*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602042157331902694.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602042157331902694.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602042157331902694.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1122
First residue number = 1
Last residue number = 120
Number of atoms found = 10787
Mean number per residue = 9.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -7.923449 +/- 19.608799 From: -48.738000 To: 49.581000
= 34.677296 +/- 59.245891 From: -67.322000 To: 139.968000
= -34.316456 +/- 68.643693 From: -150.217000 To: 73.335000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 162 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.7285 % Filled.
Pdbmat> 3814888 non-zero elements.
Pdbmat> 416764 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.27 +/- 25.96
Maximum number = 179
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 8.335280E+06
Pdbmat> Larger element = 682.554
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1122 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602042157331902694.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602042157331902694.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602042157331902694.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 10787 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1122 residues.
Blocpdb> 40 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 49 atoms in block 2
Block first atom: 41
Blocpdb> 47 atoms in block 3
Block first atom: 90
Blocpdb> 44 atoms in block 4
Block first atom: 137
Blocpdb> 52 atoms in block 5
Block first atom: 181
Blocpdb> 52 atoms in block 6
Block first atom: 233
Blocpdb> 48 atoms in block 7
Block first atom: 285
Blocpdb> 46 atoms in block 8
Block first atom: 333
Blocpdb> 49 atoms in block 9
Block first atom: 379
Blocpdb> 48 atoms in block 10
Block first atom: 428
Blocpdb> 45 atoms in block 11
Block first atom: 476
Blocpdb> 44 atoms in block 12
Block first atom: 521
Blocpdb> 38 atoms in block 13
Block first atom: 565
Blocpdb> 46 atoms in block 14
Block first atom: 603
Blocpdb> 51 atoms in block 15
Block first atom: 649
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 700
Blocpdb> 51 atoms in block 17
Block first atom: 738
Blocpdb> 49 atoms in block 18
Block first atom: 789
Blocpdb> 49 atoms in block 19
Block first atom: 838
Blocpdb> 47 atoms in block 20
Block first atom: 887
Blocpdb> 40 atoms in block 21
Block first atom: 934
Blocpdb> 49 atoms in block 22
Block first atom: 974
Blocpdb> 47 atoms in block 23
Block first atom: 1023
Blocpdb> 44 atoms in block 24
Block first atom: 1070
Blocpdb> 52 atoms in block 25
Block first atom: 1114
Blocpdb> 52 atoms in block 26
Block first atom: 1166
Blocpdb> 48 atoms in block 27
Block first atom: 1218
Blocpdb> 46 atoms in block 28
Block first atom: 1266
Blocpdb> 49 atoms in block 29
Block first atom: 1312
Blocpdb> 48 atoms in block 30
Block first atom: 1361
Blocpdb> 45 atoms in block 31
Block first atom: 1409
Blocpdb> 44 atoms in block 32
Block first atom: 1454
Blocpdb> 38 atoms in block 33
Block first atom: 1498
Blocpdb> 46 atoms in block 34
Block first atom: 1536
Blocpdb> 51 atoms in block 35
Block first atom: 1582
Blocpdb> 38 atoms in block 36
Block first atom: 1633
Blocpdb> 51 atoms in block 37
Block first atom: 1671
Blocpdb> 49 atoms in block 38
Block first atom: 1722
Blocpdb> 49 atoms in block 39
Block first atom: 1771
Blocpdb> 47 atoms in block 40
Block first atom: 1820
Blocpdb> 40 atoms in block 41
Block first atom: 1867
Blocpdb> 49 atoms in block 42
Block first atom: 1907
Blocpdb> 47 atoms in block 43
Block first atom: 1956
Blocpdb> 44 atoms in block 44
Block first atom: 2003
Blocpdb> 52 atoms in block 45
Block first atom: 2047
Blocpdb> 52 atoms in block 46
Block first atom: 2099
Blocpdb> 48 atoms in block 47
Block first atom: 2151
Blocpdb> 46 atoms in block 48
Block first atom: 2199
Blocpdb> 49 atoms in block 49
Block first atom: 2245
Blocpdb> 48 atoms in block 50
Block first atom: 2294
Blocpdb> 45 atoms in block 51
Block first atom: 2342
Blocpdb> 44 atoms in block 52
Block first atom: 2387
Blocpdb> 38 atoms in block 53
Block first atom: 2431
Blocpdb> 46 atoms in block 54
Block first atom: 2469
Blocpdb> 51 atoms in block 55
Block first atom: 2515
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2566
Blocpdb> 51 atoms in block 57
Block first atom: 2604
Blocpdb> 49 atoms in block 58
Block first atom: 2655
Blocpdb> 49 atoms in block 59
Block first atom: 2704
Blocpdb> 47 atoms in block 60
Block first atom: 2753
Blocpdb> 40 atoms in block 61
Block first atom: 2800
Blocpdb> 49 atoms in block 62
Block first atom: 2840
Blocpdb> 47 atoms in block 63
Block first atom: 2889
Blocpdb> 44 atoms in block 64
Block first atom: 2936
Blocpdb> 52 atoms in block 65
Block first atom: 2980
Blocpdb> 52 atoms in block 66
Block first atom: 3032
Blocpdb> 48 atoms in block 67
Block first atom: 3084
Blocpdb> 46 atoms in block 68
Block first atom: 3132
Blocpdb> 49 atoms in block 69
Block first atom: 3178
Blocpdb> 48 atoms in block 70
Block first atom: 3227
Blocpdb> 45 atoms in block 71
Block first atom: 3275
Blocpdb> 44 atoms in block 72
Block first atom: 3320
Blocpdb> 38 atoms in block 73
Block first atom: 3364
Blocpdb> 46 atoms in block 74
Block first atom: 3402
Blocpdb> 51 atoms in block 75
Block first atom: 3448
Blocpdb> 38 atoms in block 76
Block first atom: 3499
Blocpdb> 51 atoms in block 77
Block first atom: 3537
Blocpdb> 49 atoms in block 78
Block first atom: 3588
Blocpdb> 49 atoms in block 79
Block first atom: 3637
Blocpdb> 47 atoms in block 80
Block first atom: 3686
Blocpdb> 121 atoms in block 81
Block first atom: 3733
Blocpdb> 125 atoms in block 82
Block first atom: 3854
Blocpdb> 124 atoms in block 83
Block first atom: 3979
Blocpdb> 123 atoms in block 84
Block first atom: 4103
Blocpdb> 120 atoms in block 85
Block first atom: 4226
Blocpdb> 123 atoms in block 86
Block first atom: 4346
Blocpdb> 124 atoms in block 87
Block first atom: 4469
Blocpdb> 128 atoms in block 88
Block first atom: 4593
Blocpdb> 124 atoms in block 89
Block first atom: 4721
Blocpdb> 123 atoms in block 90
Block first atom: 4845
Blocpdb> 126 atoms in block 91
Block first atom: 4968
Blocpdb> 123 atoms in block 92
Block first atom: 5094
Blocpdb> 119 atoms in block 93
Block first atom: 5217
Blocpdb> 65 atoms in block 94
Block first atom: 5336
Blocpdb> 123 atoms in block 95
Block first atom: 5401
Blocpdb> 125 atoms in block 96
Block first atom: 5524
Blocpdb> 121 atoms in block 97
Block first atom: 5649
Blocpdb> 121 atoms in block 98
Block first atom: 5770
Blocpdb> 124 atoms in block 99
Block first atom: 5891
Blocpdb> 121 atoms in block 100
Block first atom: 6015
Blocpdb> 116 atoms in block 101
Block first atom: 6136
Blocpdb> 125 atoms in block 102
Block first atom: 6252
Blocpdb> 126 atoms in block 103
Block first atom: 6377
Blocpdb> 125 atoms in block 104
Block first atom: 6503
Blocpdb> 119 atoms in block 105
Block first atom: 6628
Blocpdb> 124 atoms in block 106
Block first atom: 6747
Blocpdb> 119 atoms in block 107
Block first atom: 6871
Blocpdb> 66 atoms in block 108
Block first atom: 6990
Blocpdb> 40 atoms in block 109
Block first atom: 7056
Blocpdb> 49 atoms in block 110
Block first atom: 7096
Blocpdb> 47 atoms in block 111
Block first atom: 7145
Blocpdb> 44 atoms in block 112
Block first atom: 7192
Blocpdb> 52 atoms in block 113
Block first atom: 7236
Blocpdb> 52 atoms in block 114
Block first atom: 7288
Blocpdb> 48 atoms in block 115
Block first atom: 7340
Blocpdb> 46 atoms in block 116
Block first atom: 7388
Blocpdb> 49 atoms in block 117
Block first atom: 7434
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 7483
Blocpdb> 45 atoms in block 119
Block first atom: 7531
Blocpdb> 44 atoms in block 120
Block first atom: 7576
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 7620
Blocpdb> 46 atoms in block 122
Block first atom: 7658
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 7704
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 7755
Blocpdb> 51 atoms in block 125
Block first atom: 7793
Blocpdb> 49 atoms in block 126
Block first atom: 7844
Blocpdb> 49 atoms in block 127
Block first atom: 7893
Blocpdb> 47 atoms in block 128
Block first atom: 7942
Blocpdb> 40 atoms in block 129
Block first atom: 7989
Blocpdb> 49 atoms in block 130
Block first atom: 8029
Blocpdb> 47 atoms in block 131
Block first atom: 8078
Blocpdb> 44 atoms in block 132
Block first atom: 8125
Blocpdb> 52 atoms in block 133
Block first atom: 8169
Blocpdb> 52 atoms in block 134
Block first atom: 8221
Blocpdb> 48 atoms in block 135
Block first atom: 8273
Blocpdb> 46 atoms in block 136
Block first atom: 8321
Blocpdb> 49 atoms in block 137
Block first atom: 8367
Blocpdb> 48 atoms in block 138
Block first atom: 8416
Blocpdb> 45 atoms in block 139
Block first atom: 8464
Blocpdb> 44 atoms in block 140
Block first atom: 8509
Blocpdb> 38 atoms in block 141
Block first atom: 8553
Blocpdb> 46 atoms in block 142
Block first atom: 8591
Blocpdb> 51 atoms in block 143
Block first atom: 8637
Blocpdb> 38 atoms in block 144
Block first atom: 8688
Blocpdb> 51 atoms in block 145
Block first atom: 8726
Blocpdb> 49 atoms in block 146
Block first atom: 8777
Blocpdb> 49 atoms in block 147
Block first atom: 8826
Blocpdb> 47 atoms in block 148
Block first atom: 8875
Blocpdb> 40 atoms in block 149
Block first atom: 8922
Blocpdb> 49 atoms in block 150
Block first atom: 8962
Blocpdb> 47 atoms in block 151
Block first atom: 9011
Blocpdb> 44 atoms in block 152
Block first atom: 9058
Blocpdb> 52 atoms in block 153
Block first atom: 9102
Blocpdb> 52 atoms in block 154
Block first atom: 9154
Blocpdb> 48 atoms in block 155
Block first atom: 9206
Blocpdb> 46 atoms in block 156
Block first atom: 9254
Blocpdb> 49 atoms in block 157
Block first atom: 9300
Blocpdb> 48 atoms in block 158
Block first atom: 9349
Blocpdb> 45 atoms in block 159
Block first atom: 9397
Blocpdb> 44 atoms in block 160
Block first atom: 9442
Blocpdb> 38 atoms in block 161
Block first atom: 9486
Blocpdb> 46 atoms in block 162
Block first atom: 9524
Blocpdb> 51 atoms in block 163
Block first atom: 9570
Blocpdb> 38 atoms in block 164
Block first atom: 9621
Blocpdb> 51 atoms in block 165
Block first atom: 9659
Blocpdb> 49 atoms in block 166
Block first atom: 9710
Blocpdb> 49 atoms in block 167
Block first atom: 9759
Blocpdb> 47 atoms in block 168
Block first atom: 9808
Blocpdb> 40 atoms in block 169
Block first atom: 9855
Blocpdb> 49 atoms in block 170
Block first atom: 9895
Blocpdb> 47 atoms in block 171
Block first atom: 9944
Blocpdb> 44 atoms in block 172
Block first atom: 9991
Blocpdb> 52 atoms in block 173
Block first atom: 10035
Blocpdb> 52 atoms in block 174
Block first atom: 10087
Blocpdb> 48 atoms in block 175
Block first atom: 10139
Blocpdb> 46 atoms in block 176
Block first atom: 10187
Blocpdb> 49 atoms in block 177
Block first atom: 10233
Blocpdb> 48 atoms in block 178
Block first atom: 10282
Blocpdb> 45 atoms in block 179
Block first atom: 10330
Blocpdb> 44 atoms in block 180
Block first atom: 10375
Blocpdb> 38 atoms in block 181
Block first atom: 10419
Blocpdb> 46 atoms in block 182
Block first atom: 10457
Blocpdb> 51 atoms in block 183
Block first atom: 10503
Blocpdb> 38 atoms in block 184
Block first atom: 10554
Blocpdb> 51 atoms in block 185
Block first atom: 10592
Blocpdb> 49 atoms in block 186
Block first atom: 10643
Blocpdb> 49 atoms in block 187
Block first atom: 10692
Blocpdb> 47 atoms in block 188
Block first atom: 10740
Blocpdb> 188 blocks.
Blocpdb> At most, 128 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 38 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3815076 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 32361
Prepmat> Matrix trace = 8335280.0000
Prepmat> Last element read: 32361 32361 52.7529
Prepmat> 17767 lines saved.
Prepmat> 16371 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10787
RTB> Total mass = 10787.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 10787
RTB> Number of blocks = 188
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 168853.8748
RTB> 47400 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1128
Diagstd> Nb of non-zero elements: 47400
Diagstd> Projected matrix trace = 168853.8748
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1128 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 168853.8748
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0008717 0.0030131 0.0043828 0.0107031
0.0243733 0.0704714 0.1007150 0.1823733 0.2068594
0.2498397 0.2913454 0.3012018 0.4471748 0.4925904
0.5960066 0.6695783 1.0084728 1.2345017 1.3283091
1.5723693 1.7457894 1.9212804 2.2486567 2.3028745
2.4367374 2.5632190 2.6869352 2.9351002 3.0820779
3.2556724 3.5185912 3.6525103 3.8173996 3.8969407
4.1260215 4.2936380 4.4206829 4.6902025 4.8834916
5.0165467 5.2677363 5.4570555 5.6757813 5.9073424
6.1611680 6.3432733 6.5325063 6.7563425 6.8136721
7.0442974 7.0492366 7.4088145 7.4833829 7.6467962
8.2102107 8.2996019 8.3701305 8.5587553 8.6692188
8.8746914 8.9130464 9.0793654 9.1499503 9.3141616
9.5321750 9.8816338 9.9220160 9.9915315 10.1705037
10.2849421 10.4165094 10.8937201 11.2235220 11.2960615
11.9404538 12.1470573 12.2641348 12.6575075 12.8537234
13.0878526 13.4172935 13.4389077 13.6867254 13.7855713
13.9640207 14.5115062 14.8182507 14.9305130 15.2249800
15.3715675 15.6363082 15.7373471 15.9780934 16.1887889
16.2580056 16.4015606 16.8432164 17.0266073 17.3946073
17.4916497
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034342
0.0034344 3.2061203 5.9607520 7.1890436 11.2344281
16.9532175 28.8271434 34.4621468 46.3741475 49.3893018
54.2782724 58.6137345 59.5969577 72.6162678 76.2146155
83.8341212 88.8578804 109.0504267 120.6538361 125.1540355
136.1672180 143.4799451 150.5187697 162.8384116 164.7898338
169.5116850 173.8553827 178.0015866 186.0401769 190.6413409
195.9366270 203.6946796 207.5348367 212.1676138 214.3666284
220.5774053 225.0131992 228.3178998 235.1749591 239.9719632
243.2191184 249.2340031 253.6731279 258.7069560 263.9315758
269.5422235 273.4966376 277.5461452 282.2611521 283.4561577
288.2133695 288.3143927 295.5763225 297.0600590 300.2859670
311.1518818 312.8411762 314.1676004 317.6878351 319.7313798
323.4982317 324.1965314 327.2073318 328.4767603 331.4111869
335.2673665 341.3576633 342.0544482 343.2506051 346.3111799
348.2540747 350.4744678 358.4126970 363.7976259 364.9713754
375.2370363 378.4694424 380.2889781 386.3397345 389.3227261
392.8524604 397.7660753 398.0863308 401.7399838 403.1880617
405.7892349 413.6676187 418.0168122 419.5972613 423.7148112
425.7497076 429.4003468 430.7854655 434.0679875 436.9205389
437.8535899 439.7824214 445.6642475 448.0838999 452.9002855
454.1618658
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10787
Rtb_to_modes> Number of blocs = 188
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.897
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.690
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.268
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.676
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.647
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.669
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.875
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.913
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.314
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.882
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.922
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.49
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
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0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
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1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
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0.99997
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 194166 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
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1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
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1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
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0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000
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1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996
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1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
0.99997
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602042157331902694.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602042157331902694.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602042157331902694.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602042157331902694.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1122
First residue number = 1
Last residue number = 120
Number of atoms found = 10787
Mean number per residue = 9.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7170E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0131E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3828E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0703E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4373E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0471E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1824
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2069
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2498
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2913
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4472
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4926
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.049
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.150
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.314
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.49
Bfactors> 106 vectors, 32361 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000872
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.708 for 960 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.809 +/- 1.80
Bfactors> = 64.698 +/- 16.92
Bfactors> Shiftng-fct= 61.889
Bfactors> Scaling-fct= 9.401
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602042157331902694.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602042157331902694.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.189
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.1
Chkmod> 106 vectors, 32361 coordinates in file.
Chkmod> That is: 10787 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.5744
0.0034 0.6118
0.0034 0.9160
0.0034 0.7550
0.0034 0.7494
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21 models are in 2602042157331902694.10.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602042157331902694 11 -1000 1000 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m32.279s
user 1m31.868s
sys 0m0.378s
rm: cannot remove '2602042157331902694.sdijf': No such file or directory
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