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LOGs for ID: 2602061631263072433

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602061631263072433.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602061631263072433.atom to be opened. Openam> File opened: 2602061631263072433.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1001 Last residue number = 1099 Number of atoms found = 1668 Mean number per residue = 8.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 3.695992 +/- 7.678034 From: -13.281000 To: 23.344000 = 3.695992 +/- 7.678034 From: -13.281000 To: 23.344000 = -0.000000 +/- 13.859680 From: -27.480000 To: 27.480000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.1466 % Filled. Pdbmat> 644487 non-zero elements. Pdbmat> 70511 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.55 +/- 26.06 Maximum number = 134 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 1.410220E+06 Pdbmat> Larger element = 609.445 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 198 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602061631263072433.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602061631263072433.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602061631263072433.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1668 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 198 residues. Blocpdb> 7 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 9 atoms in block 2 Block first atom: 8 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 17 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 25 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 32 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 40 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 54 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 72 Blocpdb> 7 atoms in block 9 Block first atom: 94 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 101 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 109 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 116 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 123 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 131 Blocpdb> 8 atoms in block 15 Block first atom: 140 Blocpdb> 4 atoms in block 16 Block first atom: 148 Blocpdb> 4 atoms in block 17 Block first atom: 152 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 156 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 165 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 173 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 182 Blocpdb> 5 atoms in block 22 Block first atom: 200 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 205 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 213 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 221 Blocpdb> 7 atoms in block 26 Block first atom: 229 Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 236 Blocpdb> 5 atoms in block 28 Block first atom: 240 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 245 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 253 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 261 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 268 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 282 Blocpdb> 9 atoms in block 34 Block first atom: 290 Blocpdb> 9 atoms in block 35 Block first atom: 299 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 308 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 324 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 332 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 340 Blocpdb> 4 atoms in block 40 Block first atom: 347 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 351 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 362 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 376 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 385 Blocpdb> 9 atoms in block 45 Block first atom: 392 Blocpdb> 8 atoms in block 46 Block first atom: 401 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 409 Blocpdb> 4 atoms in block 48 Block first atom: 417 Blocpdb> 4 atoms in block 49 Block first atom: 421 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 425 Blocpdb> 4 atoms in block 51 Block first atom: 433 Blocpdb> 4 atoms in block 52 Block first atom: 437 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 441 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 452 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 460 Blocpdb> 7 atoms in block 56 Block first atom: 469 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 476 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 487 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 496 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 508 Blocpdb> 9 atoms in block 61 Block first atom: 516 Blocpdb> 8 atoms in block 62 Block first atom: 525 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 533 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 541 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 557 Blocpdb> 8 atoms in block 66 Block first atom: 566 Blocpdb> 6 atoms in block 67 Block first atom: 574 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 580 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 584 Blocpdb> 9 atoms in block 70 Block first atom: 594 Blocpdb> 5 atoms in block 71 Block first atom: 603 Blocpdb> 8 atoms in block 72 Block first atom: 608 Blocpdb> 4 atoms in block 73 Block first atom: 616 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 620 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 627 Blocpdb> 8 atoms in block 76 Block first atom: 634 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 642 Blocpdb> 4 atoms in block 78 Block first atom: 649 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 653 Blocpdb> 7 atoms in block 80 Block first atom: 660 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 667 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 674 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 681 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 689 Blocpdb> 8 atoms in block 85 Block first atom: 705 Blocpdb> 4 atoms in block 86 Block first atom: 713 Blocpdb> 11 atoms in block 87 Block first atom: 717 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 728 Blocpdb> 8 atoms in block 89 Block first atom: 736 Blocpdb> 8 atoms in block 90 Block first atom: 744 Blocpdb> 21 atoms in block 91 Block first atom: 752 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 773 Blocpdb> 8 atoms in block 93 Block first atom: 782 Blocpdb> 4 atoms in block 94 Block first atom: 790 Blocpdb> 6 atoms in block 95 Block first atom: 794 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 800 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 807 Blocpdb> 8 atoms in block 98 Block first atom: 815 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 823 Blocpdb> 7 atoms in block 100 Block first atom: 835 Blocpdb> 9 atoms in block 101 Block first atom: 842 Blocpdb> 8 atoms in block 102 Block first atom: 851 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 859 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 866 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 874 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 888 Blocpdb> 22 atoms in block 107 Block first atom: 906 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 928 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 935 Blocpdb> 7 atoms in block 110 Block first atom: 943 Blocpdb> 7 atoms in block 111 Block first atom: 950 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 957 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 965 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 974 Blocpdb> 4 atoms in block 115 Block first atom: 982 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 986 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 990 Blocpdb> 8 atoms in block 118 Block first atom: 999 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 1007 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1016 Blocpdb> 5 atoms in block 121 Block first atom: 1034 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 1039 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 1047 Blocpdb> 8 atoms in block 124 Block first atom: 1055 Blocpdb> 7 atoms in block 125 Block first atom: 1063 Blocpdb> 4 atoms in block 126 Block first atom: 1070 Blocpdb> 5 atoms in block 127 Block first atom: 1074 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1079 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1087 Blocpdb> 7 atoms in block 130 Block first atom: 1095 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 1102 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1116 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1124 Blocpdb> 9 atoms in block 134 Block first atom: 1133 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 1142 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1158 Blocpdb> 8 atoms in block 137 Block first atom: 1166 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1174 Blocpdb> 4 atoms in block 139 Block first atom: 1181 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 1185 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 1196 Blocpdb> 9 atoms in block 142 Block first atom: 1210 Blocpdb> 7 atoms in block 143 Block first atom: 1219 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 1226 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1235 Blocpdb> 8 atoms in block 146 Block first atom: 1243 Blocpdb> 4 atoms in block 147 Block first atom: 1251 Blocpdb> 4 atoms in block 148 Block first atom: 1255 Blocpdb> 8 atoms in block 149 Block first atom: 1259 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1267 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1271 Blocpdb> 11 atoms in block 152 Block first atom: 1275 Blocpdb> 8 atoms in block 153 Block first atom: 1286 Blocpdb> 9 atoms in block 154 Block first atom: 1294 Blocpdb> 7 atoms in block 155 Block first atom: 1303 Blocpdb> 11 atoms in block 156 Block first atom: 1310 Blocpdb> 9 atoms in block 157 Block first atom: 1321 Blocpdb> 12 atoms in block 158 Block first atom: 1330 Blocpdb> 8 atoms in block 159 Block first atom: 1342 Blocpdb> 9 atoms in block 160 Block first atom: 1350 Blocpdb> 8 atoms in block 161 Block first atom: 1359 Blocpdb> 8 atoms in block 162 Block first atom: 1367 Blocpdb> 16 atoms in block 163 Block first atom: 1375 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 1391 Blocpdb> 8 atoms in block 165 Block first atom: 1400 Blocpdb> 6 atoms in block 166 Block first atom: 1408 Blocpdb> 4 atoms in block 167 Block first atom: 1414 Blocpdb> 10 atoms in block 168 Block first atom: 1418 Blocpdb> 9 atoms in block 169 Block first atom: 1428 Blocpdb> 5 atoms in block 170 Block first atom: 1437 Blocpdb> 8 atoms in block 171 Block first atom: 1442 Blocpdb> 4 atoms in block 172 Block first atom: 1450 Blocpdb> 7 atoms in block 173 Block first atom: 1454 Blocpdb> 7 atoms in block 174 Block first atom: 1461 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 1468 Blocpdb> 7 atoms in block 176 Block first atom: 1476 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 1483 Blocpdb> 7 atoms in block 178 Block first atom: 1487 Blocpdb> 7 atoms in block 179 Block first atom: 1494 Blocpdb> 7 atoms in block 180 Block first atom: 1501 Blocpdb> 7 atoms in block 181 Block first atom: 1508 Blocpdb> 8 atoms in block 182 Block first atom: 1515 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 1523 Blocpdb> 8 atoms in block 184 Block first atom: 1539 Blocpdb> 4 atoms in block 185 Block first atom: 1547 Blocpdb> 11 atoms in block 186 Block first atom: 1551 Blocpdb> 8 atoms in block 187 Block first atom: 1562 Blocpdb> 8 atoms in block 188 Block first atom: 1570 Blocpdb> 8 atoms in block 189 Block first atom: 1578 Blocpdb> 21 atoms in block 190 Block first atom: 1586 Blocpdb> 9 atoms in block 191 Block first atom: 1607 Blocpdb> 8 atoms in block 192 Block first atom: 1616 Blocpdb> 4 atoms in block 193 Block first atom: 1624 Blocpdb> 6 atoms in block 194 Block first atom: 1628 Blocpdb> 7 atoms in block 195 Block first atom: 1634 Blocpdb> 8 atoms in block 196 Block first atom: 1641 Blocpdb> 8 atoms in block 197 Block first atom: 1649 Blocpdb> 12 atoms in block 198 Block first atom: 1656 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 644685 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5004 Prepmat> Matrix trace = 1410220.0000 Prepmat> Last element read: 5004 5004 192.8865 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17238 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1668 RTB> Total mass = 1668.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1668 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 305663.5019 RTB> 85698 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 85698 Diagstd> Projected matrix trace = 305663.5019 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 305663.5019 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.9154411 2.4201663 2.8162031 4.2279290 4.8209019 5.8171534 5.9081716 7.3421919 7.5184065 8.7500165 8.8455515 9.3886484 9.6602727 10.3519921 13.0134507 13.6381607 14.5899631 18.0635598 18.2129287 18.7500101 19.0663225 20.3764941 20.8858647 21.6764047 21.7150415 22.4348106 23.0237321 23.5406618 24.1163737 25.6581844 25.7421399 28.0888838 28.2893685 28.4604235 29.1786649 30.8551344 31.2446738 31.3662095 31.9957008 33.3580887 34.0270507 34.6457738 35.4512432 35.5940889 37.2966504 38.2945231 38.4083060 39.2674292 39.6424416 40.3479755 40.4860054 42.0634194 43.3664355 43.8172852 44.5381537 44.6490669 45.6994911 46.4878121 47.1859058 48.2526788 49.7264824 49.7332956 49.8910262 50.0360748 51.0088166 52.1533358 52.7414712 53.4291407 53.8245388 55.4544995 55.5214232 55.5978327 56.5195445 56.5622836 56.8290027 57.8985285 58.4982385 59.5979537 59.7915905 60.1946876 60.3668020 61.7000033 61.7801666 62.9664732 63.2868644 63.9678349 64.9262022 65.9038001 66.2334820 67.1299791 68.0335967 68.6102476 69.2052703 69.7365591 71.1080283 71.4642914 72.6017048 72.7359780 73.3643622 74.1800345 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034331 0.0034336 0.0034336 0.0034339 0.0034355 150.2898598 168.9343199 182.2331003 223.2847809 238.4291912 261.9090693 263.9500991 294.2443599 297.7543967 321.2178833 322.9666932 332.7337212 337.5125875 349.3874065 391.7342248 401.0266018 414.7843651 461.5268276 463.4310994 470.2145169 474.1641856 490.1849935 496.2739851 505.5788588 506.0292398 514.3473235 521.0544892 526.8713881 533.2750715 550.0576903 550.9568705 575.5227839 577.5730316 579.3165815 586.5809958 603.1967622 606.9924337 608.1718294 614.2442420 627.1852846 633.4428442 639.1759320 646.5632486 647.8645559 663.1781287 671.9912423 672.9888311 680.4739666 683.7155824 689.7729423 690.9517870 704.2835869 715.1088354 718.8164605 724.7052123 725.6070171 734.0927964 740.3973125 745.9357611 754.3206456 765.7537805 765.8062381 767.0196654 768.1338374 775.5644686 784.2171332 788.6265612 793.7511639 796.6827963 808.6557430 809.1435473 809.7001342 816.3842297 816.6928393 818.6161296 826.2834295 830.5517060 838.3221756 839.6829472 842.5086390 843.7122695 852.9780860 853.5320192 861.6878405 863.8773146 868.5125656 874.9944139 881.5572246 883.7594564 889.7203748 895.6884955 899.4764011 903.3683377 906.8292874 915.7029187 917.9939653 925.2704441 926.1256694 930.1175811 935.2738589 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1668 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.420 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.816 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.821 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.660 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.18 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00003 1.00002 0.99995 0.99996 0.99996 0.99996 0.99995 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00006 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 0.99994 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00005 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 30024 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00003 1.00002 0.99995 0.99996 0.99996 0.99996 0.99995 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00006 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 0.99994 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00005 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602061631263072433.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602061631263072433.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602061631263072433.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602061631263072433.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1001 Last residue number = 1099 Number of atoms found = 1668 Mean number per residue = 8.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.816 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.821 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.660 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.18 Bfactors> 106 vectors, 5004 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.915000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.047 for 216 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.046 +/- 0.11 Bfactors> = 15.886 +/- 3.21 Bfactors> Shiftng-fct= 15.841 Bfactors> Scaling-fct= 28.532 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602061631263072433.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602061631263072433.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.7 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Chkmod> That is: 1668 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 54 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7590 0.0034 0.9605 0.0034 0.6677 0.0034 0.8060 0.0034 0.9038 0.0034 0.9110 150.2661 0.4142 168.9213 0.2933 182.2187 0.6711 223.2771 0.2076 238.4214 0.1621 261.8944 0.1116 263.9349 0.3258 294.2279 0.1266 297.7336 0.1942 321.2038 0.0690 322.9610 0.0435 332.7257 0.3926 337.4933 0.1445 349.3388 0.2490 391.6655 0.7336 401.0364 0.3326 414.7671 0.4021 461.4615 0.0726 463.3739 0.0857 470.1942 0.2741 474.1896 0.1453 490.2061 0.1508 496.3018 0.3490 505.5991 0.0654 506.0653 0.0197 514.2701 0.2971 520.9899 0.3396 526.8414 0.2656 533.2923 0.2309 550.0535 0.4174 550.9103 0.5007 575.5095 0.3963 577.5547 0.4454 579.2874 0.1089 586.5692 0.2254 603.2184 0.2595 606.9210 0.1994 608.1825 0.2002 614.2591 0.5538 627.1763 0.1274 633.4431 0.4190 639.1875 0.5260 646.5242 0.5432 647.7995 0.4973 663.1794 0.2111 671.9227 0.0665 672.9748 0.1795 680.4670 0.0967 683.6652 0.6060 689.7606 0.3616 690.9562 0.3712 704.2247 0.4969 715.1075 0.4048 718.8079 0.3910 724.6891 0.5656 725.5835 0.4024 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602061631263072433.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602061631263072433 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602061631263072433.eigenfacs 2602061631263072433.atom making animated gifs 11 models are in 2602061631263072433.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602061631263072433.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602061631263072433.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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