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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  DIM24_KELEY  ***

LOGs for ID: 2602040404331609691

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602040404331609691.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602040404331609691.atom to be opened. Openam> File opened: 2602040404331609691.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.209592 +/- 16.842429 From: -37.603000 To: 39.645000 = -0.813699 +/- 15.490935 From: -38.020000 To: 36.254000 = 0.080459 +/- 10.428409 From: -26.004000 To: 26.420000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9256 % Filled. Pdbmat> 1773598 non-zero elements. Pdbmat> 194076 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.80 +/- 23.17 Maximum number = 133 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.881520E+06 Pdbmat> Larger element = 497.997 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602040404331609691.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602040404331609691.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602040404331609691.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1475 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1503 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1546 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1572 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1616 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1636 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1685 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1704 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1727 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1750 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1795 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1819 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1862 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1884 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1906 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1952 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1996 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2018 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2042 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2071 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2090 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2109 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2131 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2182 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2215 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2240 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2259 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2263 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2285 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2310 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2357 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2459 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2511 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2538 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2558 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2577 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2631 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2650 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2667 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2688 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2708 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2736 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2778 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2797 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2821 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2839 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2892 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2908 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2936 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2955 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2980 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3002 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3033 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3057 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3078 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3107 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3125 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3146 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3165 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3213 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3233 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3253 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3271 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3288 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3339 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3358 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3379 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3411 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3434 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3454 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3474 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3494 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3547 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3567 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3589 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3609 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3642 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3663 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3690 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3715 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3737 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3765 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3784 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3808 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3834 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3878 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3898 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3921 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3966 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4012 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4037 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4057 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4081 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4098 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4124 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4146 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4168 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4190 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4214 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4258 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4280 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4304 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4333 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4352 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4371 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4393 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4421 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4444 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4477 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4502 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4520 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1773798 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3881520.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 110.6715 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17985 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 273824.1439 RTB> 73140 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73140 Diagstd> Projected matrix trace = 273824.1439 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 273824.1439 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9257899 1.5146386 2.1149426 3.9898885 4.9419322 5.2444095 8.8432957 9.1354788 9.9265554 10.2985759 11.5236748 11.6783720 12.6213381 13.2283102 14.3494069 14.4635768 15.0116867 15.3823041 16.1416617 17.1227242 17.9455347 18.5955679 18.6209031 19.1053303 19.7186420 20.3221279 20.8201942 21.0299763 22.5185723 22.7289348 22.7686794 23.1250533 23.7118323 23.8259002 24.3244846 24.9531378 25.6921694 26.3727025 26.9421306 27.1190286 27.7588380 28.3921114 28.7120082 29.2635144 29.6692721 30.0979544 30.7321366 31.5549770 32.1670817 33.0164761 33.3381265 33.6785131 34.4150629 34.7528099 35.4707634 35.7198684 35.9780461 36.4621049 36.9928932 37.1482839 38.3452033 38.8584802 39.0245050 39.6775768 39.9286912 40.2499367 40.6555735 40.8373193 41.5749804 41.9567442 42.1389354 42.4058478 42.6733491 43.2351398 43.8475318 44.4205226 44.8771287 45.2760450 46.1427953 46.4914618 47.1807243 47.5346252 48.1067253 48.1342904 48.8013944 49.4957882 49.7039511 50.4425325 51.1208652 51.4023588 52.8656861 53.0086871 53.3247979 53.6413242 54.2509860 54.4126044 55.0102678 55.3338565 55.5678124 55.7392659 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034315 0.0034328 0.0034339 0.0034342 0.0034343 0.0034349 104.4844096 133.6440998 157.9227039 216.9080462 241.4035609 248.6815581 322.9255106 328.2168988 342.1326841 348.4848220 368.6300851 371.0961369 385.7873483 394.9548622 411.3507145 412.9839120 420.7363421 425.8983685 436.2841145 449.3468593 460.0165772 468.2739552 468.5928423 474.6489833 482.2073008 489.5306297 495.4931652 497.9831768 515.3066022 517.7079355 518.1603779 522.1997407 528.7834302 530.0537843 535.5710622 542.4476885 550.4218534 557.6639848 563.6522547 565.4996559 572.1315812 578.6209122 581.8714716 587.4332443 591.4917965 595.7496150 601.9933001 609.9991278 615.8871050 623.9655893 626.9975957 630.1903302 637.0441968 640.1625183 646.7412296 649.0082317 651.3494747 655.7165552 660.4720283 661.8577492 672.4357622 676.9213087 678.3658579 684.0185043 686.1796245 688.9344167 692.3972371 693.9431503 700.1825885 703.3899688 704.9154995 707.1444799 709.3713502 714.0254871 719.0645128 723.7475595 727.4578114 730.6838722 737.6447072 740.4263758 745.8948046 748.6870435 753.1789572 753.3947109 758.5974806 763.9754495 765.5802777 771.2474151 776.4158241 778.5505299 789.5546886 790.6218351 792.9757190 795.3257163 799.8325943 801.0230937 805.4102641 807.7756364 809.4815044 810.7293634 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9857E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9258 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.990 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.74 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040404331609691.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040404331609691.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602040404331609691.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602040404331609691.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9857E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9258 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.244 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.925800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.437 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.02 Bfactors> = 90.150 +/- 5.96 Bfactors> Shiftng-fct= 90.129 Bfactors> Scaling-fct= 293.561 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602040404331609691.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602040404331609691.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9 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Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7747 0.0034 0.8424 0.0034 0.9200 0.0034 0.9335 0.0034 0.8019 0.0034 0.8387 104.4805 0.7349 133.6543 0.6791 157.9181 0.7294 216.9018 0.7799 241.3949 0.7863 248.6612 0.8021 322.9062 0.4467 328.1942 0.2337 342.1257 0.4453 348.4940 0.2765 368.5555 0.3136 371.1061 0.2234 385.7503 0.4574 394.9631 0.2614 411.3416 0.4041 412.9151 0.2318 420.6946 0.1637 425.8482 0.1211 436.2429 0.2539 449.2918 0.1663 460.0541 0.4165 468.3097 0.2760 468.5614 0.3163 474.6866 0.3985 482.2032 0.4741 489.4840 0.5329 495.4696 0.4820 497.9621 0.5797 515.3008 0.3708 517.6978 0.4881 518.1532 0.5304 522.2332 0.3940 528.7403 0.4808 530.0766 0.5465 535.4987 0.4004 542.3903 0.4132 550.3750 0.6382 557.6115 0.4491 563.6058 0.4967 565.4855 0.5654 572.1190 0.2739 578.5746 0.2136 581.8261 0.3810 587.3728 0.2689 591.4737 0.1789 595.7443 0.4961 601.9465 0.4046 609.9248 0.5487 615.8886 0.5089 623.9721 0.4230 626.9883 0.5438 630.1772 0.4196 637.0625 0.2996 640.1092 0.3778 646.7065 0.3770 648.9816 0.4528 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DQ=-80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404331609691.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040404331609691 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom making animated gifs 11 models are in 2602040404331609691.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404331609691.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404331609691.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602040404331609691 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602040404331609691.eigenfacs 2602040404331609691.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602040404331609691.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602040404331609691.10.pdb 2602040404331609691.11.pdb 2602040404331609691.7.pdb 2602040404331609691.8.pdb 2602040404331609691.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m26.177s user 0m26.055s sys 0m0.114s rm: cannot remove '2602040404331609691.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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