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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  DIM3_KELEY  ***

LOGs for ID: 2602040400101600571

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602040400101600571.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602040400101600571.atom to be opened. Openam> File opened: 2602040400101600571.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.842937 +/- 11.560521 From: -29.916000 To: 27.231000 = 0.942719 +/- 12.549008 From: -31.880000 To: 29.781000 = 1.625930 +/- 19.110118 From: -39.241000 To: 41.712000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9173 % Filled. Pdbmat> 1765985 non-zero elements. Pdbmat> 193239 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.43 +/- 22.87 Maximum number = 132 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.864780E+06 Pdbmat> Larger element = 484.802 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602040400101600571.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602040400101600571.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602040400101600571.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1475 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1503 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1546 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1572 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1616 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1636 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1685 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1704 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1727 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1750 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1795 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1819 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1862 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1884 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1906 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1952 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1996 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2018 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2042 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2071 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2090 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2109 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2131 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2182 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2215 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2240 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2259 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2263 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2285 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2310 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2459 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2511 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2538 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2558 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2577 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2631 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2650 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2667 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2688 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2708 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2736 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2778 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2797 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2821 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2839 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2892 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2908 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2936 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2955 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2980 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3002 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3033 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3057 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3078 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3107 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3125 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3146 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3165 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3213 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3233 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3253 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3339 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3358 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3379 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3411 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3434 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3454 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3474 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3494 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3547 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3567 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3589 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3609 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3642 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3663 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3690 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3715 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3737 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3765 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3784 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3808 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3834 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3878 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3898 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3921 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3966 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4012 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4037 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4057 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4081 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4098 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4124 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4146 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4168 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4190 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4214 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4258 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4280 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4304 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4333 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4352 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4371 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4393 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4421 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4444 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4477 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4502 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4520 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1766185 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3864780.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 56.8491 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18002 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 272428.3659 RTB> 72528 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72528 Diagstd> Projected matrix trace = 272428.3659 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 272428.3659 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8376197 1.1551644 1.8501915 3.4489645 3.9805411 4.5237977 8.4619196 8.5489833 9.4338954 10.2529984 10.8460637 11.1667265 12.9925536 13.3014163 13.5276963 13.9231479 14.1223917 14.6966966 15.9632476 16.4068028 17.0901819 17.8155802 17.9411087 18.6339161 19.2660244 19.3595263 20.5539556 20.9617168 21.6949978 21.9304613 22.5017027 22.6952409 23.1943987 23.6219942 24.3309514 24.4713648 25.3369558 25.8776903 26.1741093 26.7594675 27.6075059 28.1958259 28.4185374 28.6311007 29.5559832 29.7453759 30.3733811 30.6746421 31.2746970 32.8993904 32.9388267 33.4895583 33.7832604 34.1221809 35.4632985 35.7833158 35.8899048 36.5148212 37.3098581 37.9040713 38.4399090 39.0187345 39.1733663 39.8125461 40.1804721 40.5635748 40.9360270 41.0816183 41.3946554 41.6842007 41.9252274 42.1909915 42.6887090 43.0343250 43.6849409 44.1244723 44.8920334 45.1790336 45.3500050 46.0424524 46.6302482 47.1006442 47.2336722 47.4997623 47.9231215 48.4067513 48.9298020 49.7605338 50.1882606 50.6794122 50.8222279 51.9010301 52.3517020 53.3843253 54.0140703 54.1213009 54.4784132 54.9998714 55.4568709 55.9797283 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034330 0.0034337 0.0034339 0.0034349 0.0034350 99.3845151 116.7124481 147.7078642 201.6692308 216.6538132 230.9653710 315.8855265 317.5064220 333.5345352 347.7128381 357.6278694 362.8759792 391.4195727 396.0447165 399.3992106 405.1949257 408.0838491 416.2987855 433.8662875 439.8526978 448.9196580 458.3479205 459.9598455 468.7565490 476.6409295 477.7961471 492.3149084 497.1743392 505.7956450 508.5330270 515.1135473 517.3240619 522.9821183 527.7807663 535.6422498 537.1856168 546.6036118 552.4055535 555.5603418 561.7382714 570.5699129 576.6173292 578.8901254 581.0510664 590.3614436 592.2499207 598.4692627 601.4299237 607.2839956 622.8582276 623.2314242 628.4199884 631.1695819 634.3276912 646.6731722 649.5843765 650.5511270 656.1903957 663.2955428 668.5566460 673.2656472 678.3157014 679.6584596 685.1809135 688.3396676 691.6133873 694.7813076 696.0157252 698.6624717 701.1016990 703.1257352 705.3507720 709.4990048 712.3653357 717.7300946 721.3317404 727.5786037 729.9006472 731.2804275 736.8422228 741.5307134 745.2615298 746.3132224 748.4124410 751.7402936 755.5239721 759.5948463 766.0159199 769.3010980 773.0561951 774.1446733 782.3179034 785.7071099 793.4182015 798.0842364 798.8760363 801.5073416 805.3341532 808.6730335 812.4762476 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.98 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040400101600571.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040400101600571.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602040400101600571.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602040400101600571.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.98 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.837600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.429 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.02 Bfactors> = 90.594 +/- 5.87 Bfactors> Shiftng-fct= 90.571 Bfactors> Scaling-fct= 272.194 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040400101600571.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040400101600571.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.3 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vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4 Chkmod> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9796 0.0034 0.8715 0.0034 0.8308 0.0034 0.9760 0.0034 0.7691 0.0034 0.8805 99.3791 0.7382 116.6991 0.7112 147.6939 0.7532 201.6616 0.8072 216.6570 0.8204 230.9606 0.7979 315.8735 0.1663 317.4931 0.1849 333.5221 0.4241 347.6471 0.4254 357.6774 0.2222 362.9136 0.3116 391.3643 0.3196 396.0066 0.5035 399.4161 0.2946 405.1317 0.0404 408.0318 0.0510 416.3277 0.3050 433.8035 0.3753 439.8767 0.3983 448.8980 0.4272 458.3851 0.4257 459.9259 0.3064 468.6872 0.3614 476.6696 0.5152 477.7815 0.5265 492.2464 0.5712 497.1326 0.4881 505.7157 0.5242 508.5058 0.6370 515.0719 0.4849 517.3561 0.4083 522.9101 0.6701 527.7358 0.5344 535.6088 0.3792 537.1476 0.4838 546.6130 0.4454 552.4065 0.4730 555.4929 0.5221 561.7197 0.6039 570.5712 0.2330 576.6353 0.1312 578.8802 0.5180 581.0150 0.4344 590.3762 0.2266 592.2705 0.3936 598.4103 0.5504 601.3586 0.3250 607.2123 0.3963 622.8373 0.3718 623.2158 0.3913 628.3972 0.4206 631.1120 0.5403 634.2802 0.2986 646.6153 0.3671 649.5264 0.3626 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DQ=-80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400101600571.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040400101600571 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400101600571.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040400101600571 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400101600571.eigenfacs 2602040400101600571.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400101600571.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400101600571.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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