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* Dimero19_KELEY *

LOGs for ID: 2602040114081509563

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602040114081509563.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602040114081509563.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602040114081509563.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     0.389972 +/-    10.305354 From:   -26.359000 To:    25.478000
 =     1.828275 +/-    21.585601 From:   -44.634000 To:    48.164000
 =    -0.845314 +/-    12.119937 From:   -33.064000 To:    29.382000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8475 % Filled.
 Pdbmat>      1816399  non-zero elements.
 Pdbmat>       198735 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     85.04 +/-     23.32
         Maximum number =    132
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.974700E+06
 Pdbmat> Larger element =  490.114    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
618 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602040114081509563.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602040114081509563.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040114081509563.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4674 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   618 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    29 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    34 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    27 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    38 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    32 atoms in block     11
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     12
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    31 atoms in block     17
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    34 atoms in block     19
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    36 atoms in block     23
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    32 atoms in block     24
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    32 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    35 atoms in block     27
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    35 atoms in block     28
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    35 atoms in block     29
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    27 atoms in block     31
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    951
 Blocpdb>    31 atoms in block     33
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    24 atoms in block     36
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>    29 atoms in block     37
 Block first atom:   1088
 Blocpdb>    35 atoms in block     38
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    27 atoms in block     39
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    27 atoms in block     41
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    27 atoms in block     43
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1279
 Blocpdb>    35 atoms in block     45
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    38 atoms in block     48
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    34 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    33 atoms in block     51
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    35 atoms in block     52
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    31 atoms in block     54
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    29 atoms in block     56
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    35 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1842
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1867
 Blocpdb>    33 atoms in block     64
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1929
 Blocpdb>    32 atoms in block     66
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>    28 atoms in block     67
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    32 atoms in block     70
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    34 atoms in block     71
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   2143
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    36 atoms in block     74
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2234
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2274
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2360
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    34 atoms in block     82
 Block first atom:   2418
 Blocpdb>    27 atoms in block     83
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2479
 Blocpdb>    37 atoms in block     85
 Block first atom:   2514
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2551
 Blocpdb>    31 atoms in block     87
 Block first atom:   2584
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2615
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    25 atoms in block     90
 Block first atom:   2685
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    37 atoms in block     92
 Block first atom:   2742
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2779
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2805
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2830
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    34 atoms in block     97
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2920
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    28 atoms in block    100
 Block first atom:   2977
 Blocpdb>    36 atoms in block    101
 Block first atom:   3005
 Blocpdb>    32 atoms in block    102
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    35 atoms in block    105
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    35 atoms in block    106
 Block first atom:   3164
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   3234
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    26 atoms in block    110
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    31 atoms in block    111
 Block first atom:   3314
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3345
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   3375
 Blocpdb>    24 atoms in block    114
 Block first atom:   3401
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    35 atoms in block    116
 Block first atom:   3454
 Blocpdb>    27 atoms in block    117
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   3516
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3534
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    27 atoms in block    121
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    27 atoms in block    122
 Block first atom:   3616
 Blocpdb>    35 atoms in block    123
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   3709
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3735
 Blocpdb>    32 atoms in block    127
 Block first atom:   3773
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3839
 Blocpdb>    35 atoms in block    130
 Block first atom:   3872
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3907
 Blocpdb>    31 atoms in block    132
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    34 atoms in block    133
 Block first atom:   3966
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   4000
 Blocpdb>    25 atoms in block    135
 Block first atom:   4029
 Blocpdb>    35 atoms in block    136
 Block first atom:   4054
 Blocpdb>    27 atoms in block    137
 Block first atom:   4089
 Blocpdb>    30 atoms in block    138
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    33 atoms in block    139
 Block first atom:   4146
 Blocpdb>    25 atoms in block    140
 Block first atom:   4179
 Blocpdb>    29 atoms in block    141
 Block first atom:   4204
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4233
 Blocpdb>    30 atoms in block    143
 Block first atom:   4266
 Blocpdb>    32 atoms in block    144
 Block first atom:   4296
 Blocpdb>    28 atoms in block    145
 Block first atom:   4328
 Blocpdb>    30 atoms in block    146
 Block first atom:   4356
 Blocpdb>    28 atoms in block    147
 Block first atom:   4386
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4446
 Blocpdb>    24 atoms in block    150
 Block first atom:   4480
 Blocpdb>    31 atoms in block    151
 Block first atom:   4504
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4535
 Blocpdb>    40 atoms in block    153
 Block first atom:   4571
 Blocpdb>    33 atoms in block    154
 Block first atom:   4611
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>     8 atoms in block    156
 Block first atom:   4666

 Blocpdb>   156 blocks.

 Blocpdb> At most,     40 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1816555 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14022

 Prepmat> Matrix trace    =    3974700.0000
 Prepmat> Last element read:   14022  14022       166.3213
 Prepmat>        12247 lines saved.
 Prepmat>        10725 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4674
 RTB> Total mass =        4674.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4674
 RTB> Number of blocks =   156
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  198529.2984
 RTB>     52416 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      936
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    52416
 Diagstd> Projected matrix trace =  198529.2984

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    936 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 198529.2984
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.7980919      0.9112340      1.5858560      3.0195568
      3.5445652      5.6459028      9.1388580      9.5494460      9.9291762
     10.3013695     10.7722392     11.2448790     12.2333147     12.6259559
     13.7530548     13.8255843     14.5938427     15.0057155     15.7286237
     16.6129825     17.4309093     17.5754500     18.4126115     18.6248927
     19.3772771     19.9690407     20.2219023     20.5968941     21.2102901
     21.6222427     21.8844025     22.0417292     22.9162466     23.3050966
     24.2688417     25.1719974     25.2242184     25.5921087     25.9007457
     26.1791484     27.3825158     27.9113886     27.9957063     29.1331751
     29.3125627     29.3671979     30.3220267     30.7790886     32.1114111
     32.2760993     32.7064858     33.0499305     34.0533340     34.6976495
     35.2203369     36.0940547     36.5774182     36.8334770     38.4599796
     38.8274348     39.0099033     39.1701954     39.7572093     40.2969742
     42.0291014     42.5169067     42.6083209     43.0928746     43.6453504
     43.8522730     44.1364952     44.3722738     44.8582555     45.8630678
     46.2260766     46.2939510     46.7437475     46.8997233     47.0913074
     47.2771336     48.7241149     49.2233275     49.3403707     50.3964600
     51.2259665     52.0080263     52.1842017     52.2677270     52.6317864
     52.8455404     53.5995905     54.4175963     54.6153427     55.3905476
     55.6960879     56.7810295     56.8078608     57.5576442     57.6302563
     58.2541025

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034321      0.0034329      0.0034330      0.0034333      0.0034336
      0.0034337     97.0111668    103.6597676    136.7499418    188.6978192
    204.4451283    258.0251135    328.2775966    335.5709587    342.1778474
    348.5320830    356.4086824    364.1435930    379.8108384    385.8579159
    402.7122741    403.7727700    414.8395079    420.6526547    430.6660540
    442.6078213    453.3726330    455.2484831    465.9646548    468.6430384
    478.0151438    485.2593152    488.3219925    492.8288784    500.1135074
    504.9468291    507.9987312    509.8214589    519.8368034    524.2286278
    534.9581457    544.8213516    545.3861929    549.3489716    552.6515782
    555.6138172    568.2401987    573.7015222    574.5674178    586.1235746
    587.9253343    588.4729909    597.9631116    602.4529814    615.3539256
    616.9298754    621.0294880    624.2816299    633.6874396    639.6542774
    644.4541622    652.3987439    656.7526048    659.0473820    673.4413902
    676.6508474    678.2389351    679.6309514    684.7045701    689.3368561
    703.9962283    708.0698635    708.8306529    712.8497684    717.4047904
    719.1033883    721.4300065    723.3543912    727.3048279    735.4054279
    738.3100796    738.8519161    742.4326179    743.6702710    745.1876597
    746.6564979    757.9966034    761.8698103    762.7750596    770.8951192
    777.2135452    783.1238791    784.4491604    785.0766983    787.8060933
    789.4042351    795.0162691    801.0598365    802.5139897    808.1893249
    810.4152893    818.2705322    818.4638418    823.8474190    824.3669190
    828.8167855

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4674
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    156

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9892E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9980E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7981    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9112    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.586    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.020    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.545    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.646    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.139    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.549    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.929    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.25    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    936 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    84132 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040114081509563.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040114081509563.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602040114081509563.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040114081509563.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9892E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9980E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7981    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9112    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.586    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.020    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.545    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.646    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.139    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.549    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.25    

 Bfactors>  106 vectors,  14022 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.798100
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.514 for    618 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.023 +/-   0.02
 Bfactors> =     89.107 +/-   9.29
 Bfactors> Shiftng-fct=     89.083
 Bfactors> Scaling-fct=    427.502

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040114081509563.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040114081509563.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4320E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   723.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   727.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   735.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   738.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   745.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   808.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   823.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.8    

 Chkmod>  106 vectors,  14022 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4674 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7519
      0.0034      0.7565
      0.0034      0.9100
      0.0034      0.9006
      0.0034      0.7128
      0.0034      0.8186
     97.0075      0.7724
    103.6534      0.7528
    136.7503      0.7359
    188.7036      0.7992
    204.4489      0.7841
    258.0163      0.7907
    328.2661      0.3922
    335.5487      0.3927
    342.1601      0.1488
    348.4940      0.0464
    356.3563      0.1104
    364.0490      0.4121
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    385.9031      0.2583
    402.6503      0.2826
    403.8199      0.3789
    414.7671      0.3093
    420.6946      0.3115
    430.6664      0.4213
    442.5491      0.3471
    453.3413      0.2888
    455.2879      0.1489
    465.9116      0.2756
    468.5614      0.2432
    478.0282      0.3599
    485.2501      0.3254
    488.2781      0.4349
    492.8449      0.4753
    500.0886      0.4799
    504.8990      0.4059
    507.9258      0.2657
    509.7796      0.3310
    519.8571      0.4866
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    712.7954      0.4516
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    735.3493      0.4822
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    738.7887      0.4135
    742.3710      0.4074
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    745.1453      0.3342
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    824.3297      0.4138
    828.7520      0.5634
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602040114081509563 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2602040114081509563.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2602040114081509563.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602040114081509563.eigenfacs
2602040114081509563.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m15.910s
user	0m15.788s
sys	0m0.108s
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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