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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* HYDROLASE 29-MAR-07 2PC0 *

LOGs for ID: 2602061624483061109

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602061624483061109.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602061624483061109.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602061624483061109.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     99
            First residue number     =   1001
            Last  residue number     =   1099
            Number of atoms found    =    834
            Mean number per residue  =      8.4

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     3.104373 +/-     6.217967 From:    -9.840000 To:    15.065000
 =     4.287610 +/-     8.862351 From:   -13.281000 To:    23.344000
 =   -11.253145 +/-     8.090578 From:   -27.480000 To:     9.757000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   9.1813 % Filled.
 Pdbmat>       287491  non-zero elements.
 Pdbmat>        31393 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     75.28 +/-     27.82
         Maximum number =    133
         Minimum number =     14

 Pdbmat> Matrix trace   =  627860.    
 Pdbmat> Larger element =  580.535    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
99 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602061624483061109.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602061624483061109.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602061624483061109.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   834 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    99 residues.
 Blocpdb>     7 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     9 atoms in block      2
 Block first atom:      8
 Blocpdb>     8 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>     7 atoms in block      4
 Block first atom:     25
 Blocpdb>     8 atoms in block      5
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     40
 Blocpdb>    18 atoms in block      7
 Block first atom:     54
 Blocpdb>    22 atoms in block      8
 Block first atom:     72
 Blocpdb>     7 atoms in block      9
 Block first atom:     94
 Blocpdb>     8 atoms in block     10
 Block first atom:    101
 Blocpdb>     7 atoms in block     11
 Block first atom:    109
 Blocpdb>     7 atoms in block     12
 Block first atom:    116
 Blocpdb>     8 atoms in block     13
 Block first atom:    123
 Blocpdb>     9 atoms in block     14
 Block first atom:    131
 Blocpdb>     8 atoms in block     15
 Block first atom:    140
 Blocpdb>     4 atoms in block     16
 Block first atom:    148
 Blocpdb>     4 atoms in block     17
 Block first atom:    152
 Blocpdb>     9 atoms in block     18
 Block first atom:    156
 Blocpdb>     8 atoms in block     19
 Block first atom:    165
 Blocpdb>     9 atoms in block     20
 Block first atom:    173
 Blocpdb>    18 atoms in block     21
 Block first atom:    182
 Blocpdb>     5 atoms in block     22
 Block first atom:    200
 Blocpdb>     8 atoms in block     23
 Block first atom:    205
 Blocpdb>     8 atoms in block     24
 Block first atom:    213
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    221
 Blocpdb>     7 atoms in block     26
 Block first atom:    229
 Blocpdb>     4 atoms in block     27
 Block first atom:    236
 Blocpdb>     5 atoms in block     28
 Block first atom:    240
 Blocpdb>     8 atoms in block     29
 Block first atom:    245
 Blocpdb>     8 atoms in block     30
 Block first atom:    253
 Blocpdb>     7 atoms in block     31
 Block first atom:    261
 Blocpdb>    14 atoms in block     32
 Block first atom:    268
 Blocpdb>     8 atoms in block     33
 Block first atom:    282
 Blocpdb>     9 atoms in block     34
 Block first atom:    290
 Blocpdb>     9 atoms in block     35
 Block first atom:    299
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    308
 Blocpdb>     8 atoms in block     37
 Block first atom:    324
 Blocpdb>     8 atoms in block     38
 Block first atom:    332
 Blocpdb>     7 atoms in block     39
 Block first atom:    340
 Blocpdb>     4 atoms in block     40
 Block first atom:    347
 Blocpdb>    11 atoms in block     41
 Block first atom:    351
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    362
 Blocpdb>     9 atoms in block     43
 Block first atom:    376
 Blocpdb>     7 atoms in block     44
 Block first atom:    385
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    392
 Blocpdb>     8 atoms in block     46
 Block first atom:    401
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    409
 Blocpdb>     4 atoms in block     48
 Block first atom:    417
 Blocpdb>     4 atoms in block     49
 Block first atom:    421
 Blocpdb>     8 atoms in block     50
 Block first atom:    425
 Blocpdb>     4 atoms in block     51
 Block first atom:    433
 Blocpdb>     4 atoms in block     52
 Block first atom:    437
 Blocpdb>    11 atoms in block     53
 Block first atom:    441
 Blocpdb>     8 atoms in block     54
 Block first atom:    452
 Blocpdb>     9 atoms in block     55
 Block first atom:    460
 Blocpdb>     7 atoms in block     56
 Block first atom:    469
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    476
 Blocpdb>     9 atoms in block     58
 Block first atom:    487
 Blocpdb>    12 atoms in block     59
 Block first atom:    496
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    508
 Blocpdb>     9 atoms in block     61
 Block first atom:    516
 Blocpdb>     8 atoms in block     62
 Block first atom:    525
 Blocpdb>     8 atoms in block     63
 Block first atom:    533
 Blocpdb>    16 atoms in block     64
 Block first atom:    541
 Blocpdb>     9 atoms in block     65
 Block first atom:    557
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    566
 Blocpdb>     6 atoms in block     67
 Block first atom:    574
 Blocpdb>     4 atoms in block     68
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    10 atoms in block     69
 Block first atom:    584
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    594
 Blocpdb>     5 atoms in block     71
 Block first atom:    603
 Blocpdb>     8 atoms in block     72
 Block first atom:    608
 Blocpdb>     4 atoms in block     73
 Block first atom:    616
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    620
 Blocpdb>     7 atoms in block     75
 Block first atom:    627
 Blocpdb>     8 atoms in block     76
 Block first atom:    634
 Blocpdb>     7 atoms in block     77
 Block first atom:    642
 Blocpdb>     4 atoms in block     78
 Block first atom:    649
 Blocpdb>     7 atoms in block     79
 Block first atom:    653
 Blocpdb>     7 atoms in block     80
 Block first atom:    660
 Blocpdb>     7 atoms in block     81
 Block first atom:    667
 Blocpdb>     7 atoms in block     82
 Block first atom:    674
 Blocpdb>     8 atoms in block     83
 Block first atom:    681
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:    689
 Blocpdb>     8 atoms in block     85
 Block first atom:    705
 Blocpdb>     4 atoms in block     86
 Block first atom:    713
 Blocpdb>    11 atoms in block     87
 Block first atom:    717
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    728
 Blocpdb>     8 atoms in block     89
 Block first atom:    736
 Blocpdb>     8 atoms in block     90
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    21 atoms in block     91
 Block first atom:    752
 Blocpdb>     9 atoms in block     92
 Block first atom:    773
 Blocpdb>     8 atoms in block     93
 Block first atom:    782
 Blocpdb>     4 atoms in block     94
 Block first atom:    790
 Blocpdb>     6 atoms in block     95
 Block first atom:    794
 Blocpdb>     7 atoms in block     96
 Block first atom:    800
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    807
 Blocpdb>     8 atoms in block     98
 Block first atom:    815
 Blocpdb>    12 atoms in block     99
 Block first atom:    822

 Blocpdb>    99 blocks.

 Blocpdb> At most,     22 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       287590 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2502

 Prepmat> Matrix trace    =     627860.0000
 Prepmat> Last element read:    2502   2502        84.8359
 Prepmat>         4951 lines saved.
 Prepmat>         3868 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   834
 RTB> Total mass =         834.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   834
 RTB> Number of blocks =    99
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  134245.1446
 RTB>     37467 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      594
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    37467
 Diagstd> Projected matrix trace =  134245.1446

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    594 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 134245.1446
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.3205368      2.1477220      2.1852666      2.8093332
      3.5022633      3.9803646      5.5326281      5.7814811      7.5254860
      8.3366003      8.9915388     10.8316151     11.2561634     12.8318118
     15.2658320     16.1419895     17.0412093     18.3962146     18.4773000
     20.1033791     21.1659244     21.7286540     22.1815736     23.5449358
     24.3732915     25.0634456     25.8907314     26.7732086     28.0624079
     28.5804448     28.8663791     30.7530342     31.1104275     31.7412010
     33.6447894     34.5988375     36.6266980     37.4276939     37.8891624
     38.2509527     39.5519554     39.7207084     42.1720513     43.5080744
     44.0703449     45.0026530     46.5111317     46.8937336     47.5740942
     48.4462931     49.3814601     50.0106442     50.9586969     51.4791586
     52.9572540     53.2587605     54.0137962     54.8567101     56.3955421
     56.5989267     58.2397483     59.1970803     59.3030606     60.0949002
     61.3645046     63.2702344     63.6884994     64.8587001     65.9551912
     66.1729377     66.9781774     68.7152814     69.4609922     70.4800185
     71.2910151     72.6527473     73.4892266     74.2380776     74.9258850
     76.3750005     77.3380880     77.9931054     78.1918085     79.1822803
     79.6322668     81.4642017     82.1342654     83.2077814     83.8539322
     84.7790754     86.2920335     87.1483591     87.5868667     88.0878761
     88.4219894     89.2590165     89.6601636     89.7295672     90.6223456
     91.2194243

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034323      0.0034331      0.0034331      0.0034335      0.0034342
      0.0034349    124.7873444    159.1418168    160.5267805    182.0106929
    203.2215102    216.6490093    255.4235975    261.1047881    297.8945494
    313.5377006    325.6209152    357.3895829    364.3262601    388.9907472
    424.2828912    436.2885445    448.2759978    465.7571323    466.7824674
    486.8888303    499.5901888    506.1878220    511.4361904    526.9192139
    536.1081029    543.6453378    552.5447282    561.8824812    575.2514828
    580.5368232    583.4335986    602.1979402    605.6870245    611.7964572
    629.8747330    638.7428232    657.1948686    664.3421610    668.4251510
    671.6088471    682.9348263    684.3901852    705.1924330    716.2756898
    720.8891761    728.4744747    740.5829915    743.6227814    748.9978036
    755.8324900    763.0926033    767.9386122    775.1833518    779.1319259
    790.2381805    792.4845568    798.0822115    804.2853523    815.4881753
    816.9573380    828.7146662    835.4980178    836.2455780    841.8100170
    850.6558569    863.7638063    866.6141753    874.5394406    881.9008722
    883.3554398    888.7138391    900.1646312    905.0358269    911.6503122
    916.8803801    925.5956418    930.9087635    935.6396954    939.9640006
    949.0102288    954.9749852    959.0105541    960.2314126    966.2939991
    969.0357949    980.1187182    984.1413258    990.5519366    994.3905693
    999.8609753   1008.7432278   1013.7360416   1016.2832679   1019.1857662
   1021.1167993   1025.9385027   1028.2413003   1028.6391909   1033.7438284
   1037.1437241

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    834
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     99

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.321    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.148    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.185    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.809    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.502    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.980    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.533    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.781    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.525    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.337    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.992    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.22    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    594 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00004 0.99997 0.99997 0.99996
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997
 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 1.00002
 0.99999 0.99996 0.99998 0.99996 1.00003
 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00003 1.00003 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002
 0.99998 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00005
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003
 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 0.99997
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99998 1.00003 1.00000 0.99994 1.00002
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    15012 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00004 0.99997 0.99997 0.99996
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997
 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 1.00002
 0.99999 0.99996 0.99998 0.99996 1.00003
 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00003 1.00003 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002
 0.99998 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00005
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003
 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 0.99997
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99998 1.00003 1.00000 0.99994 1.00002
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602061624483061109.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602061624483061109.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602061624483061109.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602061624483061109.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     99
            First residue number     =   1001
            Last  residue number     =   1099
            Number of atoms found    =    834
            Mean number per residue  =      8.4

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.321    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.148    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.185    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.809    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.502    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.980    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.533    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.781    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.525    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.337    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.992    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.22    

 Bfactors>  106 vectors,   2502 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.321000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.075 for    108 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.079 +/-   0.18
 Bfactors> =     15.886 +/-   3.21
 Bfactors> Shiftng-fct=     15.807
 Bfactors> Scaling-fct=     17.760

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602061624483061109.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602061624483061109.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   124.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   159.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   160.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   182.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   203.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   216.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   255.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   261.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   297.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   313.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   325.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   357.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   364.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   388.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   424.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   436.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   448.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   465.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   466.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   486.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   499.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   511.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   526.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   536.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   543.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   552.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   575.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   580.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   583.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   602.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   605.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   611.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   629.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   638.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   664.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1026.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1028.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1029.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1034.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1037.    

 Chkmod>  106 vectors,   2502 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    834 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    27 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    70 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   104 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7502
      0.0034      0.8469
      0.0034      0.6555
      0.0034      0.8213
      0.0034      0.9354
      0.0034      0.7984
    124.8039      0.0478
    159.1453      0.1104
    160.5101      0.1144
    181.9921      0.1627
    203.2051      0.1917
    216.6298      0.0242
    255.4212      0.4379
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    297.8721      0.2439
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    466.7965      0.3374
    486.8270      0.1581
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    506.1818      0.2343
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    543.5846      0.3016
    552.5132      0.3705
    561.8247      0.1997
    575.2021      0.1850
    580.5074      0.0534
    583.4451      0.3856
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    605.6569      0.2838
    611.7586      0.2297
    629.8029      0.3225
    638.7261      0.4530
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    664.3341      0.0282
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    999.8235      0.1262
   1008.6880      0.2500
   1013.7021      0.3815
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   1028.1962      0.3584
   1028.5975      0.1282
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   1037.1025      0.2962
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602061624483061109 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602061624483061109.eigenfacs
2602061624483061109.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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2602061624483061109.atom
making animated gifs
11 models are in 2602061624483061109.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602061624483061109.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602061624483061109.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602061624483061109 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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calculating perturbed structure for DQ=60
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11 models are in 2602061624483061109.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602061624483061109.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602061624483061109.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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2602061624483061109.8.pdb
2602061624483061109.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m3.673s
user	0m3.639s
sys	0m0.032s
rm: cannot remove '2602061624483061109.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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