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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  DIM_KELEY  ***

LOGs for ID: 2602040401061601228

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602040401061601228.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602040401061601228.atom to be opened. Openam> File opened: 2602040401061601228.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.127835 +/- 15.438763 From: -36.359000 To: 31.352000 = -0.540510 +/- 15.960313 From: -39.112000 To: 36.225000 = -0.616923 +/- 13.124963 From: -35.424000 To: 29.362000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9006 % Filled. Pdbmat> 1750549 non-zero elements. Pdbmat> 191530 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.67 +/- 22.67 Maximum number = 129 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.830600E+06 Pdbmat> Larger element = 485.656 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602040401061601228.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602040401061601228.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602040401061601228.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1475 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1503 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1546 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1572 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1616 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1636 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1685 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1704 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1727 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1750 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1795 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1819 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1862 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1884 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1906 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1952 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1996 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2018 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2042 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2071 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2090 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2109 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2131 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2182 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2215 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2240 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2259 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2263 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2285 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2310 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2459 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2511 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2538 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2558 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2577 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2631 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2650 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2667 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2688 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2708 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2736 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2778 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2797 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2821 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2839 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2892 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2908 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2936 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2955 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2980 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3002 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3033 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3057 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3078 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3107 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3125 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3146 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3165 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3213 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3233 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3253 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3339 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3358 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3379 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3411 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3434 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3454 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3474 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3494 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3547 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3567 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3589 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3609 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3642 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3663 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3690 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3715 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3737 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3765 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3784 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3808 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3834 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3878 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3898 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3921 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3966 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4012 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4037 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4057 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4081 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4098 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4124 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4146 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4168 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4190 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4214 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4258 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4280 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4304 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4333 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4352 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4371 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4393 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4421 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4444 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4477 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4502 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4520 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1750749 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3830600.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 72.0639 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18017 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 269079.1525 RTB> 71988 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71988 Diagstd> Projected matrix trace = 269079.1525 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 269079.1525 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8106628 1.0655458 1.7670651 3.9361727 4.0573767 4.2924051 8.5202029 8.7278818 9.5617186 10.2548056 11.3938369 11.5475609 12.9028388 13.0271061 13.3115266 13.4109339 13.6623446 14.3721511 15.7035968 16.6312835 17.4619012 17.6724119 18.4013202 18.6116070 19.1488117 19.4726013 20.2953812 20.5164633 21.4191236 22.1280685 22.3671183 22.4357280 23.1349498 23.3738153 23.9874098 24.4756579 24.6511794 25.5399905 25.7851168 26.4972835 26.9334456 27.4020516 27.8392585 28.2369388 28.5682839 29.0528334 30.0641051 30.4956445 31.2878720 32.4880872 32.5596557 33.2255277 33.3697228 33.9221504 34.1042867 35.0006745 35.1043480 35.9589109 36.8520620 37.6764866 38.1720421 39.0165802 39.2704634 39.8226197 39.9232097 40.0502146 40.4398395 40.6800140 40.7283118 41.0200050 41.0569930 41.1392015 41.5404127 42.3920676 43.1956005 43.5276776 44.2528027 44.7428503 45.0239421 45.3529121 46.1337620 46.3914805 46.5469468 47.2877653 47.5731474 48.0854641 48.7180839 49.3494636 49.9944414 50.6040376 50.7282485 51.3488089 51.5123580 51.8443002 52.4147873 53.0048974 53.4069858 54.1910819 54.4638487 55.0507317 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034334 0.0034335 0.0034349 0.0034356 0.0034358 97.7722015 112.0937360 144.3515842 215.4429818 218.7348324 224.9808905 316.9715243 320.8113375 335.7865221 347.7434807 366.5475143 369.0119338 390.0658378 391.9396992 396.1952031 397.6717959 401.3820055 411.6765858 430.3232867 442.8515446 453.7754990 456.5025341 465.8217596 468.4758599 475.1887981 479.1894706 489.2083790 491.8656897 502.5694998 510.8189899 513.5707698 514.3578394 522.3114673 525.0009442 531.8472985 537.2327347 539.1556139 548.7893133 551.4165945 558.9795970 563.5613986 568.4428659 572.9597474 577.0375645 580.4133011 585.3148288 595.4145195 599.6725761 607.4118959 618.9525427 619.6339176 625.9378650 627.2946448 632.4656861 634.1613441 642.4413515 643.3921178 651.1762392 659.2136280 666.5465411 670.9157349 678.2969757 680.5002569 685.2675922 686.1325229 687.2230286 690.5577312 692.6053262 693.0163562 695.4935953 695.8070901 696.5033493 699.8914426 707.0295734 713.6989176 716.4370360 722.3799295 726.3686702 728.6467617 731.3038658 737.5724996 739.6297924 740.8680735 746.7404475 748.9903507 753.0125015 757.9496905 762.8453413 767.8142011 772.4811049 773.4285761 778.1448854 779.3831196 781.8902335 786.1803670 790.5935726 793.5865786 799.3908831 801.4001958 805.7064270 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.066 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.728 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.05 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00005 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00005 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040401061601228.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040401061601228.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602040401061601228.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602040401061601228.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.066 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.728 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.05 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.810700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.349 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.024 +/- 0.02 Bfactors> = 89.924 +/- 6.47 Bfactors> Shiftng-fct= 89.901 Bfactors> Scaling-fct= 300.753 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040401061601228.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040401061601228.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.3 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vecteur en lecture: 696.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.7 Chkmod> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7465 0.0034 0.9011 0.0034 0.7714 0.0034 0.6509 0.0034 0.7907 0.0034 0.9395 97.7702 0.7323 112.1128 0.6972 144.3427 0.7532 215.4290 0.7907 218.7153 0.7901 224.9606 0.7917 316.9541 0.3798 320.7997 0.3474 335.7770 0.3925 347.6471 0.3959 366.4701 0.1941 369.0351 0.3225 390.0062 0.1982 391.9664 0.0509 396.1555 0.1394 397.6409 0.1567 401.3303 0.3494 411.6281 0.2726 430.2555 0.4803 442.8154 0.4311 453.7313 0.3964 456.4518 0.3834 465.7851 0.4039 468.4355 0.3590 475.1831 0.5078 479.1369 0.5044 489.2430 0.5464 491.8870 0.4291 502.5582 0.5088 510.8194 0.6037 513.5818 0.4842 514.3847 0.4314 522.2332 0.5396 524.9356 0.4151 531.8532 0.3655 537.2573 0.5369 539.1196 0.4151 548.7659 0.4005 551.4451 0.5003 558.9843 0.3297 563.5012 0.4393 568.3972 0.2702 572.9428 0.4506 577.0441 0.3460 580.4058 0.3375 585.2612 0.4062 595.3483 0.3748 599.6897 0.3072 607.4065 0.5838 618.9442 0.4606 619.6106 0.4219 625.9531 0.4653 627.2703 0.3559 632.4185 0.5276 634.0943 0.3860 642.4076 0.4605 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DQ=-80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom making animated gifs 11 models are in 2602040401061601228.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040401061601228 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom making animated gifs 11 models are in 2602040401061601228.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040401061601228 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040401061601228.eigenfacs 2602040401061601228.atom making animated gifs 11 models are in 2602040401061601228.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040401061601228.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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