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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* LIPID BINDING PROTEIN 11-OCT-10 3P6D *

LOGs for ID: 2602031635461411591

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602031635461411591.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602031635461411591.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602031635461411591.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    139
            First residue number     =     -7
            Last  residue number     =    131
            Number of atoms found    =   1207
            Mean number per residue  =      8.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     7.752541 +/-     6.792992 From:    -7.769000 To:    22.852000
 =     9.955152 +/-     8.312601 From:    -7.381000 To:    31.359000
 =    14.568382 +/-    10.166247 From:   -13.981000 To:    34.107000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   7.0207 % Filled.
 Pdbmat>       460394  non-zero elements.
 Pdbmat>        50358 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     83.44 +/-     24.26
         Maximum number =    131
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.007160E+06
 Pdbmat> Larger element =  536.825    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
139 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602031635461411591.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602031635461411591.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602031635461411591.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1207 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   139 residues.
 Blocpdb>     5 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     5 atoms in block      2
 Block first atom:      6
 Blocpdb>     8 atoms in block      3
 Block first atom:     11
 Blocpdb>     4 atoms in block      4
 Block first atom:     19
 Blocpdb>    11 atoms in block      5
 Block first atom:     23
 Blocpdb>     4 atoms in block      6
 Block first atom:     34
 Blocpdb>     6 atoms in block      7
 Block first atom:     38
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:     44
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     60
 Blocpdb>     8 atoms in block     10
 Block first atom:     69
 Blocpdb>     5 atoms in block     11
 Block first atom:     77
 Blocpdb>    11 atoms in block     12
 Block first atom:     82
 Blocpdb>     7 atoms in block     13
 Block first atom:     93
 Blocpdb>     4 atoms in block     14
 Block first atom:    100
 Blocpdb>     7 atoms in block     15
 Block first atom:    104
 Blocpdb>    14 atoms in block     16
 Block first atom:    111
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    125
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    134
 Blocpdb>     7 atoms in block     19
 Block first atom:    142
 Blocpdb>     6 atoms in block     20
 Block first atom:    149
 Blocpdb>     6 atoms in block     21
 Block first atom:    155
 Blocpdb>    16 atoms in block     22
 Block first atom:    161
 Blocpdb>    13 atoms in block     23
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    11 atoms in block     24
 Block first atom:    190
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    201
 Blocpdb>     8 atoms in block     26
 Block first atom:    209
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    217
 Blocpdb>     8 atoms in block     28
 Block first atom:    229
 Blocpdb>     9 atoms in block     29
 Block first atom:    237
 Blocpdb>     9 atoms in block     30
 Block first atom:    246
 Blocpdb>     7 atoms in block     31
 Block first atom:    255
 Blocpdb>     4 atoms in block     32
 Block first atom:    262
 Blocpdb>     7 atoms in block     33
 Block first atom:    266
 Blocpdb>     4 atoms in block     34
 Block first atom:    273
 Blocpdb>    11 atoms in block     35
 Block first atom:    277
 Blocpdb>     5 atoms in block     36
 Block first atom:    288
 Blocpdb>     7 atoms in block     37
 Block first atom:    293
 Blocpdb>    11 atoms in block     38
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     9 atoms in block     39
 Block first atom:    311
 Blocpdb>    11 atoms in block     40
 Block first atom:    320
 Blocpdb>     5 atoms in block     41
 Block first atom:    331
 Blocpdb>     4 atoms in block     42
 Block first atom:    336
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    340
 Blocpdb>     5 atoms in block     44
 Block first atom:    348
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    353
 Blocpdb>     7 atoms in block     46
 Block first atom:    362
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    369
 Blocpdb>     8 atoms in block     48
 Block first atom:    377
 Blocpdb>     8 atoms in block     49
 Block first atom:    385
 Blocpdb>     8 atoms in block     50
 Block first atom:    393
 Blocpdb>     6 atoms in block     51
 Block first atom:    401
 Blocpdb>     7 atoms in block     52
 Block first atom:    407
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    414
 Blocpdb>     4 atoms in block     54
 Block first atom:    422
 Blocpdb>     8 atoms in block     55
 Block first atom:    426
 Blocpdb>     7 atoms in block     56
 Block first atom:    434
 Blocpdb>     8 atoms in block     57
 Block first atom:    441
 Blocpdb>     7 atoms in block     58
 Block first atom:    449
 Blocpdb>     8 atoms in block     59
 Block first atom:    456
 Blocpdb>     9 atoms in block     60
 Block first atom:    464
 Blocpdb>     6 atoms in block     61
 Block first atom:    473
 Blocpdb>     9 atoms in block     62
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    12 atoms in block     63
 Block first atom:    488
 Blocpdb>    14 atoms in block     64
 Block first atom:    500
 Blocpdb>    22 atoms in block     65
 Block first atom:    514
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:    536
 Blocpdb>     8 atoms in block     67
 Block first atom:    554
 Blocpdb>     7 atoms in block     68
 Block first atom:    562
 Blocpdb>     9 atoms in block     69
 Block first atom:    569
 Blocpdb>     8 atoms in block     70
 Block first atom:    578
 Blocpdb>     6 atoms in block     71
 Block first atom:    586
 Blocpdb>    11 atoms in block     72
 Block first atom:    592
 Blocpdb>     8 atoms in block     73
 Block first atom:    603
 Blocpdb>     8 atoms in block     74
 Block first atom:    611
 Blocpdb>     4 atoms in block     75
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     76
 Block first atom:    623
 Blocpdb>     9 atoms in block     77
 Block first atom:    632
 Blocpdb>    11 atoms in block     78
 Block first atom:    641
 Blocpdb>     8 atoms in block     79
 Block first atom:    652
 Blocpdb>     9 atoms in block     80
 Block first atom:    660
 Blocpdb>    14 atoms in block     81
 Block first atom:    669
 Blocpdb>     7 atoms in block     82
 Block first atom:    683
 Blocpdb>     5 atoms in block     83
 Block first atom:    690
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:    695
 Blocpdb>     8 atoms in block     85
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    11 atoms in block     86
 Block first atom:    711
 Blocpdb>     9 atoms in block     87
 Block first atom:    722
 Blocpdb>     7 atoms in block     88
 Block first atom:    731
 Blocpdb>     9 atoms in block     89
 Block first atom:    738
 Blocpdb>     6 atoms in block     90
 Block first atom:    747
 Blocpdb>     7 atoms in block     91
 Block first atom:    753
 Blocpdb>     8 atoms in block     92
 Block first atom:    760
 Blocpdb>     7 atoms in block     93
 Block first atom:    768
 Blocpdb>    16 atoms in block     94
 Block first atom:    775
 Blocpdb>    16 atoms in block     95
 Block first atom:    791
 Blocpdb>     8 atoms in block     96
 Block first atom:    807
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    815
 Blocpdb>     7 atoms in block     98
 Block first atom:    823
 Blocpdb>     8 atoms in block     99
 Block first atom:    830
 Blocpdb>     7 atoms in block    100
 Block first atom:    838
 Blocpdb>    10 atoms in block    101
 Block first atom:    845
 Blocpdb>     7 atoms in block    102
 Block first atom:    855
 Blocpdb>     9 atoms in block    103
 Block first atom:    862
 Blocpdb>     9 atoms in block    104
 Block first atom:    871
 Blocpdb>    14 atoms in block    105
 Block first atom:    880
 Blocpdb>    13 atoms in block    106
 Block first atom:    894
 Blocpdb>     4 atoms in block    107
 Block first atom:    907
 Blocpdb>     9 atoms in block    108
 Block first atom:    911
 Blocpdb>     6 atoms in block    109
 Block first atom:    920
 Blocpdb>     7 atoms in block    110
 Block first atom:    926
 Blocpdb>     7 atoms in block    111
 Block first atom:    933
 Blocpdb>     8 atoms in block    112
 Block first atom:    940
 Blocpdb>     9 atoms in block    113
 Block first atom:    948
 Blocpdb>    11 atoms in block    114
 Block first atom:    957
 Blocpdb>     9 atoms in block    115
 Block first atom:    968
 Blocpdb>    11 atoms in block    116
 Block first atom:    977
 Blocpdb>     9 atoms in block    117
 Block first atom:    988
 Blocpdb>     8 atoms in block    118
 Block first atom:    997
 Blocpdb>     8 atoms in block    119
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>     9 atoms in block    120
 Block first atom:   1013
 Blocpdb>    13 atoms in block    121
 Block first atom:   1022
 Blocpdb>     7 atoms in block    122
 Block first atom:   1035
 Blocpdb>     7 atoms in block    123
 Block first atom:   1042
 Blocpdb>    18 atoms in block    124
 Block first atom:   1049
 Blocpdb>     6 atoms in block    125
 Block first atom:   1067
 Blocpdb>     7 atoms in block    126
 Block first atom:   1073
 Blocpdb>    16 atoms in block    127
 Block first atom:   1080
 Blocpdb>    18 atoms in block    128
 Block first atom:   1096
 Blocpdb>     6 atoms in block    129
 Block first atom:   1114
 Blocpdb>     7 atoms in block    130
 Block first atom:   1120
 Blocpdb>     7 atoms in block    131
 Block first atom:   1127
 Blocpdb>     6 atoms in block    132
 Block first atom:   1134
 Blocpdb>     7 atoms in block    133
 Block first atom:   1140
 Blocpdb>    11 atoms in block    134
 Block first atom:   1147
 Blocpdb>     7 atoms in block    135
 Block first atom:   1158
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   1165
 Blocpdb>    15 atoms in block    137
 Block first atom:   1177
 Blocpdb>    11 atoms in block    138
 Block first atom:   1192
 Blocpdb>     5 atoms in block    139
 Block first atom:   1202

 Blocpdb>   139 blocks.

 Blocpdb> At most,     22 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       460533 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       3621

 Prepmat> Matrix trace    =    1007160.0000
 Prepmat> Last element read:    3621   3621       179.9321
 Prepmat>         9731 lines saved.
 Prepmat>         8124 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1207
 RTB> Total mass =        1207.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1207
 RTB> Number of blocks =   139
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  208823.1786
 RTB>     55731 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      834
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    55731
 Diagstd> Projected matrix trace =  208823.1786

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    834 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 208823.1786
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0721359      0.2110412      0.2771795      1.2939059
      1.5323448      2.9742540      4.2314467      6.1291235      8.0271999
      9.1910526      9.6835235     11.6100960     12.5902130     12.8783043
     14.6088969     14.9478355     16.1760161     16.9420089     17.2916064
     17.8437351     18.1994426     19.4694843     20.0889953     20.8366446
     20.8804205     22.5288152     23.4935700     24.6104296     25.7541754
     25.9627673     27.1383616     29.1892928     30.0365544     31.1618048
     32.5210415     33.0630933     34.8292004     35.8504789     36.4183591
     36.8932509     37.2466319     37.8224281     38.2508513     39.3990839
     40.1929839     41.1813256     42.3692950     43.0488507     43.5557998
     44.4905242     45.6940692     46.0408793     46.1421515     47.1167297
     47.9294712     48.9407281     49.5335195     50.9305141     51.4084088
     54.6292721     55.1543224     55.6666263     55.9186814     57.6979201
     57.8252103     59.2749312     59.4473558     60.1241930     60.2901230
     60.8825178     62.4052933     63.5079222     63.9106829     64.9257015
     65.6326471     66.2262307     66.9893143     67.6607309     68.6643922
     69.2920038     70.2510901     72.7792335     73.7556599     74.9794645
     75.4641144     76.5430097     77.2917379     78.4026998     78.8601337
     80.0651620     81.7152059     82.2447358     82.9464591     83.3247618
     85.1205630     85.3801734     87.1479936     88.0684675     88.3232983
     89.6662084

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034314      0.0034315      0.0034339      0.0034342      0.0034344
      0.0034346     29.1656033     49.8860305     57.1710069    123.5226575
    134.4229820    187.2769424    223.3776488    268.8403590    307.6644511
    329.2137053    337.9185134    370.0097651    385.3113656    389.6948094
    415.0534158    419.8406006    436.7481420    446.9693393    451.5573862
    458.7099538    463.2594884    479.1511162    486.7146166    495.6888752
    496.2093011    515.4237854    526.3441350    538.7098022    551.0856531
    553.3128689    565.7011906    586.6878129    595.1416378    606.1869487
    619.2663801    624.4059334    640.8657058    650.1937058    655.3230853
    659.5819207    662.7332861    667.8362412    671.6079571    681.6137487
    688.4468301    696.8598469    706.8396437    712.4855501    716.6684351
    724.3176058    734.0492479    736.8296355    737.6395611    745.3887777
    751.7900943    759.6796508    764.2665880    774.9689645    778.5963458
    802.6163220    806.4641327    810.2009182    812.0331165    824.8507224
    825.7600933    836.0472247    837.2623289    842.0151589    843.1762499
    847.3085373    857.8394104    865.3847394    868.1244931    874.9910398
    879.7418267    883.7110775    888.7877222    893.2306618    899.8312474
    903.9342465    910.1685276    926.4010082    932.5947293    940.3000243
    943.3340707    950.0534681    954.6887756    961.5254623    964.3263516
    971.6661502    981.6275079    984.8029372    988.9952504    991.2479924
   1001.8726569   1003.3993064   1013.7339157   1019.0734801   1020.5467869
   1028.2759613

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1207
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    139

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9851E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9860E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  7.2136E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2110    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2772    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.294    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.532    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.974    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.231    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.129    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.027    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.191    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.684    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.67    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    834 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99996 0.99998 1.00000 0.99997
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00006
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
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 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
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 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
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 1.00000 1.00001 1.00004 0.99996 1.00002
 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003
 1.00002 1.00001 1.00004 0.99997 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
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 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    21726 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99996 0.99998 1.00000 0.99997
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00006
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00004 0.99996 1.00002
 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003
 1.00002 1.00001 1.00004 0.99997 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003
 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602031635461411591.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602031635461411591.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602031635461411591.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602031635461411591.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    139
            First residue number     =     -7
            Last  residue number     =    131
            Number of atoms found    =   1207
            Mean number per residue  =      8.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9851E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9860E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  7.2136E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2110    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2772    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.294    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.532    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.974    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.231    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.129    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.027    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.191    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.684    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.67    

 Bfactors>  106 vectors,   3621 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.072136
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.603 for    160 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.398 +/-   2.91
 Bfactors> =     12.069 +/-   3.40
 Bfactors> Shiftng-fct=     11.670
 Bfactors> Scaling-fct=      1.171

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602031635461411591.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602031635461411591.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4313E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4314E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   29.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   49.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   57.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   123.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   134.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   187.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   223.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   268.8    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   724.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   737.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   745.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   751.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   759.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   764.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   774.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   778.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   802.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   810.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   825.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   836.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   841.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   843.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   847.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   865.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   875.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   888.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   899.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   903.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   910.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   932.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   940.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   943.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   950.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   954.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   961.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   964.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   971.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   981.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   984.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   989.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   991.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1002.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1003.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1014.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1019.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1020.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1028.    

 Chkmod>  106 vectors,   3621 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1207 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     8 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector     9 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    12 is:   0.9998 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    20 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    23 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    69 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   101 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8152
      0.0034      0.7609
      0.0034      0.8735
      0.0034      0.9815
      0.0034      0.8785
      0.0034      0.7671
     29.1644      0.0247
     49.8790      0.0167
     57.1707      0.0233
    123.5218      0.0255
    134.4021      0.0164
    187.2609      0.0323
    223.3563      0.0206
    268.8261      0.0113
    307.6474      0.1902
    329.1986      0.1274
    337.9123      0.1947
    369.9924      0.3860
    385.2916      0.3139
    389.7037      0.1640
    415.0513      0.3469
    419.8530      0.0474
    436.7832      0.0796
    446.9237      0.3397
    451.5170      0.0510
    458.6423      0.4677
    463.2467      0.5375
    479.1369      0.3038
    486.7059      0.2063
    495.7075      0.6559
    496.1830      0.6097
    515.4152      0.5470
    526.2815      0.3913
    538.6820      0.4627
    551.0173      0.3825
    553.2596      0.4282
    565.6940      0.0256
    586.6697      0.3573
    595.1502      0.2817
    606.1434      0.3797
    619.2299      0.2708
    624.3499      0.0331
    640.8456      0.2490
    650.1615      0.0407
    655.3097      0.2045
    659.5245      0.4059
    662.7348      0.2798
    667.7861      0.2521
    671.5717      0.1316
    681.5924      0.2852
    688.3917      0.3091
    696.8187      0.2946
    706.8152      0.4549
    712.4645      0.2061
    716.6722      0.2410
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    737.5907      0.3489
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    778.5750      0.5263
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    868.0826      0.3538
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    883.6983      0.2101
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   1001.8263      0.2232
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   1020.4839      0.2840
   1028.2536      0.4532
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602031635461411591 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602031635461411591.eigenfacs
2602031635461411591.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2602031635461411591.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.763s
user	0m7.701s
sys	0m0.054s
rm: cannot remove '2602031635461411591.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** LIPID BINDING PROTEIN 11-OCT-10 3P6D ***

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* LIPID BINDING PROTEIN 11-OCT-10 3P6D *
