710      0.3715
    870.0499      0.4218
    874.4432      0.5301
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    933.0245      0.3258
    940.2003      0.3707
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602031626281395717 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602031626281395717.eigenfacs
2602031626281395717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602031626281395717.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2602031626281395717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602031626281395717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2602031626281395717.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.322s
user	0m10.267s
sys	0m0.051s
rm: cannot remove '2602031626281395717.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** SIGNALING PROTEIN 20-OCT-09 3KB3 ***

LOGs for ID: 2602031626281395717

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* SIGNALING PROTEIN 20-OCT-09 3KB3 *
