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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  DIM6_KELEY  ***

LOGs for ID: 2602040400451600740

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602040400451600740.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602040400451600740.atom to be opened. Openam> File opened: 2602040400451600740.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.753017 +/- 13.114403 From: -33.985000 To: 32.279000 = -0.223425 +/- 12.311169 From: -31.499000 To: 28.132000 = 0.232227 +/- 18.350699 From: -36.991000 To: 38.874000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8969 % Filled. Pdbmat> 1747120 non-zero elements. Pdbmat> 191139 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.50 +/- 22.77 Maximum number = 130 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.822780E+06 Pdbmat> Larger element = 476.926 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602040400451600740.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602040400451600740.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602040400451600740.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1475 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1503 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1546 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1572 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1616 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1636 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1685 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1704 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1727 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1750 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1795 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1819 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1862 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1884 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1906 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1952 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1996 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2018 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2042 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2071 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2090 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2109 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2131 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2182 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2215 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2240 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2259 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2263 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2285 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2310 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2459 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2511 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2538 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2558 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2577 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2631 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2650 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2667 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2688 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2708 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2736 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2778 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2797 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2821 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2839 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2892 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2908 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2936 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2955 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2980 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3002 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3033 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3057 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3078 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3107 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3125 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3146 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3165 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3213 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3233 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3253 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3339 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3358 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3379 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3411 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3434 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3454 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3474 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3494 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3547 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3567 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3589 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3609 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3642 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3663 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3690 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3715 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3737 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3765 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3784 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3808 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3834 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3878 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3898 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3921 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3966 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4012 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4037 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4057 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4081 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4098 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4124 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4146 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4168 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4190 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4214 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4258 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4280 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4304 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4333 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4352 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4371 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4393 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4421 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4444 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4477 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4502 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4520 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1747320 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3822780.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 64.9620 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18019 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 268544.2219 RTB> 71916 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71916 Diagstd> Projected matrix trace = 268544.2219 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 268544.2219 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8287644 1.0686394 1.5909546 3.3053993 3.9422571 4.3290951 8.3164367 8.4917608 9.4497418 10.1885469 11.1215771 11.2455079 12.7104247 12.8629640 13.2718779 14.0904467 14.3371771 14.6027156 15.7427896 16.2716061 17.1714552 17.2849122 17.8908009 18.3968762 18.9099375 19.1117107 19.9688547 20.2428877 21.4831165 21.5177914 22.2918287 22.6236962 22.6830305 23.1306323 23.6262310 23.7735902 24.8979855 25.1577948 25.5277857 26.2664444 27.2219057 27.5694877 27.9072123 28.6499592 29.4129666 29.6739033 30.1930855 30.8899382 31.2587729 32.4075747 32.7057584 33.2928457 33.6446921 33.8971558 35.0135610 35.0207921 35.5478160 35.9806344 36.9086397 37.5458802 38.0194712 38.1982645 38.5287175 39.0759443 39.3382980 39.5082438 39.7846229 40.1750890 40.3275235 40.6663339 40.7944447 41.2722872 41.5183700 42.7089819 43.0167593 43.1080803 44.1467608 44.2345699 44.7059283 44.7858111 44.9671303 45.5866206 46.4016086 46.9002230 47.2055024 47.5812013 48.3003579 48.6352007 48.9825820 49.8888104 50.3498927 50.6075689 51.0223848 51.7046501 52.1437016 52.5357972 53.0853937 53.7649988 53.8411169 54.0696070 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034326 0.0034331 0.0034335 0.0034336 0.0034366 98.8577739 112.2563364 136.9695942 197.4273192 215.6094301 225.9403735 313.1582974 316.4420266 333.8145419 346.6182343 362.1416434 364.1537766 387.1464775 389.4626436 395.6047237 407.6220427 411.1753827 414.9655985 430.8599486 438.0366929 449.9858225 451.4699715 459.3145168 465.7655071 472.2155963 474.7282337 485.2570557 488.5753064 503.3196920 503.7257207 512.7056799 516.5080097 517.1848786 522.2627276 527.8280957 529.4715958 541.8478888 544.6676299 548.6581728 556.5394106 566.5712624 570.1769134 573.6585996 581.2423961 588.9313794 591.5379598 596.6903696 603.5368612 607.1293707 618.1851182 621.0225819 626.5716479 629.8738221 632.2326357 642.5596070 642.6259559 647.4433013 651.3729034 659.7194674 665.3902382 669.5735917 671.1461393 674.0429283 678.8127971 681.0877409 682.5573423 684.9405897 688.2935565 689.5981010 692.4888601 693.5787734 697.6290369 699.7057256 709.6674559 712.2199340 712.9755256 721.5138993 722.2310985 726.0689068 726.7173057 728.1869079 733.1856893 739.7105254 743.6742326 746.0906415 749.0537486 754.6932310 757.3046728 760.0044192 767.0026324 770.5388759 772.5080571 775.6676109 780.8364568 784.1446959 787.0873701 791.1936658 796.2420344 796.8054770 798.4944222 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.329 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.07 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040400451600740.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040400451600740.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602040400451600740.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602040400451600740.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.329 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.07 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.828800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.367 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.024 +/- 0.02 Bfactors> = 90.182 +/- 6.37 Bfactors> Shiftng-fct= 90.158 Bfactors> Scaling-fct= 296.190 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040400451600740.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040400451600740.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.1 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vecteur en lecture: 697.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.5 Chkmod> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8653 0.0034 0.9828 0.0034 0.8132 0.0034 0.9633 0.0034 0.7711 0.0034 0.7716 98.8557 0.7478 112.2705 0.7174 136.9657 0.7530 197.4069 0.8027 215.5931 0.8432 225.9282 0.7819 313.1366 0.3687 316.4329 0.3451 333.8048 0.3697 346.6281 0.4695 362.1004 0.1717 364.2109 0.3491 387.1234 0.2753 389.4011 0.3326 395.5598 0.3954 407.5981 0.2639 411.1982 0.0477 414.9092 0.0786 430.8033 0.3416 437.9963 0.3976 449.9474 0.4109 451.3864 0.4167 459.2845 0.3351 465.7851 0.3059 472.1961 0.4545 474.6866 0.4661 485.2501 0.3630 488.5195 0.5036 503.2616 0.5166 503.7299 0.6384 512.6626 0.5358 516.4436 0.5049 517.1281 0.3985 522.2332 0.5098 527.8475 0.3658 529.4089 0.3860 541.8465 0.3022 544.6681 0.5930 548.6584 0.4985 556.5532 0.6408 566.5271 0.4533 570.1577 0.2906 573.6626 0.4416 581.2179 0.3468 588.8764 0.3828 591.4737 0.3527 596.6343 0.3237 603.5116 0.3067 607.1152 0.5107 618.1817 0.4132 621.0362 0.3832 626.5180 0.5935 629.8029 0.3483 632.2320 0.3330 642.4993 0.4299 642.5911 0.3526 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DQ=-80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400451600740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040400451600740 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400451600740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040400451600740 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040400451600740.eigenfacs 2602040400451600740.atom making animated gifs 11 models are in 2602040400451600740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040400451600740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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