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LOGs for ID: 2602070057293190342

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602070057293190342.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602070057293190342.atom to be opened. Openam> File opened: 2602070057293190342.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 378 First residue number = 52 Last residue number = 429 Number of atoms found = 2862 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.386800 +/- 10.282980 From: -24.181000 To: 26.710000 = 5.109211 +/- 10.327421 From: -18.257000 To: 31.091000 = 4.244370 +/- 12.791358 From: -23.098000 To: 34.902000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0361 % Filled. Pdbmat> 1119214 non-zero elements. Pdbmat> 122473 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.59 +/- 23.45 Maximum number = 136 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 2.449460E+06 Pdbmat> Larger element = 510.456 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 378 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602070057293190342.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602070057293190342.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602070057293190342.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2862 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 378 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 30 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 45 Blocpdb> 13 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 73 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 87 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 103 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 120 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 139 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 156 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 175 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 191 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 204 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 217 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 232 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 247 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 266 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 283 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 303 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 318 Blocpdb> 18 atoms in block 22 Block first atom: 333 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 351 Blocpdb> 12 atoms in block 24 Block first atom: 365 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 377 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 390 Blocpdb> 15 atoms in block 27 Block first atom: 404 Blocpdb> 12 atoms in block 28 Block first atom: 419 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 431 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 442 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 460 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 472 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 487 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 502 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 517 Blocpdb> 12 atoms in block 36 Block first atom: 534 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 546 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 558 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 573 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 587 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 607 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 621 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 635 Blocpdb> 10 atoms in block 44 Block first atom: 652 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 662 Blocpdb> 20 atoms in block 46 Block first atom: 678 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 698 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 713 Blocpdb> 9 atoms in block 49 Block first atom: 728 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 737 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 751 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 766 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 781 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 799 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 816 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 829 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 840 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 852 Blocpdb> 15 atoms in block 59 Block first atom: 875 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 890 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 900 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 913 Blocpdb> 12 atoms in block 63 Block first atom: 932 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 944 Blocpdb> 8 atoms in block 65 Block first atom: 959 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 967 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 981 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 999 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1012 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1028 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1048 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1067 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1080 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1092 Blocpdb> 10 atoms in block 75 Block first atom: 1107 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1117 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1129 Blocpdb> 11 atoms in block 78 Block first atom: 1142 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1153 Blocpdb> 15 atoms in block 80 Block first atom: 1166 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1181 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1199 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 1217 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1241 Blocpdb> 9 atoms in block 85 Block first atom: 1258 Blocpdb> 20 atoms in block 86 Block first atom: 1267 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1287 Blocpdb> 18 atoms in block 88 Block first atom: 1312 Blocpdb> 10 atoms in block 89 Block first atom: 1330 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1340 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1355 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1370 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1383 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1400 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 1417 Blocpdb> 18 atoms in block 96 Block first atom: 1439 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1457 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 1473 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1493 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1512 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1528 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1543 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1561 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1577 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1594 Blocpdb> 11 atoms in block 106 Block first atom: 1611 Blocpdb> 8 atoms in block 107 Block first atom: 1622 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1630 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1645 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1657 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1674 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1694 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 1713 Blocpdb> 11 atoms in block 114 Block first atom: 1732 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1743 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1759 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1777 Blocpdb> 12 atoms in block 118 Block first atom: 1792 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 1804 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1824 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1843 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1857 Blocpdb> 10 atoms in block 123 Block first atom: 1867 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1877 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 1892 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 1911 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 1923 Blocpdb> 13 atoms in block 128 Block first atom: 1938 Blocpdb> 12 atoms in block 129 Block first atom: 1951 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1963 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 1979 Blocpdb> 13 atoms in block 132 Block first atom: 1994 Blocpdb> 14 atoms in block 133 Block first atom: 2007 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2021 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2036 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 2053 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2064 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 2079 Blocpdb> 12 atoms in block 139 Block first atom: 2099 Blocpdb> 10 atoms in block 140 Block first atom: 2111 Blocpdb> 11 atoms in block 141 Block first atom: 2121 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 2132 Blocpdb> 12 atoms in block 143 Block first atom: 2150 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 2162 Blocpdb> 13 atoms in block 145 Block first atom: 2179 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2192 Blocpdb> 25 atoms in block 147 Block first atom: 2206 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2231 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2246 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2261 Blocpdb> 16 atoms in block 151 Block first atom: 2274 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2290 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2304 Blocpdb> 10 atoms in block 154 Block first atom: 2319 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 2329 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 2347 Blocpdb> 16 atoms in block 157 Block first atom: 2364 Blocpdb> 21 atoms in block 158 Block first atom: 2380 Blocpdb> 13 atoms in block 159 Block first atom: 2401 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2414 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2430 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2442 Blocpdb> 19 atoms in block 163 Block first atom: 2455 Blocpdb> 18 atoms in block 164 Block first atom: 2474 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2492 Blocpdb> 13 atoms in block 166 Block first atom: 2508 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2521 Blocpdb> 15 atoms in block 168 Block first atom: 2537 Blocpdb> 20 atoms in block 169 Block first atom: 2552 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 2572 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 2589 Blocpdb> 15 atoms in block 172 Block first atom: 2607 Blocpdb> 18 atoms in block 173 Block first atom: 2622 Blocpdb> 22 atoms in block 174 Block first atom: 2640 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2662 Blocpdb> 16 atoms in block 176 Block first atom: 2675 Blocpdb> 9 atoms in block 177 Block first atom: 2691 Blocpdb> 19 atoms in block 178 Block first atom: 2700 Blocpdb> 13 atoms in block 179 Block first atom: 2719 Blocpdb> 16 atoms in block 180 Block first atom: 2732 Blocpdb> 11 atoms in block 181 Block first atom: 2748 Blocpdb> 12 atoms in block 182 Block first atom: 2759 Blocpdb> 11 atoms in block 183 Block first atom: 2771 Blocpdb> 10 atoms in block 184 Block first atom: 2782 Blocpdb> 18 atoms in block 185 Block first atom: 2792 Blocpdb> 11 atoms in block 186 Block first atom: 2810 Blocpdb> 14 atoms in block 187 Block first atom: 2821 Blocpdb> 12 atoms in block 188 Block first atom: 2835 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 2846 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1119403 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8586 Prepmat> Matrix trace = 2449460.0000 Prepmat> Last element read: 8586 8586 365.5703 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 15763 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2862 RTB> Total mass = 2862.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2862 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 272894.1145 RTB> 76077 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 76077 Diagstd> Projected matrix trace = 272894.1145 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 272894.1145 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.8870520 4.1211878 6.1036767 7.7940403 9.5921871 10.6717614 11.1997311 11.7349115 12.4704357 13.0641956 13.8776423 14.6669953 15.0563886 15.6950480 16.7786129 17.0488984 17.9461194 18.0816193 18.8278182 19.7263525 19.9431160 20.0478859 21.1531249 21.4704850 22.4721520 22.9035011 23.0760807 24.9074017 25.4174166 26.7584247 27.5811026 28.5021925 29.4632714 30.7531641 31.0668930 31.6414539 31.9251901 32.4831171 32.7425563 33.0535108 33.4049002 34.6746627 35.9624045 36.4206392 37.0470535 37.9588190 38.2427490 38.6902303 39.4422034 40.0773404 41.1297215 41.8131932 42.5450452 43.3746183 44.5820232 44.8183099 45.2746693 45.7953478 46.4070354 47.5898923 48.5945142 48.8958691 49.2611107 50.1472488 50.5807561 51.0158952 51.8898301 52.9370567 53.0643314 53.5914697 53.9295654 54.7750480 55.4069254 56.2338687 56.9475543 57.2416478 58.1192556 58.3912396 59.4352152 60.1990424 60.6038186 60.9573532 61.4062815 61.6951591 62.7938921 63.5621683 63.9562311 64.8360818 65.2033543 65.7736087 66.4127329 66.5074645 67.4675113 68.5692828 69.3913466 69.5434302 70.4693087 70.8698827 71.1983337 71.2316680 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034340 0.0034340 0.0034342 0.0034342 0.0034345 0.0034355 214.0944731 220.4481621 268.2816957 303.1632842 336.3210898 354.7425903 363.4118453 371.9933614 383.4741505 392.4972488 404.5322264 415.8779139 421.3623119 430.2061401 444.8087354 448.3771186 460.0240714 461.7574815 471.1891467 482.3015688 484.9442203 486.2163642 499.4391090 503.1717004 514.7751955 519.6922234 521.6465085 541.9503395 547.4708291 561.7273261 570.2970064 579.7415332 589.4347871 602.1992125 605.2630902 610.8344121 613.5670460 618.9051967 621.3718456 624.3154429 627.6251956 639.4423604 651.2078710 655.3435997 660.9553412 669.0392949 671.5368234 675.4542489 681.9866360 687.4557150 696.4230948 702.1856469 708.3041312 715.1762990 725.0620372 726.9809286 730.6727714 734.8622890 739.7537797 749.1221550 756.9878391 759.3314104 762.1621551 768.9867131 772.3033856 775.6182802 782.2334879 790.0874724 791.0366922 794.9560413 797.4596917 803.6864821 808.3087984 814.3184254 819.4695470 821.5828101 827.8569549 829.7917789 837.1768298 842.5391142 845.3669697 847.8291235 850.9453705 852.9446008 860.5061556 865.7542504 868.4337873 874.3869378 876.8599797 880.6860463 884.9545290 885.5854571 891.9543451 899.2078379 904.5819925 905.5727270 911.5810443 914.1682576 916.2841940 916.4986665 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2862 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.592 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.23 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51516 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602070057293190342.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602070057293190342.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602070057293190342.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602070057293190342.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 378 First residue number = 52 Last residue number = 429 Number of atoms found = 2862 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.592 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.23 Bfactors> 106 vectors, 8586 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.887000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.451 for 378 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.020 +/- 0.02 Bfactors> = 94.872 +/- 6.19 Bfactors> Shiftng-fct= 94.852 Bfactors> Scaling-fct= 258.693 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602070057293190342.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602070057293190342.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.3 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vecteur en lecture: 803.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.4 Chkmod> 106 vectors, 8586 coordinates in file. Chkmod> That is: 2862 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7643 0.0034 0.9772 0.0034 0.8373 0.0034 0.9270 0.0034 0.7853 0.0034 0.7604 214.0839 0.4539 220.4337 0.4871 268.2773 0.4102 303.1495 0.0145 336.3034 0.2885 354.6981 0.2429 363.4006 0.1721 371.8995 0.2587 383.4510 0.3437 392.4174 0.2763 404.5492 0.2652 415.9027 0.2668 421.3948 0.2552 430.2555 0.4783 444.8080 0.4105 448.3724 0.2490 460.0541 0.2475 461.7170 0.2284 471.1962 0.3852 482.3255 0.4493 484.8855 0.4215 486.2211 0.3819 499.3808 0.3515 503.1444 0.4050 514.7284 0.0794 519.6302 0.4166 521.6684 0.3449 541.9553 0.3069 547.4751 0.2531 561.7197 0.3926 570.2611 0.2725 579.6943 0.4056 589.3768 0.2275 602.1424 0.5117 605.2674 0.4698 610.7942 0.1455 613.5869 0.1468 618.8489 0.4042 621.3209 0.4258 624.2555 0.4953 627.5522 0.0955 639.3719 0.3726 651.1581 0.3924 655.3097 0.3561 660.9533 0.4004 669.0210 0.5523 671.4839 0.3626 675.4232 0.5177 681.9383 0.3193 687.4490 0.3057 696.3956 0.4599 702.1287 0.3348 708.3150 0.3476 715.1075 0.3724 725.0145 0.4719 726.9634 0.2842 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DQ=-80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602070057293190342.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602070057293190342 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom making animated gifs 11 models are in 2602070057293190342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602070057293190342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602070057293190342.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602070057293190342 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602070057293190342.eigenfacs 2602070057293190342.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602070057293190342.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602070057293190342.10.pdb 2602070057293190342.11.pdb 2602070057293190342.7.pdb 2602070057293190342.8.pdb 2602070057293190342.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.161s user 0m19.071s sys 0m0.082s rm: cannot remove '2602070057293190342.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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