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* Dimero11_KELEY *

LOGs for ID: 2602040112171505831

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602040112171505831.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602040112171505831.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602040112171505831.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.135576 +/-    19.549951 From:   -41.325000 To:    44.794000
 =     0.616146 +/-    10.967141 From:   -26.417000 To:    31.868000
 =     1.112763 +/-    12.633958 From:   -29.322000 To:    32.685000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8462 % Filled.
 Pdbmat>      1815140  non-zero elements.
 Pdbmat>       198604 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     84.98 +/-     23.48
         Maximum number =    131
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.972080E+06
 Pdbmat> Larger element =  495.313    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
618 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602040112171505831.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602040112171505831.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040112171505831.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4674 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   618 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    29 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    34 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    27 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    38 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    32 atoms in block     11
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     12
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    31 atoms in block     17
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    34 atoms in block     19
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    36 atoms in block     23
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    32 atoms in block     24
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    32 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    35 atoms in block     27
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    35 atoms in block     28
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    35 atoms in block     29
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    27 atoms in block     31
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    951
 Blocpdb>    31 atoms in block     33
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    24 atoms in block     36
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>    29 atoms in block     37
 Block first atom:   1088
 Blocpdb>    35 atoms in block     38
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    27 atoms in block     39
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    27 atoms in block     41
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    27 atoms in block     43
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1279
 Blocpdb>    35 atoms in block     45
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    38 atoms in block     48
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    34 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    33 atoms in block     51
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    35 atoms in block     52
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    31 atoms in block     54
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    29 atoms in block     56
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    35 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1842
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1867
 Blocpdb>    33 atoms in block     64
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1929
 Blocpdb>    32 atoms in block     66
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>    28 atoms in block     67
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    32 atoms in block     70
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    34 atoms in block     71
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   2143
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    36 atoms in block     74
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2234
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2274
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2360
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    34 atoms in block     82
 Block first atom:   2418
 Blocpdb>    27 atoms in block     83
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2479
 Blocpdb>    37 atoms in block     85
 Block first atom:   2514
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2551
 Blocpdb>    31 atoms in block     87
 Block first atom:   2584
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2615
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    25 atoms in block     90
 Block first atom:   2685
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    37 atoms in block     92
 Block first atom:   2742
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2779
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2805
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2830
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    34 atoms in block     97
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2920
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    28 atoms in block    100
 Block first atom:   2977
 Blocpdb>    36 atoms in block    101
 Block first atom:   3005
 Blocpdb>    32 atoms in block    102
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    35 atoms in block    105
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    35 atoms in block    106
 Block first atom:   3164
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   3234
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    26 atoms in block    110
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    31 atoms in block    111
 Block first atom:   3314
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3345
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   3375
 Blocpdb>    24 atoms in block    114
 Block first atom:   3401
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    35 atoms in block    116
 Block first atom:   3454
 Blocpdb>    27 atoms in block    117
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   3516
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3534
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    27 atoms in block    121
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    27 atoms in block    122
 Block first atom:   3616
 Blocpdb>    35 atoms in block    123
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   3709
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3735
 Blocpdb>    32 atoms in block    127
 Block first atom:   3773
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3839
 Blocpdb>    35 atoms in block    130
 Block first atom:   3872
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3907
 Blocpdb>    31 atoms in block    132
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    34 atoms in block    133
 Block first atom:   3966
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   4000
 Blocpdb>    25 atoms in block    135
 Block first atom:   4029
 Blocpdb>    35 atoms in block    136
 Block first atom:   4054
 Blocpdb>    27 atoms in block    137
 Block first atom:   4089
 Blocpdb>    30 atoms in block    138
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    33 atoms in block    139
 Block first atom:   4146
 Blocpdb>    25 atoms in block    140
 Block first atom:   4179
 Blocpdb>    29 atoms in block    141
 Block first atom:   4204
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4233
 Blocpdb>    30 atoms in block    143
 Block first atom:   4266
 Blocpdb>    32 atoms in block    144
 Block first atom:   4296
 Blocpdb>    28 atoms in block    145
 Block first atom:   4328
 Blocpdb>    30 atoms in block    146
 Block first atom:   4356
 Blocpdb>    28 atoms in block    147
 Block first atom:   4386
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4446
 Blocpdb>    24 atoms in block    150
 Block first atom:   4480
 Blocpdb>    31 atoms in block    151
 Block first atom:   4504
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4535
 Blocpdb>    40 atoms in block    153
 Block first atom:   4571
 Blocpdb>    33 atoms in block    154
 Block first atom:   4611
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>     8 atoms in block    156
 Block first atom:   4666

 Blocpdb>   156 blocks.

 Blocpdb> At most,     40 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1815296 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14022

 Prepmat> Matrix trace    =    3972080.0000
 Prepmat> Last element read:   14022  14022       133.5384
 Prepmat>        12247 lines saved.
 Prepmat>        10721 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4674
 RTB> Total mass =        4674.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4674
 RTB> Number of blocks =   156
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  198133.0869
 RTB>     52560 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      936
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    52560
 Diagstd> Projected matrix trace =  198133.0869

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    936 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 198133.0869
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.0898459      1.2336056      1.3112815      1.6394159
      2.4894330      4.5682435      5.0024329      5.3591689      7.5617093
      7.8039720      8.6413322      8.7160264      8.9013559      9.8250665
      9.9733047     10.5410420     11.4542391     11.8910177     12.1905372
     12.7778509     14.6066683     14.7561216     15.1365799     15.7098436
     16.1486605     16.9542128     18.2265498     18.6510483     19.5654947
     20.0083575     20.1623958     20.7614743     21.0167002     21.3477103
     22.0168215     22.3027765     23.3419204     23.5608534     24.5610744
     25.4886876     25.5851032     25.6899368     26.0407993     26.3330100
     26.3938237     26.9428419     28.3474450     28.7694167     28.9116767
     29.0540759     29.5230595     30.2318358     30.6995192     31.8796934
     32.1337426     32.8755681     33.9423285     34.3165789     34.7729794
     35.3430109     36.6839941     37.2260627     38.0298148     38.1707004
     39.1726302     39.3741507     40.4103326     41.4937851     41.7162397
     43.0520509     43.8856580     43.9058900     44.0284483     44.1636422
     44.6427816     45.0053992     45.4638345     45.5125874     45.9119350
     46.4369944     46.8328887     46.9679900     48.1879218     48.6095381
     49.2359254     49.5178198     49.5994954     50.4460823     50.8331658
     51.0550363     52.5682423     53.1779886     53.5596994     54.0225346
     55.0574270     55.4945865     55.8200992     56.2919292     56.5713689
     56.7213576

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034332      0.0034339      0.0034341      0.0034343      0.0034347
      0.0034348    113.3646949    120.6100339    124.3492720    139.0400314
    171.3347694    232.0972008    242.8767361    251.3876876    298.6106332
    303.3563779    319.2167209    320.5933787    323.9838517    340.3792123
    342.9373783    352.5632588    367.5178209    374.4594487    379.1461949
    388.1719844    415.0217561    417.1395740    422.4829226    430.4088684
    436.3786889    447.1302943    463.6043620    468.9719890    480.3310885
    485.7367909    487.6029772    494.7939433    497.8259651    501.7309950
    509.5333222    512.8315624    524.6426250    527.0972971    538.1693511
    548.2378528    549.2737785    550.3979379    554.1437454    557.2441685
    557.8872503    563.6596956    578.1655903    582.4528952    583.8911859
    585.3273445    590.0325364    597.0731481    601.6737543    613.1296919
    615.5678590    622.6326824    632.6537641    636.1320442    640.3482570
    645.5755186    657.7087015    662.5502653    669.6646676    670.9039439
    679.6520745    681.3980396    690.3057530    699.4985312    701.3710848
    712.5120321    719.3770650    719.5428674    720.5464294    721.6518375
    725.5559425    728.4967009    732.1976177    732.5900965    735.7971118
    739.9925229    743.1401974    744.2113131    753.8143122    757.1048484
    761.9672982    764.1454613    764.7753995    771.2745526    774.2279743
    775.9157629    787.3303774    791.8833897    794.7203714    798.1467665
    805.7554210    808.9479712    811.3170118    814.7387019    816.7584270
    817.8404538

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4674
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    156

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9957E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.090    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.234    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.311    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.639    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.489    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.568    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.002    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.359    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.562    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.804    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.641    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.716    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.901    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.825    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.973    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.72    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    936 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 0.99996
 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 1.00002
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00004
 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    84132 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 0.99996
 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 1.00002
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00004
 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040112171505831.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040112171505831.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602040112171505831.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040112171505831.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9957E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.090    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.234    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.311    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.639    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.489    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.568    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.002    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.359    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.562    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.804    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.641    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.716    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.901    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.825    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.973    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.72    

 Bfactors>  106 vectors,  14022 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.090000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.639 for    618 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.026 +/-   0.07
 Bfactors> =     88.994 +/-  10.29
 Bfactors> Shiftng-fct=     88.968
 Bfactors> Scaling-fct=    138.340

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040112171505831.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040112171505831.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   719.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   720.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   735.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   798.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   805.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   808.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   811.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   814.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   816.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.8    

 Chkmod>  106 vectors,  14022 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4674 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7877
      0.0034      0.9512
      0.0034      0.7154
      0.0034      0.7773
      0.0034      0.9820
      0.0034      0.7516
    113.3678      0.2570
    120.6241      0.1222
    124.3306      0.2986
    139.0164      0.0088
    171.3125      0.7114
    232.0811      0.7524
    242.8558      0.7829
    251.3729      0.7943
    298.6036      0.0156
    303.3439      0.0077
    319.1969      0.0613
    320.5791      0.0254
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    340.3634      0.0878
    342.9174      0.2343
    352.5307      0.1835
    367.4340      0.2217
    374.4273      0.1386
    379.1216      0.2489
    388.1880      0.3209
    415.0513      0.1507
    417.1765      0.1644
    422.5125      0.3934
    430.3925      0.4348
    436.3781      0.0655
    447.0555      0.0432
    463.6283      0.4205
    468.9387      0.4681
    480.3658      0.0042
    485.7359      0.4170
    487.5531      0.4297
    494.7551      0.3694
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    501.7364      0.4505
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    670.8690      0.4481
    679.6001      0.3925
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    721.5911      0.4792
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    732.5378      0.5697
    735.7500      0.5438
    739.9847      0.6143
    743.0854      0.4947
    744.1953      0.4111
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    817.7956      0.5523
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602040112171505831 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2602040112171505831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2602040112171505831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602040112171505831.eigenfacs
2602040112171505831.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m16.000s
user	0m15.894s
sys	0m0.094s
rm: cannot remove '2602040112171505831.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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