*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602041024501707124.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602041024501707124.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602041024501707124.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 169
First residue number = -1
Last residue number = 168
Number of atoms found = 1348
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 26.111310 +/- 9.278702 From: 6.999000 To: 46.713000
= 33.034397 +/- 10.032080 From: 10.078000 To: 56.974000
= 45.504604 +/- 8.391870 From: 24.035000 To: 65.214000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.8502 % Filled.
Pdbmat> 478489 non-zero elements.
Pdbmat> 52279 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.57 +/- 22.02
Maximum number = 125
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 1.045580E+06
Pdbmat> Larger element = 451.944
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
169 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602041024501707124.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602041024501707124.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602041024501707124.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1348 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 170 residues.
Blocpdb> 9 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 10
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 21
Blocpdb> 7 atoms in block 4
Block first atom: 32
Blocpdb> 8 atoms in block 5
Block first atom: 39
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 47
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 56
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 64
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 75
Blocpdb> 4 atoms in block 10
Block first atom: 82
Blocpdb> 8 atoms in block 11
Block first atom: 86
Blocpdb> 14 atoms in block 12
Block first atom: 94
Blocpdb> 11 atoms in block 13
Block first atom: 108
Blocpdb> 9 atoms in block 14
Block first atom: 119
Blocpdb> 7 atoms in block 15
Block first atom: 128
Blocpdb> 5 atoms in block 16
Block first atom: 135
Blocpdb> 4 atoms in block 17
Block first atom: 140
Blocpdb> 12 atoms in block 18
Block first atom: 144
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 156
Blocpdb> 8 atoms in block 20
Block first atom: 164
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 172
Blocpdb> 9 atoms in block 22
Block first atom: 180
Blocpdb> 7 atoms in block 23
Block first atom: 189
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 196
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 204
Blocpdb> 9 atoms in block 26
Block first atom: 213
Blocpdb> 4 atoms in block 27
Block first atom: 222
Blocpdb> 4 atoms in block 28
Block first atom: 226
Blocpdb> 7 atoms in block 29
Block first atom: 230
Blocpdb> 6 atoms in block 30
Block first atom: 237
Blocpdb> 6 atoms in block 31
Block first atom: 243
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 249
Blocpdb> 11 atoms in block 33
Block first atom: 257
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 268
Blocpdb> 8 atoms in block 35
Block first atom: 277
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 285
Blocpdb> 4 atoms in block 37
Block first atom: 293
Blocpdb> 7 atoms in block 38
Block first atom: 297
Blocpdb> 6 atoms in block 39
Block first atom: 304
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 310
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 317
Blocpdb> 7 atoms in block 42
Block first atom: 324
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 331
Blocpdb> 9 atoms in block 44
Block first atom: 339
Blocpdb> 11 atoms in block 45
Block first atom: 348
Blocpdb> 8 atoms in block 46
Block first atom: 359
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 367
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 374
Blocpdb> 6 atoms in block 49
Block first atom: 382
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 388
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 392
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 401
Blocpdb> 4 atoms in block 53
Block first atom: 409
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 413
Blocpdb> 9 atoms in block 55
Block first atom: 421
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 430
Blocpdb> 8 atoms in block 57
Block first atom: 438
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 446
Blocpdb> 10 atoms in block 59
Block first atom: 454
Blocpdb> 7 atoms in block 60
Block first atom: 464
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 471
Blocpdb> 8 atoms in block 62
Block first atom: 479
Blocpdb> 7 atoms in block 63
Block first atom: 487
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 494
Blocpdb> 9 atoms in block 65
Block first atom: 506
Blocpdb> 4 atoms in block 66
Block first atom: 515
Blocpdb> 8 atoms in block 67
Block first atom: 519
Blocpdb> 6 atoms in block 68
Block first atom: 527
Blocpdb> 4 atoms in block 69
Block first atom: 533
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 537
Blocpdb> 9 atoms in block 71
Block first atom: 545
Blocpdb> 8 atoms in block 72
Block first atom: 554
Blocpdb> 4 atoms in block 73
Block first atom: 562
Blocpdb> 9 atoms in block 74
Block first atom: 566
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 575
Blocpdb> 9 atoms in block 76
Block first atom: 583
Blocpdb> 9 atoms in block 77
Block first atom: 592
Blocpdb> 8 atoms in block 78
Block first atom: 601
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 609
Blocpdb> 9 atoms in block 80
Block first atom: 620
Blocpdb> 7 atoms in block 81
Block first atom: 629
Blocpdb> 7 atoms in block 82
Block first atom: 636
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 643
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 655
Blocpdb> 7 atoms in block 85
Block first atom: 662
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 669
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 677
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 685
Blocpdb> 10 atoms in block 89
Block first atom: 695
Blocpdb> 11 atoms in block 90
Block first atom: 705
Blocpdb> 9 atoms in block 91
Block first atom: 716
Blocpdb> 7 atoms in block 92
Block first atom: 725
Blocpdb> 8 atoms in block 93
Block first atom: 732
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 740
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 748
Blocpdb> 12 atoms in block 96
Block first atom: 758
Blocpdb> 4 atoms in block 97
Block first atom: 770
Blocpdb> 7 atoms in block 98
Block first atom: 774
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 781
Blocpdb> 7 atoms in block 100
Block first atom: 789
Blocpdb> 8 atoms in block 101
Block first atom: 796
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 804
Blocpdb> 4 atoms in block 103
Block first atom: 812
Blocpdb> 7 atoms in block 104
Block first atom: 816
Blocpdb> 7 atoms in block 105
Block first atom: 823
Blocpdb> 7 atoms in block 106
Block first atom: 830
Blocpdb> 8 atoms in block 107
Block first atom: 837
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 845
Blocpdb> 8 atoms in block 109
Block first atom: 853
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 861
Blocpdb> 12 atoms in block 111
Block first atom: 869
Blocpdb> 11 atoms in block 112
Block first atom: 881
Blocpdb> 4 atoms in block 113
Block first atom: 892
Blocpdb> 11 atoms in block 114
Block first atom: 896
Blocpdb> 7 atoms in block 115
Block first atom: 907
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 914
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 926
Blocpdb> 4 atoms in block 118
Block first atom: 935
Blocpdb> 8 atoms in block 119
Block first atom: 939
Blocpdb> 5 atoms in block 120
Block first atom: 947
Blocpdb> 7 atoms in block 121
Block first atom: 952
Blocpdb> 11 atoms in block 122
Block first atom: 959
Blocpdb> 8 atoms in block 123
Block first atom: 970
Blocpdb> 4 atoms in block 124
Block first atom: 978
Blocpdb> 9 atoms in block 125
Block first atom: 982
Blocpdb> 9 atoms in block 126
Block first atom: 991
Blocpdb> 8 atoms in block 127
Block first atom: 1000
Blocpdb> 7 atoms in block 128
Block first atom: 1008
Blocpdb> 7 atoms in block 129
Block first atom: 1015
Blocpdb> 7 atoms in block 130
Block first atom: 1022
Blocpdb> 4 atoms in block 131
Block first atom: 1029
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 1033
Blocpdb> 8 atoms in block 133
Block first atom: 1040
Blocpdb> 14 atoms in block 134
Block first atom: 1048
Blocpdb> 8 atoms in block 135
Block first atom: 1062
Blocpdb> 4 atoms in block 136
Block first atom: 1070
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1074
Blocpdb> 9 atoms in block 138
Block first atom: 1082
Blocpdb> 8 atoms in block 139
Block first atom: 1091
Blocpdb> 8 atoms in block 140
Block first atom: 1099
Blocpdb> 8 atoms in block 141
Block first atom: 1107
Blocpdb> 9 atoms in block 142
Block first atom: 1115
Blocpdb> 11 atoms in block 143
Block first atom: 1124
Blocpdb> 8 atoms in block 144
Block first atom: 1135
Blocpdb> 8 atoms in block 145
Block first atom: 1143
Blocpdb> 8 atoms in block 146
Block first atom: 1151
Blocpdb> 7 atoms in block 147
Block first atom: 1159
Blocpdb> 8 atoms in block 148
Block first atom: 1166
Blocpdb> 4 atoms in block 149
Block first atom: 1174
Blocpdb> 6 atoms in block 150
Block first atom: 1178
Blocpdb> 8 atoms in block 151
Block first atom: 1184
Blocpdb> 8 atoms in block 152
Block first atom: 1192
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 1200
Blocpdb> 11 atoms in block 154
Block first atom: 1211
Blocpdb> 7 atoms in block 155
Block first atom: 1222
Blocpdb> 7 atoms in block 156
Block first atom: 1229
Blocpdb> 8 atoms in block 157
Block first atom: 1236
Blocpdb> 8 atoms in block 158
Block first atom: 1244
Blocpdb> 4 atoms in block 159
Block first atom: 1252
Blocpdb> 7 atoms in block 160
Block first atom: 1256
Blocpdb> 7 atoms in block 161
Block first atom: 1263
Blocpdb> 4 atoms in block 162
Block first atom: 1270
Blocpdb> 14 atoms in block 163
Block first atom: 1274
Blocpdb> 11 atoms in block 164
Block first atom: 1288
Blocpdb> 8 atoms in block 165
Block first atom: 1299
Blocpdb> 6 atoms in block 166
Block first atom: 1307
Blocpdb> 9 atoms in block 167
Block first atom: 1313
Blocpdb> 11 atoms in block 168
Block first atom: 1322
Blocpdb> 8 atoms in block 169
Block first atom: 1333
Blocpdb> 8 atoms in block 170
Block first atom: 1340
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 478659 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4044
Prepmat> Matrix trace = 1045580.0000
Prepmat> Last element read: 4044 4044 63.2607
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 12500 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1348
RTB> Total mass = 1348.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1348
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 241076.6698
RTB> 70710 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 70710
Diagstd> Projected matrix trace = 241076.6698
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 241076.6698
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.2495399 2.6002354 4.5868687 8.3175491
8.6381599 8.7513153 10.1447880 11.0074398 12.4214102
13.0446171 14.1463803 14.2687318 15.5905467 16.2547350
17.8475597 18.2129998 19.0862518 19.9524553 20.7080312
21.1537199 21.3912565 22.5588402 24.1936854 25.9947963
27.3613116 28.1482154 28.3609193 28.4945920 29.5515909
31.4048292 32.0616606 32.5003150 33.0614141 33.3358653
35.1348216 36.1305389 36.8148437 38.0455149 38.8918595
39.9946514 40.5010583 40.9572279 41.1804170 42.8072364
43.7731006 45.4374400 45.7788868 46.0914045 47.2400658
48.3497399 49.1314326 49.9323116 51.6509269 52.2726602
53.2170139 54.0260729 54.8927252 55.3527107 56.2292822
56.7014966 58.0257425 58.5688958 59.4999862 60.6279720
62.0557390 62.4473813 63.0626229 63.9878358 64.4487584
65.2198566 65.8455384 66.3771634 67.5864819 68.1733930
69.3173688 69.4094065 70.5739377 71.0740597 71.4507907
72.3327307 73.4817844 74.2999738 74.7764026 75.5618790
76.6993830 78.0155721 78.2886183 79.3796540 79.9013306
80.8681108 81.6326416 82.7835885 83.6178290 84.6579076
85.0886431 85.5443983 85.8316644 86.5577119 87.3647466
88.2206037
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034339 0.0034344 0.0034346 0.0034347
0.0034353 162.8703866 175.1062373 232.5698617 313.1792410
319.1581214 321.2417226 345.8730853 360.2785778 382.7196248
392.2030326 408.4302920 410.1927385 428.7715421 437.8095462
458.7591102 463.4320029 474.4119335 485.0577560 494.1566970
499.4461331 502.2424623 515.7671338 534.1291676 553.6540612
568.0201418 576.1302953 578.3029826 579.6642300 590.3175748
608.5461208 614.8770543 619.0690118 624.3900780 626.9763317
643.6713165 652.7283858 658.8806612 669.8028838 677.2119837
686.7461572 691.0802255 694.9611988 696.8521595 710.4833027
718.4539475 731.9850441 734.7302046 737.2338225 746.3637313
755.0789290 761.1583117 767.3369582 780.4306911 785.1137468
792.1739029 798.1729040 804.5493281 807.9132431 814.2852165
817.6972578 827.1906815 831.0531467 837.6328726 845.5354117
855.4335048 858.1286381 862.3454875 868.6483341 871.7712810
876.9709350 881.1674720 884.7175142 892.7404244 896.6082590
904.0996783 904.6996987 912.2575262 915.4841752 917.9072493
923.5548868 930.8616260 936.0296605 939.0258853 943.9449225
951.0234272 959.1486703 960.8256635 967.4975660 970.6715173
976.5262655 981.1314684 988.0237961 992.9896551 999.1462105
1001.6847897 1004.3638393 1006.0487999 1010.2949080 1014.9938038
1019.9533128
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1348
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.250
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.318
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.638
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.751
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.22
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001
1.00002 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 24264 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001
1.00002 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602041024501707124.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602041024501707124.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602041024501707124.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602041024501707124.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 169
First residue number = -1
Last residue number = 168
Number of atoms found = 1348
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.318
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.638
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.22
Bfactors> 106 vectors, 4044 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.250000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.670 for 170 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.037 +/- 0.04
Bfactors> = 25.329 +/- 11.28
Bfactors> Shiftng-fct= 25.292
Bfactors> Scaling-fct= 318.096
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602041024501707124.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602041024501707124.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Chkmod> 106 vectors, 4044 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1348 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7431
0.0034 0.9162
0.0034 0.7569
0.0034 0.7646
0.0034 0.8488
0.0034 0.8906
162.8801 0.5451
175.0908 0.3789
232.5632 0.5897
313.1743 0.3179
319.1415 0.5552
321.2221 0.3051
345.7766 0.3660
360.3050 0.2791
382.6815 0.0410
392.1168 0.1142
408.4650 0.0712
410.1934 0.2954
428.7456 0.3060
437.7270 0.3192
458.7708 0.0843
463.3739 0.2411
474.4381 0.2037
485.0071 0.0827
494.1590 0.3842
499.3808 0.1767
502.2062 0.4365
515.7583 0.3323
534.0656 0.6592
553.5792 0.5270
567.9821 0.2543
576.1238 0.2635
578.2688 0.2130
579.5926 0.5050
590.2763 0.0831
608.4732 0.3966
614.8347 0.2993
619.0394 0.3957
624.3499 0.3521
626.9883 0.4085
643.5995 0.3841
652.6955 0.4203
658.8090 0.3627
669.8136 0.2582
677.1667 0.2132
686.6767 0.2977
691.0415 0.3995
694.9549 0.2081
696.8187 0.3249
710.4757 0.3278
718.3977 0.3728
731.9742 0.4704
734.7076 0.4789
737.1909 0.4173
746.3312 0.4725
755.0485 0.5243
761.1145 0.4677
767.2863 0.3806
780.3902 0.5892
785.0601 0.5126
792.1621 0.4848
798.1676 0.2474
804.4948 0.3549
807.8588 0.4876
814.2555 0.3163
817.6514 0.5763
827.1855 0.5055
831.0253 0.3588
837.5970 0.4766
845.5133 0.4013
855.4261 0.4388
858.1098 0.4218
862.2905 0.2593
868.6257 0.3962
871.7423 0.3322
876.9343 0.3248
881.1595 0.1832
884.6984 0.3768
892.7253 0.4438
896.5475 0.3427
904.0780 0.3601
904.6647 0.4631
912.1929 0.4771
915.4187 0.5290
917.8628 0.3792
923.4978 0.3679
930.8104 0.4178
935.9896 0.3597
939.0082 0.3521
943.8927 0.4035
950.9864 0.3971
959.1347 0.3092
960.7929 0.3546
967.4581 0.4459
970.6218 0.2272
976.4958 0.4166
981.0735 0.4146
987.9600 0.4281
992.9599 0.0837
999.1157 0.3516
1001.6498 0.3662
1004.2949 0.2601
1005.9959 0.4143
1010.2649 0.4286
1014.9227 0.4111
1019.9060 0.2783
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602041024501707124 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
making animated gifs
11 models are in 2602041024501707124.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602041024501707124 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
making animated gifs
11 models are in 2602041024501707124.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602041024501707124 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
making animated gifs
11 models are in 2602041024501707124.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602041024501707124 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
making animated gifs
11 models are in 2602041024501707124.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602041024501707124 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602041024501707124.eigenfacs
2602041024501707124.atom
making animated gifs
11 models are in 2602041024501707124.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602041024501707124.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602041024501707124.10.pdb
2602041024501707124.11.pdb
2602041024501707124.7.pdb
2602041024501707124.8.pdb
2602041024501707124.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m14.860s
user 0m14.800s
sys 0m0.049s
rm: cannot remove '2602041024501707124.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
