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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  DIM22_KELEY  ***

LOGs for ID: 2602040404091608812

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602040404091608812.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602040404091608812.atom to be opened. Openam> File opened: 2602040404091608812.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.317907 +/- 12.122796 From: -29.027000 To: 31.980000 = -0.016013 +/- 17.030405 From: -37.520000 To: 37.002000 = 0.280965 +/- 15.180864 From: -34.103000 To: 33.018000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9096 % Filled. Pdbmat> 1758886 non-zero elements. Pdbmat> 192448 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.08 +/- 23.39 Maximum number = 133 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 3.848960E+06 Pdbmat> Larger element = 502.776 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602040404091608812.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602040404091608812.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602040404091608812.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1475 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1503 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1546 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1572 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1616 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1636 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1685 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1704 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1727 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1750 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1795 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1819 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1862 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1884 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1906 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1952 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1996 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2018 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2042 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2071 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2090 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2109 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2131 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2182 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2215 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2240 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2259 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2263 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2285 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2310 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2459 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2511 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2538 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2558 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2577 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2631 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2650 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2667 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2688 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2708 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2736 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2778 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2797 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2821 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2839 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2892 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2908 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2936 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2955 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2980 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3002 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3033 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3057 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3078 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3107 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3125 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3146 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3165 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3213 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3233 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3253 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3339 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3358 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3379 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3411 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3434 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3454 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3474 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3494 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3547 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3567 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3589 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3609 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3642 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3663 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3690 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3715 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3737 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3765 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3784 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3808 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3834 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3878 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3898 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3921 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3966 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4012 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4037 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4057 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4081 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4098 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4124 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4146 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4168 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4190 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4214 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4258 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4280 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4304 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4333 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4352 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4371 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4393 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4421 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4444 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4477 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4502 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4520 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1759086 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3848960.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 101.0614 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18028 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 271064.0083 RTB> 71592 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71592 Diagstd> Projected matrix trace = 271064.0083 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 271064.0083 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4503641 0.6785871 0.7559335 2.4081301 2.8618472 3.1036804 7.2972621 7.3466612 7.9503535 8.5666786 9.5738089 9.6080268 11.3475787 11.6328782 12.3314405 12.4172924 13.8201932 14.3225724 14.4886877 14.9455045 16.1623098 17.0400656 17.1264751 17.4800808 17.9822684 18.5453828 19.2327301 19.3431821 20.1517106 20.4007428 21.4721526 21.7384607 22.3161156 22.4312308 23.1154050 23.3246068 23.6274386 23.8086178 24.4367834 25.2556581 25.3335235 26.6639534 27.1053043 27.7663508 29.0289743 29.4067120 29.6041481 29.7253519 30.8207853 30.9070418 31.3733695 31.6169573 32.0143961 32.8028327 32.8745151 33.5623887 35.3972553 35.5548798 35.7800396 36.4218376 36.5317110 37.0339089 37.4422414 38.0747320 38.2704702 39.2194011 39.4604058 39.7689452 39.8495122 40.4024358 40.6201278 41.0294287 41.0879583 41.7685463 42.0113500 42.3302112 42.8943864 43.1595303 43.3195301 44.0845153 44.6520226 44.9398331 45.4354366 45.8930583 46.1075784 47.7406553 48.0207368 48.5175801 49.2192839 49.4097159 50.0965214 51.1760566 51.3028238 51.4325133 52.1369979 52.5444783 53.7443273 54.0248554 54.4217085 54.4713957 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034307 0.0034311 0.0034319 0.0034336 0.0034349 0.0034351 72.8747678 89.4536516 94.4141463 168.5137135 183.7039515 191.3082830 293.3426774 294.3339001 306.1882355 317.8348515 335.9987462 336.5986605 365.8026785 370.3726168 381.3310650 382.6561815 403.6940397 410.9659060 413.3422562 419.8078647 436.5630694 448.2609538 449.3960745 454.0116509 460.4871520 467.6416465 476.2289018 477.5944158 487.4737558 490.4765747 503.1912405 506.3020368 512.9849003 514.3062857 522.0907926 524.4480151 527.8415840 529.8615084 536.8059245 545.7259749 546.5665870 560.7348527 565.3565446 572.2089991 585.0744403 588.8687593 590.8422784 592.0505416 602.8609176 603.7039254 608.2412396 610.5979150 614.4236686 621.9435304 622.6227112 629.1029358 646.0707421 647.5076257 649.5546386 655.3543813 656.3421374 660.8380744 664.4712576 670.0600228 671.7801694 680.0576951 682.1439847 684.8056207 685.4989364 690.2383013 692.0953364 695.5734800 696.0694303 701.8106601 703.8475430 706.5135543 711.2061608 713.4008712 714.7219976 721.0050645 725.6310334 727.9658525 731.9689068 735.6458342 737.3631624 750.3078122 752.5055195 756.3883757 761.8385165 763.3108902 768.5976734 776.8348302 777.7963759 778.7788594 784.0942886 787.1523970 796.0889500 798.1639104 801.0901027 801.4557183 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9807E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9835E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4504 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6786 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.862 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.574 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.47 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040404091608812.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040404091608812.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602040404091608812.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602040404091608812.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9807E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9835E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4504 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6786 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.862 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.574 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.47 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.450400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.576 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.03 Bfactors> = 90.250 +/- 5.95 Bfactors> Shiftng-fct= 90.217 Bfactors> Scaling-fct= 227.238 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040404091608812.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040404091608812.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.8 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vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.4 Chkmod> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7446 0.0034 0.9035 0.0034 0.8800 0.0034 0.9996 0.0034 0.9364 0.0034 0.7328 72.8745 0.7371 89.4507 0.7676 94.4080 0.7758 168.5019 0.7591 183.7010 0.8088 191.3099 0.7113 293.3248 0.3947 294.3281 0.3747 306.1683 0.3964 317.8272 0.2145 335.9877 0.2325 336.5837 0.2146 365.8260 0.2878 370.3109 0.2854 381.2924 0.3474 382.6815 0.2674 403.6739 0.2733 410.9114 0.2472 413.3432 0.3375 419.8530 0.2229 436.5131 0.1436 448.2408 0.2290 449.4230 0.2538 453.9911 0.3773 460.4383 0.2927 467.6798 0.4040 476.1747 0.5691 477.5346 0.5542 487.4321 0.5162 490.4466 0.3532 503.1444 0.4935 506.2982 0.5319 513.0075 0.5549 514.2701 0.6454 522.1203 0.3988 524.3737 0.4013 527.8475 0.3911 529.8541 0.5301 536.8182 0.4348 545.7495 0.4761 546.5051 0.4032 560.6692 0.4070 565.3812 0.3192 572.2220 0.4278 585.0597 0.3454 588.8764 0.5344 590.7755 0.3349 592.0714 0.3723 602.8274 0.4835 603.7069 0.5070 608.1825 0.2037 610.6011 0.2444 614.3551 0.4210 621.8900 0.3545 622.5532 0.3898 629.0535 0.5003 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DQ=-80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom making animated gifs 11 models are in 2602040404091608812.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040404091608812 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom making animated gifs 11 models are in 2602040404091608812.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040404091608812 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom making animated gifs 11 models are in 2602040404091608812.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040404091608812 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404091608812.eigenfacs 2602040404091608812.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404091608812.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602040404091608812.10.pdb 2602040404091608812.11.pdb 2602040404091608812.7.pdb 2602040404091608812.8.pdb 2602040404091608812.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m26.042s user 0m25.934s sys 0m0.099s rm: cannot remove '2602040404091608812.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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