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* Dimero17_KELEY *

LOGs for ID: 2602040113391508286

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602040113391508286.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602040113391508286.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602040113391508286.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -1.796247 +/-    11.202178 From:   -27.316000 To:    26.390000
 =     0.336938 +/-     9.910920 From:   -26.528000 To:    24.862000
 =     1.548374 +/-    21.693355 From:   -45.260000 To:    47.002000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8682 % Filled.
 Pdbmat>      1836755  non-zero elements.
 Pdbmat>       201004 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     86.01 +/-     23.10
         Maximum number =    131
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   = 4.020080E+06
 Pdbmat> Larger element =  494.749    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
618 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602040113391508286.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602040113391508286.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040113391508286.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4674 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   618 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    29 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    34 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    27 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    38 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    32 atoms in block     11
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     12
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    31 atoms in block     17
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    34 atoms in block     19
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    36 atoms in block     23
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    32 atoms in block     24
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    32 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    35 atoms in block     27
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    35 atoms in block     28
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    35 atoms in block     29
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    27 atoms in block     31
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    951
 Blocpdb>    31 atoms in block     33
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    24 atoms in block     36
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>    29 atoms in block     37
 Block first atom:   1088
 Blocpdb>    35 atoms in block     38
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    27 atoms in block     39
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    27 atoms in block     41
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    27 atoms in block     43
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1279
 Blocpdb>    35 atoms in block     45
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    38 atoms in block     48
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    34 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    33 atoms in block     51
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    35 atoms in block     52
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    31 atoms in block     54
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    29 atoms in block     56
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    35 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1842
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1867
 Blocpdb>    33 atoms in block     64
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1929
 Blocpdb>    32 atoms in block     66
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>    28 atoms in block     67
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    32 atoms in block     70
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    34 atoms in block     71
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   2143
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    36 atoms in block     74
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2234
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2274
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2360
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    34 atoms in block     82
 Block first atom:   2418
 Blocpdb>    27 atoms in block     83
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2479
 Blocpdb>    37 atoms in block     85
 Block first atom:   2514
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2551
 Blocpdb>    31 atoms in block     87
 Block first atom:   2584
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2615
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    25 atoms in block     90
 Block first atom:   2685
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    37 atoms in block     92
 Block first atom:   2742
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2779
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2805
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2830
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    34 atoms in block     97
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2920
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    28 atoms in block    100
 Block first atom:   2977
 Blocpdb>    36 atoms in block    101
 Block first atom:   3005
 Blocpdb>    32 atoms in block    102
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    35 atoms in block    105
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    35 atoms in block    106
 Block first atom:   3164
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   3234
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    26 atoms in block    110
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    31 atoms in block    111
 Block first atom:   3314
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3345
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   3375
 Blocpdb>    24 atoms in block    114
 Block first atom:   3401
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    35 atoms in block    116
 Block first atom:   3454
 Blocpdb>    27 atoms in block    117
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   3516
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3534
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    27 atoms in block    121
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    27 atoms in block    122
 Block first atom:   3616
 Blocpdb>    35 atoms in block    123
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   3709
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3735
 Blocpdb>    32 atoms in block    127
 Block first atom:   3773
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3839
 Blocpdb>    35 atoms in block    130
 Block first atom:   3872
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3907
 Blocpdb>    31 atoms in block    132
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    34 atoms in block    133
 Block first atom:   3966
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   4000
 Blocpdb>    25 atoms in block    135
 Block first atom:   4029
 Blocpdb>    35 atoms in block    136
 Block first atom:   4054
 Blocpdb>    27 atoms in block    137
 Block first atom:   4089
 Blocpdb>    30 atoms in block    138
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    33 atoms in block    139
 Block first atom:   4146
 Blocpdb>    25 atoms in block    140
 Block first atom:   4179
 Blocpdb>    29 atoms in block    141
 Block first atom:   4204
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4233
 Blocpdb>    30 atoms in block    143
 Block first atom:   4266
 Blocpdb>    32 atoms in block    144
 Block first atom:   4296
 Blocpdb>    28 atoms in block    145
 Block first atom:   4328
 Blocpdb>    30 atoms in block    146
 Block first atom:   4356
 Blocpdb>    28 atoms in block    147
 Block first atom:   4386
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4446
 Blocpdb>    24 atoms in block    150
 Block first atom:   4480
 Blocpdb>    31 atoms in block    151
 Block first atom:   4504
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4535
 Blocpdb>    40 atoms in block    153
 Block first atom:   4571
 Blocpdb>    33 atoms in block    154
 Block first atom:   4611
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>     8 atoms in block    156
 Block first atom:   4666

 Blocpdb>   156 blocks.

 Blocpdb> At most,     40 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1836911 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14022

 Prepmat> Matrix trace    =    4020080.0000
 Prepmat> Last element read:   14022  14022       108.2828
 Prepmat>        12247 lines saved.
 Prepmat>        10696 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4674
 RTB> Total mass =        4674.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4674
 RTB> Number of blocks =   156
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  201619.6320
 RTB>     53460 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      936
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    53460
 Diagstd> Projected matrix trace =  201619.6320

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    936 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 201619.6320
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.2407779      1.5216146      1.9996479      4.3386684
      6.1401476      6.7574654      8.9508444      9.3726887      9.8078193
     10.3964755     11.5407160     11.8361523     12.1900392     12.5521545
     14.4526285     15.3076928     15.6414497     16.1208626     16.5657320
     16.8202405     18.7569746     19.0438714     19.5061706     19.8961794
     20.0607409     20.4527821     21.1852326     21.7704835     22.2361207
     22.6338172     22.7806737     22.9158201     24.1146169     24.3101309
     25.2162688     25.3506313     26.2030964     26.2855376     26.7800844
     27.6830392     28.3767899     28.8291482     29.2679805     29.6864747
     30.2533997     31.0115668     31.1297387     32.4664592     32.8906136
     33.1035598     34.1438547     34.7909448     35.5631855     36.5969242
     36.8621575     37.8134709     38.1932708     38.9446605     39.1067405
     39.9657367     40.4547023     40.8470056     41.2241283     41.7539162
     43.3560362     43.6415973     44.1043151     44.2776827     44.8038073
     45.1837636     45.9418904     46.4385926     46.7903236     46.9588831
     47.1585515     47.2930765     48.2013893     49.5033404     50.2385078
     50.7788832     51.1878797     51.8654761     52.4979634     52.6041288
     52.7515490     53.0409873     53.4387388     53.7681647     54.5032928
     54.6262045     55.2577943     55.5878505     56.4729663     57.2746087
     58.3181360     59.1312225     59.3744709     60.4410956     60.5044431
     60.6072304

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034322      0.0034329      0.0034346      0.0034352      0.0034353
      0.0034356    120.9601447    133.9515121    153.5578588    226.1900563
    269.0820234    282.2846067    324.8832231    332.4507959    340.0803262
    350.1372748    368.9025497    373.5945672    379.1384516    384.7285527
    412.8275759    424.8642111    429.4709389    436.0029408    441.9779428
    445.3601773    470.3018377    473.8849321    479.6023361    484.3732211
    486.3722236    491.1017439    499.8180075    506.6748148    512.0646454
    516.6235294    518.2968414    519.8319665    533.2556477    535.4130212
    545.3002456    546.7511053    555.8678896    556.7416495    561.9546266
    571.3499113    578.4647677    583.0572303    587.4780691    591.6632494
    597.2860514    604.7239019    605.8749797    618.7464833    622.7751398
    624.7879279    634.5291165    640.5136536    647.5832508    656.9276982
    659.3039165    667.7571577    671.1022680    677.6715307    679.0802343
    686.4978664    690.6846192    694.0254441    697.2219011    701.6877393
    715.0230882    717.3739448    721.1669598    722.5829705    726.8632985
    729.9388544    736.0371091    740.0052569    742.8024108    744.1391599
    745.7195153    746.7823821    753.9196418    764.0337316    769.6861039
    773.8144808    776.9245600    782.0498998    786.8039077    787.5990732
    788.7019030    790.8626763    793.8224556    796.2654764    801.6903400
    802.5937871    807.2202593    809.6274434    816.0477661    821.8193179
    829.2721826    835.0331355    836.7489123    844.2312894    844.6735873
    845.3907650

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4674
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    156

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9899E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9940E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.241    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.522    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.000    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.339    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.140    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.757    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.951    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.373    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.808    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.61    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    936 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001
 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00005 0.99999
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    84132 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001
 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00005 0.99999
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040113391508286.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040113391508286.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602040113391508286.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040113391508286.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9899E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9940E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.241    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.522    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.000    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.339    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.140    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.757    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.951    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.373    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.808    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.61    

 Bfactors>  106 vectors,  14022 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.241000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.470 for    618 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.019 +/-   0.02
 Bfactors> =     88.791 +/-   9.49
 Bfactors> Shiftng-fct=     88.773
 Bfactors> Scaling-fct=    431.468

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040113391508286.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040113391508286.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   659.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   742.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   821.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   829.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   835.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   836.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.4    

 Chkmod>  106 vectors,  14022 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4674 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector   104 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8872
      0.0034      0.7502
      0.0034      0.7612
      0.0034      0.9172
      0.0034      0.8489
      0.0034      0.9226
    120.9658      0.7514
    133.9627      0.7224
    153.5648      0.7313
    226.1890      0.7448
    269.0672      0.7756
    282.2628      0.7440
    324.8721      0.0116
    332.4420      0.3219
    340.0689      0.0152
    350.1816      0.2576
    368.8753      0.3957
    373.6392      0.3334
    379.1216      0.3182
    384.6790      0.2216
    412.7723      0.1768
    424.8780      0.3031
    429.4326      0.1971
    435.9726      0.1649
    442.0159      0.4359
    445.3379      0.0885
    470.3196      0.3800
    473.8164      0.2733
    479.6288      0.3660
    484.3989      0.2193
    486.3424      0.2848
    491.0473      0.2593
    499.8528      0.4927
    506.6474      0.3559
    512.0873      0.0064
    516.5578      0.2365
    518.2669      0.3807
    519.8571      0.5706
    533.1817      0.5972
    535.3886      0.5748
    545.3172      0.4468
    546.7208      0.4671
    555.8112      0.5082
    556.7650      0.5143
    561.9296      0.2806
    571.2940      0.2580
    578.4727      0.1712
    583.0408      0.4429
    587.4731      0.4772
    591.6730      0.1646
    597.2269      0.1224
    604.6827      0.1035
    605.8515      0.3620
    618.7537      0.3785
    622.7426      0.4852
    624.7275      0.5295
    634.4661      0.2749
    640.4775      0.3485
    647.5264      0.2883
    656.9271      0.3800
    659.2563      0.4749
    667.6978      0.3287
    671.0447      0.3785
    677.6019      0.3889
    679.0794      0.4575
    686.5050      0.5325
    690.6148      0.3559
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    697.1571      0.2556
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    717.3300      0.4310
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    722.5709      0.4631
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    729.8771      0.2480
    735.9904      0.1859
    739.9847      0.3866
    742.7680      0.3545
    744.1161      0.5136
    745.6990      0.5116
    746.7260      0.4425
    753.8764      0.5579
    763.9752      0.4871
    769.6645      0.4703
    773.7898      0.4766
    776.9073      0.5738
    782.0504      0.5456
    786.7854      0.3903
    787.5344      0.5060
    788.6565      0.5189
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    844.6063      0.4218
    845.3738      0.4523
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602040113391508286 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602040113391508286.eigenfacs
2602040113391508286.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2602040113391508286.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602040113391508286.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m15.389s
user	0m15.287s
sys	0m0.098s
rm: cannot remove '2602040113391508286.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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