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LOGs for ID: 2602042136061897888

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602042136061897888.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602042136061897888.atom to be opened. Openam> File opened: 2602042136061897888.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1122 First residue number = 1 Last residue number = 120 Number of atoms found = 10787 Mean number per residue = 9.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -7.923449 +/- 19.608799 From: -48.738000 To: 49.581000 = 34.677296 +/- 59.245891 From: -67.322000 To: 139.968000 = -34.316456 +/- 68.643693 From: -150.217000 To: 73.335000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 162 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7285 % Filled. Pdbmat> 3814888 non-zero elements. Pdbmat> 416764 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 77.27 +/- 25.96 Maximum number = 179 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 8.335280E+06 Pdbmat> Larger element = 682.554 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1122 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602042136061897888.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602042136061897888.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602042136061897888.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10787 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1122 residues. Blocpdb> 40 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 49 atoms in block 2 Block first atom: 41 Blocpdb> 47 atoms in block 3 Block first atom: 90 Blocpdb> 44 atoms in block 4 Block first atom: 137 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 181 Blocpdb> 52 atoms in block 6 Block first atom: 233 Blocpdb> 48 atoms in block 7 Block first atom: 285 Blocpdb> 46 atoms in block 8 Block first atom: 333 Blocpdb> 49 atoms in block 9 Block first atom: 379 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 428 Blocpdb> 45 atoms in block 11 Block first atom: 476 Blocpdb> 44 atoms in block 12 Block first atom: 521 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 565 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 603 Blocpdb> 51 atoms in block 15 Block first atom: 649 Blocpdb> 38 atoms in block 16 Block first atom: 700 Blocpdb> 51 atoms in block 17 Block first atom: 738 Blocpdb> 49 atoms in block 18 Block first atom: 789 Blocpdb> 49 atoms in block 19 Block first atom: 838 Blocpdb> 47 atoms in block 20 Block first atom: 887 Blocpdb> 40 atoms in block 21 Block first atom: 934 Blocpdb> 49 atoms in block 22 Block first atom: 974 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1023 Blocpdb> 44 atoms in block 24 Block first atom: 1070 Blocpdb> 52 atoms in block 25 Block first atom: 1114 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1166 Blocpdb> 48 atoms in block 27 Block first atom: 1218 Blocpdb> 46 atoms in block 28 Block first atom: 1266 Blocpdb> 49 atoms in block 29 Block first atom: 1312 Blocpdb> 48 atoms in block 30 Block first atom: 1361 Blocpdb> 45 atoms in block 31 Block first atom: 1409 Blocpdb> 44 atoms in block 32 Block first atom: 1454 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1498 Blocpdb> 46 atoms in block 34 Block first atom: 1536 Blocpdb> 51 atoms in block 35 Block first atom: 1582 Blocpdb> 38 atoms in block 36 Block first atom: 1633 Blocpdb> 51 atoms in block 37 Block first atom: 1671 Blocpdb> 49 atoms in block 38 Block first atom: 1722 Blocpdb> 49 atoms in block 39 Block first atom: 1771 Blocpdb> 47 atoms in block 40 Block first atom: 1820 Blocpdb> 40 atoms in block 41 Block first atom: 1867 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 1907 Blocpdb> 47 atoms in block 43 Block first atom: 1956 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2003 Blocpdb> 52 atoms in block 45 Block first atom: 2047 Blocpdb> 52 atoms in block 46 Block first atom: 2099 Blocpdb> 48 atoms in block 47 Block first atom: 2151 Blocpdb> 46 atoms in block 48 Block first atom: 2199 Blocpdb> 49 atoms in block 49 Block first atom: 2245 Blocpdb> 48 atoms in block 50 Block first atom: 2294 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2342 Blocpdb> 44 atoms in block 52 Block first atom: 2387 Blocpdb> 38 atoms in block 53 Block first atom: 2431 Blocpdb> 46 atoms in block 54 Block first atom: 2469 Blocpdb> 51 atoms in block 55 Block first atom: 2515 Blocpdb> 38 atoms in block 56 Block first atom: 2566 Blocpdb> 51 atoms in block 57 Block first atom: 2604 Blocpdb> 49 atoms in block 58 Block first atom: 2655 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2704 Blocpdb> 47 atoms in block 60 Block first atom: 2753 Blocpdb> 40 atoms in block 61 Block first atom: 2800 Blocpdb> 49 atoms in block 62 Block first atom: 2840 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 2889 Blocpdb> 44 atoms in block 64 Block first atom: 2936 Blocpdb> 52 atoms in block 65 Block first atom: 2980 Blocpdb> 52 atoms in block 66 Block first atom: 3032 Blocpdb> 48 atoms in block 67 Block first atom: 3084 Blocpdb> 46 atoms in block 68 Block first atom: 3132 Blocpdb> 49 atoms in block 69 Block first atom: 3178 Blocpdb> 48 atoms in block 70 Block first atom: 3227 Blocpdb> 45 atoms in block 71 Block first atom: 3275 Blocpdb> 44 atoms in block 72 Block first atom: 3320 Blocpdb> 38 atoms in block 73 Block first atom: 3364 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3402 Blocpdb> 51 atoms in block 75 Block first atom: 3448 Blocpdb> 38 atoms in block 76 Block first atom: 3499 Blocpdb> 51 atoms in block 77 Block first atom: 3537 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3588 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 3637 Blocpdb> 47 atoms in block 80 Block first atom: 3686 Blocpdb> 121 atoms in block 81 Block first atom: 3733 Blocpdb> 125 atoms in block 82 Block first atom: 3854 Blocpdb> 124 atoms in block 83 Block first atom: 3979 Blocpdb> 123 atoms in block 84 Block first atom: 4103 Blocpdb> 120 atoms in block 85 Block first atom: 4226 Blocpdb> 123 atoms in block 86 Block first atom: 4346 Blocpdb> 124 atoms in block 87 Block first atom: 4469 Blocpdb> 128 atoms in block 88 Block first atom: 4593 Blocpdb> 124 atoms in block 89 Block first atom: 4721 Blocpdb> 123 atoms in block 90 Block first atom: 4845 Blocpdb> 126 atoms in block 91 Block first atom: 4968 Blocpdb> 123 atoms in block 92 Block first atom: 5094 Blocpdb> 119 atoms in block 93 Block first atom: 5217 Blocpdb> 65 atoms in block 94 Block first atom: 5336 Blocpdb> 123 atoms in block 95 Block first atom: 5401 Blocpdb> 125 atoms in block 96 Block first atom: 5524 Blocpdb> 121 atoms in block 97 Block first atom: 5649 Blocpdb> 121 atoms in block 98 Block first atom: 5770 Blocpdb> 124 atoms in block 99 Block first atom: 5891 Blocpdb> 121 atoms in block 100 Block first atom: 6015 Blocpdb> 116 atoms in block 101 Block first atom: 6136 Blocpdb> 125 atoms in block 102 Block first atom: 6252 Blocpdb> 126 atoms in block 103 Block first atom: 6377 Blocpdb> 125 atoms in block 104 Block first atom: 6503 Blocpdb> 119 atoms in block 105 Block first atom: 6628 Blocpdb> 124 atoms in block 106 Block first atom: 6747 Blocpdb> 119 atoms in block 107 Block first atom: 6871 Blocpdb> 66 atoms in block 108 Block first atom: 6990 Blocpdb> 40 atoms in block 109 Block first atom: 7056 Blocpdb> 49 atoms in block 110 Block first atom: 7096 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 7145 Blocpdb> 44 atoms in block 112 Block first atom: 7192 Blocpdb> 52 atoms in block 113 Block first atom: 7236 Blocpdb> 52 atoms in block 114 Block first atom: 7288 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 7340 Blocpdb> 46 atoms in block 116 Block first atom: 7388 Blocpdb> 49 atoms in block 117 Block first atom: 7434 Blocpdb> 48 atoms in block 118 Block first atom: 7483 Blocpdb> 45 atoms in block 119 Block first atom: 7531 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 7576 Blocpdb> 38 atoms in block 121 Block first atom: 7620 Blocpdb> 46 atoms in block 122 Block first atom: 7658 Blocpdb> 51 atoms in block 123 Block first atom: 7704 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 7755 Blocpdb> 51 atoms in block 125 Block first atom: 7793 Blocpdb> 49 atoms in block 126 Block first atom: 7844 Blocpdb> 49 atoms in block 127 Block first atom: 7893 Blocpdb> 47 atoms in block 128 Block first atom: 7942 Blocpdb> 40 atoms in block 129 Block first atom: 7989 Blocpdb> 49 atoms in block 130 Block first atom: 8029 Blocpdb> 47 atoms in block 131 Block first atom: 8078 Blocpdb> 44 atoms in block 132 Block first atom: 8125 Blocpdb> 52 atoms in block 133 Block first atom: 8169 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 8221 Blocpdb> 48 atoms in block 135 Block first atom: 8273 Blocpdb> 46 atoms in block 136 Block first atom: 8321 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 8367 Blocpdb> 48 atoms in block 138 Block first atom: 8416 Blocpdb> 45 atoms in block 139 Block first atom: 8464 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 8509 Blocpdb> 38 atoms in block 141 Block first atom: 8553 Blocpdb> 46 atoms in block 142 Block first atom: 8591 Blocpdb> 51 atoms in block 143 Block first atom: 8637 Blocpdb> 38 atoms in block 144 Block first atom: 8688 Blocpdb> 51 atoms in block 145 Block first atom: 8726 Blocpdb> 49 atoms in block 146 Block first atom: 8777 Blocpdb> 49 atoms in block 147 Block first atom: 8826 Blocpdb> 47 atoms in block 148 Block first atom: 8875 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 8922 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 8962 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 9011 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 9058 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 9102 Blocpdb> 52 atoms in block 154 Block first atom: 9154 Blocpdb> 48 atoms in block 155 Block first atom: 9206 Blocpdb> 46 atoms in block 156 Block first atom: 9254 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 9300 Blocpdb> 48 atoms in block 158 Block first atom: 9349 Blocpdb> 45 atoms in block 159 Block first atom: 9397 Blocpdb> 44 atoms in block 160 Block first atom: 9442 Blocpdb> 38 atoms in block 161 Block first atom: 9486 Blocpdb> 46 atoms in block 162 Block first atom: 9524 Blocpdb> 51 atoms in block 163 Block first atom: 9570 Blocpdb> 38 atoms in block 164 Block first atom: 9621 Blocpdb> 51 atoms in block 165 Block first atom: 9659 Blocpdb> 49 atoms in block 166 Block first atom: 9710 Blocpdb> 49 atoms in block 167 Block first atom: 9759 Blocpdb> 47 atoms in block 168 Block first atom: 9808 Blocpdb> 40 atoms in block 169 Block first atom: 9855 Blocpdb> 49 atoms in block 170 Block first atom: 9895 Blocpdb> 47 atoms in block 171 Block first atom: 9944 Blocpdb> 44 atoms in block 172 Block first atom: 9991 Blocpdb> 52 atoms in block 173 Block first atom: 10035 Blocpdb> 52 atoms in block 174 Block first atom: 10087 Blocpdb> 48 atoms in block 175 Block first atom: 10139 Blocpdb> 46 atoms in block 176 Block first atom: 10187 Blocpdb> 49 atoms in block 177 Block first atom: 10233 Blocpdb> 48 atoms in block 178 Block first atom: 10282 Blocpdb> 45 atoms in block 179 Block first atom: 10330 Blocpdb> 44 atoms in block 180 Block first atom: 10375 Blocpdb> 38 atoms in block 181 Block first atom: 10419 Blocpdb> 46 atoms in block 182 Block first atom: 10457 Blocpdb> 51 atoms in block 183 Block first atom: 10503 Blocpdb> 38 atoms in block 184 Block first atom: 10554 Blocpdb> 51 atoms in block 185 Block first atom: 10592 Blocpdb> 49 atoms in block 186 Block first atom: 10643 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 10692 Blocpdb> 47 atoms in block 188 Block first atom: 10740 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 128 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 38 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3815076 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32361 Prepmat> Matrix trace = 8335280.0000 Prepmat> Last element read: 32361 32361 52.7529 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 16371 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10787 RTB> Total mass = 10787.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10787 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 168853.8748 RTB> 47400 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47400 Diagstd> Projected matrix trace = 168853.8748 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 168853.8748 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0008717 0.0030131 0.0043828 0.0107031 0.0243733 0.0704714 0.1007150 0.1823733 0.2068594 0.2498397 0.2913454 0.3012018 0.4471748 0.4925904 0.5960066 0.6695783 1.0084728 1.2345017 1.3283091 1.5723693 1.7457894 1.9212804 2.2486567 2.3028745 2.4367374 2.5632190 2.6869352 2.9351002 3.0820779 3.2556724 3.5185912 3.6525103 3.8173996 3.8969407 4.1260215 4.2936380 4.4206829 4.6902025 4.8834916 5.0165467 5.2677363 5.4570555 5.6757813 5.9073424 6.1611680 6.3432733 6.5325063 6.7563425 6.8136721 7.0442974 7.0492366 7.4088145 7.4833829 7.6467962 8.2102107 8.2996019 8.3701305 8.5587553 8.6692188 8.8746914 8.9130464 9.0793654 9.1499503 9.3141616 9.5321750 9.8816338 9.9220160 9.9915315 10.1705037 10.2849421 10.4165094 10.8937201 11.2235220 11.2960615 11.9404538 12.1470573 12.2641348 12.6575075 12.8537234 13.0878526 13.4172935 13.4389077 13.6867254 13.7855713 13.9640207 14.5115062 14.8182507 14.9305130 15.2249800 15.3715675 15.6363082 15.7373471 15.9780934 16.1887889 16.2580056 16.4015606 16.8432164 17.0266073 17.3946073 17.4916497 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034342 0.0034344 3.2061203 5.9607520 7.1890436 11.2344281 16.9532175 28.8271434 34.4621468 46.3741475 49.3893018 54.2782724 58.6137345 59.5969577 72.6162678 76.2146155 83.8341212 88.8578804 109.0504267 120.6538361 125.1540355 136.1672180 143.4799451 150.5187697 162.8384116 164.7898338 169.5116850 173.8553827 178.0015866 186.0401769 190.6413409 195.9366270 203.6946796 207.5348367 212.1676138 214.3666284 220.5774053 225.0131992 228.3178998 235.1749591 239.9719632 243.2191184 249.2340031 253.6731279 258.7069560 263.9315758 269.5422235 273.4966376 277.5461452 282.2611521 283.4561577 288.2133695 288.3143927 295.5763225 297.0600590 300.2859670 311.1518818 312.8411762 314.1676004 317.6878351 319.7313798 323.4982317 324.1965314 327.2073318 328.4767603 331.4111869 335.2673665 341.3576633 342.0544482 343.2506051 346.3111799 348.2540747 350.4744678 358.4126970 363.7976259 364.9713754 375.2370363 378.4694424 380.2889781 386.3397345 389.3227261 392.8524604 397.7660753 398.0863308 401.7399838 403.1880617 405.7892349 413.6676187 418.0168122 419.5972613 423.7148112 425.7497076 429.4003468 430.7854655 434.0679875 436.9205389 437.8535899 439.7824214 445.6642475 448.0838999 452.9002855 454.1618658 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10787 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7170E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0131E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3828E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0703E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4373E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0471E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4926 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.687 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.294 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.017 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.907 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.343 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.409 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.300 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.370 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.669 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.922 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.49 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99995 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99996 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 194166 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99995 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99996 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602042136061897888.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602042136061897888.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602042136061897888.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602042136061897888.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1122 First residue number = 1 Last residue number = 120 Number of atoms found = 10787 Mean number per residue = 9.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7170E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0131E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3828E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0703E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4373E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0471E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4926 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.687 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.294 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.017 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.907 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.343 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.409 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.647 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.300 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.370 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.669 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.922 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.49 Bfactors> 106 vectors, 32361 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000872 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.708 for 960 C-alpha atoms. Bfactors> = 2.809 +/- 1.80 Bfactors> = 64.698 +/- 16.92 Bfactors> Shiftng-fct= 61.889 Bfactors> Scaling-fct= 9.401 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602042136061897888.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602042136061897888.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.961 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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Chkmod> That is: 10787 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.5744 0.0034 0.6118 0.0034 0.9160 0.0034 0.7550 0.0034 0.7494 0.0034 0.9141 3.2060 0.7141 5.9605 0.5899 7.1887 0.6365 11.2339 0.7917 16.9524 0.6925 28.8258 0.3094 34.4581 0.4943 46.3755 0.5395 49.3920 0.5643 54.2716 0.6918 58.6066 0.4319 59.5942 0.6271 72.6152 0.5554 76.2121 0.5990 83.8301 0.4140 88.8555 0.4728 109.0202 0.1918 120.6730 0.4226 125.1341 0.3545 136.1454 0.3492 143.4824 0.4870 150.5013 0.5925 162.8439 0.3596 164.7872 0.4919 169.5135 0.6077 173.8405 0.6994 177.9961 0.5382 186.0290 0.3996 190.6307 0.4261 195.9381 0.0364 203.6978 0.4039 207.5398 0.1232 212.1474 0.2912 214.3591 0.0289 220.5674 0.3057 225.0130 0.0171 228.3163 0.0357 235.1598 0.2103 239.9496 0.3258 243.2197 0.0148 249.2295 0.3588 253.6609 0.0420 258.7008 0.3422 263.9126 0.0713 269.5270 0.1578 273.4790 0.3264 277.5447 0.0268 282.2419 0.1280 283.4508 0.3834 288.1949 0.0458 288.2972 0.0456 295.5673 0.1612 297.0397 0.2221 300.2771 0.0720 311.1345 0.1933 312.8352 0.2636 314.1517 0.1014 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-300 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2602042136061897888.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602042136061897888 9 -300 300 60 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-300 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2602042136061897888.eigenfacs 2602042136061897888.atom 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