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* Dimero24_KELEY *

LOGs for ID: 2602040115101512187

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602040115101512187.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602040115101512187.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602040115101512187.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.075418 +/-    16.841954 From:   -37.603000 To:    39.905000
 =    -0.478425 +/-    15.511934 From:   -38.020000 To:    36.254000
 =     0.038686 +/-    10.535701 From:   -26.130000 To:    26.420000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8626 % Filled.
 Pdbmat>      1831215  non-zero elements.
 Pdbmat>       200379 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     85.74 +/-     23.37
         Maximum number =    133
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 4.007580E+06
 Pdbmat> Larger element =  497.997    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
618 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602040115101512187.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602040115101512187.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040115101512187.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4674 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   618 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    29 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    34 atoms in block      4
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    27 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    35 atoms in block      6
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    38 atoms in block     10
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    32 atoms in block     11
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     12
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    31 atoms in block     17
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    34 atoms in block     19
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    583
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    640
 Blocpdb>    36 atoms in block     23
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    32 atoms in block     24
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    32 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    35 atoms in block     27
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    35 atoms in block     28
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    35 atoms in block     29
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    27 atoms in block     30
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    27 atoms in block     31
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    951
 Blocpdb>    31 atoms in block     33
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    24 atoms in block     36
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>    29 atoms in block     37
 Block first atom:   1088
 Blocpdb>    35 atoms in block     38
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    27 atoms in block     39
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    27 atoms in block     41
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    27 atoms in block     43
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1279
 Blocpdb>    35 atoms in block     45
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    38 atoms in block     48
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    34 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    33 atoms in block     51
 Block first atom:   1502
 Blocpdb>    35 atoms in block     52
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    31 atoms in block     54
 Block first atom:   1598
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    29 atoms in block     56
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    35 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    33 atoms in block     61
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1842
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1867
 Blocpdb>    33 atoms in block     64
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1929
 Blocpdb>    32 atoms in block     66
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>    28 atoms in block     67
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    30 atoms in block     68
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    32 atoms in block     70
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    34 atoms in block     71
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    24 atoms in block     72
 Block first atom:   2143
 Blocpdb>    31 atoms in block     73
 Block first atom:   2167
 Blocpdb>    36 atoms in block     74
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2234
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2274
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   2338
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2360
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    34 atoms in block     82
 Block first atom:   2418
 Blocpdb>    27 atoms in block     83
 Block first atom:   2452
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2479
 Blocpdb>    37 atoms in block     85
 Block first atom:   2514
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2551
 Blocpdb>    31 atoms in block     87
 Block first atom:   2584
 Blocpdb>    38 atoms in block     88
 Block first atom:   2615
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    25 atoms in block     90
 Block first atom:   2685
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    37 atoms in block     92
 Block first atom:   2742
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2779
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2805
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2830
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2861
 Blocpdb>    34 atoms in block     97
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2920
 Blocpdb>    31 atoms in block     99
 Block first atom:   2946
 Blocpdb>    28 atoms in block    100
 Block first atom:   2977
 Blocpdb>    36 atoms in block    101
 Block first atom:   3005
 Blocpdb>    32 atoms in block    102
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    32 atoms in block    104
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    35 atoms in block    105
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    35 atoms in block    106
 Block first atom:   3164
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   3234
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3261
 Blocpdb>    26 atoms in block    110
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    31 atoms in block    111
 Block first atom:   3314
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3345
 Blocpdb>    26 atoms in block    113
 Block first atom:   3375
 Blocpdb>    24 atoms in block    114
 Block first atom:   3401
 Blocpdb>    29 atoms in block    115
 Block first atom:   3425
 Blocpdb>    35 atoms in block    116
 Block first atom:   3454
 Blocpdb>    27 atoms in block    117
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   3516
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3534
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    27 atoms in block    121
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    27 atoms in block    122
 Block first atom:   3616
 Blocpdb>    35 atoms in block    123
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   3678
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   3709
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3735
 Blocpdb>    32 atoms in block    127
 Block first atom:   3773
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3839
 Blocpdb>    35 atoms in block    130
 Block first atom:   3872
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3907
 Blocpdb>    31 atoms in block    132
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    34 atoms in block    133
 Block first atom:   3966
 Blocpdb>    29 atoms in block    134
 Block first atom:   4000
 Blocpdb>    25 atoms in block    135
 Block first atom:   4029
 Blocpdb>    35 atoms in block    136
 Block first atom:   4054
 Blocpdb>    27 atoms in block    137
 Block first atom:   4089
 Blocpdb>    30 atoms in block    138
 Block first atom:   4116
 Blocpdb>    33 atoms in block    139
 Block first atom:   4146
 Blocpdb>    25 atoms in block    140
 Block first atom:   4179
 Blocpdb>    29 atoms in block    141
 Block first atom:   4204
 Blocpdb>    33 atoms in block    142
 Block first atom:   4233
 Blocpdb>    30 atoms in block    143
 Block first atom:   4266
 Blocpdb>    32 atoms in block    144
 Block first atom:   4296
 Blocpdb>    28 atoms in block    145
 Block first atom:   4328
 Blocpdb>    30 atoms in block    146
 Block first atom:   4356
 Blocpdb>    28 atoms in block    147
 Block first atom:   4386
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4414
 Blocpdb>    34 atoms in block    149
 Block first atom:   4446
 Blocpdb>    24 atoms in block    150
 Block first atom:   4480
 Blocpdb>    31 atoms in block    151
 Block first atom:   4504
 Blocpdb>    36 atoms in block    152
 Block first atom:   4535
 Blocpdb>    40 atoms in block    153
 Block first atom:   4571
 Blocpdb>    33 atoms in block    154
 Block first atom:   4611
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   4644
 Blocpdb>     8 atoms in block    156
 Block first atom:   4666

 Blocpdb>   156 blocks.

 Blocpdb> At most,     40 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1831371 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14022

 Prepmat> Matrix trace    =    4007580.0000
 Prepmat> Last element read:   14022  14022        81.0144
 Prepmat>        12247 lines saved.
 Prepmat>        10687 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4674
 RTB> Total mass =        4674.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4674
 RTB> Number of blocks =   156
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  200698.5209
 RTB>     53784 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      936
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    53784
 Diagstd> Projected matrix trace =  200698.5209

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    936 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 200698.5209
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.0377583      1.6384716      2.3086534      4.5393059
      5.1779045      5.7775973      9.8370190      9.9289251     10.3563321
     10.5389095     11.4560331     12.2642737     12.5743202     12.7857043
     13.9579475     14.1277960     14.8596018     15.1292451     17.6679958
     17.9082762     18.5017461     18.9273889     20.1701427     20.2355583
     20.7416511     21.2066989     21.4366854     22.0027431     23.2585934
     23.5813107     23.7856937     24.1911166     24.6568883     25.1377954
     25.7922601     26.3991532     26.7210340     27.2637321     27.5024172
     27.9531159     28.2258459     28.4138585     29.4796925     29.7136388
     30.6108308     30.9242763     32.1618883     32.9788456     33.1444882
     33.3955149     34.3025452     34.9080290     35.3619204     36.0020245
     37.6944308     37.8396741     38.0931311     39.1448501     39.8315498
     40.0371683     40.8634754     40.9749803     42.7302946     43.2933657
     43.6496436     44.2951744     44.3216340     44.4440246     44.9665268
     45.1596028     45.3877562     45.8609700     46.3041766     46.6409685
     47.1698746     47.4297389     47.7656917     49.0478353     49.1556069
     49.9853085     50.1721000     50.3849119     51.1124425     51.5227049
     52.3942459     52.8246048     53.2242341     53.7564225     54.4274910
     55.2527742     55.2850207     55.4930192     56.0673858     56.3852600
     56.7669080     57.9094346     58.5481535     59.2721619     59.4263029
     60.1591154

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034326      0.0034331      0.0034335      0.0034336      0.0034340
      0.0034350    110.6224795    138.9999799    164.9964672    231.3609227
    247.0997445    261.0170725    340.5861904    342.1735208    349.4606371
    352.5275947    367.5466008    380.2911309    385.0680964    388.2912538
    405.7009828    408.1619231    418.5996554    422.3805484    456.4454944
    459.5387855    467.0911502    472.4334424    487.6966427    488.4868480
    494.5576709    500.0711682    502.7754892    509.3703881    523.7053421
    527.3260801    529.6063598    534.1008107    539.2180409    544.4510927
    551.4929689    557.9435717    561.3347257    567.0063634    569.4829334
    574.1302010    576.9242086    578.8424681    589.5990224    591.9338828
    600.8040325    603.8722218    615.8373852    623.6099060    625.1740448
    627.5370220    636.0019586    641.5905292    645.7481959    651.5664922
    666.7052504    667.9884819    670.2219018    679.4110366    685.3444219
    687.1110886    694.1653477    695.1117939    709.8445034    714.5061236
    717.4400742    722.7256829    722.9415097    723.9389942    728.1820218
    729.7436706    731.5847383    735.3886091    738.9335120    741.6159480
    745.8090367    747.8605892    750.5045264    760.5104793    761.3455465
    767.7440662    769.1772311    770.8067905    776.3518600    779.4613902
    786.0262994    789.2478516    792.2276401    796.1785257    801.1326609
    807.1835910    807.4190994    808.9365476    813.1121186    815.4138315
    818.1687734    826.3612474    830.9059744    836.0276943    837.1140603
    842.2596610

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4674
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    156

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9923E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.038    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.638    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.309    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.539    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.178    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.778    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.837    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.929    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.16    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    936 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00005
 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    84132 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00005
 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040115101512187.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040115101512187.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602040115101512187.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602040115101512187.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    618
            First residue number     =      8
            Last  residue number     =    316
            Number of atoms found    =   4674
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9923E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.038    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.638    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.309    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.539    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.178    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.778    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.837    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.16    

 Bfactors>  106 vectors,  14022 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.038000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.484 for    618 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.019 +/-   0.02
 Bfactors> =     88.748 +/-   9.67
 Bfactors> Shiftng-fct=     88.729
 Bfactors> Scaling-fct=    498.879

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602040115101512187.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602040115101512187.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4325E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   641.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   645.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   666.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   679.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   687.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   709.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   723.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   729.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   731.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   735.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   738.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   741.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   745.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   760.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   767.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   769.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   770.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   776.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   786.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   789.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   807.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   815.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   826.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   830.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   836.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.2    

 Chkmod>  106 vectors,  14022 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4674 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    27 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    60 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7774
      0.0034      0.7283
      0.0034      0.8041
      0.0034      0.9444
      0.0034      0.9073
      0.0034      0.7412
    110.6306      0.7371
    138.9740      0.6752
    165.0018      0.7294
    231.3432      0.7897
    247.0914      0.7950
    261.0150      0.8129
    340.5712      0.3203
    342.1601      0.4187
    349.5075      0.0690
    352.5307      0.0311
    367.5944      0.2580
    380.2085      0.3334
    384.9854      0.2677
    388.3398      0.2265
    405.7134      0.2900
    408.1762      0.1701
    418.5873      0.4383
    422.3730      0.3291
    456.4518      0.4103
    459.5412      0.4199
    467.0491      0.2268
    472.4457      0.2362
    487.6740      0.3751
    488.5195      0.3173
    494.5168      0.2115
    500.0886      0.6289
    502.7928      0.3403
    509.3168      0.4131
    523.6987      0.4969
    527.2888      0.4149
    529.6316      0.7319
    534.0656      0.4875
    539.2289      0.4508
    544.4516      0.3297
    551.4451      0.3446
    557.9286      0.5741
    561.2998      0.4515
    566.9432      0.2922
    569.4335      0.4184
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    576.9419      0.6010
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    589.5768      0.5035
    591.8722      0.4492
    600.7701      0.4421
    603.8045      0.6012
    615.7929      0.4539
    623.5940      0.1802
    625.1049      0.3226
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    635.9511      0.4158
    641.5811      0.3897
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    667.9627      0.3031
    670.1656      0.2369
    679.3398      0.4222
    685.3017      0.2872
    687.1059      0.2865
    694.1060      0.4141
    695.0397      0.4024
    709.8116      0.4614
    714.4477      0.4741
    717.4122      0.3699
    722.7340      0.4041
    722.8971      0.4476
    723.8751      0.4834
    728.1789      0.5169
    729.7156      0.4124
    731.5714      0.4678
    735.3493      0.4189
    738.8685      0.4187
    741.5764      0.3616
    745.7780      0.3887
    747.8305      0.4795
    750.5062      0.4883
    760.4946      0.3733
    761.3469      0.3409
    767.7471      0.5049
    769.1281      0.4849
    770.7361      0.4321
    776.3000      0.5218
    779.4075      0.4907
    785.9607      0.5658
    789.1796      0.5799
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    801.1167      0.4783
    807.1287      0.3652
    807.4208      0.4177
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    813.0962      0.4087
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    830.8834      0.4102
    835.9766      0.3612
    837.1042      0.3240
    842.2297      0.4114
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602040115101512187 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602040115101512187.eigenfacs
2602040115101512187.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602040115101512187.eigenfacs
2602040115101512187.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m15.842s
user	0m15.731s
sys	0m0.107s
rm: cannot remove '2602040115101512187.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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