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* Dimero21_KELEY *

LOGs for ID: 2602040114331510563

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602040114331510563.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602040114331510563.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602040114331510563.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     0.580075 +/-    16.730397 From:   -38.306000 To:    39.183000
 =    -0.850106 +/-    14.064390 From:   -31.846000 To:    30.067000
 =     0.642203 +/-    11.700365 From:   -27.422000 To:    31.228000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8710 % Filled.
 Pdbmat>      1839523  non-zero elements.
 Pdbmat>       201311 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     86.14 +/-     23.18
         Maximum number =    132
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 4.026220E+06
 Pdbmat> Larger element =  491.604    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
618 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602040114331510563.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602040114331510563.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040114331510563.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4674 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   618 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    29 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    34 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    27 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    38 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    32 atoms in block     11
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     12
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    31 atoms in block     17
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    34 atoms in block     19
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    36 atoms in block     23
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    32 atoms in block     24
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    32 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    35 atoms in block     27
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    35 atoms in block     28
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    35 atoms in block     29
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    27 atoms in block     31
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    951
 Blocpdb>    31 atoms in block     33
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    24 atoms in block     36
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>    29 atoms in block     37
 Block first atom:   1088
 Blocpdb>    35 atoms in block     38
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    27 atoms in block     39
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    27 atoms in block     41
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    27 atoms in block     43
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1279
 Blocpdb>    35 atoms in block     45
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    38 atoms in block     48
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    34 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    33 atoms in block     51
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    35 atoms in block     52
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    31 atoms in block     54
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    29 atoms in block     56
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    35 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1842
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1867
 Blocpdb>    33 atoms in block     64
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1929
 Blocpdb>    32 atoms in block     66
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>    28 atoms in block     67
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    32 atoms in block     70
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    34 atoms in block     71
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   2143
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    36 atoms in block     74
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2234
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2274
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2360
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    34 atoms in block     82
 Block first atom:   2418
 Blocpdb>    27 atoms in block     83
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2479
 Blocpdb>    37 atoms in block     85
 Block first atom:   2514
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2551
 Blocpdb>    31 atoms in block     87
 Block first atom:   2584
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2615
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    25 atoms in block     90
 Block first atom:   2685
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    37 atoms in block     92
 Block first atom:   2742
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2779
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2805
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2830
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    34 atoms in block     97
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2920
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    28 atoms in block    100
 Block first atom:   2977
 Blocpdb>    36 atoms in block    101
 Block first atom:   3005
 Blocpdb>    32 atoms in block    102
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    35 atoms in block    105
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    35 atoms in block    106
 Block first atom:   3164
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   3234
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    26 atoms in block    110
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    31 atoms in block    111
 Block first atom:   3314
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3345
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   3375
 Blocpdb>    24 atoms in block    114
 Block first atom:   3401
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    35 atoms in block    116
 Block first atom:   3454
 Blocpdb>    27 atoms in block    117
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   3516
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3534
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    27 atoms in block    121
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    27 atoms in block    122
 Block first atom:   3616
 Blocpdb>    35 atoms in block    123
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   3709
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3735
 Blocpdb>    32 atoms in block    127
 Block first atom:   3773
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3839
 Blocpdb>    35 atoms in block    130
 Block first atom:   3872
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3907
 Blocpdb>    31 atoms in block    132
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    34 atoms in block    133
 Block first atom:   3966
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   4000
 Blocpdb>    25 atoms in block    135
 Block first atom:   4029
 Blocpdb>    35 atoms in block    136
 Block first atom:   4054
 Blocpdb>    27 atoms in block    137
 Block first atom:   4089
 Blocpdb>    30 atoms in block    138
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    33 atoms in block    139
 Block first atom:   4146
 Blocpdb>    25 atoms in block    140
 Block first atom:   4179
 Blocpdb>    29 atoms in block    141
 Block first atom:   4204
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4233
 Blocpdb>    30 atoms in block    143
 Block first atom:   4266
 Blocpdb>    32 atoms in block    144
 Block first atom:   4296
 Blocpdb>    28 atoms in block    145
 Block first atom:   4328
 Blocpdb>    30 atoms in block    146
 Block first atom:   4356
 Blocpdb>    28 atoms in block    147
 Block first atom:   4386
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4446
 Blocpdb>    24 atoms in block    150
 Block first atom:   4480
 Blocpdb>    31 atoms in block    151
 Block first atom:   4504
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4535
 Blocpdb>    40 atoms in block    153
 Block first atom:   4571
 Blocpdb>    33 atoms in block    154
 Block first atom:   4611
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>     8 atoms in block    156
 Block first atom:   4666

 Blocpdb>   156 blocks.

 Blocpdb> At most,     40 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1839679 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14022

 Prepmat> Matrix trace    =    4026220.0000
 Prepmat> Last element read:   14022  14022       175.4713
 Prepmat>        12247 lines saved.
 Prepmat>        10693 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4674
 RTB> Total mass =        4674.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4674
 RTB> Number of blocks =   156
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  201576.0489
 RTB>     53568 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      936
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    53568
 Diagstd> Projected matrix trace =  201576.0489

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    936 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 201576.0489
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.7749980      2.4638646      2.9270597      6.6568707
      6.8044717      7.5174567      8.7710995      9.4383346      9.4580531
     10.5708344     11.6673376     12.0126277     12.3258631     12.9148832
     14.5670790     14.8673194     15.0840072     15.9142717     16.9277723
     17.4660527     18.2542543     18.6097279     18.8045588     19.5613646
     19.8637289     20.6413441     21.0553224     21.5498635     22.4861693
     22.9192723     23.0395608     23.8536795     24.0911722     24.3001186
     25.7217110     25.8425585     26.1494068     26.6091623     27.1932541
     27.6402724     29.0718946     29.3397340     29.9400840     30.6225187
     30.6454567     31.5004615     32.1085044     32.7083091     32.7960131
     33.2827466     33.6300255     33.7465387     34.1462120     34.5306482
     36.6079930     36.7063227     38.4315304     39.8349375     40.0922270
     40.6121743     40.9083516     41.3510983     42.4906318     42.8467848
     43.2366019     43.3762599     43.6583075     44.4318382     44.6295698
     44.8813485     45.8419434     46.2460115     46.6683559     46.8334440
     47.0044677     47.4638722     48.5747700     49.0948199     49.6499259
     50.1817436     50.5323927     51.5900927     51.6307893     51.7357149
     52.6376425     52.9233054     53.1025474     54.1270228     55.0357400
     55.5987438     55.7742159     56.0359710     56.5555903     57.1839341
     57.8327471     58.3550055     59.1922650     59.3709585     60.3538303
     60.8778589

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034322      0.0034337      0.0034340      0.0034341      0.0034351
      0.0034351    144.6752425    170.4526259    185.7851803    280.1756187
    283.2647202    297.7355882    321.6046343    333.6129990    333.9613088
    353.0611373    370.9207789    376.3693843    381.2448189    390.2478531
    414.4589457    418.7083449    421.7485957    433.2002157    446.7815022
    453.8294387    463.9565690    468.4522095    470.8980088    480.2803898
    483.9780554    493.3603763    498.2831805    504.1009803    514.9357198
    519.8711207    521.2335694    530.3626964    532.9963640    535.3027530
    550.7382080    552.0304505    555.2981176    560.1584365    566.2730210
    570.9084086    585.5068059    588.1977598    594.1851421    600.9187216
    601.1437405    609.4719718    615.3260749    621.0467981    621.8788777
    626.4766077    629.7365186    630.8264544    634.5510195    638.1130783
    657.0270355    657.9088365    673.1922685    685.3735662    687.5833798
    692.0275762    694.5464093    698.2947949    707.8510400    710.8114245
    714.0375602    715.1898321    717.5112718    723.8397363    725.4485729
    727.4920120    735.2360456    738.4692596    741.8336527    743.1446030
    744.5002534    748.1296435    756.8340394    760.8746518    765.1640947
    769.2511494    771.9340741    779.9709621    780.2785398    781.0709893
    787.8499203    789.9848463    791.3214860    798.9182651    805.5967127
    809.7067692    810.9834979    812.8842917    816.6445162    821.1685265
    825.8139052    829.5342794    835.4640357    836.7241627    843.6216160
    847.2761179

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4674
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    156

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9896E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.775    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.464    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.927    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.657    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.804    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.517    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.771    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.438    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.458    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.88    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    936 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 1.00000
 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    84132 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 1.00000
 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040114331510563.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040114331510563.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602040114331510563.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040114331510563.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9896E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.775    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.464    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.927    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.657    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.804    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.517    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.771    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.438    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.458    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.88    

 Bfactors>  106 vectors,  14022 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.775000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.473 for    618 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.016 +/-   0.02
 Bfactors> =     88.477 +/-  10.15
 Bfactors> Shiftng-fct=     88.461
 Bfactors> Scaling-fct=    488.114

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040114331510563.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040114331510563.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4320E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   821.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   829.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   835.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   836.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   843.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   847.3    

 Chkmod>  106 vectors,  14022 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4674 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    52 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8171
      0.0034      0.8908
      0.0034      0.8197
      0.0034      0.7647
      0.0034      0.7181
      0.0034      0.8811
    144.6691      0.7090
    170.4500      0.6713
    185.7753      0.7303
    280.1663      0.7328
    283.2427      0.7206
    297.7138      0.7449
    321.5890      0.0126
    333.5928      0.4008
    333.9460      0.0125
    353.0320      0.2721
    370.9472      0.4574
    376.3121      0.3118
    381.2924      0.3661
    390.1573      0.2213
    414.4827      0.2741
    418.7281      0.2868
    421.6745      0.3333
    433.1235      0.3041
    446.7917      0.1028
    453.8612      0.1359
    463.8826      0.1374
    468.4355      0.1495
    470.8207      0.3442
    480.2430      0.2140
    483.9119      0.3638
    493.3231      0.3718
    498.3171      0.2995
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    514.9575      0.5580
    519.8571      0.3867
    521.2162      0.5978
    530.2990      0.7623
    532.9605      0.3484
    535.2785      0.2731
    550.6962      0.3882
    551.9794      0.5005
    555.2806      0.4708
    560.1432      0.5272
    566.2148      0.5040
    570.8811      0.3454
    585.4626      0.1443
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    600.8682      0.4987
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    630.8317      0.5729
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    673.1500      0.3920
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    756.7644      0.3790
    760.8046      0.2960
    765.1318      0.4584
    769.2048      0.6193
    771.8827      0.5996
    779.9368      0.3498
    780.2391      0.5789
    781.0698      0.5458
    787.8337      0.5402
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    847.2546      0.4936
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602040114331510563 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m16.611s
user	0m16.485s
sys	0m0.116s
rm: cannot remove '2602040114331510563.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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